Metamycoplasma orale: NCTC10112_00626
Help
Entry
NCTC10112_00626 CDS
T08183
Symbol
yhgF
Name
(GenBank) RNA (S1 domain)-binding protein
KO
K06959
protein Tex
Organism
mob
Metamycoplasma orale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mob00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99973 Transcription
NCTC10112_00626 (yhgF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tex_YqgF
Tex_N
HHH_3
Tex_central_region
HHH_9
S1
YqgF
HHH_7
HHH_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU56025
UniProt:
A0A448ZXP6
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(700344..702488)
Genome browser
AA seq
714 aa
AA seq
DB search
MKSIDLVANNLKVSHSQVENTLTLLNEGATVPFIARYRKNVTGNLNEEIIEKIFEQFKYN
EELNKRKEAIIKILSESKLLTDELKNAIENAKQKQELENIYEPFKVGKKTKASEAIEKGL
MPFALEILNNKDDNYKIFKNAEKYLDKFSTKDEVIENVQYVIAQLIYQDIENRNLIKKYV
YENGKIITKIKKNARDENKVFEQYYDYYEKVKYIPNHRILAISRGENLKILSYDITFYIT
PIEKELREKYFKSRATAHYINLAINDCLNRLFFPSIIREIKSDLFERAEQDAIELFGKSL
EQMLLAPAIKNKIILAIDPGFINGCKIAILNENGKLLDKRIIYPNTQKNNSNQDEKLINF
LIDKYSIDLIVIGNGTASQETKEFISKVLDIRKKENFKDHVKCLIVSEIGASVYSASKIA
IEEFPKLSVEERSAISIGRRFQDPLNELVKIDPKSIGIGQYQHDVNQKELSKHLEFKVNK
VVNMVGVDLNTTNKIILSFISGLNEKLANNIIEYREKNGIFSSRKELLDVKGINEKVYEQ
CIGFLRIFDSSTFYDKTNIHPESYNNANKLVKYLNIDLNNINKEILKNVNLDLLEKELNI
NKYDLTLIIDSLLNPGKDIRDEKEGFIINEGIKSFEDLKVGQELIGHVSNITDFGAFIFI
GIKNNVLVHIKYMKKSPNQFVSHPSEVLSIGDNVKIRIININKENKRIQGQILW
NT seq
2145 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcaattgatttagttgcaaataatttaaaagtttcacattcgcaagttgaaaat
actttaacacttttaaatgaaggagctacagttccttttatagctagatatagaaaaaat
gttacaggtaatttaaatgaagaaattattgaaaaaatatttgaacaatttaaatacaat
gaagaactaaacaaaagaaaagaagcaataattaaaattcttagtgaaagtaaactgcta
acagatgaattaaaaaatgctattgaaaatgccaaacaaaaacaagaactagaaaatatt
tatgagccatttaaagttggcaaaaaaacaaaagcttctgaagctattgaaaaaggttta
atgccttttgctttagaaatacttaataataaagacgacaattataaaatatttaaaaat
gctgaaaaatacttagataagtttagtactaaggatgaggtaattgaaaatgtacaatat
gttatcgctcaattaatttatcaagatattgaaaatagaaatctaattaaaaaatatgtt
tatgaaaatggaaagataattactaaaattaaaaagaatgcaagagatgaaaataaagta
tttgaacaatattatgattattatgaaaaagttaaatatatacctaatcatagaatatta
gctatatctcgtggagaaaatttaaaaatactaagctatgatattacattttatattacg
ccaattgaaaaagaattaagagaaaaatattttaaatctcgtgccacagcacactatatt
aatttagcaattaatgattgcctaaatcgattattttttccttcaataattagggaaata
aaaagtgatttatttgaaagagctgaacaagatgcaatagaactttttggtaaaagttta
gaacaaatgcttttggctcctgcaattaaaaataaaattattttagcaattgatcctggt
tttattaatggttgtaaaatagctatcttaaatgaaaatggaaaattactagataaaaga
ataatttatcctaacacacaaaaaaataattcaaatcaggatgaaaaattaattaatttt
ttaattgataaatactcaattgatttaattgtaattggaaatggaactgccagtcaagaa
acaaaagaatttatatctaaagtattagatataaggaaaaaagaaaattttaaagatcat
gtaaaatgtttaattgtttcagaaattggagcgtcagtatattcagcttcaaaaattgca
attgaagaatttccaaaattaagtgtagaggaaagaagtgcaataagtattggtagaaga
tttcaagatccgcttaatgaattagttaaaattgatcctaaatctatcggaattggtcaa
tatcaacatgatgttaatcaaaaagaattgtcaaaacatcttgaatttaaagttaataaa
gtcgttaatatggtaggcgttgatttgaacacaaccaataaaattattttatcttttatt
tctggacttaatgaaaagcttgctaacaatattattgaataccgtgaaaaaaatgggatt
ttttcttcaagaaaagaattacttgatgtaaaaggcattaatgaaaaagtttatgaacaa
tgtattggatttttaagaatatttgattcaagtacattttatgataaaaccaacatacac
cctgaaagttataacaatgctaataaattagttaaatatttaaatattgatttaaataat
ataaataaagaaattttaaaaaatgttaacttagacttattagaaaaagaacttaacatt
aataaatatgatttaactttaataattgactctcttttaaatccaggaaaagatattcgt
gatgaaaaagaaggatttattataaatgaaggaattaaatcatttgaagatctaaaagtt
ggtcaagaactaattgggcatgtttctaatatcactgattttggtgcatttatttttata
ggaattaaaaacaatgttttagtgcatattaaatacatgaaaaaaagtcctaatcaattt
gttagtcatccttctgaagttttatctattggagataatgtaaaaattagaattatcaac
ataaataaagaaaataaaagaattcaaggtcaaatattatgataa
DBGET
integrated database retrieval system
