Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713: mycmycITA_00550
Help
Entry
mycmycITA_00550 CDS
T03541
Symbol
recD_1
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit alpha
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
mmyi
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713
Pathway
mmyi03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmyi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
mycmycITA_00550 (recD_1)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmyi03400
]
mycmycITA_00550 (recD_1)
Enzymes [BR:
mmyi01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
mycmycITA_00550 (recD_1)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmyi03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
mycmycITA_00550 (recD_1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
Viral_helicase1
UvrD_C_2
AAA_11
SH3_13
SLFN-g3_helicase
OB_YrrC
AAA_22
AAA
NPHP3_N
AAA_12
nSTAND3
DEAD
NTPase_1
AAA_28
NAT10_TcmA_helicase
T2SSE
AAA_29
RsgA_GTPase
ResIII
NACHT
NB-ARC
ABC_tran
AAA_18
AAA_17
AAA_16
AAA_14
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIZ55373
UniProt:
A0AAE2EI52
LinkDB
All DBs
Position
594660..596843
Genome browser
AA seq
727 aa
AA seq
DB search
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YDQVILVLQDTLFSSFLSKKLLYTAITRAKKQLIVIGDFDLFIKASKKNARIRKTTLVEH
ILNKLNN
NT seq
2184 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
