Faucicola osloensis: AXE82_10900
Help
Entry
AXE82_10900 CDS
T04294
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
mos
Faucicola osloensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mos00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mos02000
]
AXE82_10900
Transporters [BR:
mos02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AXE82_10900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
ESPR
YadA_anchor
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AME02423
UniProt:
A0A378QVJ2
LinkDB
All DBs
Position
unnamed4:15614..24328
Genome browser
AA seq
2904 aa
AA seq
DB search
MNHIYKVIFNKATGTFMAVAEYARGQGKKANRVKSEGVKSVYFTFTALASSFVLMNSAVA
AIGDTLPTTVTTDANGTTAFNYCYYDVTSKTVICGDATTTSATGVTGSVILGAGAKSITN
NAVAIGNNAISSSPNDISIGNGANAIAGDGVAIGTNAKVNIGTSGVVSAARGIAIGLDSN
AQVASSIAMGNGATTTGTGNIANSIAIGTGARTYGTNSIAIGVGTGQNATQPNNVAVGIN
SGQNVTAGDTVANSGTAVGGSTNVALGVTSGNNVAGNGNLAVGTNAGNRVKVLGASVTLP
DGTVQDTGPSSLYCLFPPFYCNGGSGNGGNNTAIGPAAANDVSGAQNIGLGFRAGSFTTG
NNNLSIGQLAGFQTNGSGNVGVGSFASSSMIGHQNSAVGNASGSNIIGSYNSTLGVNSGQ
NVKGESNIGIGNATGQFVSGNENIAIGKNAGKGATGAPIVVNRSVAGGSQAMAYGDDSIA
MGTGAIAGIVGANTTQVNAIAIGKGAQATGKQSISVGTGNVVSGDNSGAFGDPTTISGTG
SYSTGNNNTITTNDTFVVGSNVTKTLDNSVFLGKDAAYTAKGASTDGVEKVPDAKVGGIT
YAGTSFAGQTPVGVVTVGDVGKERRIQNVAAGKIAATSTDAINGSQLYAVASKLGEQVEN
TYFHVNTGTNAGTGDATTNLGKITDAAGAQATGALTAGINTIATGKSSVSIGHKAQAKAD
NDIAIGNLAGSGRGDKGSDFTAGTTFAAGTVYSGGTTQTVTSIATNSGISIGQNSGTNST
GVNNTMIGTAAGEQLFGDNTVTIGTNANNYRVNGFSNGQVNTNNNTVDALSGNTKNAANA
VNRSRKSVAIGNNAMTYDDSNIAIGDGAKSLGASSIAMGTGARAGMAYATVGGVARGDGG
SIAIGKNSVAPLEGDLSIGVNTGSRVNQNTIPAHQMTTTRNISVGYDVGGNVYGYTNTVI
GTSSGSNIGTAAVPNYANVAIGDQVGKGIRGNNNVNIGYQGGNNITSNSNTSIGTRSGSH
VSGANNVTTGTFSGNYVSGTDNWAAGVESGTHVGVLSNASSLNINDNQFYAGSTQLVKRS
ATANVAAGKNAGQYINGSRNIAFGQNAGQYVGHKGTTFGAVSNNNIAMGEKAGQYIEGSD
NFAVGLEAGRGTGTDATLTRHRSISQGFKANAYTNDSIAIGSNSVAGVQSANGAGKINAI
AIGTGAQATGKQSISIGTQNRVTADNAGAIGDPSIVSGAGSYTLGNDNAVGSTSTNVGAF
GNNNQIGATANYDANGKLIALNGLADTAAVENSRAVGNKNYINTSNTYVLGSGVGTKDNG
TVLDTVANSVYLGNDSTVAKGAAVGTKNLDKEGVAGTTTTAGDAGTVETATVNGVTYGSF
AGKTAAGAVSVGSAGLERRVMNVAAGEISATSTDAINGSQLYATNAKLGNVANTVVENFG
GNATLDADGNITYTNIGNTGKDNIHDAIQAATTVVKAGTNVVVDEATNATTGQKEYTVNA
WDTTVSAAADSAVTVTPTIDDTNRTRAYEVTVNTDGNTIKVENGQLTANTTPLATTDGKV
DAPANADALATAGDIANAINNSGWKATSGATGSGVVDGTTEELINPSETVTFQAGDNMVL
NQAENVFTYSLNKDININSVQFNDGPKITNDGDNIKVGDKDGNATKITNVAAGTDDTDAV
NMSQLEKAQAAATTKVEEADGINVEATPNADGSTTYTVSAKTDGTTTKIDDNGNIAAVTT
TFKPSTDGKVGAPVDNGDSLVTANTVADAINNSGWKATSGATGSGVVDGTTVELINPSET
VTFQAGDNMVLNQAENVFTYSLNKDININSVQFNDGPKITNDGDNIKVGDKDGNATKITN
