Methanobrevibacter olleyae: YLM1_0390 Help Entry YLM1_0390         CDS       T04385                                  Name (GenBank) CRISPR-associated helicase Cas3   KO K07012   CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4] Organism mol  Methanobrevibacter olleyae Brite KEGG Orthology (KO) [BR:mol00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02048 Prokaryotic defense system [BR:mol02048]     YLM1_0390 Enzymes [BR:mol01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      YLM1_0390 Prokaryotic defense system [BR:mol02048]  CRISPR-Cas system   Type I CRISPR-Cas system    Type I signiture cas proteins     YLM1_0390 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Cas3-like_C_2 DEAD ResIII PhoH Cas3_HD Helicase_C AAA_22 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AMK14950 UniProt:  A0A126QXU2 LinkDB All DBs Position 458273..461113 Genome browser AA seq 946 aa AA seqDB search MDFTDLKYNFESSSINLDGDTFFIYAHTNEYLYAHILKTKHVFNNLIDKSVLKSFYNTFK ENQIINLSYDEFEDIIFDCINFHDVGKISFKFQVERLNSKDSYVGTIQKNILNKFDWSDN LMDNLTADHSLTSALVFLSKYEDIFDENKLFLLSLAHVINGHHTYLKDLLKQSQLSYSID EKTENTFRLLSLFLGIKYSEEDILEKYDLNVMQDNTFEFLNNDVDDLYSPISFFYMYIYS LLIVSDVFASDKSNFSLEEVKKLNFNNRIYSNLHQKMKNSFYNIPYNNDLNYSDYMENLN DVKDINFLRKQMLLESSKNLINQISNKNVFFLNMPTGGGKTNTSMKLALDILENTTTDRI IYAMPFINIIEQNFDVICKSFGLSEDEGEIRKIYSGSETLFSNKTDDYKNNILLNDDFFN YPVICTTFVSLFDSIIKSNKKLKYKLSSLANSVIILDEIQSLPLKNWNSLYYIINELAQN YNIYFIIMSATLPDFDKLKLDSNTNFSFSNISLINNPSKYYNHYLFNRTEIKDYIKSFEL NENQNKEFIEYLWSIIQDNFNQGYTKGLMVFNTIKSSRLIFDKLSEFIEEKEFEDDTLDL EINLLNSSLMPATKRSIISKINNLDDEKKYILISTQSVEAGVDVSFDFVVRDFAMIDSIE QIRGRCNRSRELNKRFDDEYKMGNIYLTKLVHKKNNHFFDYIYSEEEMKTRIKCTDNLLN NSLNYSFSNINEYYANVSNLINCIHDEEEKSHFIDRDNIKYLNKMKFSKLMDKNTGINII DTGQDQFSIFICTDVSIFSEDLETNIFDLDDESMELFYQKNKEKSIFSLNEIKFIKNLEY DEELYGFNRIHGESILNYYTSLLKTIDKKNDYFQFKLLQKEFSSIFYKFIINISINSYED LYSEINSLKLIDYFRILPKDKIGDTEFKFYSLEKGFNYKPTIVNIL NT seq 2841 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggatttcactgatttaaaatataattttgaatcttcatctattaatttagatggagat actttttttatttatgcacacactaatgaatatttatatgctcatattttaaaaacaaaa catgtttttaataatttaatcgataaatcagtattaaaatctttttataatacttttaaa gaaaatcaaataatcaatttatcttatgatgaatttgaggatataatttttgattgtatt aattttcatgatgttggtaaaatttcattcaagtttcaagttgaaagattaaattctaaa gatagttatgttggtactattcagaaaaatatattaaataaatttgactggtcagataat ttaatggataatctaactgcagaccattcattaacaagtgctttggtttttttatctaag tacgaagatatttttgacgaaaataaattatttttattaagtttagctcatgttattaat ggacatcatacttatctaaaagatttattgaagcaatctcaattatcatatagtattgat gagaagactgagaatacatttcgtttgttatccctatttttaggaattaaatattcggaa gaagatatattagagaagtatgatttaaatgttatgcaagataacacttttgaattctta aataatgatgttgatgatttatatagtcctatttctttcttttatatgtatatttattcc ttgttaattgtttctgatgtttttgcaagtgataaatctaatttttctttagaagaagta aaaaaattaaatttcaataatcggatttactctaatttacatcaaaaaatgaaaaattcg ttttataatattccatataataatgatttaaattattctgattatatggagaacttaaat gatgttaaagatattaattttttaagaaaacaaatgttgttggaatcttcaaaaaattta attaatcaaatttctaataaaaatgtgttttttttaaatatgcctactggtggtggtaaa actaatacttctatgaaattagcattagatattttagaaaatactactacagacagaata atatatgcaatgccttttataaatattattgaacaaaattttgatgtaatttgtaaatct tttggcctatctgaagatgagggagaaataagaaaaatttattctgggtctgaaacatta ttttctaacaaaacagatgattataaaaataatattttattaaatgatgatttctttaat tatccagttatttgcacaacttttgttagtctattcgatagtataattaaatctaataaa aaattaaaatataaattatcttctttagcaaactcagtaataattttagatgaaatacaa tctttaccattaaaaaattggaatagtttgtattatataattaatgaattggcacagaat tataatatttactttattattatgagtgcaacattgccagattttgataaattaaaatta gattctaatacaaactttagtttttctaatatttctttaatcaataatccatctaaatat tataatcattatctatttaacaggacagaaattaaggattatattaaatcttttgaactt aatgaaaatcaaaataaagaatttatagagtatttatggagtattattcaagataatttt aatcaaggttatactaaaggattgatggttttcaatacgattaaatcttctagactaata tttgataaattatctgaattcattgaagaaaaagaatttgaagatgatacattagattta gaaataaatttattgaattctagtttaatgcccgctactaaaagaagcattatctctaag attaataatttagatgatgagaaaaaatatattttaatcagtacacagagtgttgaggca ggggttgatgttagttttgattttgtagtcagagattttgctatgattgattcaattgaa caaattagaggtcgttgtaataggagtagggagctaaataaacgttttgatgatgaatat aaaatgggtaatatttatttaactaaattagttcacaaaaagaataatcatttttttgac tatatttatagtgaagaagaaatgaaaacaagaattaaatgtacagataatttattaaat aattctttaaattattcattttcaaatattaatgaatattatgctaatgtttctaattta attaattgtattcatgatgaagaagagaaatctcattttatagatagggataatataaaa tatttaaataaaatgaaattttctaaattaatggataaaaatactgggattaatattatt gatactgggcaagatcaattttctatttttatttgcacagatgtaagtatattttcagaa gacttagaaacaaatatttttgatttagatgatgagtctatggaattattttatcaaaaa aataaagaaaaatctattttttcattaaatgaaataaaatttattaagaatttggaatat gatgaggaattatatggttttaatcgtattcatggtgagagtatattaaattattatact tctttattgaaaacgatagataaaaagaatgattatttccaatttaaattacttcaaaag gaattttcatctatattttataaatttataattaatatatctataaactcttatgaagat ttatattctgaaatcaattctttaaaactaattgattatttccgtattttaccaaaagat aaaattggagatactgaatttaaattttattcattagaaaaaggatttaattataaaccc acgattgtgaatatattgtga

DBGET integrated database retrieval system