KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale: MMS_A0734
Entry
MMS_A0734         CDS       T02595                                 
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mmym  Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale
Pathway
mmym03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmym00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    MMS_A0734
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mmym03019]
    MMS_A0734
Messenger RNA biogenesis [BR:mmym03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     MMS_A0734
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_b_CASP RNase_J_C Lactamase_B RMMBL Lactamase_B_2 Sacchrp_dh_C Lactamase_B_6
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADK69905
LinkDB
Position
776896..778728
AA seq 610 aa
MSNIDKKDLDILNKENENLINTFDDDGDQLNISIDEKEFKPYVFKQKEVKRQYQKTNIPT
KIFALGGLEEVGKNTYCIEYDNELIMIDAGVKFPESTMLGVSAVIPDYSYLAENQKKIKA
LFITHGHEDHIGGIQYLVQQVKIPVIYAPKLAAMLIRDKLKEYKIEDKTIVKEYDADDVW
KTKNFKVSYAALNHSIPDAFGILVQTPNGNIFSTGDYKFDWSPLGHFAELTKLASMGENG
VELLMADSTNSEVEGYTQGEKSIISNIDKLFLQAKGRIFLTTFASNVHRIQHIIETAHKY
NRKIVILGRSFERIIKIIRQIGHLKISEKEFIKSTDIDKYKPEELMILTTGSQGEPMAAL
SRIANNKHLSINIIPGDTIVFSSSPIPGNRADVEKLVNKLTRVGAIVIENTSDNKIHTSG
HASQEEQKLLFSLIRPKYFMPMHGEYRMLKKHVETGESVNLEKGNGFIMANGDVLELLQG
KAKIGKRVEADAVYVDGKDMTGKASNVIREREILSKDGLIAVVISLDSQTNKLISQPRII
SRGSFYVKDAGSIISDSIQIITNAVNEVLMSSKPTFAAIKKAIKSSSSPYIFRVKRRNPL
IIPVILNKKS
NT seq 1833 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaaatatagataaaaaagatctagatatacttaataaagaaaatgaaaatttaatt
aatacttttgatgatgatggtgaccagttaaatattagtattgatgaaaaagaatttaaa
ccatatgtatttaagcaaaaagaagttaaaaggcaatatcaaaaaacaaatatacctact
aaaatttttgctttaggtggattagaagaagttggaaaaaacacttattgtattgagtat
gataatgaattaattatgattgatgctggagttaaatttcctgaatcaactatgttagga
gtaagtgctgttattcctgattattcttatttagctgaaaatcaaaaaaagattaaagct
ttatttattactcatggtcatgaagatcatattggtggaattcaatatttagttcaacaa
gtaaaaattcctgtaatttatgctccaaaattagctgctatgttaattagagataaatta
aaagaatataaaattgaagataaaactattgttaaagaatatgacgctgatgatgtgtga
aaaactaaaaactttaaagttagttatgctgcattaaaccactctattcctgatgcattt
ggaattttagttcaaactcctaatggtaatattttttcaacaggagattataaatttgac
tgatcaccactaggacattttgctgaacttactaaattagcttcaatgggtgaaaatggg
gttgaattattaatggcagattcaactaatagtgaagttgaaggatatacacaaggtgaa
aaaagtattatttcaaatattgataaattatttttacaagctaaaggaagaatcttttta
acaacttttgcttcaaatgttcatagaattcaacacattattgaaactgctcacaaatat
aatagaaaaattgttattttaggtagatcatttgaaagaattattaaaatcattcgtcaa
attggtcatttaaaaattagtgaaaaagaatttattaaatcaactgatattgataaatat
aaaccagaagaattaatgattttaacaacaggtagtcaaggtgaaccaatggctgcttta
tctagaattgctaataataaacatttatcaatcaatattattcctggtgatactattgta
ttttcatcatcaccaattccaggaaatagagctgatgttgaaaagttagttaataagtta
actagagttggggctatagtaattgaaaatacttcagataataaaatacatacttcaggt
catgctagtcaagaagaacaaaaattattatttagtttaattagaccaaaatattttatg
ccaatgcatggtgaatatcgtatgttaaaaaaacatgtcgaaactggtgaaagtgttaat
ttagaaaaaggcaatggttttataatggctaatggtgatgttttagaactattacaaggt
aaagctaaaattggaaagcgtgttgaagctgatgcagtatatgttgatggaaaagatatg
actggaaaagcaagtaatgttattagagaaagagaaattctttcaaaagatggattaatt
gctgttgtaatttcattagattcacaaactaataaattaatctctcaacctagaattatt
tctcgtggtagtttttatgtaaaagatgcaggatcaataattagtgattcaattcaaatt
attactaatgcagttaatgaagtattaatgtcatcaaaaccaacttttgcagctattaaa
aaagcgattaaatcttcttcaagtccatatatttttagagtaaaaagaagaaatccatta
attattccagtaatcttaaataaaaaatcttaa

DBGET integrated database retrieval system