Metamycoplasma orale: NCTC10112_00601
Help
Entry
NCTC10112_00601 CDS
T08183
Symbol
valS
Name
(GenBank) Valine--tRNA ligase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
mob
Metamycoplasma orale
Pathway
mob00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mob00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
NCTC10112_00601 (valS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
mob01007
]
NCTC10112_00601 (valS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mob03016
]
NCTC10112_00601 (valS)
Enzymes [BR:
mob01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
NCTC10112_00601 (valS)
Amino acid related enzymes [BR:
mob01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
NCTC10112_00601 (valS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
mob03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
NCTC10112_00601 (valS)
Prokaryotic type
NCTC10112_00601 (valS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
Val_tRNA-synt_C
tRNA-synt_1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU56005
UniProt:
A0A448ZXM0
LinkDB
All DBs
Position
1:666463..671367
Genome browser
AA seq
1634 aa
AA seq
DB search
MAKTKIKSLDFKDIRIYEKQANKWSYKLRNFNMHLEQNEILGIISYNANLQEDIFKLVTN
KWKSLKSYQGLASVKFDYEKNLSIKNKQYIKNLAYSFDTKLIDNDSDDSKASQISLYQYL
ENYFVESNLLKTSLDDFSSAWKETFDNYGFYLKKEFALNFNNLEKTLKYMLEDLLEMLET
FKVESARTSLSAINKNLEELEEKFTLIINKYKDIEYELMQISYNTINRFQKGEILLNYNQ
YVACRDKYIDAHNKYYNFFNLRKEIKKFKAQRRKEIRNEFFIQSNDVTLLLKKIYYDIKI
ENKFCMYKLSKAQSNKEYAYYLENYLIDNKISNLIKILLKNAKWLNMEIISIILQKIYEL
KTEIFDEFSFINLNKSKRNIRKNITLLVNNSFVIKEDFYKDIIDEKKANYIEKISQYSSK
KKISTDEFEINFKNRFSLEELNQIKNEYIKIKNEYLWNYNNLYNDSTSVYSREMAQISKV
KKANKNIFKKISSLFIHYLYSINSVVIDNYNSFDYKLITDYHVNMMKINNLWKTLESQRN
DFQGYRKIFVNGLYHDCPIIRKFIIRSLVYTIMKKSNISLEKYNFSLDSFSNETKLKVEI
EKIKINKPSLIVIGHYISKLSELMQKKFLNEINKYIFENNIIGIYLLNDFQVAKDVTTNI
IFINNKKPIEQGKTLKIISNPINPLVKGFVGSADERTVENITDYISYLDDYENINRYEID
TDHKVWCTWEELNKWATKENVANPKLAALIFNEVEHSESVEVNFDNPNANEKDTELFDFS
NTLLNKESKGEEMKPQFDHKIVEEKRVDKWNEAKFFSTHDLNKKAFTVILPPPNVTGKLH
IGHAFGDYIQDTVIRYKKLQGFDVLWIPGKDHAGIATQAKIEKRLAEKKIDKYKIGRDKF
LEEAIKWKDEYSKNITNQWNKLGLALDYDAERFTLDNDANEAVIKVFIDLYNDGLIYRDV
KPINWDPILKTALSNIEVINKDVEQKMYYIKYMLKNSSSFIVVATTRLETMFSDVAIAIN
PSDIRAKNLLGKLVINPLTKKEIPIIASELIDKDFGTGLMKVSAHAMDDFNIIKDNKLEL
IECIDENGILNENAMQFKGLDRFEARKQIEAYLAKNNLIEKIEKITSAVGFSERSDCPIE
ILVQPQWFVKMKELAEGLLAHFNQEDKVNFIPKRFEDVLRKWMENVHDWTISRQIWWGHR
IPAWYKDNKVLVQKNCPGDGWVQDEDVLDTWFSSALSPFVFLGWPQSTAKLDRYFPTSLL
VTGYDIIFFWVARMYFQSLYFLDKKPFDTVLIHGLVRDSQGRKMSKSLGNGIDPIDVIDK
YGSDVLRNALIFNSTPGQDINFGDDKINSAKLFINKFWNIARLISQIKIKDEIDYDLHKI
DKFDLWILNKFIQLRKSIDDSMSKYEFTVIFKNIQNFIVNDLSSWYLEFLKLKSNKKFIH
