KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713: mycmycITA_00997
Entry
mycmycITA_00997   CDS       T03541                                 
Symbol
cbiO_2
Name
(GenBank) cobalt ABC transporter ATP-binding protein
  KO
K03701  excinuclease ABC subunit A
Organism
mmyi  Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam_mm5713
Pathway
mmyi03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmyi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    mycmycITA_00997 (cbiO_2)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmyi03400]
    mycmycITA_00997 (cbiO_2)
DNA repair and recombination proteins [BR:mmyi03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     mycmycITA_00997 (cbiO_2)
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
     Supressor
      mycmycITA_00997 (cbiO_2)
SSDB
Motif
Pfam: UvrA_inter UvrA_DNA-bind ABC_tran SMC_N nSTAND3 AAA_21 AAA_29 RsgA_GTPase AAA_14 nSTAND1 AAA_22 APS_kinase AAA_16 AAA_18 NB-ARC NACHT ATPase DnaJ_CXXCXGXG ATPase_2 cobW Viral_helicase1 AAA_23 MeaB
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIZ55810
UniProt: A0A7U5AZK5
LinkDB
Position
complement(1073813..1076653)
AA seq 946 aa
MSTDKIIIKGAREHNLKNIDLELPKNKLIIFTGLSGSGKSSLAFSTIYQEGRRRYIESLS
AYARQFLGGNEKPDVDSIEGLSPAISIDQKTTSHNPRSTVGTVTEIYDYLRLLYARIGQP
YCINNHGQIKAVSIKEIVENIKQSTSDGEQIHILSPVIRDKKGTHIDILEKLRNDGFIRV
IVDDQLRMLDDQINLEKNQRHNIDIVVDRIIYHNNDEINSRIFTAVEMGLKYSNNLIKIA
FPNSNKQEKLFSTSFSCKVCDFVVPELEPRLFSFNVPLGACELCNGLGVSLEPDINLILP
DLKLSINQGGVVYYKNFMHTKNIEWQKFRILCDYYYIDLNTPLKDLTQKQRDIILWGSDR
EIDIKIVTENNNKYEKYDFIEGNAALIKRRYFESKSEEARKWYAKFMSSKICKQCKGSRL
NDIALSVKINEKSIFDYTNMSISEQLDFLLNIDLTATQAMIAKLVLDEIISRTNFLNEVG
LGYLNLSRTATTLSGGESQRIRLAKQIGSQLTGILYVLDEPSIGLHQKDNDKLIKTLKHL
RDLGNTLIVVEHDEDTMKSSDWIVDIGPRAGEYGGEITFSGTYQDILKSDTITGRYLSRK
EGIAVPKTRRGGNGKKIEIIGASENNLKNINVTIPLNKFITITGVSGSGKSTLLEDIVYK
GIHNNLSKEYLPIGKVKEIKGIENINKAIYISQEPIGKTPRSNPATYTSVFDDIRDLFTN
LPEAKIRGYKKGRFSFNVHGGRCEHCQGDGVITISMQFMPSVEVVCEICDGKRYNDETLT
VKYKNKSIADVLNMSVSEAYVFFENIPQIKQKLETILEVGLGYIKLGQNATTLSGGESQR
IKLSTYLLKKQTGNTMFLLDEPTTGLHVDDVKRLIGVLNKLVDLGNTVLCIEHNLDFIKV
SDHIIDLGPDGGEYGGQVIVTGTPEQVIHHQTSYTAKYLKDYIIND
NT seq 2841 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaacagataaaattattataaagggtgctagagagcataatttaaaaaatattgat
ttagaacttcctaaaaataaattaattatttttacaggtttaagtggttctggaaaatct
tcattagctttttcaacaatttatcaagaaggaagaagaagatatattgaatcactttct
gcttatgctagacaatttttaggtggtaatgaaaaacctgatgttgattctattgaaggt
ttatctcctgcaatttctattgatcaaaaaaccacaagtcacaatcctagatcaactgtt
gggactgttactgaaatttatgattatttacgtttattatatgcaagaattggtcaacct