VAAGVDATDAVNVSQLKGAVDALGGGAAINTDGTIKAPTYNITNPANGTVTAANNVGDAL
KGLNDAVNSPLTFKGDSGEFNRNLGQTTTVKGGITDTAKLSDNNIGVVAKDGTLDIKLAK
DIAVDSVKTGDTTVNTYGVSIANADPNKVVSLTASGLNNGNNRITNVAAGQAGTDAVNKD
QLDKAQAAATTKVEEADGIKVVPTTNADDSTTYTVSAKTDGTTTKIDGNGNIAAVTTTFT
PSTDGKVGAPVGNGDSLVTANTVADAINNSGWKATSGATGSGVVDGTTEELINPSETVTF
RAGDNMVLNQAENVFTYSLNKDININSVQFNDGPKITNDGDNIKVGDKDGNATKITNVKA
GEADTDAVNVSQLKEAANNLVTTGFNIADGKGGNDNVKLGETVTFTDPAGNIITTVTDNK
VEFGLNSTLSVGKDGEPGKVGIKGADGKDAISLNGEDGTIGLKGADGKDGISLNGKDGTI
GINGKDGANATLTVEKAKPALDGKDGQNGEDGQTRIVYTKPNGSKEEVATLNDGLNFKAD
DGSIVAKKLNETLEIVGGADKDKLTDNNIGVNNKDGKLTVQLAKDLKGIDSITVNNGPVI
SGNGIDMKGDKITNVKAGTEDNDAVNVSQLKAVEATANQGWNLTTNGKADSKSNVKPGDT
VDFANTDRNVKIENTGNNVTVNLNKDIDLTKDGSVTIGDTKVNNDGLTIVGGPSVTKSGI
DAGDKKITKLADGEISATSKDAVNGSQLYTLQQAAVAAKTEVKAGDNVEVKKESGGNGQD
IYTVSAKDTSASVTAGSDAITVNKADPKKVGTVDVTDYKVDLSQATKDNIQKGVDAKDIV
DNKGLTFAGDNNSSTEVQKLGSTVNVNGDSNITTQASGNTVKVTLNPNVTVESLTATNSV
NVGSGGAQVALTTNVGKDGVRELSVGSANAPTRITNVAPGVDATDAVNMNQLKDFGYNLG
NKIDKVGDEANAGVSSAMAMAALPQAYIPGKSMATGGMATYNGQGAVAVGISKLSDNGRW
VLKISGSADTEGNVGGAVGAGFHF
NT seq
8715 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcatatttataaagttatctttaacaaggctacaggcacttttatggcggttgct
gagtatgctcgaggtcaaggtaaaaaagcaaatagagtcaaatcagaaggcgtcaaatca
gtatactttacgtttactgcactagcttctagctttgtactgatgaatagtgcagtagca
gcaattggcgatacgctaccaaccactgtcacaacagatgctaatggcacgacagccttt
aattactgctactatgatgtgacaagcaaaacagtgatttgcggtgacgcgacaaccact
tctgcaacaggtgtaacaggctcagtgatactaggtgctggcgctaaatctatcacaaat
aacgctgtggccatcgggaacaatgcgatttcttcatcgccaaatgatatctccattggt
aatggcgctaacgccattgctggtgacggggtagcgattggtaccaatgctaaggttaat
atcggtacttctggggttgtttctgcggcacgcggtatcgcaattggtctcgattcaaat
gcacaggttgccagttctattgcaatggggaatggtgcaacaacgacgggtactggtaat
attgctaattcaatcgctattggtacaggagcgcgaacttacggcacaaactcgattgct
ataggtgtgggcactgggcaaaatgcgacacaacccaacaatgtagcggttggcatcaat
tcagggcaaaatgtcacagctggtgatacggtagccaactcaggtacagcggttggtggt
tcaaccaatgtagcactaggcgttaccagcggtaacaacgtggcaggcaatggtaactta
gctgtgggcaccaatgctggtaatagagttaaggtgcttggcgcttccgtaacattgcca
gatggcacggtacaagacacgggacctagctcactgtattgcttattcccacctttttac
tgtaacggcggttcaggtaacggcggtaacaataccgctattggtccagcagcggcaaat
gatgtcagtggcgctcaaaatattggtttaggatttagagccggtagttttaccacaggt
aacaataacttatccattgggcaattagctggatttcaaacgaatggttcgggtaatgtt
ggtgttggttcatttgcaagctcttcgatgattggtcatcaaaactctgcagtaggtaat
gccagcggtagcaatataataggtagctataacagtacgctaggtgtcaattcaggtcaa
aatgtgaagggtgaaagtaacatcggtatcggcaatgcaactggtcagtttgtaagcggt
aatgaaaatattgcgattggtaaaaatgccggcaaaggcgctactggcgcaccaatcgtg
