KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713: mycmycITA_00007
Entry
mycmycITA_00007   CDS       T03541                                 
Symbol
gyrA_1
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
  KO
K02469  DNA gyrase subunit A [EC:5.6.2.2]
Organism
mmyi  Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmyi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mmyi03032]
    mycmycITA_00007 (gyrA_1)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmyi03400]
    mycmycITA_00007 (gyrA_1)
Enzymes [BR:mmyi01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
     mycmycITA_00007 (gyrA_1)
DNA replication proteins [BR:mmyi03032]
 Prokaryotic type
  DNA Topoisomerases
   mycmycITA_00007 (gyrA_1)
DNA repair and recombination proteins [BR:mmyi03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
     Facilitator
      mycmycITA_00007 (gyrA_1)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C DUF2119 UBA_RAD5A
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIZ54840
LinkDB
Position
7447..9951
AA seq 834 aa
MNNENNNNDSLNENQDHYHGKISPIDISTEVRKDFLEYAMSVIVSRALPDLKDGLKPVHR
RIIYAMNDLGITSDKPHKKSARIVGEVIGKYHPHGDSAVYETMVRMAQEFSYRYPLIDGH
GNFGSIDGDGAAAMRYTEARLAKISNYLIKDIDMDTVPFIDNYDASEHEPAYLTGYLPNL
LVNGTMGIAVGMATSIPPHNLKEVVSAINAYIDNNDITIDEILNDHILGPDFPTGALMTN
GSKMREGYKTGRGSVIIRAKIDFEENKKHDRFVVTEIPYQTNKAKIIEKIAELVKDKTIE
GIFDIRDESNYEGIRIIIELKKDANPDVVLSKLYKYTALQSSFSINLLTLNNNLPVLLDL
KTIIKNYVEFQVSVIIKRSIFEKNKLTKRYHILEALHIALDNVDDVINIIKNSKTSEEAK
VELTNKYNFDEEQNKAILDMRLQRLVGLERDKITLEMTNIKERLTYLDVLINTKEEQDNV
LKNQLNEIADKFGDNRRTELIDEELINIEDEELIPDLKWMILLSQEGYIRRINPDEFRIQ
KRGGRGVSVNAEPSDPIDIATMGKAKDWVLFFTNSGKVYRTKLYNIRSYSRTARGLPIVN
FLNDLTSEDKITAILPLRNNKEKFNYLTFVTQKGMIKRTKISEFENINRNGKKAINLREN
DQLVSVFATTGQDTVFIANESGKVIRIKESVVNPQSRVGGGVRALKLEDDDVVVGAISSF
KLTHITTVSNKGLFKKTPIDDYRISGRNGKGIKVMNLNQRTGKFKAIIGARETDLIMIIS
SDGNLIKTKVSNIPSLSRNASGVKAIRLTDNQEINAITLEYRKHGLENEDFEED
NT seq 2505 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataatgaaaataacaacaatgattctttaaatgaaaatcaagatcattatcatggt
aaaatttctcctattgatatttcaacagaagttagaaaagatttcttagaatatgcaatg
agtgttattgtaagtcgtgctttacctgatttaaaagatggattaaaaccagttcataga
cgtattatttatgcaatgaacgatttaggaattacttcagataaaccacacaaaaaatct
gctcgtatagttggagaagtaattggtaagtaccacccacatggagatagtgctgtttat
gaaacaatggtaagaatggctcaagagttttcttatcgttatcctttaatagatggtcat
ggtaactttggttcaattgatggtgatggtgcagctgcaatgcgttatactgaagcaaga
ttagctaaaatatcaaattatctaataaaagatattgatatggatacagtaccatttatt
gataattatgatgctagtgaacatgaaccagcttatttaacaggttatttaccaaacctt
ttagttaatggaactatgggtattgcagttggaatggcaacttcaattccaccacataat
ttaaaagaagtagttagtgctattaatgcttatattgataataatgatattactattgat
gaaatattaaatgatcatattttaggtcctgattttccaactggtgctttaatgactaat
ggatcaaaaatgcgcgaaggttataaaacaggacgaggtagtgttattattagagcaaaa
attgattttgaagaaaataaaaagcacgatagatttgtagttactgaaattccatatcaa
actaataaagctaaaattattgaaaaaatagctgaattagttaaagacaaaactattgaa
ggtatttttgatattagagatgaatcaaattatgaaggtattagaatcattattgaatta
aaaaaagatgctaatcctgatgttgttttatctaaactttataaatatactgctttacaa
tcaagtttttcaattaacttattaactttaaataataatttacctgttttattagattta
aaaactattattaaaaactatgttgagtttcaagttagtgttattataaaacgttctatt
tttgaaaaaaataaattaactaaacgttatcatattttagaagctttacatattgcctta
gataatgttgatgatgttattaatattattaaaaactctaaaactagtgaagaagccaaa
gttgaattaactaataaatataactttgatgaagaacaaaataaagctattttagatatg
cgtttacaaagattagttggtttagaaagagataaaatcactttagaaatgactaatata
aaagaacgtttaacttatttagatgttttaattaatacaaaagaagaacaagataatgtt
ttaaaaaatcaattaaatgaaatagctgacaagtttggagataatagaagaacagaatta
attgatgaagaattgattaatattgaagatgaagaattgattcctgatttaaaatgaatg
attttattatcacaagaaggttatattagaagaattaatcctgatgagtttagaatccaa
aaacgcggtggacgtggagttagtgttaatgctgaaccaagtgatcctattgatatagca
acaatgggaaaagctaaggactgagtattattctttactaattcaggaaaagtttataga
actaagttatataacatcagaagttattcaagaacagctagaggattaccaattgttaac
tttttaaatgacttaactagtgaagataaaattacagctattttacctttaagaaacaat
aaagaaaaatttaattatttaacttttgttactcaaaaaggaatgattaaaagaactaaa
atttctgaatttgaaaacattaatagaaatggtaaaaaagcaattaatttaagagaaaat
gatcaactagtttcagtatttgcaacaactggacaagatactgtttttattgctaatgaa
tctggaaaagtaattagaattaaagaaagcgtagttaatccacaatccagagttggtggt
ggagttagagcattaaaactagaagatgatgatgttgtagttggagcaattagttcattt
aaattaactcatattactactgtttcaaataaaggtttatttaaaaaaacaccaattgat
gattatagaattagtggaagaaatggtaaaggaattaaagtaatgaacttaaaccaaaga
actggtaagttcaaagctattatcggagctagagaaactgatttaataatgatcatttca
agtgatggtaacttaattaaaacaaaagtttcaaatattccttcactttcaagaaatgct
agtggggttaaagcgattagattaacagataatcaagagatcaatgcaattactttagaa
tatcgtaaacacggtcttgaaaatgaagattttgaagaagattaa

DBGET integrated database retrieval system