Methyloradius palustris: ZMTM_18560
Help
Entry
ZMTM_18560 CDS
T07445
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mpau
Methyloradius palustris
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HCBP_related
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCM25597
UniProt:
A0A8D5G9H8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2008257..2015501)
Genome browser
AA seq
2414 aa
AA seq
DB search
MSYLKLAEEVVEAADQAKSLDDFLKTVTDSAGQEQAIDALKAFMGAAATGLAGLAGAPLI
PAIGIGLILGYGAEYVIDHLPTPRTMTDEEFWAEWQMNRNLRLGNYGINAGVSTAFKKFS
NFPQRSDPFTLDLNGNGVETTGISNTNPILFDVDADGIKTSTGWVAPSDGLLVMDRNGNG
YIDNGRELFGDATLKSNGQLAADGFDAIADQDTNQDGIVSSLDDNWDNLLVWRDLNQDGI
SQANELTSLNTLGIASINVTSVEHNTLLNNGNVLADLGTFTYSDGTSGTAGTAANLADVN
LVQDTFNSEFTDHIPLTTQAATLPDLQGSGQVRDLREAASLSPSLAALLTQFASATRAEQ
HILIDAILKAWSDTSTMATTFTGAYAGHNLTVDMQTWYTGIITGSADYQAMVDKLTIMEH
FNGRTYQPIPTGTDDVTLTLWHNAQYLLNQSYDELKNSVFNSLHISGVYDTLVKPMLDKI
GLVISDTGFSLDFSELNADFNARIALNPSDGILDLIDFYSATKSDLRGSGWQGQQMILDF
LTTHTLTSEIGIAASNAGLFLRGYTAWNDGNGSTGDDYIRGNDQPNTISGASGNDTIIGG
NGYDSLDGGDGNDIISGGGYNDNLNGGDGDDTLIGGVGNDYLVGGNGNDTYRFSLGDGQD
YIDNTVNSIVHQDTIQFTNVDSASLTSLTRSGNNLIINYGTSDSITLWNRFYVSNVGASF
DQFIFSDGAYFTLPQLYGAYAINLTSDSDNVSFDTFAVEPHFTYTANMHILAGAGNDTVS
SGVGNDTLEGGDGNDSLTSGNGNDLLVGGAGADTLNGGIGIDTASYLTSTAGVQVNLLTG
ASHGGDAEGDYLVGIENLIGSSNSDVLTGNAGNNLLDGQAGADTLTGGAGDDTYIVDDLG
DVVIENVNEGIDTIKASISYTLGDYVENLTLTGSTANNATGNALSNIIQGNAANNIILGN
GGNDTLIGGAGDDTYIVDDLGDVVIENAYEGIDIIKTSVSYTLGDYVENLTLTGSTAINA
TGNALSNIIQGNAANNIILGNGGNDTLIGGAGDDFLDGGTGSDTYVFSKGDGVDVISSSD
SSDKISFLDVGVNELTSLDQIGNDLVIKYGDSDVLTIQSYFSSPDNSIMSFWFSDQALRF
SQPPTLSDLRATFLLTDGGTNTGPILGTSNDDYLGGAYYAAEIRGLGGNDTLSGGSYNGV
KFNDTLVGGIGNDELWGGGGDDTYVFNLGDGQDSINNSGDVASTTRGILKFGSGILSSQI
SLSVSNYDLTFAIDGTSDQVTIMGWTAGSLFQIREIQFDDGTNWNAEYINSMIHAGNDTL
TSSSYSPSDYINGYAGDDALYGQGGNDTLEGGIGNDYLSGKGGSDTYLFGLGDGQDTINN
YDDSATASTSVDTLKFAAGISTSDISFSINGTDLVLSIANTTDQITIQNWTVSQSYHIQQ
IEFANGSIWDAAAIEDFVANIGDSGGGDGGTGGGSGSTTVVNGTEGDDYISAFTTDAQLI
SGLAGNDTIFGSLGQDTLEGNAGNDYLSGGGASDTYLFNLGDGQDTISNYDDLATTSIDT
LKFGTGIAASDVTVGVSGDDLILSIGASTDQVILQSWNIDQKYRHQQVVFADGTTWDSTY
LSNEYLIAKLSGDDYLSPYSTDDQILKGFAGNDTIFGSLGNDTLEGGIGNDYLNGQTGSD
TYIFNLGDGQDIINNYDDSATDSLKFGTGISESDITIGLSGSDLILSIANTTDQITIQNW
GYGQDYRLDQVEFADGTSWDSAYLNDQYLRVKLSGDDYLSLDTTDDQLLKGFTGNDTIYG
SLGNDTLEGGIGNDYLGGQGGSDTYLFGLGDGQDTINNYDDSSTATTSVDTLKFGAGIST
SDISFTINGSDLILSIANTTDQITIQNWTVSQSYKLQQIEFANGSIWDAVAIEGLVAGGG
DGGGGDPGDGGNGGDGGGAGNGNVINGTEDSDYFTAIDDNPAYLKGLGGDDTIIGYTGND
TLEGGAGNDFLMGQTGNDTYKFNLGDGQDIIGDYDATPGNIDTLHFGAGINASDISFTLQ
GVDLVLGISGTDDQVKIADWGYGQDHYIENVQFADGTVWDNGYLNTQYLQALLSGDDYLT
APDDQDALVRGFAGNDTLWGFAGNDTLEGGTGNDYLAGQVGNDLYRFNIGDGQDTIGEYD
