Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale: MMS_A0747
Help
Entry
MMS_A0747 CDS
T02595
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA-directed DNA polymerase
KO
K02335
DNA polymerase I [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mmym
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale
Pathway
mmym03030
DNA replication
mmym03410
Base excision repair
mmym03420
Nucleotide excision repair
mmym03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmym00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MMS_A0747 (polA)
03410 Base excision repair
MMS_A0747 (polA)
03420 Nucleotide excision repair
MMS_A0747 (polA)
03440 Homologous recombination
MMS_A0747 (polA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mmym03032
]
MMS_A0747 (polA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmym03400
]
MMS_A0747 (polA)
Enzymes [BR:
mmym01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MMS_A0747 (polA)
DNA replication proteins [BR:
mmym03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
Other elongation factors
MMS_A0747 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmym03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
DNA polymerase I
MMS_A0747 (polA)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
MMS_A0747 (polA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_polI_exo1
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADK69833
LinkDB
All DBs
Position
complement(792663..795398)
Genome browser
AA seq
911 aa
AA seq
DB search
MKTKILVVDGNSLIFRAFYATAYSPNTSLLKTKSGVLTNAVYSFINMLLSVIHQRGPYDH
ILIAFDKSKKTFRHDLLSDYKANRIKTPNELVEQFSIVREFLTKANIQWFEQENIEADDI
VGSICKYAEKQFDDLQAEILSSDKDMYQLITNKVICLNPVQGVNELEEVDTNKLFEKWQI
LPNQVPDYKAIVGDSSDNLKGVNGIGQKGAIKLIQQYESLENIYNSLEQLKGAIKTKLEQ
DKKMAFLCKDLATIKTDVVLENFSFNKLDFNVDNIYEFLNKYEMYSLKKRFTNILNLDFN
PYQNKKQNLDVKIINSWSKDYEDSINYLYVESLEEDYHKDKIIGIGISNNKGNFYLDFKN
KAQQLSFFEDTTLSSTDSLFEEFLNNSNLKKYTYDIKKTTYLLKNHKYNVLASNFDFDFM
VACYSLNANVISDLSNQIKLVDNMIELETIDEIFGKGVKKNPDIDLDIKSKYISKKAYLL
KKYSDQLIEQLKQTNTYDLYLKIDHPLIEVLYDIEVQGILIDKEQLKLQTQQILKKINHI
EGQMKILVAEEIDNNFNFSSPKQIQELLFDKLKLPNLEKGTTSKEVLEKLITFHPIINLL
LEHRKYTKLYITYLKGFEKFIFDDNKVHTIFNHTLTNTGRLSSSYPNIQNISIRDNEQKE
VRKIFITNNNKTFLSYDYSQIELRVLAQMSKESNLIKAFNQDADIHLQAAKLIFNLSDDQ
ITSEQRRIAKVFNFGILYGLTDFGLANDLNMNVNQAKQMIKDYYSAFPSLLDFKEKQVEI
ATNQGYITTLSNRRRYIDELNSTNHNIRQFGKRIAVNTPIQGTASDILKVAMISIYKKLK
EQNLDARIVCQIHDEIILEVNDNQLEQTKKIVVSELENALEKLFLDLNIKEQVVVKLKVG
ESVGKTWFDLK
NT seq
2736 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactaaaattttagtagtagatggtaattctttaatttttcgagctttttatgca
actgcttattcaccaaatactagtttattaaaaacaaaaagcggtgttttaacaaatgca
gtttattcttttattaatatgttattatctgtaattcatcaaagaggaccttatgatcat
attttaatagcgtttgataaaagtaaaaaaacttttagacacgatttattaagcgattat
aaagctaatagaattaaaactcctaatgaattagttgaacaatttagtattgttagagaa
tttttaacaaaagcaaacattcaatgatttgaacaagaaaatattgaagctgatgatatt
gttggatcaatttgtaaatatgctgaaaaacaatttgatgatttacaagctgaaatttta
agtagtgataaagatatgtatcaattaattacaaataaagtaatttgtttaaacccagtt
caaggagttaatgaacttgaagaagttgatactaataaattgtttgaaaaatgacaaatt
ttaccaaaccaagttccagattataaagcaatagttggtgattcttcagataatttaaaa
ggagttaatgggattgggcaaaaaggagctattaaattaattcaacaatatgaaagttta
gaaaatatttataatagtttagaacaattaaaaggtgcaattaaaactaaattagaacaa
gataaaaaaatggcttttttatgtaaagatttagcaacaatcaaaactgatgtagtttta
gaaaatttttcttttaataaattagattttaatgttgataatatttatgagtttttaaac
aaatatgaaatgtattctttaaaaaaacgctttacaaatattttaaatcttgattttaat
ccttatcaaaataagaaacaaaatttggatgttaaaataattaattcttgatcaaaagat
tatgaagattctataaattatttatatgttgaatcattagaagaagattatcataaagat
aaaattattggaattggtatttcaaataataaaggtaatttttatttagattttaaaaat
aaagctcaacagttatctttttttgaagatacaacactaagttcaactgatagtttgttt
gaagaatttttaaataattctaatttaaaaaaatatacttatgatattaaaaaaactact
tatttattaaaaaatcacaagtataatgttttagcaagtaattttgattttgattttatg
gttgcttgttattctttaaatgctaatgttatttctgatttatctaatcaaattaaatta
gttgataatatgattgaattagaaactattgatgaaatttttggaaaaggtgttaaaaaa
aatccagatatagatcttgatattaaatctaaatatattagtaaaaaagcttatttacta
aaaaaatattctgatcaattaattgaacaattaaaacaaactaatacttatgatttatat
ttaaaaattgatcatcctttaattgaggttttatatgatattgaagttcaaggaatttta
atagataaagaacaattaaaactacaaacccaacaaatattaaaaaaaattaatcatatt
gaaggacaaatgaaaattttagttgctgaagaaattgataataattttaatttttcttca
ccaaaacaaattcaagaattattatttgataaattaaagctgcctaatttagaaaaaggc
actactagtaaagaagttttagaaaaattaataacttttcatccaataattaatttatta
ttagaacatagaaaatatactaagttatatataacttatttaaaaggttttgaaaaattt
atttttgatgataataaagttcatactatttttaatcatactttaacaaatactggacga
ttaagttcttcttatccaaacattcaaaatatttctattagagataatgaacaaaaagaa
gttagaaaaatttttattacaaataataataagacatttttaagttatgattattctcaa
attgaattaagagttttagcacaaatgtctaaagagtcaaatctaattaaggcatttaat
caagatgctgatattcacttacaagctgctaaactaatttttaatcttagtgatgatcaa
attacaagtgaacaaagaagaatagctaaagtttttaattttggaattttatatggttta
actgattttggtttagcaaatgatttaaatatgaatgttaatcaagcaaaacaaatgatt
aaagattattattctgcttttccaagtttattagattttaaagaaaaacaagtagaaatt
gcaacaaatcaaggctatattacaaccttatcaaatagaagaagatatattgatgaatta
aattcaacaaatcataacattagacaatttggaaagagaatagcagtaaatacaccaatt
caaggaactgcttcagatattttaaaagtagctatgataagtatttataaaaagctaaaa
gaacaaaatttagatgctagaatcgtttgtcaaattcatgatgaaattattttagaagtt
aatgataatcaattagaacaaactaaaaaaattgttgttagtgaattagaaaatgcttta
gaaaaactatttttagatctaaatataaaagaacaagtagttgttaaattaaaagttgga
gaatcagttggtaaaacttgatttgacttaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
