Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale: MMS_A1105
Help
Entry
MMS_A1105 CDS
T02595
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mmym
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC Gladysdale
Pathway
mmym03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmym00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
MMS_A1105 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mmym03021
]
MMS_A1105 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmym03400
]
MMS_A1105 (rpoC)
Enzymes [BR:
mmym01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
MMS_A1105 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mmym03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
MMS_A1105 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmym03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
MMS_A1105 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADK69241
LinkDB
All DBs
Position
1156514..1160281
Genome browser
AA seq
1255 aa
AA seq
DB search
MENLNRKKAIKIELANPDTIRSWSHGEVLKPETINYKTLKAEKDGLFDERIFGPTKNYEC
VCGRYKKANPMNKGKKCEKCGVELTESIVRRERMGHIELEEPVTHIWMLKVAPYRIAAIL
DLKAKELEEVVYFVSHIVLEQGNQKHFVEKEVLDLGSSRITKTREKLQLTILDVIDLIND
PNHRDTKKANRLLEELKNTAVPFSIDEATSLISKYTGAKFGIGARAVEYLLEKVDLTKEI
EAIKIQLENSKKTPNERTKLLKRLETFDSLKRSKQRPEWMVMRVIPVIPPDIRPIIQLDG
GRFTTSEINDLYRRIIIRNERLKKVKEMGAPSIIVNNEKRMLQEAVDALFDNERKPKPVQ
GKNKRPLKSLTSVLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIAIGPDLKMYQAGLPREMAITLF
KPFVIQWLQDHEYAENVKIAEKMLLQNDPKVWEALEQVIKDRPVLLNRAPTLHRLGIQAF
EPKLVKGKAIRLHPLVTTAFNADFDGDQMAVHVPITKEAVAESRALMLGSSAILGPKDGK
AIVTPGQDIILGNYYLTTEEKNAKGQGMIFSSLDEAFMAYDSGQIHLNSLIGIALSALPE
QKFSDKNQRLNSYLLTTVGKLYFNQIFDDNFPWINSNNIWNAKEAVKEFIYYFSQDINNV
IENIQVQQPIKKKELSLIIERYFETHGARKTAEMLDKMKDLGFSFSTKSGTTISAGDVVA
FTHKYDEFKEADQKVEQITDFYNMGMLTNSEKKRRIIEVWSDVKDKIQDELATVLRKDVK
NPIFVMVDSGARGNISNFTQLVGMRGLMNDTKGDIKEIPIKSSFREGLTVSEYFVSTHGA
RKGMADIALKTADSGYLTRRLVDVSQEIVVVNEDCEPSKGFEVSAIIDTKHDNVIVPLKD
RLVGRFTFEDIYDDDKNLVAFANTLIDKNIAEKIIMSGISSVVIRSVLTCDNKRGVCQKC
YGLNLATASVVNIGEPVGVIAAQSIGEPGTQLTMRNFHTGGVAGNVDITQGLPRIKELLD
VTTPKGAVAIISEVDGVVSEIEDYNGVFVINIVTENEEVKKYKTEFNSVLRVEQGSSVVA
GQKLTEGAIDLHQLLEFGGIQDVQNYILKEVQKVYRLQGIEISDKYIEIIIKQMLNKVKI
TDGGDSDLLPGEVITIQNYKEVVQDCIVKSIRPPLSKAQIFGIKKAPLESSSWLSSASFQ
DTARVLTRAIIKGKEDKLEGLKENIMLGNLIPAGTGLTGTQEVEQLAEQYHNNEY
NT seq
3768 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatctaaatcgtaaaaaagcaataaaaattgaattagctaaccctgatacaatt
cgttcatgatcacatggtgaagttttaaaaccagaaactatcaactataaaacattaaaa
gctgaaaaagatgggctatttgatgaaagaatttttggtccaactaaaaattatgaatgt
gtttgtggaagatataaaaaagccaaccctatgaataaagggaaaaaatgtgaaaaatgt
ggtgttgaattaactgaatcaattgttagaagagaaagaatgggacatattgaattagaa
gaaccagttactcacatttgaatgttaaaagttgctccttatagaattgctgcaatttta
gatctaaaagcaaaagaactagaagaagtagtttattttgtttcacatattgtcttagaa
caaggaaatcaaaaacattttgtagaaaaagaagttctagatttaggttcatcaagaatt
actaaaactagagaaaaattacaattaacaattttagatgttattgatctaattaatgat
ccaaatcatagagacacaaaaaaagctaatagattattagaagaattaaaaaatactgct
gtgccattttcaattgatgaagctactagtttaattagtaaatatactggtgcaaaattt
ggaattggagctagagctgttgaatatctattagaaaaagtagatttaactaaagaaatt
