Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale: MMS_A1034
Help
Entry
MMS_A1034 CDS
T02595
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease ABC, A subunit
KO
K03701
excinuclease ABC subunit A
Organism
mmym
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale
Pathway
mmym03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmym00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
MMS_A1034 (uvrA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmym03400
]
MMS_A1034 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmym03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
MMS_A1034 (uvrA)
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
MMS_A1034 (uvrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrA_inter
UvrA_DNA-bind
ABC_tran
SMC_N
nSTAND3
AAA_21
AAA_29
RsgA_GTPase
AAA_14
nSTAND1
AAA_22
APS_kinase
AAA_18
NB-ARC
NACHT
DnaJ_CXXCXGXG
ATPase
T2SSE
cobW
Viral_helicase1
MeaB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADK69577
LinkDB
All DBs
Position
complement(1075123..1077963)
Genome browser
AA seq
946 aa
AA seq
DB search
MSTDKIIIKGAREHNLKNIDLELPKNKLIIFTGLSGSGKSSLAFSTIYQEGRRRYIESLS
AYARQFLGGNEKPDVDSIEGLSPAISIDQKTTSHNPRSTVGTVTEIYDYLRLLYARIGQP
YCINNHGQIKAVSIKEIVENIKQSTSDGEQIHILSPVIRDKKGTHIDILEKLRNDGFIRV
IVDDQLRMLDDQINLEKNQRHNIDIVVDRIIYHNNDEINSRIFTAVEMGLKYSNNLIKIA
FPNSNKQEKLFSTSFSCKVCDFVVPELEPRLFSFNAPLGACELCNGLGVSLEPDINLILP
DLKLSINQGGVVYYKNFMHTKNIEWQKFRILCDYYYIDLNTPLKDLTQKQRDIILWGSDR
EIDIKIVTENNNKYEKYDFIEGNAALIKRRYFESKSEEARKWYAKFMSSKICKQCKGSRL
NDIALSVKINEKSIFDYTNMSISEQLDFLLNIDLTATQAMIAKLVLDEIISRTNFLNEVG
LGYLNLSRTATTLSGGESQRIRLAKQIGSQLTGILYVLDEPSIGLHQKDNDKLIKTLKHL
RDLGNTLIVVEHDEDTMKSSDWIVDIGPRAGEYGGEITFSGTYQDILKSDTITGRYLSRK
EGIAVPKTRRGGNGKKIEIIGASENNLKNINVTIPLNKFITITGVSGSGKSTLLEDIVYK
GIHNNLSKEYLPIGKVKEIKGIENINKAIYISQEPIGKTPRSNPATYTSVFDDIRDLFTN
LPEAKIRGYKKGRFSFNVHGGRCEHCQGDGVITISMQFMPSVEVVCEICDGKRYNDETLT
VKYKNKSIADVLNMSVSEAYVFFENIPQIKQKLETILEVGLGYIKLGQNATTLSGGESQR
IKLSTYLLKKQTGNTMFLLDEPTTGLHVDDVKRLIGVLNKLVDLGNTVLCIEHNLDFIKV
SDHIIDLGPDGGEYGGQVIVTGTPEQVIHHQTSYTAKYLKDYIIND
NT seq
2841 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaacagataaaattattataaagggtgctagagagcataatttaaaaaatattgat
ttagaacttcctaaaaataaattaattatttttacaggtttaagtggttctggaaaatct
tcattagctttttcaacaatttatcaagaaggaagaagaagatatattgaatcactttct
gcttatgctagacaatttttaggtggtaatgaaaaacctgatgttgattctattgaaggt
ttatctcctgcaatttctattgatcaaaaaaccacaagtcacaatcctagatcaactgtt
gggactgttactgaaatttatgattatttacgtttattatatgcaagaattggtcaacct
tattgtattaataatcatggtcaaattaaagcagtaagtattaaagaaattgttgaaaat
