KEGG   Methanobrevibacter olleyae: YLM1_0801
Entry
YLM1_0801         CDS       T04385                                 
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein
  KO
K03725  putative ATP-dependent RNA helicase [EC:5.6.2.-]
Organism
mol  Methanobrevibacter olleyae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mol00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mol03019]
    YLM1_0801
Messenger RNA biogenesis [BR:mol03019]
 Prokaryotic type
  Archeal mRNA degradation factors
   Exosome components
    Others
     YLM1_0801
SSDB
Motif
Pfam: DUF5814 DEAD Helicase_C SecA_DEAD Helicase_dom4_arc
Other DBs
NCBI-ProteinID: AMK15358
UniProt: A0A126QZT4
LinkDB
Position
complement(959596..962922)
AA seq 1108 aa
MIVLNKKKKSWEIYPIGSPKGALNTKRKPEFIGVLKFREDEEDGTISIKRFLVKDENEDK
LYPPSRAINILRSQAVFLSEKDEKLESFLKQNNIKVRFTNICQHCSYEGEVTIINSDFSY
RYHDQLICKTCAEDTIKRELQLRGYDKKVFGNFKRVLEKTGSLNDVLDMLSPRFDPLARS
DLTLFDRIKVQDDKIPKIAMKRLKIPKEFKQIIIEEKNQYLLPVQYLAIREGLFKGENLL
VVSATGSGKTLVGELVGVPKALNGKKFLFLTPLVALANQKYRDFKKRYEPLGLKVAIKVG
MNRIKAKGELKLPDSNIADADILVGTYEGIDFLIRSGKSDLLEDLGLVLVDEIHTISDEE
RGLRLNGLIKRIRHIFPNTQIIGLSATIKNPQSLANDFNMKLVQYKQRPVPLERHIVFVR
GDIQRRILMRKLVEKEFYTSSSKGFNGQTLIFTNSRRKTHKIANFLSGKGISASAYHAGL
SYFKKEKIEKDFLKGKIATVVTTAALAAGVDFPASQVIFESLLMGNKWISPNEFSQMLGR
AGRPSYHDRGLIYLIPEIGSEVDNESEEAVALDLLESDVEDIFVDYTEDGSLEQILADIS
SKSLRKVNDLEEFYKNIPVPMDIKTALDELHDKKAIDVYSDGTIDTTKFGKAVAMSFLSI
DDGVIIKDSIDNPHYLSYYYNKSFFKTNLKELHLLSRKIDKENDNILKKNKKIQNNLNKQ
VKNSSRKDKKDKKDNKKNFNKSGKDRSKDNFNKSGKDRSKDNFNKSRKDRSKDNFNKSRK
DRSKDNFKDESNKSIRTDVNKANESNINENNSKIKLITDDESVEKLIPKKETKKASKTNR
YINNIADALNEINKSKDYKDSNENNSKSTGQKNDYKSFKKDKSRDIKSDVIYNKKTTSKS
KNKNKKNRSKSKSSTIVKQIKFKENIFSEINEKMSKDEVNSNNLLKIQSIALDLELFENA
YLAPVVHKQMISALKMNFSTRLFSESTLDIISSGEAISKVDKKFQDALLKIQIDFLRCDC
YERPFCECLQRGVSYYIINQRLNRKDPIDISNSLLKEYQIQTYPGDIFAWLDTYVRNLDA
IKRIAKAFGEKDIVKETDKLMKIIESGK
NT seq 3327 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatagtactaaataaaaagaaaaaatcttgggagatttatcctattggaagccctaaa
ggagctcttaatacaaaacgcaaacctgaatttataggtgtattaaagtttagggaagat
gaagaagatggaacaatatccattaaacgttttctagttaaagatgaaaatgaagataag
ctttatcctccctcaagggctattaatattttacgctcccaagctgtttttttatcagaa
aaagatgagaaattggaatctttcctcaagcaaaataatattaaagttagatttacaaat
atctgtcaacattgcagttatgaaggtgaagtaactattatcaattcagatttttcttat
agatatcatgatcaattaatctgtaaaacttgtgctgaagatacaattaaaagggaactt
cagcttagaggctatgataaaaaggtatttggaaatttcaagagagtgctggaaaaaaca
ggtagcttaaatgatgttttagacatgctttcaccaagatttgatccattagctcgttct
gatttaacattgttcgataggattaaagttcaggatgataaaatacctaaaatagctatg
aaaaggcttaaaataccaaaagagtttaaacagattatcatagaggaaaaaaaccaatac
cttttaccagttcaatatttagctattcgtgaaggtttatttaagggagaaaatttattg