gaagcaatcaaaattcaacttgaaaattctaaaaaaaccccaaatgaaagaactaaatta
ttaaaacgtttagaaacttttgattctttaaaacgttctaaacaacgtcctgaatgaatg
gttatgagagtaattccagttattccaccagacattcgtccaattattcaattagatggt
ggtcgttttactacttctgaaattaatgatttatatagaagaatcattattagaaatgaa
agattaaaaaaagttaaagaaatgggtgcaccttcaattattgttaataatgaaaagcgt
atgttgcaagaagctgttgatgctttatttgataatgaaagaaaaccaaaaccagttcaa
ggaaaaaacaaacgtccattaaaatctttaactagtgttttaaaaggaaaacaaggtcgt
tttagacaaaacttattaggaaaacgtgttgattattcagctagatcagttattgcaatt
ggaccagatctaaagatgtatcaagcaggtttaccaagagaaatggcaattactttattt
aaaccatttgtaattcaatgacttcaagatcatgagtatgctgaaaatgtaaaaattgct
gaaaaaatgttattacaaaatgatccaaaagtttgagaagcactagaacaagtaattaaa
gatagacctgttttattaaatcgtgctcctacattacaccgtttaggaattcaagcattt
gaacctaagttagttaaaggaaaggcaattcgtttacacccactagttacaactgcattt
aatgctgactttgacggggatcaaatggcagttcacgtacctattacaaaagaagctgtt
gctgaatcaagagctttaatgttaggttcaagtgctattttaggaccaaaagatggaaaa
gcaattgttactcctggtcaagatattattttaggaaactactatttaactactgaagaa
aaaaacgctaaaggtcaaggaatgattttttcaagtttagatgaagcatttatggcttat
gatagtggtcaaattcatttaaactcattaattggaattgctttatcagctttacctgaa
caaaaatttagtgataaaaatcaaagattaaattcttatttactaacaactgttggaaaa
ctttactttaatcaaatttttgatgataatttcccatgaatcaattcaaataatatttga
aatgctaaagaagcggttaaagaatttatttattatttttcacaagacattaataatgta
attgaaaatattcaagttcaacaaccaattaagaaaaaagaattatcacttattattgaa
agatactttgaaactcatggagctagaaaaactgctgaaatgctagataagatgaaagat
ctaggatttagtttttcaacaaaatcaggaactacaatttcagctggagatgttgttgcc
tttactcataaatatgatgaatttaaagaagcagatcaaaaagttgaacaaattactgat
ttttacaatatgggtatgttaactaatagtgaaaagaaacgtagaattattgaagtttga
tctgatgttaaagataaaattcaagatgaattagcaacagtattgcgtaaagatgttaaa
aatccaatttttgtaatggttgattcaggagctcgtggtaatatttcaaactttactcaa
ttagttggtatgcgtggattaatgaacgatactaagggagatattaaagaaattcctatt
aagtcatcattccgtgaaggattgactgtttcagaatactttgtttcaactcatggagct
agaaaaggtatggcagatattgccttaaaaactgctgattcaggttatttaactagaaga
ttagttgacgttagtcaagaaattgttgttgttaatgaagattgtgaaccaagtaaagga
tttgaagtatcagctattattgatacaaaacatgataatgttattgttccactaaaagat
agattagttggaagatttacatttgaagacatttatgatgatgataaaaacctagttgct
tttgctaatacattaattgataaaaatattgctgaaaaaattattatgtcaggaattagt
tcagtagttattagatcggttttaacttgtgataacaaacgtggtgtttgtcaaaaatgt
tatggattaaacttagctactgcttcagttgttaatattggtgaaccagttggagttatt
gctgctcaatcaattggagaaccaggaactcaattaacaatgcgtaatttccatacagga
ggagttgctggtaatgttgatattactcaagggcttccacgtattaaagaattattagac
gttacaactccaaaaggcgctgttgctataatttctgaagttgatggagtagttagtgaa
attgaagattataatggtgtatttgtaattaatattgttactgaaaatgaagaagttaaa
aagtataaaactgaatttaactcagtattacgtgttgaacaaggatcaagtgttgttgct
ggtcaaaaattaactgaaggagctattgatttacaccaattattagaatttggtggaatt
caagatgtacaaaattacattttaaaagaagttcaaaaagtttatagattacaaggtatt
gaaatttcagataaatatattgaaattatcattaaacaaatgttaaacaaagtaaaaatt
actgatggtggtgattctgatttattacctggagaagttattacaattcaaaactataaa
gaagttgttcaagattgtattgttaaatcaattagacctcctttatcaaaagctcaaatc
tttggtattaaaaaagcacctttagaatcaagttcatgattatcttctgcttcattccaa
gatactgctagagtattaactagagcaattattaaaggaaaagaagataaattagaagga
ctaaaagaaaatattatgttaggtaatttaattccagctggtactggtttaactggaact
caagaagttgaacaactagcagaacaataccataacaatgaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