attaaacaatcaactagtgatggtgaacaaattcatattttatctccagtaattagagat
aaaaaaggaactcatattgatattttagaaaaactaagaaatgatgggtttattagagtt
attgttgatgatcaattaagaatgctagatgatcaaattaatttagaaaaaaatcaaaga
cataatatagatatagttgttgatagaattatttatcataataatgatgaaattaattca
agaatatttacagctgttgaaatgggattaaaatattcaaataacttaattaaaattgca
tttccaaattctaataaacaagaaaaattattttcaacttctttttcatgtaaggtttgt
gattttgtagttccagaacttgagcctagattattttcatttaatgctccacttggtgct
tgtgaattatgtaatggattaggtgttagtttagaaccagatataaatttaattcttcct
gatttaaaattatcaattaatcaaggtggagttgtttattataaaaattttatgcataca
aaaaatatagaatgacaaaaatttagaattttgtgtgattattactatattgatctaaac
actcctttaaaagatttgactcaaaaacaaagagatataattttatgaggaagtgatcga
gaaattgatattaaaattgttactgaaaataataataaatatgaaaaatatgattttatt
gaaggtaatgctgctttaatcaaaagaagatattttgaatctaaatcagaagaagctaga
aaatgatatgcaaaatttatgtcttctaaaatatgcaaacaatgtaaaggaagtagatta
aacgatattgctttatctgtaaaaattaatgaaaaatctatatttgactatactaatatg
agtatttctgaacaattagattttttattaaacattgatttaactgcaactcaagctatg
attgcaaaattagttttagatgaaattatttcaagaactaactttttaaatgaagttggg
ttagggtatttaaatctatcaagaacagctacaactttaagtggtggagaatctcaaaga
attagattagctaaacaaattggatctcaattaactggaattttatacgttttagatgaa
ccatcaattggattacatcaaaaagataatgataaattaattaaaactttaaaacattta
agagatctaggaaatactttaattgttgttgagcatgatgaagatacaatgaaaagtagt
gattgaattgttgatattggccctagagctggagagtatggtggagaaattacttttagt
ggaacatatcaagatattttaaaatcagatactattactggtagatatttatcaagaaaa
gaaggtatagcagttcctaaaactagacgtggtggtaatggtaaaaaaattgaaattatt
ggagctagtgaaaacaatttaaaaaatattaatgtaactattcctttaaataaatttata
actattacaggtgttagtggatctggaaaatcaactttactagaagatattgtttataag
ggaattcataataatttatcaaaagagtatttaccaattggaaaggttaaagaaattaaa
ggtatagaaaatatcaataaagctatttatatttctcaagaaccaatcggaaaaactcct
agatcaaacccagcaacttatacttcagtttttgatgatattagagatttatttactaat
cttccagaagcaaaaattaggggttataaaaaaggtagattttcatttaatgttcatggt
ggtagatgcgagcattgtcaaggtgatggagtaattacaatttctatgcaatttatgcca
agtgttgaagtggtttgcgaaatttgtgatggtaaaagatataatgatgaaactttaaca
gttaaatataaaaacaaatcaattgctgatgttttaaatatgagtgttagtgaagcttat
gtcttttttgaaaatattcctcaaattaaacaaaagctagaaactattttagaagttggt
ttaggttatattaaactaggacaaaatgctacaactttaagtggtggagaatctcaaaga
attaaattatctacttacttattaaaaaaacaaactggaaatactatgtttttattagat
gaaccaacaactggtttgcatgttgatgatgttaaaagattaattggtgttttaaataaa
ttagttgatttaggaaatacagttttatgtattgaacataatctagattttattaaagtt
tcagatcatattattgatcttggtcctgatggtggagagtatggtggtcaagttatagta
actggaactccagaacaagtaattcatcatcaaacttcttatacagctaaatatttaaag
gattatataattaatgattag
DBGET
integrated database retrieval system