gtggtatcagcaacaggtagtggaaaaacattggttggagagcttgtaggtgttccgaag
gcactaaatggaaaaaaattcttatttttaactccacttgttgcattagcaaatcagaag
tatagggattttaaaaagagatacgaacctctcggattaaaagtagctattaaggtaggt
atgaataggattaaagcaaagggagaacttaaactacctgactctaatattgctgatgca
gatattcttgttggaacctatgaaggaattgactttttaatccgttctggtaaatccgat
ttattagaggacttaggattagttttagttgatgaaattcatactatttccgatgaagaa
agaggtcttagattaaacggtttaattaaaagaataaggcatattttcccaaacactcaa
ataataggtttatctgctaccattaaaaatccacaaagtttagctaatgattttaatatg
aaattagttcagtataagcagagaccagttccccttgaacgccatatcgtttttgtaagg
ggagatattcaaagaagaatactaatgagaaaattagttgaaaaagaattctacacaagc
tcttcaaagggctttaatggccagactttaatttttactaattctagaagaaaaacacat
aaaatagctaatttcttatctggtaaagggattagtgcttctgcttatcatgcaggttta
tcctattttaaaaaggaaaaaattgaaaaagactttttaaaaggcaaaatagctacagtt
gttacaacagcggcacttgcagcaggtgtagattttccggcttctcaagttatttttgaa
tccttactaatgggtaataaatggatttcccctaatgaattttcacaaatgctgggaagg
gctggaaggcctagttatcatgatagaggattaatttatcttattccagaaattggcagt
gaagttgataatgaaagtgaagaggcagttgcacttgatttgcttgaaagtgatgttgaa
gatatttttgtagactataccgaggatggatcacttgaacaaatacttgctgatatatca
tcaaagtctttaaggaaagttaatgatcttgaggaattctataaaaatattccagttccg
atggatataaaaacagcacttgatgaacttcatgataaaaaagctattgatgtatattct
gatggtacaattgatacaactaagtttggaaaagctgtggcaatgtcatttttatctatt
gatgatggtgtgattattaaagattccattgataatcctcattatttaagttattattat
aataaatctttctttaaaactaatttaaaggagcttcatttattatctagaaagatagat
aaagaaaatgataatattcttaaaaagaataagaagattcagaacaatttaaataaacaa
gttaaaaacagctctagaaaggataaaaaggataaaaaggataataaaaagaattttaat
aaatctggaaaagacaggtctaaagataattttaataaatctggaaaagacaggtctaaa
gataattttaataaatctaggaaagacaggtctaaagataattttaataaatctaggaaa
gacaggtctaaagataattttaaagatgaatcaaataaatctattagaactgatgtaaat
aaggctaatgaaagtaacattaatgaaaataattctaaaattaagcttattacggatgat
gaaagtgtagaaaaactgattcctaaaaaagaaactaaaaaggcatctaaaactaataga
tatataaataatattgctgatgctcttaatgaaataaataaatctaaagattataaagat
tccaatgagaataattctaaatccactggccaaaaaaatgattataaatcttttaaaaag
gataaatcaagagatattaaatctgatgtaatttataacaaaaaaacaactagtaaatca
aaaaataaaaataaaaagaatagatctaaatctaaaagttctacaattgttaaacagatt
aaatttaaagaaaatatattctctgaaattaatgaaaagatgtctaaagatgaagttaat
tctaataatttattgaagattcaatcaattgcactagatttagaattatttgaaaatgct
tatttagcacctgttgttcataaacaaatgattagtgctttaaagatgaatttctctact
agattattctctgaatcaacattagatattatatcatctggtgaagctatttcaaaggta
gataagaaattccaagatgccttattaaaaatccaaattgattttttaagatgtgattgt
tatgaaagaccattttgtgaatgcttacaaagaggtgtttcctactatatcatcaatcaa
agattaaatagaaaggatccaattgacatttctaattcattacttaaagaataccaaatc
caaacttatcctggagatatttttgcttggctagatacttatgtaaggaatttagatgct
attaagagaatagctaaagcatttggtgaaaaagatatagttaaagaaacagataaatta
atgaaaataattgaatctggtaaataa

DBGET integrated database retrieval system