KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713: mycmycITA_00810
Entry
mycmycITA_00810   CDS       T03541                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA
  KO
K03657  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:5.6.2.4]
Organism
mmyi  Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713
Pathway
mmyi03420  Nucleotide excision repair
mmyi03430  Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmyi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    mycmycITA_00810
   03430 Mismatch repair
    mycmycITA_00810
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmyi03400]
    mycmycITA_00810
Enzymes [BR:mmyi01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     mycmycITA_00810
DNA repair and recombination proteins [BR:mmyi03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     mycmycITA_00810
   MMR (mismatch excision repair)
    Other MMR factors
     mycmycITA_00810
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 Viral_helicase1 AAA_12 AAA_11 AAA_30 PcrA_UvrD_tudor DEAD
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIZ55629
LinkDB
Position
complement(867911..870079)
AA seq 722 aa
MSVDHLLDLLNSQQLAAVLNTDKPVRIIAGAGSGKTRVITTKIAYLIEKKDIDPTRILAV
TFTNKAAKEMKERVLQITKNQKKSPFISTFHAWCSKVLRIDGKHVGLKDKFLIIDSDDQK
RIIKNALKESNIELSENDKKTFDKKILYKIKEWKEELVDPDEAILNANSTYDRNSAIIYK
LYQETLLKNNSIDFDDLQIYVYLLFKNHQEILNKWKNSYDYVLVDEFQDTNDIQFNLIKF
LTINTNHLTAVGDPDQTIYSWRGTKLDIILNFNKTYSNAISIVLNQNYRSTKQILDISNS
FIKNNKFREHKEIYTNNKTGKKVVLKECNSKTSEASYVSFKIKELIKQGYHYKDIFILYR
MNAWSQEFEKELINRKIPFQLIGGIKFRERKVIKDAMAFLKMISIKDDLSSQRVLSLIPK
IGNITIEKIINTANLNHISIFDLITNKDKTLLQSITKNLDELIEVFKTAHQLYLDNTNIE
EILKYLLIQSGYGNKLKVKKEQDDLENINALYDQLKRFDEDFDPKYYSEENKLIAFLQEE
ALTSDIDEAQQIDKVSLLTVHAAKGLENKVVFITGLNQGIFPTRLSENNQKELEEERRAL
YVALTRAKEELFLTYVKGDYSHIIQSELKPSKFIHELDKDLYEFESQFLNSQIYDKNQHK
TPSFYVSPKQHNLYNVGDHVEHKLFGKGIITKVINDQLQISFTNSSYGVMIIAANNSALT
KI
NT seq 2169 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcagtagatcatttattagatttattaaattctcaacaactagcagcagttttaaat
acagataaaccagtaagaattattgctggagctggtagtggaaaaactagagtaattaca
actaaaattgcttatttaatagaaaaaaaagatattgatccaactagaattttagctgta
acttttacaaataaagctgctaaagaaatgaaagaacgtgttttgcaaattacaaaaaat
caaaaaaaatctccttttatttctacttttcatgcttgatgttctaaagtattaagaatt
gatggaaaacatgttggtttaaaagataagttcttaataattgatagtgatgatcaaaaa
agaataattaaaaatgctttaaaagaatcaaatatagaattaagtgaaaatgataaaaaa
acttttgataaaaagattttatataaaatcaaagaatgaaaagaagaactagttgatcca
gatgaagctattttaaatgctaatagtacttatgatagaaattctgctattatttataaa
ctatatcaagaaacgcttttaaaaaataattctattgattttgatgatctacaaatttat
gtttatttattatttaaaaatcatcaagaaattttaaataaatgaaaaaacagttatgat
tatgtattagttgatgagtttcaagatactaatgatattcaatttaatctaattaaattt
ttaacaattaatactaatcatttaacagcagttggtgatcctgatcaaactatttattct
tgaagaggaactaaattagatattattttaaactttaataaaacatatagtaatgctata
agtattgttttaaatcaaaactatagatcaacaaaacaaatactagatatttctaatagt
tttattaaaaataataagtttagagaacataaagaaatttatacaaataataaaactggt
aaaaaagtagttttaaaggaatgtaattcaaaaactagtgaagctagttatgtaagtttt
aaaattaaagaactaataaaacaaggttatcattataaagatatttttattttatataga
atgaatgcttgatctcaagaatttgaaaaagaactaattaatagaaaaattccttttcaa
ttaattggtggaattaagtttagagaaagaaaagtaattaaagatgctatggcattttta
aaaatgatttcaattaaagatgacttgtcatctcaaagagttttaagtttaattccaaaa
attggaaatattacaattgaaaaaattataaatactgcaaatttaaaccatataagtata
tttgatttgattacaaataaagacaaaacattattacaatcaattactaaaaatttagat
gaacttattgaagtgtttaaaacagcacatcaattgtatttagataatacaaatattgaa
gaaattttaaaatatctattaattcaatctggttatggaaataaattaaaagttaaaaaa
gagcaagacgatttagaaaatattaatgctttatatgatcaattaaaaagatttgatgaa
gattttgatccaaaatattatagtgaagaaaataaactaattgcttttttacaagaagaa
gctttaactagtgatattgatgaagcacaacaaattgataaagtttcattactaacagtt
catgctgctaaaggattagaaaataaagtagtttttattactggattaaatcaaggaatt
tttccaacaagactatctgaaaataatcaaaaagaattagaagaagaaagacgtgcttta
tatgttgctttaactagagcaaaagaagaattatttttaacttatgttaaaggtgattat
tctcatattatacaatctgaattaaaaccaagtaagtttattcatgaacttgataaagat
ttatatgaatttgaatctcaatttttaaatagtcaaatttatgataaaaaccaacataaa
acaccttcattttatgtttcaccaaaacaacataacttatataatgttggtgatcatgtt
gaacataaattatttggtaaaggaattataacaaaagttataaatgatcaattacaaatt
tcatttacaaattctagttatggagtaatgatcattgctgctaataattcggctttaact
aagatataa

DBGET integrated database retrieval system