Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713: mycmycITA_00509
Help
Entry
mycmycITA_00509 CDS
T03541
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
mmyi
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmyi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mmyi03019
]
mycmycITA_00509
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mmyi03009
]
mycmycITA_00509
Enzymes [BR:
mmyi01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
mycmycITA_00509
Messenger RNA biogenesis [BR:
mmyi03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
mycmycITA_00509
Ribosome biogenesis [BR:
mmyi03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
mycmycITA_00509
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
PhoH
AAA_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIZ55333
UniProt:
A0AAE2EJ01
LinkDB
All DBs
Position
542607..543968
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MKFTDFGFKKYINDTLDQIEFIAPTSIQQKVIPLLKKHKNVIALAHTGTGKTHSFLLPIL
NNLKLEENNNYAQAVIISPTRELSLQIYQNTKLFFKNNPLINCNLFIGGEDISKNIEQLE
KKQPHIVIGTPTRLKELYDLNKLRLTTTSYFIIDECDMIFDLGFIEDVDYLISKINQDVT
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KKGIEFETKKLIDNQLVDIKTNYKKVKVFKELDAESKQVINKYKNKKVKPNYKKKRKQEL
DKIKQKIRRKHIKENIEKIKKAKYQKRRAELFD
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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aaagcaaaatatcaaaaaagaagagcagaactatttgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