STPGNTDTLSFGENISSSDIIFSTQGSDLILGISGTSDQVTLLNWSYGSDYRIETVQFNN
GTVWDADYLNTEYLKSSLSGDDYLTPPDNQDALLRGFAGNDTIWSFDGNDTLAGGTGNDF
LAGQLGNDTYIFNAGDGQDTVYDWDQNSDPSNVDTLKFGAGIGYDQLWFTQSDNNLEISV
IGTTDKTIIQDWYSGSSYHVEEIATADGNHTLIDTQVQNLVNAMAGLTPPAAGQTSLPPA
YQAQLAPVLAANWS
NT seq
7245 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagctatctaaaattggctgaagaagttgttgaggcagcagatcaggcaaaaagcctc
gatgattttctaaaaacggtaaccgactctgctggccaagagcaggcgattgacgcatta
aaggcttttatgggtgccgccgctacgggattggcaggtcttgcaggcgcacctttaatt
cccgcaataggtattggccttattcttgggtatggggcggagtatgttattgaccattta
ccaacaccaaggaccatgacagatgaagagttttgggccgagtggcaaatgaatagaaat
ttaaggcttggtaattatggaattaatgctggtgtatcaaccgctttcaaaaaatttagc
aattttcctcagcgcagtgacccctttactttagatctcaatggcaacggtgtagaaacg
acaggcatctctaataccaatccgattctctttgatgtagatgcagacggtataaaaact
agtactggttgggtcgcacctagtgatgggctgttagtgatggacagaaacggaaacggt
tacatagacaatggacgtgaactttttggtgatgcaacccttaaaagcaacggtcaactt
gctgcggacggctttgatgctatcgccgaccaggataccaaccaagatggaatagtcagc
agtctcgatgataactgggataacctcctagtctggcgagacctcaatcaggacggcatc
agccaggcgaacgaactcactagcctaaatactcttggtattgccagcatcaatgtcact
agtgtggaacataacaccctgctaaataatggcaacgtgctcgccgaccttggcaccttt
acttacagcgacggtactagcggtaccgcaggcaccgctgccaacttggctgacgttaat
cttgtgcaagatacatttaattcggaatttacggaccatatccctctcacaacacaggca
gcaaccttgcccgacctgcaaggcagtgggcaagtacgcgatctacgagaagccgcaagc
ctctcacctagccttgcagccttattgacccaatttgctagcgccaccagagcagaacag
catatactcatcgatgctattctcaaggcttggtcagataccagcaccatggccactact
ttcactggcgcatatgctggacataaccttactgtcgatatgcaaacttggtacaccgga
attattactggtagtgcagattatcaggccatggttgacaagctcaccatcatggaacat
tttaatggtagaacttaccaaccaattccgacaggcacggatgatgtcacattaactctt
tggcataacgcacaatacttattgaatcagagttacgatgagttaaagaattcagtcttt
aatagcctccatatatcgggtgtctatgacactttagttaagcctatgctagataaaatt
ggtctagtaatctccgatacaggtttttcattagatttcagcgaattaaatgccgatttc
aatgctcgcattgcattaaatcctagtgatggaatccttgatttgatagatttttacagt
gcaacaaagtccgatttgcgtgggagtggttggcagggtcagcagatgatattggacttt
ttaacaactcacacacttacttcagaaattggtatcgctgcctcaaatgctggacttttc
ttaagaggctataccgcatggaacgatggcaatggaagtacaggtgatgattatattagg
ggtaatgatcagcccaatacaatttctggtgcctcaggtaacgatacgatcataggtgga
aacggatatgactctttagatggtggtgatggtaatgatattatttctggcggtggttat
aacgacaatctaaatggaggtgacggcgatgacacacttattggtggcgttggtaatgat
tatttagtcggtggtaatggcaatgatacctatcggtttagtctcggcgatgggcaagat
tatatagacaatactgttaatagtatcgtacatcaggataccatccagttcactaatgtg
gactcggcaagcttgacctcattaacacgctcaggaaataacttaataatcaattatggt
acgagtgacagtatcactttgtggaaccgcttttacgtatcaaatgtaggtgcaagcttt
gatcaattcatctttagtgatggcgcatattttacattgccgcagttgtacggcgcatat