gtgaatcgctcagttgctggcggtagccaagccatggcctacggtgatgattcgattgct
atgggtactggtgctatcgcagggatagtaggtgctaacactacccaagtcaacgcaatt
gccattggtaaaggcgcacaagcgactggtaagcagtcgatctctgtcggtacgggtaat
gtcgtcagcggtgataactcaggtgcatttggtgatccgaccaccatcagcggcacaggc
tcatacagcaccggtaacaacaataccatcaccaccaatgatacatttgtcgtaggtagt
aatgtcaccaaaacgctagacaactcagtattcctaggtaaagatgctgcgtacaccgcc
aaaggtgcttctacagacggcgtagaaaaagtccctgatgccaaagttggcggtatcacc
tatgctggcacaagctttgctggtcaaacaccggtgggcgtggtgactgttggtgatgtc
ggcaaagagcgtcgcatccaaaatgtggcagcaggtaagattgctgcgaccagtacagat
gcgattaatggtagccagctgtatgcagtggctagcaagcttggtgagcaagttgagaat
acttatttccatgtgaataccggcaccaatgcaggtacaggcgatgcaacgaccaactta
ggtaagatcacagatgcagctggtgcacaagcgacaggtgcgttaaccgcaggtatcaat
accatcgcaaccggcaaatcgtctgtttctatcggtcataaggcacaggcaaaagctgat
aatgacatcgccatcggtaacctagcgggttcgggtcgtggtgacaagggcagtgacttt
accgcaggtacgacatttgccgcagggacggtttattctggtggaaccacgcagacagtt
acatctatcgctaccaattccggtatctccatcggtcaaaattcaggtacaaactcaacg
ggcgtgaataacaccatgatcggtactgctgccggtgagcagctgtttggtgataacacc
gtgaccatcggtaccaatgctaataactaccgtgtcaatggcttctcaaacggtcaggtc
aataccaacaataacaccgtagatgctctgtcaggcaacactaaaaacgccgccaatgcc
gtaaaccgcagccgtaaatcggtagctatcggtaacaatgccatgacttatgatgacagc
aacatcgccatcggtgatggtgccaaatcattgggcgcaagcagtatcgccatgggtaca
ggtgcgcgtgccggtatggcgtatgcgaccgtaggcggtgtcgctcgtggtgatggcggc
tcgatcgccatcggtaagaactcggtcgctccactcgaaggcgatctgtctatcggtgtc
aataccggtagccgtgtcaaccaaaatacgatcccagcccaccaaatgacaaccaccaga
aacatcagcgtcggctatgatgtgggcggtaatgtctatggctataccaacacagtgatc
ggtaccagttcaggcagcaatatcggtactgccgctgtgccaaactacgccaatgtcgcc
atcggtgatcaggtcggtaaaggtatccgtggtaataacaatgtcaatatcggctaccaa
ggcggtaacaatattaccagtaactcaaataccagtattggcactcgttcaggctcacat
gtcagcggtgctaataacgtaaccaccggtactttctctggtaactatgtcagcggtacc
gacaactgggcagctggtgtggagtctggtacgcatgtgggtgtgctaagcaatgcttct
agtttgaatatcaacgacaatcagttttatgcaggtagcacccaattagtcaaacgcagc
gccactgccaacgtggcggcaggtaaaaacgctggtcaatatatcaacggcagtagaaat
atcgcctttggtcaaaatgctggtcagtatgtcggccataaaggcacaacatttggtgcg
gtcagtaataacaacatcgccatgggcgaaaaagccggtcaatatatcgaaggtagcgat
aactttgccgtaggcttggaagcaggtcgtggcacaggcactgatgcgacattgacccgt
catcgttcaatcagccaaggctttaaagcgaatgcctataccaatgacagtattgccatc
ggtagcaactctgtagcaggtgtgcagtctgctaatggtgcaggcaaaatcaatgccatc
gctatcggtactggcgcacaagcgactggtaagcagtcgatctctatcggtacccaaaac
cgtgtaacagcagacaacgctggtgccatcggtgacccatcaatcgttagcggtgcaggt
tcttatactttaggtaatgacaatgccgtcggcagtacatcaaccaatgtcggtgccttt
ggtaacaacaaccaaatcggtgcaactgcaaattatgatgcgaacggtaagttaattgca
