Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale: MMS_A0519
Help
Entry
MMS_A0519 CDS
T02595
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
mmym
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmym00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mmym03019
]
MMS_A0519
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mmym03009
]
MMS_A0519
Enzymes [BR:
mmym01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
MMS_A0519
Messenger RNA biogenesis [BR:
mmym03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
MMS_A0519
Ribosome biogenesis [BR:
mmym03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
MMS_A0519
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
PhoH
AAA_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADK69480
LinkDB
All DBs
Position
542606..543967
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MKFTDFGFKKYINDTLDQIEFIAPTSIQQKVIPLLKKHKNVIALAHTGTGKTHSFLLPIL
NNLKLEENNNYAQAVIISPTRELSLQIYQNTKLFFKNNPLINCNLFIGGEDISKNIEQLE
KKQPHIVIGTPTRLKELYDLNKLRLTTTSYFIIDECDMIFDLGFIEDVDYLISKINQDVT
IGIFSATISQQLSVFCKKYIKNAHFIDDSQNKISTSNVKHILIDTKNKELEQSLIQIINS
INPFLCIIFVNQKDEISKIVEILHKNNIKQVAELHGNLQPRLRLSMLKKIQNNEFKYLVA
TDVASRGVDVKGVSHIISINLPNDLTYYIHRSGRTGRNNSTGYSYIIYNLKNKIQIEELI
KKGIEFETKKLIDNQLVDIKTNYKKVKVFKELDAESKQVINKYKNKKVKPNYKKKRKQEL
DKIKQKIRRKHIKENIEKIKKAKYQKRRAELFD
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttactgattttggttttaaaaagtatattaatgatactttagatcaaattgaa
tttatagctccaacttcaattcaacaaaaagtaattcctttattaaaaaaacacaaaaat
gttattgctttagcacatactggaacaggtaaaactcacagttttttattacctatttta
aataatttaaaattagaagaaaataataattacgctcaagcagtaattattagtccaact
agagaactaagtttacaaatttatcaaaacactaaactattttttaaaaataatccttta
attaattgtaatttatttattggtggagaagatattagtaaaaatattgaacaattagaa
aaaaaacaaccacatattgtaattggaacaccaactagattaaaagaactttatgattta
aataaattaagattaacaactacaagttattttattattgatgaatgtgatatgattttt
gatctaggttttattgaagatgttgattatttaatttctaaaattaatcaagatgttaca
attggaatatttagtgcaactatttctcaacaacttagtgtgttttgtaaaaaatatatt
aaaaatgctcattttattgatgatagtcaaaataaaatttcaacaagtaatgttaaacat
attttaattgatactaaaaacaaagaactagaacaaagtttaatacaaattattaattca
attaatccttttttatgtattatttttgttaatcaaaaagatgaaattagtaaaatagtt
gaaatcttgcataaaaataatattaaacaagttgctgaattacatggtaacttacaacca
agattaagattatcaatgttaaaaaaaattcaaaataatgagtttaaatatttagttgca
actgatgttgcttctagaggtgttgatgttaaaggtgtaagtcatattatttcaattaat
ttaccaaatgatttaacttattatatacatagatctggaagaactggaagaaataattca
actggatatagttatataatttataatttaaaaaataaaattcaaattgaagaactaatt
aaaaaagggattgaatttgaaactaaaaaacttattgataaccaattagttgatataaaa
actaattataaaaaagttaaagtttttaaagaattagatgctgaatcaaaacaagttata
aataaatataaaaataaaaaagtaaaaccaaattataagaaaaaaagaaaacaagaacta
gataaaatcaaacaaaaaataagaagaaaacatattaaagaaaatattgaaaaaattaaa
aaagcaaaatatcaaaaaagaagagcagaactatttgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