gcaatcaatttgacctctgattctgataatgtaagtttcgatacctttgcagtagagcct
catttcacctacaccgccaacatgcatattctggctggggcgggtaatgatactgtctcg
agtggtgtaggtaacgatacgttagaaggtggggatggtaacgacagtctgactagcggc
aatggcaacgatctattagtcggaggtgctggtgctgatactttaaacggtgggataggc
atagacacggcaagttatctaacttcaactgctggagttcaggtaaatctcctaacagga
gctagtcatggtggggatgccgagggcgattaccttgttggcatagagaatctgattggt
tccagcaatagtgatgtattgacaggaaatgctggcaataatctgcttgatggtcaggct
ggtgcagatactctgactggtggtgctggtgacgacacttatatcgtagatgaccttggc
gatgtggtgattgagaatgttaatgaaggcatcgatactataaaagcgagtatcagctat
accctcggtgattacgtagagaaccttaccttgactggcagcactgctaataatgctacc
ggcaacgcgctgagcaatatcattcagggaaatgccgctaataatattattctgggaaat
ggcgggaatgacaccttgattggtggtgctggtgacgacacttatatcgtagatgacctt
ggcgatgtcgtaattgagaatgcctatgaaggcatcgatattatcaaaacgagtgtcagc
tataccctcggtgattacgtagagaaccttaccttgactggcagcactgctataaatgct
actggtaacgcgctgagcaatatcattcagggaaatgccgctaataatattattttggga
aatggcgggaatgacaccttgattggtggtgctggtgacgactttctcgatggcggaact
ggtagcgacacctacgtcttctctaagggagatggtgtcgatgtgatttccagttctgac
tcctcagataaaatttcgtttcttgatgtcggtgttaacgaactgacaagtcttgaccaa
attggtaatgatttggtcataaagtacggggatagcgacgttctcactatccagtcatat
ttttcttctccagataattcaattatgagtttctggttttctgatcaggctttgcgtttt
agtcagccaccaactctcagcgatctgcgagctacatttctgctgacagatggaggaacc
aacacgggcccaatactgggaacatcgaatgatgactatttgggtggggcttattatgct
gccgagataagaggccttggaggtaatgatacgcttagcggtggatcctataatggagta
aagttcaacgatactttagttggtggaattggaaacgatgagttatggggcggcggtgga
gatgatacctatgtgttcaatctcggagatggacaagacagcatcaataattcaggggat
gttgcatctacgactcgtggcatcctgaagttcggttcaggtattttatcttcccagata
tcgttgagtgtcagcaattatgatttaacatttgcaatagacggtacctctgaccaagtc
accattatggggtggacggcaggcagtttattccagatcagagaaattcaatttgatgac
ggtacgaactggaatgctgaatacatcaattcaatgattcatgcagggaatgatacctta
acatccagttcttacagtccttctgattatattaatggttatgctggggatgatgctctt
tacggacagggcggcaacgacaccttagaaggtggaataggtaatgattatctgagcggc
aaaggtggtagcgatacttatctgttcggccttggagatggccaggacactatcaacaat
tatgacgattcagcaacagcatccacgtcagttgatacattgaagtttgctgcaggtatt
tcaaccagcgatatcagtttcagtatcaatggcactgaccttgtcctgagtatagccaac
acgaccgatcagatcacgatccagaactggactgtgagccagagttatcatattcagcag
atagagtttgcgaatggcagtatttgggatgcagctgcaattgaagatttcgtggctaac
attggtgattccggaggaggcgatggtggtactggcggtggttcaggcagtaccacagtg
gttaatggtactgaaggcgatgattatatttctgcttttacaaccgatgcccaattaatc
agtggccttgcaggtaatgacacaatattcgggtctctgggtcaagataccttggaaggg
aatgcagggaatgactacctttcaggtggcggcgccagcgatacatacctattcaatcta
ggtgacggtcaggatactatcagtaattatgatgacttagctactacatcaatagacaca
ttaaaattcggcacaggcattgcagctagtgatgtaactgtcggcgttagtggtgatgat
