KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale: MMS_A0391
Entry
MMS_A0391         CDS       T02595                                 
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III, alpha subunit, Gram-positive type
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mmym  Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale
Pathway
mmym03030  DNA replication
mmym03430  Mismatch repair
mmym03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmym00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MMS_A0391 (polC)
   03430 Mismatch repair
    MMS_A0391 (polC)
   03440 Homologous recombination
    MMS_A0391 (polC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mmym03032]
    MMS_A0391 (polC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmym03400]
    MMS_A0391 (polC)
Enzymes [BR:mmym01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MMS_A0391 (polC)
DNA replication proteins [BR:mmym03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MMS_A0391 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mmym03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MMS_A0391 (polC)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP DNA_pol3_a_NII DNA_pol3_a_NI HHH_6 RNase_H_2 tRNA_anti-codon Rv2179c-like DUF166
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADK69287
LinkDB
Position
complement(413832..418280)
AA seq 1482 aa
MQTKILGIFKKIGIELDQTDYIYFKDAILVETPRISQIKNKGYLHVEIKDFLPIDVLKKI
EDKLKNNQYFNFKLIIDVKNQQFNKDLLIQYLEFIKMHKSLFNNRASWKLLDIYNFELIN
NQLVFLVNSQTIKNEISLELDYCLAKLNQFGFKDLSYLINVNEISLDTLDTKQQINKTYD
KPEYEQQIIKPIEKKPSVNNSYKNKRPSLDKPSYNSLLDVEDDAQNIVIQGMVINKEFKL
SKTGRKIFYIDITDFQSSIRCMYFAKSDALCEFDDLTEDELKSKEIEQIKENKIQINDWI
SVKGKTSLSVYDQEQIFYIDDFKKIKKQVGLRIDDAKIKRVELHAHTKMSVMDGVSDPID
YLELISSWNHKAIAFTDHTNVQAFPDIYKALNSVNKKRSDQDKIKAIYGLEMNMLNNDLW
YVKNPKNQKLKDARMVFFDLETTGLSPELDEIIEFGAIEYNLKTGERKKIDILIKPKTKL
KAFTQKLTNITEKMLEDKPSIEQAFKQINEIIKDAILVAHNANFDFTFLSYWSEKLGYSK
LENTIIDTLTISRIIYPDLKSHRLGSLAKRVNISYDPSIAHRGDYDADILADIYERMLDE
TRKKIKIITDSDWNKIDPINYADNLNYYKNKGFHTNILVKNQAGLKELYKLVTKSHTTNF
YSSPKIFKDDLIQIKQNNNLLFGASCVNSEIFELARTSTLENLKQAISFYDYIEVQPISV
YKNLLQNDSLDLDQLKEIITNIINIAKQENKLVVASSDCHYTNPELKQIREVYINAKGLG
GIRHPLFDFNNRVKDYPDQHLRTTKEMLKEFEWLNDDDLINEIVITNSNKIADMIDSNVI
PIKDGLFTPKIANVNEKLKDKCYQTAKQMYGEMLPEIVEKRLEKELGSITKHGFAIVYWI
SHLLVKQSLDDGYLVGSRGSVGSSFVATMAQITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFNTDPAYKC
GYDLPEKNCPNCNQKLIGDGHDIPFETFLGFNGDKVPDIDLNFSGEYQNQAHNFTKKMFG
ENNVFRAGTISTVAEKTAFGYVKTYFEETKRDASLPRKTEINRLAKLAQGVKRTTGQHPG
GIIILPNEYEIEDFTPVNYPADDLNSTWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHDDPTALKMLR
DLTNIDPITIPTDDKNVYSLFSSLQALNLTSDKINDEITGAIGIPEFGTGFVRNMLKETQ
PKTFADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKDKKADISTVIGCRDDIMVYLINMGLESSLAF
MIMESVRKGKGLKKEWIDVMKQYNVPDWYIDSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIAWYKI
YYPTEYYATYLTTRADVFDLKTVLGGYDAVLLKLKSQQQRVKNGEKLSKKEEDLEVVYEV
LLEMFARGIKFSNIDFEKSEATKFKVDILQDNSKIIIPPFNVIDSLGEAVALSIINARNT
KPITSVNDLKNRTQTTQTQIKIFEEFNILDSLSVDEQLAFDF
NT seq 4449 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaaacaaaaatacttggtatttttaaaaaaatcggtattgaattagatcaaactgat
tatatttattttaaagatgctattttagttgaaactcctagaatttctcaaattaaaaac
aaaggttatttacatgttgaaattaaagattttttaccaattgatgttttaaaaaaaatt
gaagacaaactaaaaaataatcaatattttaatttcaaattaattattgatgttaaaaac
caacaatttaataaagacttattaattcagtatttagaatttattaaaatgcataagtct
ttatttaataaccgtgcttcttgaaaattattagatatttataattttgaattaattaat
aatcaattagtatttttagtaaatagtcaaactattaaaaatgaaattagtttagaactt
gattattgtttagctaaattaaatcagtttggatttaaagatttaagttatttaattaat
gttaatgaaattagtttagatactttagatacaaaacaacaaattaataaaacttatgat
aaacctgaatatgaacaacaaataattaaaccaattgaaaaaaaacctagtgtaaataat
agttataaaaacaaaagacctagtttagataaacctagttataattctttattagatgtt
gaagacgatgctcaaaatattgttattcaaggaatggttattaataaagagtttaaatta
