Methanothermococcus okinawensis: Metok_1242
Help
Entry
Metok_1242 CDS
T01534
Name
(GenBank) APHP domain protein
Organism
mok
Methanothermococcus okinawensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CARDB
Cohesin
S_layer_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH07210
UniProt:
F8AJM3
LinkDB
All DBs
Position
1266362..1270423
Genome browser
AA seq
1353 aa
AA seq
DB search
MKWKFFTLSVLMISLIGMCYAENVSVELIPNNISANVGDTINLDLIVKNVPDNLKCEGFE
TYIYYNSSMLNISKNDVVLKDVSGSISKENITVSNGEIWISLWFSKDFSGNFTIAALSFK
ALNEGTGNVSLHNTVVSDANGQHIEDNPNISLVLKNSNMDIIIKPIADIITPKIANSELG
ENITIPIIISPKENETINEICGTLSYDKTIVNPVNLSSSDGIVSFNISNGFFKIENINKS
SNFTINVTYNVINVGSTATQLRDVAIKDIENYSVVKNSDIINIYIPGPDLVITNISIPCL
KSYQDNIIPITVKNIGERNISNNFTVTLYMDANEIGKKTVNGLTIGKTKTTNFTFMPLDN
KNYTLVAVVDSSGKIKETNETNNKYVKIVEAVEQPISLNLVPSTNLTKTGETFTVDIKLN
NITDKRPAKGIDGVLTYDSKVLNCTNFTFSINASENLKNITFKNGKVLFSIMDGNITKPT
VIGRATFKAINVGNSNIGLENVVVSDINGYKFNKIFIYPKTMTVEGPDAYIKNISVENPY
YLEPAIVKVEVSNKGHADSTETFDVHLYVDSNDLGTKTVNNLSIGKTKTISFNWIPQDKK
NYTIVALINPTVDENVSNNKLVKKVMIVEQPISLNLVPSTNLTKTGETFTVDIKLNNITD
KRPAKGIDGVLTYDSKILECTNVTFSINASENLKNITFENGKVLFSIMDGNITKPTVIGK
ATFKALDVGNSEIGLCGVAVSDINGYKFNNVITTPKTVVVQGPNIKITSIDVSNPSLYRA
PTTINITITNNGHQDIINKSFDVHLYVDSNDLGTKTVNNLLIGETKTLSFNWTPTDIKTY
TVVAIADKFNAVKEENESDNKLVKKVNVVEEPVWLKLYNRSESNGTITASIDVDSINPKR
PCSGYDLGLTLKNVEILNISGIGTCYWNLTNGSLFVSGYNFSKSGKFNIGNITFKVINKN
DTSYLIIKHAVLSDWKGYKFKRIFLNNTITTKTINEALKSINMDSKVWNLTELDKIDIIS
ESFNITVVPIENDTLRIPILENISINLTEENVETLEEVKQKATEFNNIKIENENDIYKII
NNTEIKPIVNTGFNITNITKETKKENNKVISSIKFNVTNTSTKGLSITRIPIGPLNVEGI
TVNNGTKNITLKENDYSSKIGWYTIPTKGVLEITLVKDPEVNVILSATLPSITTTYYSGG
GGSHHMTIKTYSDVAQDIKSEKIKEIVHNYKLILGSEIDNNMSAKHLKNTSELINKPLEI
KEDCILIGGPVANPLVKKFLWTFPVKVTNDYPGAHMGVIQKQIINGHNVILLAGSDRYGT
KAAVEYFKTLDDIPSEPIFVEWKDNKAIKINKP
NT seq
4062 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtggaagttttttacactctcagttttgatgatttcattaattgggatgtgttat
gcagaaaatgtatccgtagagttaatcccaaataatatatcagccaatgttggagatact
attaatttagatttgattgtaaaaaatgtgccagataacttaaaatgtgaaggttttgaa
acatatatttattataattcaagtatgttgaatatatcaaagaacgatgttgttttaaaa
gatgtatccggaagcataagcaaagaaaatataactgtatctaatggagaaatttggatt
tcattatggtttagtaaagatttttcaggtaattttaccatagcagccttatcatttaag
gcattaaatgagggaactggaaatgtatcactccacaatactgttgtatctgatgcaaat
ggacagcatattgaggataatcctaacatatcattagttcttaaaaactcaaatatggat
ataattatcaaacccatagctgatataataactcctaaaattgcaaatagtgagctcgga
gagaatataactattcctataattatatcaccaaaagaaaatgaaactataaatgaaatt
tgtggaactttaagttatgataaaacaatagtgaatcctgttaatttatcatcaagtgat
ggaatagtttcatttaatatatcaaatggattctttaaaatagaaaatattaataaatca
tcaaatttcacaataaatgtcacttataatgtaataaatgtaggatctactgcaactcag
ttaagagatgttgcaattaaagatattgaaaattacagtgtcgttaaaaattctgatatt
ataaatatttacatccctggaccggatctggtaattactaatatctcaataccctgctta
aaatcatatcaagacaatataataccaatcactgtcaaaaatattggagaaagaaacatt
tcaaataatttcacagttacattatatatggatgctaatgaaattggtaaaaagacagta
aatggattaactattggaaaaacaaaaactacaaactttacatttatgcctttggataat
aaaaactacaccctagttgcagttgttgattcatctggaaaaataaaagaaactaatgaa