cttatattgagtataggagcttcaaccgatcaggtcatattacagagctggaatattgac
caaaaatatcgtcatcagcaagtcgtgtttgctgatgggacgacatgggacagcacatat
ctgagtaatgaatatctgatagccaagttatctggtgacgattacttatctccatattca
acggatgatcagatacttaaaggctttgccggaaatgacaccattttcggatctttaggt
aacgatactctggaaggggggatcggcaacgattatctgaatgggcaaactggtagtgac
acatacatattcaatctaggcgatggccaggacattattaacaactatgatgattcagct
actgactcattgaagtttggtacaggtatatcggaaagtgatatcactattggtcttagc
ggcagtgatttgatcttgagtatagctaacacaactgatcagattacaatccagaactgg
ggttatggacaagactatcgtcttgatcaggtcgaatttgcagatggaacttcatgggac
agtgcatatttgaatgaccaatacctaagagtcaaattatctggtgatgactatttatct
ttagatacaacggatgatcagctgctcaaaggttttactggaaatgacaccatctacggt
tcactaggcaatgacaccttggaaggtggaataggtaatgattatctgggcggacaaggt
ggtagcgatacttatctgttcggccttggagatggccaggacactatcaacaattatgac
gattcaagtaccgcaactacgtcagttgatacattgaaatttggtgcaggcatttcaacc
agcgatatcagtttcactatcaatggcagcgatcttattctaagtatagccaacacgact
gatcagatcacgatccaaaactggacagttagccagagttacaagcttcagcagattgag
tttgcaaatgggagtatctgggacgcggtagctattgaaggtcttgtagccggaggtggt
gatggcggtggaggtgaccctggagatggtggcaatggtggagacgggggcggagcaggt
aacggcaacgtcattaacggtactgaagacagtgattacttcacagccattgacgacaat
cctgcctacctgaaaggcctgggtggcgacgataccatcataggttataccggtaacgat
actcttgaaggcggagcaggcaacgacttccttatgggtcaaacaggtaacgatacctac
aagtttaatctgggggatggccaagacatcattggtgattacgatgctacccctggaaat
attgacaccttgcatttcggtgcagggattaatgcctcagatataagctttacattacaa
ggggtggatctggttctgggaatcagcggaacagatgaccaggtaaaaatcgcagactgg
ggttatggtcaggatcactatattgagaatgtccagtttgctgatgggactgtttgggat
aatggttatttgaatacccagtatctccaggccctgttatctggtgatgactatttgact
gcccctgacgaccaagatgctttggtcaggggctttgcaggtaatgatactctatggggc
tttgctggtaacgataccttggaaggtggtacgggcaacgactatctggctggacaggtt
ggtaatgatttgtaccgatttaatatcggtgatggccaagacactatcggagagtatgac
tcaaccccgggcaatactgataccctaagttttggggaaaacatctcttcatccgatatt
atctttagcacgcaaggcagcgatctgattcttggaatatcaggaaccagtgatcaggtg
actctactcaactggagctatggttcagattatcgcattgagactgtacagtttaataac
ggtacagtctgggatgctgattacttgaacactgagtatcttaaatcctctttatctggc
gatgattacctcactcctccagataatcaggatgccctgctcagagggtttgctggcaat
gatacgatatggtcctttgatggaaacgataccttggcaggcggtacagggaatgatttc
cttgctggccaactaggtaatgatacatatattttcaacgctggtgatggtcaggatacg
gtatatgactgggaccagaattctgatcctagtaatgtagatacgctgaaatttggtgct
ggcattggttatgaccagctatggtttacccagtcagacaacaatcttgagatcagtgtt
attggtactaccgataaaacgatcattcaggattggtatagcggttcttcctatcatgta
gaagagattgctacagcagatggtaatcacaccctgattgatacgcaggtacagaacctg
gttaatgcgatggctggcttaactccgccagcagcgggccagacctcattgccacctgca
tatcaggctcaattggcgcctgtgctggcagcaaactggtcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system