Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713: mycmycITA_00629
Help
Entry
mycmycITA_00629 CDS
T03541
Name
(GenBank) tRNA-binding domain-containing protein
KO
K01890
phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain [EC:
6.1.1.20
]
Organism
mmyi
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713
Pathway
mmyi00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmyi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
mycmycITA_00629
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
mmyi01007
]
mycmycITA_00629
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mmyi03016
]
mycmycITA_00629
Enzymes [BR:
mmyi01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.20 phenylalanine---tRNA ligase
mycmycITA_00629
Amino acid related enzymes [BR:
mmyi01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (U)
mycmycITA_00629
Transfer RNA biogenesis [BR:
mmyi03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
mycmycITA_00629
Prokaryotic type
mycmycITA_00629
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA_synthFbeta
B5
FDX-ACB
tRNA_bind
B3_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIZ55452
UniProt:
A0AAE2EHS3
LinkDB
All DBs
Position
complement(668448..670832)
Genome browser
AA seq
794 aa
AA seq
DB search
MIITRNWLKKYLNLDNISNDQINMALNSLGFEVDSVYDLNSLNSELILGYVEQSKQIPDT
HLKLNQVNIGTKSLQIVCGASNVDANQFVVIAPINATIANGLTLTSKKIQNYESQGMICA
LNEIGIDLSVINKEDQLKIYNVSDKNLDLKKYIGSDVKQIIGLDDYLFEIDLTLNRSDCL
ASFQILKELANYFDLKIKNLDNNFSDFKKNNLDLKIDLANQVKDQIKTISYSYFELNNKN
DKLDSKDEIFLKLNQINSSNHSITNLSLISTLSTAQTHILIDLDKLKSSNLKLEFINHDN
KELLCLTNNNKLVNIIGLDTQNEFNVDNNSKNVLNIMLNIEPNLMRKQQKLLNISNTYLQ
RYIKPINPNLFNLANQTFSNLLNDYQLINKAYEVKILKQTFKNKQSLEIKLNEINDLLGT
NLTIKQIKSLFKHLDFKITNKDDLLDFQIDQNRIDITSKNDLCEEVARLYSYDKIDEIPL
SFTSFKKAKNLNLKLENKLTNYLIGLGFNNTKTYSLTSLNEAKYWNLFNISEFINLVSPL
SNLRQTYRTNLSKSLIDVAIFNHSINNKELKLFEIADIYDLNNLKQRHLVFLTSNHIYKN
SLNQQLIENNFYYNKEILENIFNLYNLDLSEIQYQSDLNLIKEIHPYINTTIYYQNQLIG
YLYKLNPKFESENKLNPTFVCEINLDILNQFKNSFIEAKTLSKFQSSSRDLTIEISNDLT
YQKVLFNALSDVKYLKSHKIVDLYLDDNLIKNNTKALTIQFVFNDLEHQLTENEINQEFE
KIIKNIKQMKVVIR
NT seq
2385 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattattacaagaaattgattaaaaaaatatcttaatttagataatatttcaaatgat
caaattaatatggctttaaattctttagggtttgaagttgatagtgtttatgatttaaac
tcactaaattctgaactaattttaggatatgtagaacaatcaaaacaaattccagacact
catttaaaattaaatcaagttaatataggaactaaaagtttacaaattgtttgtggagct
agtaatgttgatgctaatcaatttgtagtaattgctccaattaatgcaactattgcaaac
ggtttaactttaactagtaaaaaaattcaaaattatgaatcacaaggaatgatttgtgct
ttaaatgaaattggaattgatctatcagttattaataaagaagaccagttaaaaatttat
aatgtttctgataaaaatctagatttaaaaaaatatattggtagtgatgttaaacaaatt
attggtttagatgattatttatttgaaattgatttaactttaaatagaagtgattgttta
gctagttttcaaattttaaaagaacttgcaaattactttgatttaaaaattaaaaactta
gataataatttttctgattttaaaaaaaataatttagatttaaaaattgatttagctaat
caagttaaagatcaaattaaaacaattagttattcttattttgaattaaataataaaaat
gacaaattagactcaaaagatgaaatctttttaaaattaaatcaaataaattcttctaat
cattcaattacaaatttaagtttaatttcaactttatcaacagctcaaactcacatttta
attgatttagataaattaaagagttctaatttaaaattagaatttataaatcatgataat
aaagaacttttatgtttaactaataataataaattagtaaatattattggattagacaca
caaaatgaatttaatgttgataataactcaaaaaatgttttaaacattatgttaaatatt
gaacctaacttaatgagaaaacaacaaaaacttttaaacatttcaaatacttatttacaa
agatatataaaaccaattaaccctaatttatttaatttagcaaatcaaactttttctaat
ttattaaatgattatcaattaataaataaagcttatgaagttaaaatactaaaacaaact
tttaaaaacaaacaaagtttagaaattaaattaaatgaaattaatgacttattaggaact
aatttaactattaaacaaattaaaagtttatttaaacatttagattttaaaatcactaat
aaagatgatcttttagattttcaaattgatcaaaatagaattgatataactagtaaaaat
gatttatgtgaagaagttgctagattatattcatatgataaaattgatgaaattccatta
agctttactagttttaaaaaagctaaaaacttaaatttaaaactagaaaataaattaact
aattatttaataggattaggatttaataatactaaaacttattcactaactagtttaaat
gaagctaaatattgaaatttatttaatatttctgaatttattaatttagtatcaccatta
tcaaatttaagacaaacttatagaactaatttaagtaaatcattaattgatgtagctatt
ttcaatcattcaattaataataaagaattaaaattatttgaaatagctgatatttatgat
ttaaataatttaaaacaaagacatttagtatttttaacaagcaatcatatttataaaaac
agtttaaatcaacaattaattgaaaataatttttactacaataaagaaattttagaaaat
atttttaatttatataatttagatttgtctgaaattcaataccaaagtgatttaaatctt
attaaagaaattcatccatatattaatacaactatttattatcaaaatcaattaatcgga
tatttatataaattaaatcctaaatttgaatcagaaaataaattaaatcctacatttgta
tgtgaaattaatttagatattttaaatcagttcaaaaatagttttatagaagcaaaaact
ttaagtaagtttcaaagttcttcaagagatttaactatagaaatttcaaatgatttaact
tatcaaaaagttttatttaatgctttaagtgatgttaaatatttaaaaagtcataaaatt
gttgatttatatttagatgataatctaattaaaaataatactaaagctttaactattcaa
tttgtttttaatgacctagaacatcaattaactgaaaatgaaatcaatcaagaatttgaa
aaaataataaaaaatattaaacaaatgaaagtagtgattagataa
DBGET
integrated database retrieval system