accaataataaatatgtaaaaattgttgaagcagttgaacaacctatttcactaaactta
gttccatcgacaaacttaacaaaaacaggcgaaacatttacagtagatattaaattgaac
aacataactgataaaagacctgctaagggcatagatggagttttaacttatgattcaaaa
gtattaaactgcacaaactttacattctcaataaatgcatcagaaaaccttaaaaatata
acatttaaaaatggaaaggtattatttagtataatggatggaaatataaccaaaccaact
gttataggtagagcaacctttaaagcaataaatgtaggtaactcaaacataggattagaa
aatgtcgttgtttcagatataaatggatacaaatttaataagatatttatatatccaaaa
acaatgactgttgagggtccagatgcgtatattaaaaatatatccgttgaaaatccatat
tatttagaacctgcaatagttaaagttgaagtatctaataaaggacatgcggattcaaca
gaaacttttgatgtccatttatatgtggattcaaatgacttaggaacaaaaacagtaaat
aatttatcaattggaaaaacaaaaaccatatcatttaattggataccacaagataaaaag
aactatacaattgtagctttaataaatccaacagttgatgagaatgtatcaaataataaa
ttagttaaaaaagtgatgatagttgaacaacctatttcattaaacttagttccatcgaca
aacttaacaaaaacaggcgaaacatttacagtagatattaaattgaacaacataactgat
aaaagacctgctaagggtatagatggagttttaacttatgattcaaaaatattggaatgc
acaaacgttacattctcaataaatgcatcagaaaaccttaaaaatataacattcgaaaat
ggaaaggtattatttagcataatggatggaaatataaccaaaccaactgttataggtaaa
gcaacctttaaagcactggatgttggaaactcagaaattggattatgtggagttgcggta
tcggatataaacggatacaaatttaataatgtaattactactccgaaaactgttgtagtt
caaggaccaaatattaaaattacaagtatagatgtttcaaatccatcattatacagagca
cctactacaataaatataacaataaccaataatggtcatcaggatattataaacaagtca
tttgatgttcatttatatgtagattcaaatgatttaggaacaaaaacagtaaataatttg
ttaattggggaaacaaaaactttatcatttaattggacaccaacagatattaaaacatat
acagttgttgcaatagcagataaattcaatgctgttaaagaagaaaacgaaagcgataat
aagttggttaagaaggtgaatgttgttgaagaacctgtttggctaaaattatacaacaga
tctgaatctaatggaaccataacggcatctattgatgtagactccataaatcctaaaaga
ccttgcagtggttatgaccttggcttaaccttaaaaaatgttgaaattttaaatataagt
ggaattggtacatgttattggaatctaactaatggcagtttatttgtaagtggatacaac
ttctcaaaatctggaaaattcaatattggaaatataacatttaaagttattaataaaaat
gatacctcttacttgataataaaacatgcagtattgtcagattggaaggggtataaattt
aagagaatattcctaaacaatacaattacaactaaaacaataaatgaagcattaaaatcc
attaatatggattctaaagtatggaatctaactgaattagataagatagatataatctct
gaaagctttaatataacagtagttccaatagaaaatgatactcttagaatacctatctta
gaaaatatatccataaaccttactgaagaaaatgttgagactttggaagaggttaaacaa
aaagctactgaatttaacaatattaaaattgaaaatgaaaatgatatatataaaataata
aataatacggaaatcaaacctatcgtaaatacaggatttaacataacaaatataacaaag
gaaactaaaaaagaaaacaataaagtgatatcttcaattaaatttaatgtaacaaacaca
tcaactaagggactttcgataacaagaattccaataggtcctttaaatgttgaaggtata
actgtaaataatggaacaaaaaacataaccttaaaagaaaatgattattccagtaaaata
ggatggtatacaataccaactaagggggtattagaaataaccttagttaaggaccctgaa
gtaaatgttatattatctgccacacttccatcaataactacaacatattacagtggaggt
ggtggaagccaccatatgacgataaaaacttattcagatgtagcacaagatattaaatca
gaaaagattaaagaaatcgttcataactacaaattaatattaggttcagaaattgacaat
aacatgtcagcaaaacatcttaaaaacacatcagaattaataaataaaccattggaaata
aaagaagactgtatattaataggaggtccagtagctaacccattggttaaaaaattcctc
tggacattcccagttaaagtaacaaatgattacccaggagctcatatgggagtcatccaa
aaacagataataaacggacataatgtaatattattggcaggttcagatagatacggaaca
aaagcagcagtagaatactttaaaacattggatgatattccatcagaacctatattcgta
gaatggaaagataacaaagcaattaaaataaataaaccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
