Metamycoplasma orale: NCTC10112_00022
Help
Entry
NCTC10112_00022 CDS
T08183
Name
(GenBank) putative DNA helicase
Organism
mob
Metamycoplasma orale
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MTES_1575
DUF4011
AAA_11
AAA_12
AAA_19
AAA_30
DEAD
DUF559
NAT10_TcmA_helicase
NPHP3_N
AAA_5
AAA
Mg_chelatase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU55144
UniProt:
A0A448ZV79
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(18105..22835)
Genome browser
AA seq
1576 aa
AA seq
DB search
MEQNKEYKKLAEKLEIQKRKLLDLSLKNKMINFKDSSSNLEIVSPDIKTILKKIASNDKL
EFASSYFDSKKIEEIKREELDNLDFYYDSENDNPKSKKEKSNLKIQTNKDLKDEYKTLNL
LSKKTKEFKDEYSIDILYLALGTLVYFDNSNPFTKEEKIKAPLLFCQAKLERKNLSSNYV
LSFENDKLYVNESLIQKLKLNYNIDIDFEKDNKVEDENDDSDFSNTLNYFEYVEQVKKAI
PSNFSVEDSINLSIFSFQKINMVKDIERNKEKFLDNVLIKQLLNNSSESSIFDISEYYSE
KDIDNILNIKEYYHALDSDSSQEVAIQNAIKGLSFVLQGPPGTGKSQTIANIISELIARN
KKVLFVSEKLAALQVVYNNLSKIGINKYCFPLHSVSTKNKSEIYKELWSVLENADVHKTI
DKESEENILNNYEEAKNALNNLGEYLFKKSDNINKNIYEMYQEYFKHINLKETIALSNFS
VNSITSDKLNKYELKIKYFEKWINDNKYSILTNPFKGLSSKNLLPDEIEYLTKFHLDFIK
SFSNIKTYINLISNIIPINKDDKLENILKTLNFINEHLKKLTGNLHSSILNIDCQKELLK
YKHIKSLYEENLQIKNKINYINLELLDNEKLIIDYYTFFREYKNAFKRAFSKKYKEKFKK
LCENMQYKVKPKFHLFYKDLKLSKLYIENRNTLLHKISELNYKLFDIDKDLYTNIQNIEW
FNELTIYAYKNNFELNKSNFFDYQKIIQKDFITQFDKELIWFNQINTIINGFYFENIFNS
NSKSINELDPIVSDWHNKINKIFERIEFNKIYYDEDNDELIKAFLSEIISRKINKDIWGI
FAKSLFLNLINNALSNNMIDVDSSDKYQNFVEMFRKYDKKMIDIAANKIEYQIKKYIPQK
DSLDEYDHSKRILRKEINKKSKLMPFLKLFKLIPDLILQLKPCVMMSPLSVSSYLFESDI
EFDTVIFDEASQITTENALCAIARGKQLIICGDNEQLPPTSFFKKLEDDNEYDEEDDSSL
EGLESVLDAANIFLPSKKLKWHYRSKYEELIIPSNEEIYKELITFPSNDNQNDYSKIKFI
KVKGSFINRKNEVEANEVINQIKQIYDKFGTEKSIGIVTFNINQQTLIESKISQLCRKEK
KYEQLLNLDNSKNLFIKNIENVQGDERDIIIVSMGYGPNEKGSVSMNFGAINKEGGYRRL
NVVFTRAKECLILVSSISWDDINSQKITGRGIKFLQNYLKYAEYGSSQNQNNDNKTAQIL
KNNAFENYVYNELVKLGYEVDKQVGCSKYKIDLAIKNPNDPSKYVLGIECDGTTYMSSLT
ARDRDRIRQNVLQSKGWNIYRIWSTNWFINKEKELNNLQKVINSYINNNKTDNKASKEID
STKTNEISYILKKKKVVNINSKPFPNIEILYEKLLKKTNEYKNKEIGWFTFKDEFRVFLQ
AICPIHTNTLRRNKISLSKVKNLILSLNFYFDKDKFLKERNFDYVIFRTTDENSTKRLID
EIWPNELMSGIYEYIKLINSTSVSDVIDYFADLLKMKNTEKFKDTIINALETLKKNNYIE
LDLLSDKAQIINKNAE
NT seq
4731 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacaaaataaagaatataaaaagctagctgaaaaattagaaatacaaaaaagaaag
ctattagatttaagtttaaaaaataaaatgattaattttaaagattcttcatcaaatctt
gaaatagttagcccagatattaaaacaatacttaaaaaaattgcaagcaatgataagcta