ttgaatggtttagctgatactgctgcagtagaaaattctcgtgctgtgggtaacaaaaac
tatatcaacacctctaacacctatgtattaggtagcggtgtgggtactaaagataacggt
actgtgctagatacagtagcaaattctgtttatttaggtaatgacagtactgttgctaaa
ggcgcagcagtaggcaccaaaaaccttgacaaagaaggtgttgcaggtacaacaacaacc
gctggtgatgcaggtactgtagaaacagctacagtaaacggtgtgacttatggtagcttt
gctggtaaaacagcagcaggtgcggtatctgtgggttctgcaggtcttgagcgtcgtgtg
atgaatgtggcagcaggcgaaatctctgctacttcaaccgatgccatcaatggtagccag
ttgtatgcgactaatgccaaactgggcaatgtggccaataccgtggtggaaaacttcggt
ggtaatgccactttggatgcagatggcaacattacatacactaatatcggcaataccggt
aaagacaatatccatgatgcgattcaggccgctaccacagtagtgaaagcgggtactaat
gttgttgtggatgaagcgaccaatgcaactactggtcaaaaagaatacaccgtcaatgcg
tgggatacgactgtatcggctgctgcagacagtgctgttactgtaacaccaaccattgat
gataccaaccgtacccgtgcgtatgaagtgacggtaaataccgacggcaataccattaaa
gtagaaaatggccagctgaccgcgaataccacacctttagccactaccgacggtaaggtt
gatgctcctgccaatgcagatgcactggcaactgcaggtgacatcgctaatgcgattaac
aactctggttggaaagcaacatcaggtgcaacaggttcaggtgttgttgatggcacgaca
gaagagctaatcaacccatctgaaacagtaacattccaagctggcgataacatggttcta
aaccaagctgaaaatgtattcacttacagcttgaataaagacatcaacatcaacagcgta
cagttcaacgatggtcctaagatcaccaacgatggcgacaacatcaaggttggtgataaa
gacggtaatgccacgaagatcaccaatgtagccgcaggtacagacgacacagatgctgta
aacatgagccagttggaaaaagctcaagcagctgcaaccaccaaggttgaagaagctgac
ggcatcaatgtagaagctacaccaaatgctgacggttcaaccacttacaccgtatctgct
aagactgatggtactactacgaagattgatgacaacggcaacatcgcagctgtcaccacc
acctttaaaccatctaccgatggcaaagtgggtgcacctgttgacaatggtgattcacta
gtaacggcaaatactgtcgctgacgctattaacaactctggttggaaagcaacatcaggt
gcaacaggttcaggtgttgttgatggcacgacagtagagctaatcaacccatctgaaaca
gtaacattccaagctggcgataacatggttctaaaccaagctgaaaatgtattcacttac
agcttgaataaagacatcaacatcaacagcgtacagttcaacgatggtcctaagatcacc
aacgatggcgacaacatcaaggttggtgataaagacggtaatgccacgaagatcaccaat
gtagccgcaggcgtcgatgcgactgatgcagtcaatgtcagccagttgaaaggtgcagta
gatgcactgggtggcggagcagctatcaacactgatggtactatcaaagcaccaacttat
aacattaccaaccctgctaatggtacagtgacggcagccaacaatgttggtgatgcgtta
aaaggcttaaatgatgcggtaaatagcccattgactttcaaaggcgacagtggcgaattt
aaccgcaatttaggtcaaaccactaccgttaaaggtggcatcactgatacggctaaattg
tctgacaataacattggtgttgtggctaaagatggtactttagatatcaaattggcgaaa
gatattgctgtggatagtgtgaaaacaggcgatactacagtgaatacctatggtgtttct
attgccaatgctgatccaaacaaagtggtaagtttaactgccagcggtttaaataacggc
aataaccgtatcacaaatgtggcggcaggtcaggcaggaacagatgcagttaataaagac
caattagacaaagctcaagcagctgcaaccaccaaggttgaagaagctgacggcatcaaa
gtagtacctacaacaaatgctgacgattcaaccacttacaccgtatctgctaagactgat
ggtactactacgaagattgatggcaacggcaacatcgcagctgtcaccaccacctttaca