tattgtattaataatcatggtcaaattaaagcggtaagtattaaagaaattgttgaaaat
attaaacaatcaactagtgatggtgaacaaattcatattttatctccagtaattagagat
aaaaaaggaactcatattgatattttagaaaaactaagaaatgatgggtttattagagtt
attgttgatgatcaattaagaatgctagatgatcaaattaatttagaaaaaaatcaaaga
cataatatagatatagttgttgatagaattatttatcataataatgatgaaattaattca
agaatatttacagctgttgaaatgggattaaaatattcaaataacttaattaaaattgca
tttccaaattctaataaacaagaaaaattattttcaacttctttttcatgtaaggtttgt
gattttgtagttccagaacttgagcctagattattttcatttaatgttcctcttggtgct
tgtgaattatgtaatggattaggtgttagtttagaaccagatataaatttaattcttcct
gatttaaaattatcaattaatcaaggtggagttgtttattataaaaattttatgcataca
aaaaatatagaatgacaaaaatttagaattttgtgtgattattactatattgatctaaac
actcctttaaaagatttgactcaaaaacaaagagatataattttatgaggaagtgatcga
gaaattgatattaaaattgttactgaaaataataataaatatgaaaaatatgattttatt
gaaggtaatgctgctttaatcaaaagaagatattttgaatctaaatcagaagaagctaga
aaatgatatgcaaaatttatgtcttctaaaatatgcaaacaatgtaaaggaagtagatta
aacgatattgctttatctgtaaaaattaatgaaaaatctatatttgactatactaatatg
agtatttctgaacaattagattttttattaaacattgatttaactgcaactcaagctatg
attgcaaaattagttttagatgaaattatttcaagaactaactttttaaatgaagttggg
ttagggtatttaaatctatcaagaacagctacaactttaagtggtggagaatctcaaaga
attagattagctaaacaaattggatctcaattaactggaattttatacgttttagatgaa
ccatcaattggattacatcaaaaagataatgataaattaattaaaactttaaaacattta
agagatctaggaaatactttaattgttgttgagcatgatgaagatacaatgaaaagtagt
gattgaattgttgatattggccctagagctggagagtatggtggagaaattacttttagt
ggaacatatcaagatattttaaaatcagatactattactggtagatatttatcaagaaaa
gaaggtatagcagttcctaaaactagacgtggtggtaatggtaaaaaaattgaaattatt
ggagctagtgaaaacaatttaaaaaatattaatgtaactattcctttaaataaatttata
actattacaggtgttagtggatctggaaaatcaactttactagaagatattgtttataag
ggaattcataataatttatcaaaagagtatttaccaattggaaaggttaaagaaattaaa
ggtatagaaaatatcaataaagctatttatatttctcaagaaccaatcggaaaaactcct
agatcaaacccagcaacttatacttcagtttttgatgatattagagatttatttactaat
cttccagaagcaaaaattaggggttataaaaaaggtagattttcatttaatgttcatggt
ggtagatgcgagcattgtcaaggtgatggagtaattacaatttctatgcaatttatgcca
agtgttgaagtggtttgcgaaatttgtgatggtaaaagatataatgatgaaactttaaca
gttaaatataaaaacaaatcaattgctgatgttttaaatatgagtgttagtgaagcttat
gtcttttttgaaaatattcctcaaattaaacaaaagctagaaactattttagaagttggt
ttaggttatattaaactaggacaaaatgctacaactttaagtggtggagaatctcaaaga
attaaattatctacttacttattaaaaaaacaaactggaaatactatgtttttattagat
gaaccaacaactggtttgcatgttgatgatgttaaaagattaattggtgttttaaataaa
ttagttgatttaggaaatacagttttatgtattgaacataatctagattttattaaagtt
tcagatcatattattgatcttggtcctgatggtggagagtatggtggtcaagttatagta
actggaactccagaacaagtaattcatcatcaaacttcttatacagctaaatatttaaag
gattatataattaatgattag

DBGET integrated database retrieval system