VLFRELLLTLHPFMPFLTDYLFETIYHEELLNNISYNFNVDFVQSDLQEIDSLINIITAL
RQYRESKKISKSELLKFHLEEFSLSTLYATIVNKMTNFEQEKNFDYLIEIPNARIYVKLN
KENIKNDINDLEAKIKQLQIDIDFNKKMLENPKFLEKASKKIIAEKTEKLNNFISQIEGY
KEELTKKKNKLNEQ
NT seq
4905 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaaaactaaaattaaatctttggattttaaagatataagaatttatgaaaagcaa
gctaacaaatgatcttacaaattaagaaatttcaatatgcatttagagcaaaatgaaatt
ttgggtattatttcttataatgcaaatttgcaagaagatatttttaaactagtaaccaat
aaatgaaagtctctaaaatcttatcaaggacttgcaagtgtaaaatttgattatgaaaag
aatttatcaattaaaaataaacaatacattaaaaacttagcatattcttttgatacaaaa
ttaattgataatgattctgatgattctaaagcgagtcaaatttctctttatcaatattta
gaaaattattttgtagaatctaatttattaaaaacttcactagatgattttagtagtgct
tgaaaagaaacttttgataattatggcttttatttaaaaaaagaatttgcccttaatttt
aataatctagaaaaaactcttaaatatatgttagaagatttgctagaaatgttagaaact
tttaaagttgaatcagctagaacaagtttatctgctattaataaaaacttagaagaattg
gaagaaaaattcactttgataattaataaatataaagatattgaatatgaacttatgcaa
atatcttataacactatcaatagatttcaaaaaggtgaaattcttttaaattacaatcaa
tatgttgcatgtagagacaaatacatcgatgcacacaacaagtattataattttttcaat
ttaagaaaagaaattaaaaaatttaaagctcaaagaagaaaagaaattagaaatgaattc
tttattcaatcaaatgatgtaactttacttcttaagaaaatttattatgatataaaaatt
gaaaataaattttgtatgtataaattatctaaagctcaaagcaataaagaatatgcttat
tatttagaaaactatttaattgataataaaatatctaatttaatcaaaattttattgaaa
aatgctaaatgattaaatatggaaataattagcattattcttcaaaaaatttatgaatta
aaaactgaaatattcgatgagttcagttttattaatttaaacaagtcaaaaagaaatata
agaaaaaatattactttattagttaataatagttttgttataaaagaagatttctataaa
gatattattgatgaaaagaaagctaattatatagaaaaaatttctcaatatagttcaaag
aaaaaaatatcaacagacgaatttgaaattaattttaaaaatagattttcacttgaagaa
ttaaatcaaattaaaaatgaatatataaaaatcaaaaatgaatacttgtgaaattacaat
aatttatataatgattcaactagtgtatattcaagggaaatggctcaaattagcaaagtt
aaaaaagctaacaagaatattttcaaaaaaatttcgtcattgtttatacactatttatat
tctataaatagtgttgtaattgataattataattcatttgattataaactaattactgac
tatcatgttaacatgatgaaaattaataatttatgaaaaactttagaatcgcaaagaaat
gattttcaaggttatcgtaagatttttgttaatggactttatcatgattgcccaattata
agaaagtttattattcgttccttagtttatacaataatgaaaaaatctaatatttcatta
gaaaaatataatttcagtttagattcattttcgaatgaaacaaagctaaaagtcgagata
gaaaaaattaaaattaataaacctagtttaattgtgattggtcattatatttctaaatta
agcgaattaatgcaaaaaaaatttttaaatgaaattaataaatatatttttgaaaacaat
attattggtatttatttattaaatgactttcaagttgcaaaggatgtaaccactaacata
atatttataaataataagaagccaattgaacaaggaaaaactttaaaaattatttcaaac
ccgattaacccacttgttaaagggttcgttggtagtgctgatgaaagaacagtggaaaat
attactgattatatttcctatttagatgattatgaaaatattaatcgatatgaaattgat
acagatcataaagtttgatgtacatgagaagaactaaataaatgagcaacaaaggaaaat
gttgcaaaccccaaactcgctgcacttatatttaatgaagttgaacatagtgaaagcgtt
gaagtaaattttgataacccaaatgcaaatgaaaaagatacagaattatttgatttttca