gaatttgcttcatcatactttgattctaaaaaaatagaagaaataaaaagggaggaatta
gataatttagatttttattatgattcagaaaatgataatcctaaaagtaaaaaagaaaaa
tcaaatttaaaaatacaaactaataaagatttaaaagatgaatataaaacattgaactta
ttaagtaagaaaaccaaagaatttaaagatgaatattctattgatattttatatttagcg
ttaggaactttagtatattttgataatagcaatccttttactaaagaagaaaaaattaaa
gcacctcttttattttgccaagctaaattagaaagaaaaaatttaagttcaaattatgtt
ttaagttttgaaaatgataaattatatgtaaatgagtcactaattcaaaaattaaagcta
aattacaatattgatattgattttgaaaaagataataaagtagaagatgaaaatgatgat
agcgacttttcaaacactctcaattattttgaatatgttgaacaagttaaaaaggctatt
ccaagtaatttcagtgttgaagatagtataaacttatcaatcttttcatttcaaaaaatc
aatatggtaaaagatattgaaagaaataaagaaaagtttcttgataatgtattaataaaa
caattacttaataatagttctgaaagtagtatatttgatatttcagaatactattctgaa
aaagatattgataatattttaaatataaaagaatattaccatgcgcttgattctgatagt
tcgcaagaagttgctatacaaaatgctattaaaggcttaagttttgttttacaaggacct
ccaggaaccggaaaaagtcaaacaattgcaaacattatttctgaactaattgctagaaat
aaaaaagttttatttgtttctgaaaaattggctgctttgcaagttgtatataataactta
tctaaaataggtattaataaatattgttttcctttgcatagtgtaagtacaaaaaataag
tcagaaatatataaagaactttgaagtgttctggaaaatgctgatgtacataaaacaata
gataaagaatcggaagaaaatattttaaataactatgaagaagctaaaaatgcattaaat
aatttaggtgaatatttatttaaaaaatctgataacatcaataaaaatatttatgaaatg
tatcaagaatattttaaacacattaatcttaaagaaactattgctttaagcaattttagt
gttaatagtattacaagtgataagttaaataaatacgaacttaaaattaaatattttgaa
aaatgaattaatgataataaatatagtattttaactaatccttttaaaggcttatcaagc
aaaaacttattacctgatgaaatagaatatttaactaaatttcatttagattttattaag
tcattttctaatattaaaacttacattaatttaatttctaatataattccaattaataaa
gatgataaattagaaaatatacttaaaacacttaattttataaatgaacatttaaaaaaa
ttaactggtaatttacatagttcaattcttaacattgactgccaaaaagaattattaaaa
tataagcatataaaaagcttatatgaagaaaacctacaaattaaaaataaaattaattac
ataaacctagaactattagataatgaaaaactaataattgattactatacattttttaga
gaatacaaaaatgcttttaaaagagcattttctaaaaaatacaaagaaaaatttaaaaag
ctatgtgaaaacatgcaatataaagttaaaccaaaatttcatctattttataaagattta
aagttatctaaattgtatatagaaaatagaaacacattactgcacaaaataagtgaatta
aattataaactatttgatattgataaagatttatatacaaatattcaaaatattgaatga
tttaatgaactaacaatatatgcatacaaaaacaattttgaacttaataaatcaaatttc
tttgattatcaaaaaataattcaaaaagactttataactcaatttgataaggaacttatt
tgatttaatcaaataaatacaattattaatggtttttactttgaaaatatatttaactca
aattctaaatcaattaatgagttagatcctatagttagtgattgacataataaaattaat
aaaatatttgaaagaatagaattcaataaaatatattatgatgaagataatgatgaacta
