Mesomycoplasma ovipneumoniae: NCTC10151_00575 Help Entry NCTC10151_00575   CDS       T08113                                  Symbol rnjA Name (GenBank) hydrolase   KO K12574   ribonuclease J [EC:3.1.-.-] Organism moe  Mesomycoplasma ovipneumoniae Pathway moe03018   RNA degradation Brite KEGG Orthology (KO) [BR:moe00001]  09120 Genetic Information Processing   09123 Folding, sorting and degradation    03018 RNA degradation     NCTC10151_00575 (rnjA)  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:moe03019]     NCTC10151_00575 (rnjA) Messenger RNA biogenesis [BR:moe03019]  Prokaryotic type   Bacterial mRNA degradation factors    RNA degradosome components     Ribonucreases      NCTC10151_00575 (rnjA) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  RNase_J_b_CASP Lactamase_B_2 RMMBL Lactamase_B RNase_J_C Anti-Pycsar_Apyc1 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  VEU71818 LinkDB All DBs Position 4:823805..826330 Genome browser AA seq 841 aa AA seqDB search MSLTTNPTRFFGLGGMQEIGKSTLVIEDNYDIVIIDAGIKFANLFSTGIKGMVPNYQYLL KNQAKIRGIFITHGHEDHIGGIVYLVQEVPIKKIFAPKIAIEYLKAKFVDHKIKREIEFV EIKKDDVYHFQSFKVDFWTAQHSIPDAFGVRVTSKHGSIMCTGDFRFDYTPIGNYTDFDK LKQIGKNNLTVLFSDSTNAMRPNHSPSERDILADIEMHMRAASRKIIITAFASNLTRIKA LIEIGIKLDKKILVFGRSMVNGINIGRRSGYINAPDEAFLGKNLSGVEENQMLILTTGSQ GEQLAALDRMSNKKHPKISIEPRDMVIFSSSPIPGNKIKIEHLINRLYKLGAIIKENGPD GYLHTSGHAYKSEHEKIFQLTKPKYFFPYHGEYRMALAHSQTAIESGVSPKNVIIPDNGE VFEIVNQEVRKTKRKIPCEPIYIDGDTISRDNSRIINERQYMRENGVVFIFVPFDKKNNE IKGRISIITKGVFSIRTGSPIIADIRRISYSSIRFFVQKDPNWSMPQVKQLLKNRLGAYF HRSKRWNPVILSKFIFVDEKFDFLANYEQKEAEKFVDYKADQTKIASPVDKKVAKPSPNN KSSSLNSQKSANSSEKAAVKPNNLNKKNLNYYNIPKSTDEKLSQPSQPSQKNIPNKITKK ALNSQNLLKNEAQANSSQEKTFANSESSQNKKSRIIRKKPDYLTANSANSGDNLNTKNIQ PKFRKNQNTANSKQFFAKNIKENPVAFSKNTDSDNFENLNYNNKKFNKNSKNLNQNFVKK QTVRFNNTKMCPVFYPKSPDSTQATFHKKPLAIRKNYKSQNLNDKIGKPENSKPKQTTES N NT seq 2526 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtcactaactactaatccaacgcgtttttttggtcttggcggaatgcaagaaatcggg aaatcaacgcttgtaattgaagataattatgatattgtaattattgatgctggtattaaa tttgctaaccttttttcaacaggaatcaaaggaatggttccaaattaccaatatcttttg aaaaatcaagcaaaaattcgcggtatttttatcacccacggtcatgaagatcatatcggc ggaattgtctaccttgttcaagaagttccaattaaaaaaatttttgccccaaaaattgca attgaatatttaaaagccaaatttgttgaccataaaattaaaagagaaattgaatttgtt gaaataaaaaaggacgatgtctatcattttcaaagttttaaagttgacttttgaacagct cagcactcaattcctgatgcctttggggttcgggtgacttcaaaacatggctcaattatg tgtactggcgatttcaggtttgactatacccccattggaaattacacagattttgataag ctaaaacaaatcggaaagaacaatctcacagtacttttttcagattcaactaatgcaatg cggccaaaccactcgccctctgaacgggacattcttgctgatattgaaatgcacatgcgt gctgcaagtcgaaaaattattattacggcatttgcctcaaacttaacaagaattaaggca ctaattgaaattggaattaaattagataagaaaattcttgtctttggaagatcgatggta aatgggattaatatcggtcggcgttctggctatattaatgcccctgatgaagcctttctt ggtaaaaatttatcaggtgttgaagaaaatcagatgctaattttaacaacaggatcccaa ggtgaacaactagctgctcttgatcgaatgtcaaacaaaaaacaccctaaaatcagtatt gagcctcgtgatatggtcattttttcttcatcgccaattccaggaaacaaaattaaaatt gagcatttgattaatcgactttataaattaggtgcaattattaaagaaaacgggcctgat ggttatcttcatacctcagggcatgcttataaatctgagcatgaaaaaattttccaactg acaaagccaaaatattttttcccttatcatggcgaataccgaatggcgcttgctcactct cagacagcaattgaatctggagttagtccaaaaaatgtaataatcccagataatggcgaa gtttttgaaattgttaatcaagaagttcgcaaaactaagagaaaaattccgtgcgagcct atttatattgatggagatacaatttcccgtgataattcgcggattataaatgaacgtcaa tacatgcgtgaaaacggtgttgtttttatttttgttccttttgataaaaaaaataatgaa attaaaggtagaatttcgattattacaaaaggtgtcttttctattcgaacaggaagtcca attattgctgatattaggcgaattagctattcatcaattcgcttttttgtgcaaaaagat ccaaactgatcaatgcctcaagtaaagcaacttttaaaaaatagattgggcgcatatttc catcggtcaaaacgttgaaatccggttattttgtcaaaatttatttttgttgatgaaaaa tttgattttttagcaaactatgaacaaaaagaagcagaaaaatttgttgactataaagca gaccagacaaaaatagcaagtccagttgacaaaaaagttgcaaaaccaagtccaaataat aagtcctcaagcctaaattcacaaaaaagtgccaattctagcgaaaaagcagctgttaag ccgaataatttaaacaaaaaaaatctaaattattataatatcccaaaaagcacagatgaa aaattaagtcaaccaagtcaaccaagtcaaaaaaatattccaaataaaataacaaaaaaa gcattaaattcgcaaaatcttctaaaaaatgaggctcaggctaactcaagtcaggaaaaa acttttgctaacagcgagtcttctcaaaataaaaaatcacggattatacgaaaaaaacct gattatttgacagcaaattcagccaattctggggataatttaaacactaaaaatattcag ccaaaatttagaaaaaatcaaaatacagccaattctaaacaattttttgcaaaaaatata aaagaaaatcctgttgctttttcaaaaaatactgatagtgataattttgaaaacttaaat tataataataaaaaatttaataaaaacagtaaaaatttaaatcaaaattttgttaaaaag caaactgtacgctttaacaacactaaaatgtgcccggttttttaccctaaaagccctgat tctacccaagcaacttttcataaaaagccactagcaatcagaaaaaattataaaagccaa aatttgaatgataaaattggcaaacctgaaaattcaaaacctaaacaaacaacagaaagc aattaa

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