Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale: MMS_A0089
Help
Entry
MMS_A0089 CDS
T02595
Symbol
trmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase TrmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
mmym
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmym00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mmym03016
]
MMS_A0089 (trmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:
mmym03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
MMS_A0089 (trmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
MMS_A0089 (trmE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
Dynamin_N
Roc
Ras
ABC_tran
RsgA_GTPase
AAA_29
TdIF1_2nd
ATP-synt_ab
GCV_T
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADK69571
LinkDB
All DBs
Position
103078..104436
Genome browser
AA seq
452 aa
AA seq
DB search
MLINDTVVAPATNISTQAIALIRVSGSEAFLIVNKLIKDKKLEEKRGLFLRKLYFEDELI
DEVVLSCFVAPNSFTGENVVEIACHGGILNTNKIINILIQSGARMALRGEFSQRSFLNGK
IDLIQAEGINNLIHAKNELALKIGVANMSGSNNKAIIELKDNLLDIISRIQVSIDYPDYD
DVEGSSIEDLTNLLEIINDQINKLLMRSKMAFKNSEGIKTAIIGQTNVGKSSILNALINE
DKAIVTDIPGTTRDIVEGQINLENVSLNLIDTAGIRKTSDVVENLGILKSKNLINEADLV
LFVVNKENINDLDNQEIFELLKNKTYILIVNKAEKLSKTEKQNLEKKYQNIVFTSAINHD
IDQLVLRINQMYLNEEINKNDELILIGLNQITLVEQIKNKLSTALSIIKSGMPIDIVNVD
LYDAWNLLNELIGVEYEDEIIDNIFRKYCLGK
NT seq
1359 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaataaatgatacagtagttgctcctgctacaaatatttcaactcaagctattgct
ttaattagagttagtggttctgaagcttttttaatagttaataagttaattaaagataaa
aaactagaagaaaaaagaggattatttttaagaaagttatattttgaagacgaattaatt
gatgaagtagttttatcttgttttgttgctcctaattcttttactggtgaaaatgttgtt
gaaattgcttgtcatggtggaattttaaatactaataaaatcatcaatattttaattcaa
tcaggagctagaatggctttaagaggagaatttagtcaacgttcttttttaaatggaaaa
attgatttaattcaagctgagggtattaataatttaattcatgcaaaaaacgaactagct
ttaaaaattggtgttgctaatatgagtggatctaataataaggcaatcattgaattaaaa
gataatttattagatattattagtcgtattcaagtttcaattgattatcctgattatgat
gatgttgaaggttcaagtatagaagatttaactaatttattagaaattattaatgatcaa
atcaataaacttttaatgagatctaaaatggcttttaaaaactctgaaggaattaaaact
gctattattggtcaaactaatgttggtaaatcatcaattttaaatgctttaattaatgaa
gataaagcgattgttacagatatcccaggaactactagagatatagttgaaggccaaatc
aatttagaaaatgttagtttaaatttaattgatactgctggaattagaaaaactagtgat
gttgttgaaaatttaggaattttaaaatctaaaaatttaattaatgaagctgatttagtt
ttatttgttgttaataaagaaaatatcaatgatttagataatcaagaaatttttgaactt
ttaaaaaacaaaacttatattttgattgtaaataaagctgaaaagctaagcaaaactgaa
aaacaaaacttagaaaaaaaatatcaaaatattgtatttactagtgcaataaatcatgat
atagaccaattagttttaagaattaatcaaatgtatttaaatgaagaaattaataaaaat
gatgaactaattttaattggattaaatcaaattactttagttgaacaaatcaaaaacaaa
ctttcaactgctttaagtataattaaatcaggaatgccaattgatatagttaatgttgat
ttgtatgatgcttgaaacctgttaaatgaactaattggtgttgagtatgaagatgaaatt
attgataatatctttagaaaatattgtttaggaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