aatacccttcttaataaggaaagcaaaggagaagaaatgaagccacaatttgatcataaa
attgttgaagaaaaaagagtagataaatgaaatgaagcaaaattcttttctactcatgat
ttaaataaaaaagcatttacagttattttacctcctcctaatgtaacaggtaagttacat
ataggtcatgcttttggtgattatattcaagacactgttattagatataaaaaattacaa
ggatttgatgttttatgaattcctggtaaagaccatgctggaattgctacacaagctaaa
attgaaaaaagattagccgaaaagaaaattgataagtataaaattggtagagataaattc
ttagaagaagcaattaaatgaaaagatgaatattcaaaaaacattactaatcaatgaaat
aaattaggtttagcattagattatgatgcagaaagatttactttagataatgatgctaat
gaagctgttattaaagtgtttattgatttatataatgatggattaatttatagagatgtt
aaaccaataaattgagacccaattttaaaaactgcactttctaatattgaagttattaat
aaagatgttgaacaaaaaatgtattacattaaatacatgttgaaaaattcttcttcattt
attgttgttgctactactagacttgaaactatgttttctgatgttgcaattgcgattaat
cctagtgatataagagcaaaaaacttacttggaaaattagttattaatccgttaactaag
aaagaaattcctatcattgcttcagaattaattgataaagattttggaactggacttatg
aaggtttcagctcatgctatggatgattttaatattattaaagataataaattagaatta
attgaatgtattgatgagaatggtattttaaatgaaaatgctatgcaatttaaaggcctt
gatcgttttgaagctagaaaacaaattgaagcatatttagctaaaaataatttaattgaa
aaaattgagaaaataacttctgctgttggttttagtgaaagaagcgattgcccaatagaa
atattagttcaacctcaatgatttgttaaaatgaaagaacttgcagaaggccttttagca
cattttaatcaagaagataaagttaattttattccaaagcgttttgaagatgttctaaga
aaatgaatggaaaatgttcatgattgaactattagtcgtcaaatatgatgaggacataga
atacctgcatgatataaagacaataaagtcttggtacaaaaaaattgccctggcgatggt
tgagttcaagatgaagatgttcttgatacctgatttagttcagcactttctccatttgta
tttttaggttgacctcaaagtactgcaaagttagatagatatttccctacttcactttta
gttaccggatatgacattatctttttttgagttgctagaatgtatttccaatctctatac
tttttggataaaaaaccatttgatactgttttaatccatggtctagttagagatagtcaa
ggtagaaaaatgtctaagtctttaggaaatggaattgatcctatcgacgttattgataaa
tatggttcagatgttttaagaaatgctttaatatttaattcaactcctggccaagatatc
aattttggtgatgataaaataaatagtgctaaactatttatcaataagttttgaaatata
gcccgtttaatttctcaaattaaaattaaagatgaaattgactatgacttacataaaatt
gataaatttgatttatgaattttaaataaatttatacaattaagaaaatcaattgatgat
agtatgtctaaatatgaatttacagttatttttaaaaatattcaaaacttcattgtaaat
gatctttctagctgatatttagaatttctcaaattaaaatcaaataaaaaatttatccat
gttttatttagagaacttttattaacattgcatccattcatgccattcttaactgactat
ttatttgaaactatttatcatgaagaacttttaaataatatttcatacaatttcaatgtt
gactttgttcaaagcgatctacaagaaattgattcattaataaatataattactgcatta
agacaatatcgtgaaagcaaaaagatttctaaatctgaattattaaaattccatcttgaa
gagtttagtttaagtactttatatgcaactatagtaaataagatgacaaattttgaacaa
gaaaaaaactttgattatttaatagaaattcctaatgcaagaatttatgtcaaattaaat
aaggaaaatattaaaaatgatatcaatgatttagaagcaaaaatcaaacaattacaaatt
gatattgattttaataaaaagatgttagaaaatcctaaattcttagaaaaagcaagcaaa
aagattattgctgaaaaaactgaaaaattaaataattttatttctcaaattgaaggttac
aaagaagaacttactaagaagaaaaacaaattaaatgaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