tcaaaaactggaagaaaaattttttatatagatataactgattttcaatcttcaattaga
tgtatgtattttgcaaaaagtgatgcattatgtgaatttgatgatttaactgaagatgaa
ttaaaatcaaaagaaattgaacaaattaaagaaaataaaattcaaatcaatgattgaatt
agtgttaaaggaaaaactagtttatctgtatatgaccaagagcaaatcttttatatagat
gattttaaaaaaatcaaaaaacaagttggtttgagaattgatgatgcaaaaatcaaacgt
gttgaattacatgcgcatactaaaatgagtgtaatggatggagttagtgatccaattgat
tatttagaacttattagtagttgaaatcataaagcaattgcatttacagatcatacaaat
gttcaagcttttccagatatttataaagctttaaatagtgttaataaaaaacgtagtgat
caagataaaattaaagctatttatggattagaaatgaacatgttaaataatgatttatga
tatgttaaaaatccaaaaaaccaaaaactaaaagatgctagaatggtcttttttgactta
gaaactactgggttaagtcctgaattagatgaaatcattgaatttggtgctattgaatat
aatttaaaaactggtgaaagaaaaaaaatagatattttaattaaaccaaaaacaaaatta
aaagcatttactcaaaaactaactaacattactgaaaaaatgttagaagataaaccaagt
attgaacaagcttttaaacaaataaatgaaattataaaagatgctattttagttgctcat
aatgctaattttgactttacatttttatcttattgatctgaaaaactaggttatagtaaa
ttagaaaatactattattgatactttaacaatttcaagaattatttatcctgatttaaaa
tcacacagattaggatcattagcaaaaagagtaaatatctcatatgatccaagtattgct
caccgtggagattatgatgctgatatcttagctgatatttatgaaagaatgctagatgaa
actagaaaaaaaatcaaaattataacagatagtgattgaaataaaatagatccaattaat
tatgctgataatttaaattattataaaaacaaaggttttcatactaacattttagttaaa
aaccaagcaggattaaaagagttatataaactagttacaaaatcacatactactaatttt
tattcatctccaaaaatctttaaagatgatttaattcaaattaaacaaaataataattta
ttgtttggagcaagttgtgttaatagtgaaatttttgaactcgctagaactagtacatta
gaaaatttaaaacaagcaattagtttttatgattatatagaagttcaaccaattagtgtt
tataaaaacttattacaaaatgactcactagatttagatcaattaaaagaaataattaca
aatattattaatatagcaaaacaagaaaataaactagttgttgcaagtagtgattgtcat
tatacaaatcctgaactaaaacaaattagagaagtttatattaatgctaaaggacttggt
ggaattagacatccattatttgattttaataacagagttaaagattatcctgatcaacat
ttaagaactacaaaagaaatgctaaaagagtttgaatgacttaatgatgatgatttaatt
aatgaaattgtaattactaattcaaataaaatagcagatatgatagatagtaatgttatt
ccaattaaagatggtttatttactccaaaaattgctaatgttaatgaaaaattaaaagat
aagtgttatcaaacagcaaaacaaatgtatggagaaatgcttccagaaattgttgaaaaa
agattagaaaaagaactaggttcaattacaaaacatggatttgcgattgtttattgaatt
tctcatttattagtaaaacaatcactagatgatggttatttagtaggatcgcgtggatct
gttggttcatcatttgtagcaacaatggctcaaattacagaagttaatcctttaaaagct
cactatagatgtttaaattgtaaatattcagattttaatacagatccagcttataagtgt
ggatatgatttaccagaaaaaaattgtcctaattgtaatcaaaaattaattggagatggt
catgatattccatttgaaacttttttaggttttaatggagataaagttccagatattgat
ttaaacttttctggtgaatatcaaaaccaagctcataattttactaaaaaaatgtttggt
gaaaataatgtttttagagctggaacaatctcaacagttgctgaaaaaacagcttttggt
tatgtaaaaacttattttgaagaaactaaaagagatgcaagtttaccaagaaaaactgaa
attaatagattagcaaaactagctcaaggagtaaaaagaacaactggtcaacatccaggt
ggaattattattctaccaaatgagtatgaaattgaagattttactccagtaaattatcca
gctgatgatttgaattcaacttgaaaaacaacacattttgattttcactcaattcacgat
aatttattaaaaatggatattttaggtcatgatgatccaactgctttaaaaatgttaaga
gatttaacaaatattgatccaattactattccaactgatgataaaaatgtttattcatta
ttttcatctttacaagctttaaatttaacttcagataaaattaatgatgaaatcactgga
gctattggaatacctgaatttggaactggttttgttagaaatatgttaaaagaaactcaa
ccaaaaacttttgcagatctagtacaaatttctggtctttcacatggtactgatgtttga
ctaggtaatgctagagatttaattaaagataaaaaagcagatatttctacagttattgga
tgtagagatgatattatggtttatttaataaatatgggattagaaagttctttagctttt
atgattatggaatcagttagaaaaggtaaaggattaaaaaaagaatggatcgatgtaatg
aaacaatataatgttccagattgatacattgattcatgtttaaaaattaaatatatgttt
ccaaaagcacatgctacagcttatgtgttaatggcttatagaattgcttgatataaaatc
tattatccaactgaatattatgcaacctatctaacaacaagagctgatgtgtttgattta
aaaacagtgcttggtggttatgatgcagttttattaaaattaaaatctcagcaacaaaga
gtaaaaaatggagaaaaattatctaaaaaagaagaagatttagaagttgtttatgaagtt
ttattagaaatgtttgcaagaggaattaaatttagtaatattgattttgaaaaatctgaa
gctactaaatttaaagtagacattttacaagataactctaaaataattattccaccattt
aatgtaattgattcactaggtgaagccgtggcactttcaataattaatgcaagaaataca
aaaccaattacttcagttaatgatttaaaaaacagaacacaaactacacaaactcaaatt
aaaatttttgaagaatttaatattttagattcattatcagttgatgaacaacttgctttt
gatttctaa

DBGET integrated database retrieval system