ccatctaccgatggcaaagtgggtgcacctgttggcaatggtgattcactagtaacggca
aatactgtcgctgacgctattaacaactctggttggaaagcaacatcaggtgcaacaggt
tcaggtgttgttgatggcacgacagaagagctaatcaacccatctgaaacagtaacattc
cgagctggcgataacatggttctaaaccaagctgaaaatgtattcacttacagcttgaat
aaagacatcaacatcaacagcgtacagttcaacgatggtcctaagatcaccaacgatggc
gacaacatcaaggttggtgataaagacggtaatgccacgaagatcaccaatgtaaaagca
ggtgaagctgatactgatgctgtgaatgtcagccagttgaaagaagctgctaataaccta
gtgaccactggctttaatattgctgacggtaaaggtggtaatgacaatgttaaacttggt
gagactgtaacgtttacagatccagcaggtaacatcatcactactgtaactgacaacaaa
gttgagttcggtctaaacagcaccctaagcgtaggtaaagatggcgaacctggcaaagtt
ggcatcaaaggtgctgacggcaaagacgctattagcctaaatggtgaagacggtactatc
ggtctaaaaggtgctgacggtaaagacggcatcagcctaaatggtaaagacggtaccatc
ggcatcaacggtaaagacggtgctaacgcaacgctaacagttgaaaaagccaaacctgcc
ctagatggcaaagacggtcaaaacggtgaagacggtcaaactcgcattgtttacaccaag
ccaaacggttctaaggaagaagttgctaccttgaatgacggtctaaacttcaaagcagac
gatggcagcatcgtagcgaagaagcttaatgaaactctagagatcgtaggcggtgcagac
aaagacaaattgacagacaacaacatcggcgtgaacaacaaagatggtaagttgactgta
cagttggctaaagacctaaaaggcattgatagcatcacagttaacaatggccctgttatc
agcggcaacggtattgacatgaaaggtgataagatcactaatgtcaaagctggtaccgaa
gataatgacgcagtgaacgtaagtcaattgaaagcagttgaagcaacagcaaatcaaggt
tggaatttgactactaatggtaaagctgatagtaaatcaaatgtaaaacctggtgatact
gtcgactttgcgaatactgatcgcaatgtgaagattgaaaacactggcaacaatgttacc
gtcaatctaaacaaagacatcgacttgactaaagacggctctgtaaccattggcgataca
aaagtcaataatgatggtttaaccatcgttggtggcccaagtgttactaagtctggtatc
gatgctggtgataagaaaatcaccaaacttgctgatggtgaaatctcagctaccagcaaa
gatgcggtgaacggcagccagttgtacactttacaacaagcggctgttgcggcgaagact
gaagttaaggcaggtgataatgttgaggttaagaaagagtcaggaggtaatggtcaagac
atctatacagtaagtgcaaaagatacttcagcaagtgtaaccgctggctctgatgcgatc
actgtaaataaagcagatcctaagaaggtaggtactgttgatgttactgactataaagtt
gacttatctcaagcaactaaagacaatatccaaaaaggagttgatgctaaagacatcgtg
gataacaagggtctgaccttcgctggtgacaataacagctctacagaggttcaaaaacta
ggtagtaccgtaaatgttaacggtgatagcaacattaccacacaagcatcaggcaatact
gtaaaagttacactaaacccaaatgtaacagtagagagcctaacagcaactaattctgtt
aatgtgggttctggtggtgctcaagttgccctaactaccaatgttggcaaagatggtgtg
cgagagctgagtgtgggtagtgcaaatgctccgactcgaatcaccaacgtcgccccaggc
gtcgatgcgactgatgcagtaaatatgaatcaacttaaggattttggctataaccttggt
aataagattgataaagttggtgatgaagccaacgctggtgtgtcatcagcaatggctatg
gcagctttaccgcaagcttacatccctggtaagagcatggcaacaggtggtatggctact
tataacggacaaggagcagtagctgttggtatatctaaactgtctgataacggtcgctgg
gtactaaaaatcagtggtagtgcggatactgaaggtaatgtaggtggtgcagtgggtgca
ggtttccacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system