Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0816
Help
Entry
MSC_0816 CDS
T00161
Name
(GenBank) putative variable surface protein
Organism
mmy
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF285
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAE77431
UniProt:
Q6MSF9
LinkDB
All DBs
Position
complement(926531..927748)
Genome browser
AA seq
405 aa
AA seq
DB search
MKKLLTILTTSSAVFLITAGVMLANKNSVENNIYISKQIQRKPHKIEGDKLIEIGYYWDS
HDRQVRIMRIPPTVKVIAAQLPPIITSLKGAFQARINDVIWHVPWDTKNITNMNSMFYNN
IWFNSSSILEWDTSNVTDMGEMFGRTGSFNQDLSKWDVSKVKNFKKMFYNAKKYNNNDKP
LKWNDKLKSAVNIEDMFQGTSDFKHSLSDWKLETEINNKNFGLLEDRHPKWKEKLIKPSS
PISSSNSLSSNNINDRSDDNQINRNSSTPTNSNTISTNPSNDLSSNTTNNENISESSMSN
NMLEIPINSENKPENPKNNENINYKILPKVDKTKKQSEAKNKIPVEKGELSKDENQTTKT
SNAIKDKENSSIKSDSLYKIPPKPNTIISKLSSPNAGIITGAVFR
NT seq
1218 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattattgacaattttaacaactagtagtgctgtatttttaataacagcagga
gttatgctagctaataagaatagtgttgagaataatatttatataagcaagcaaattcaa
agaaaaccacataaaattgaaggtgataaactaattgagattggatattattgagatagt
catgatagacaggtgagaataatgagaattccacctactgttaaagttattgctgctcaa
ctaccaccaataattacaagtttaaaaggtgcttttcaagcaagaattaatgatgtaata
tgacatgttccatgagatacaaaaaatataaccaatatgaacagtatgttttacaacaat
atttgatttaatagttctagtatacttgaatgagacacttcaaatgttactgatatggga
gaaatgtttggaagaacaggtagttttaatcaagatctgtcaaaatgagatgtttcaaaa
gtaaaaaactttaaaaaaatgttttataatgctaaaaaatataataacaatgataagcca
ttaaaatgaaatgacaaattaaaaagcgctgtaaatatagaagatatgtttcaaggtact
tctgattttaagcatagtttaagtgattgaaaattagaaacagaaataaataataaaaat
tttggattattagaggatagacatcctaaatgaaaggaaaaattaataaaacctagtagt
ccaattagttcgtcaaattctttaagttcaaataatattaatgatagatcagatgataat
caaataaatagaaattcatctacacctacaaattctaatactatatcaactaatccaagt
aatgacttatcttcaaatacaactaataatgaaaatatttctgaatcatctatgtctaat
aatatgttagaaattccaattaattctgaaaacaagccagaaaatcctaaaaacaatgaa
aatataaattacaaaatattacctaaagttgataaaactaagaagcagtcagaggccaaa
aacaaaattcctgttgaaaaaggtgaattgtctaaagatgaaaatcaaacaacaaaaact
agcaatgctataaaggataaggaaaatagttctataaaaagtgatagcctttacaaaatt
ccaccaaaaccaaatactataatttctaaattaagctctcctaatgctggaataattaca
ggagcagtttttaggtag
DBGET
integrated database retrieval system