attaaagcttttttaagcgaaataatttcaagaaaaattaataaagatatctgaggaatt
tttgctaaatcgttgttcttaaatctaattaacaatgctttgtcaaacaatatgattgac
gtcgattcaagcgataaatatcaaaattttgttgaaatgtttagaaaatatgacaaaaag
atgattgatatagccgccaataaaattgaataccaaattaaaaaatatattcctcaaaaa
gactcattagatgaatatgatcattctaaaagaatattgagaaaagaaattaataaaaaa
tcaaaattaatgcctttcttaaaactatttaaattaattccggatttaattttgcaactt
aaaccttgcgtcatgatgtcacctttatcggtaagttcttatttatttgaaagcgatata
gaatttgatactgttatatttgacgaagcatctcaaataactacagaaaatgctttatgt
gccattgcaagaggaaagcaattaattatttgcggtgataatgaacaactcccacctaca
tcattcttcaaaaaattagaagatgataatgaatatgatgaagaagatgatagttctctt
gaaggccttgaatctgttcttgatgcagcaaatattttcttaccttctaaaaaattgaaa
tgacattaccgttctaaatatgaagaattaattattccttctaatgaagaaatttacaaa
gaattaataactttcccttcaaatgacaaccaaaatgattattctaaaattaaatttata
aaagtaaaaggttcatttataaatagaaaaaatgaagttgaagctaatgaagttataaat
caaataaaacaaatatatgataaatttggtactgaaaaaagtattggaatagttacattt
aatataaatcaacaaactttaatagagtctaaaataagccaactttgccgtaaagaaaaa
aaatatgaacaacttcttaatttagataattctaaaaacttattcatcaaaaacattgaa
aatgttcaaggggatgaaagagatattattattgtttcaatgggttacggacctaatgaa
aaaggcagtgtttctatgaactttggtgcaattaataaagaaggtggatatagacgttta
aatgttgtatttacccgtgctaaagaatgtttaatactagtttcatcaatctcttgagat
gatattaatagtcaaaaaataacaggcagaggaattaaattcttacaaaactatttaaaa
tatgctgaatatggttcaagtcaaaatcaaaataatgataataaaactgcacaaatacta
aaaaataatgcatttgaaaactatgtatataatgaattagttaagttagggtatgaagtt
gacaaacaagtaggatgttcaaaatataaaattgatttagcaattaaaaatcctaatgac
ccttctaaatatgttttaggaattgaatgtgatggaacaacttacatgtcttctttaact
gcaagagatagagatagaataagacaaaatgttttacaatctaagggttgaaacatatat
agaatttgatctacaaattgatttataaataaagaaaaagaattaaataatcttcaaaaa
gttattaatagttatattaataataataaaaccgataataaagcatctaaagaaatagac
agcactaaaaccaatgaaataagttacattcttaagaaaaagaaagttgtaaatataaat
tcaaagcctttccctaacattgaaattttatatgaaaaactactaaaaaagactaatgaa
tataaaaataaagaaattggttgatttacttttaaagatgaatttagagtatttttacaa
gcaatttgtccaatacacactaacacattgagaagaaataaaataagtctaagtaaagta
aaaaatctaatattatctttaaacttttattttgataaagataagtttcttaaagaacga
aactttgattatgttatttttagaactactgatgaaaatagtaccaaaagattaattgat
gaaatatgaccaaatgaattaatgagtggaatatatgaatatattaaacttattaattca
acttcagtaagtgatgtaatagattattttgcagatcttttaaaaatgaaaaatacagaa
aaattcaaagatacaataataaatgccttagaaactttaaagaaaaataattacatagaa
cttgatttgcttagtgataaagcacaaattataaataaaaatgcagaataa
DBGET
integrated database retrieval system