Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713: mycmycITA_00328
Help
Entry
mycmycITA_00328 CDS
T03541
Symbol
valS
Name
(GenBank) Valine--tRNA ligase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
mmyi
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713
Pathway
mmyi00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmyi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
mycmycITA_00328 (valS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
mmyi01007
]
mycmycITA_00328 (valS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mmyi03016
]
mycmycITA_00328 (valS)
Enzymes [BR:
mmyi01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
mycmycITA_00328 (valS)
Amino acid related enzymes [BR:
mmyi01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
mycmycITA_00328 (valS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
mmyi03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
mycmycITA_00328 (valS)
Prokaryotic type
mycmycITA_00328 (valS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
tRNA-synt_1_2
tRNA-synt_1e
Val_tRNA-synt_C
PGDYG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIZ55157
UniProt:
A0A7U5HST1
LinkDB
All DBs
Position
complement(355875..358493)
Genome browser
AA seq
872 aa
AA seq
DB search
MKKQLNPKYDHLQVEKDKYQYWLDKNLFKADINSNKPKFSIILPPPNVTGKLHIGHAWDT
SLQDAIIRFKKLTGYDTLFLPGMDHSGISTQVKVEAKLKQQGIDKNKLGREKFLLEAWKW
KEEYANIIRKQWAKLGLSLDYSTEKFTLDEDINQIVKEIFVKFYNDQIIYKDKQIVNWDP
EQKTAISNVEVIYKETQSKMYYFKYILEDSNEYLTVATTRPETMFADQCLVVNPNDSRYQ
KYINKKVINPVNKQVIPIISDEYVDIEFGTGVMKCTPAHDLNDYHLGIKHNLKMPICLNI
DGSVNQLGGKYQGLDRFVARKKIIKNAIKEDLFVKEEDIINQVGFSERSNAIVEPYLSDQ
WFVKMDKFKNMVIDLQNSDNKINFYPNRFSDVLNRWMTDAHDWCISRQLWWGHQIPCWYH
KKTNEMYVGINPPSDIENWTQDQDVLDTWFSSGLWAFSTLLNNKGLESEYFKNYFPTSVL
VTGYDIIFFWVARMIFQTLEYTKQIPFKDVLIHGLVRDESNRKMSKSLGNGIDPMDVINN
NGCDSLRLFLLTNSTPGQDIRYSNEKILASWNFINKLWNASRYVFLNLDEDFKFDPNFYK
TDLEITNQWILTQLSKTQTYVYEKMNKYEFSLAGNHLWDFVWNKYCSWYIEFSKVNLNND
KFTHQTKQTLFYVLKEILIMLHPLIPFVSEEIYLNMMLKESILLEQWTNLNSNYDTSFID
DVIKMITSIREFRNTKNIKNDVCLSVNISNTNQNHTKLFKKHFDQIYNFLFNFCNTKLVD
EAIKNKTSLSIDEYFIEIANDSFINKNELIKELEQKQNYLNNEITRSQKILNNQEFIKKA
KPEKIQSEKIKYQNYLDQLQAIKDKLKELTND
NT seq
2619 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacaattaaatcctaaatatgatcatcttcaagttgaaaaagacaaatatcaa
tattgattagataagaatttatttaaagctgatattaattctaataaacctaaattttct
attattttacctccgccaaatgttactggtaaattacatataggacatgcatgagatact
agtttacaagatgctattattagatttaaaaaattaactggatatgatactttgttttta
cctggtatggatcattctggaattagtacccaagtaaaagttgaagctaaattaaaacaa
caaggtatagataaaaataaactaggtagagaaaagtttttattagaagcttgaaaatga
aaagaagaatatgcaaacattattagaaaacaatgagctaaattaggtttaagtttagat
tattcaactgaaaaatttactctagatgaagatattaatcaaattgttaaagaaatattt
gtaaagttttataatgatcaaataatttataaagacaaacaaattgttaattgagatcca
gagcaaaaaactgctatttctaatgttgaagtaatttataaagaaactcaaagtaaaatg
tattattttaaatacatattagaagattctaatgagtatttaacagttgctacaactcgt
cctgaaactatgtttgctgatcaatgtttagttgttaatccaaatgattctagatatcaa
aaatatattaataaaaaagtaattaatccagttaataaacaagttattccaattattagt
gatgaatatgttgatattgagtttggaactggagttatgaaatgtactcctgctcatgat
ttaaatgattatcatttaggaattaaacataatttaaaaatgccaatttgtttaaatatt
gatggttcagttaatcaattaggtggaaaatatcaaggtttagatagatttgttgctaga
aaaaaaatcattaaaaatgcaattaaagaagatttgtttgtaaaagaagaagatattatt
aatcaagttggatttagtgaaagatcaaatgctattgttgaaccatatttatctgatcag
tgatttgttaaaatggataaatttaaaaatatggtaattgatttacaaaattcagataat
aaaattaatttttatccaaatagatttagtgatgttttaaatagatgaatgactgatgct
catgattgatgtattagtagacaattatgatgaggacatcaaattccttgttgatatcac
aaaaaaactaatgaaatgtatgttggaattaatcctccaagtgatatagaaaattgaact
caagatcaagatgttttagatacttgattttcatcaggactatgagctttttcaacactt
ttaaataataaaggcttagaaagtgaatattttaaaaattattttccaaccagtgtttta
gttactggttatgatattattttcttttgagtagctagaatgatttttcaaactttagaa
tatacaaaacaaattccatttaaagatgttttaattcatggtcttgtaagagacgaatca
aatagaaaaatgtctaaatctttaggtaatggaatagatcctatggatgttattaataat
aatggttgtgattcattaagattatttttattaactaattcaactccaggtcaagacatt
agatattcaaatgaaaaaattttagctagttgaaactttataaataaattatgaaatgca
agtaggtatgtgtttttaaatttagatgaagattttaaatttgatcctaacttttataaa
actgatttagaaataactaatcaatgaattttaactcaattaagtaaaacacaaacttat
gtttatgaaaaaatgaacaaatatgagtttagtttagctggaaatcatctttgagatttt
gtatgaaataaatattgttcttgatatattgaatttagtaaagttaatttaaataatgat
aaatttactcatcaaactaaacaaactttattttatgtattaaaagaaattttaattatg
cttcaccctttaataccatttgtaagtgaagaaatttatttaaatatgatgttaaaagaa
tctattcttttagaacaatgaactaatttaaattctaattatgatacaagttttattgat
gatgttattaaaatgattacaagtattagagaatttagaaatactaaaaatattaaaaat
gacgtttgtttatcagtaaatatttcaaatactaatcagaatcatacaaaattatttaaa
aaacattttgatcaaatttataattttttatttaatttttgtaatactaaattagttgat
gaagctattaaaaataagactagtttatcaattgatgaatattttattgaaattgcaaat
gattcatttattaataaaaatgaactaataaaagaattagaacaaaaacaaaattatcta
aataatgaaataactagaagtcaaaaaatcttaaataatcaagaatttataaaaaaagca
aaacctgaaaaaattcaatcagaaaaaataaaatatcaaaattatttagatcaactacaa
gcaattaaagacaaattaaaagaattaacaaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
