Marinomonas posidonica: Mar181_0509
Help
Entry
Mar181_0509 CDS
T01508
Name
(GenBank) O-antigen polymerase
KO
K02847
O-antigen ligase [EC:
2.4.99.26
]
Organism
mpc
Marinomonas posidonica
Pathway
mpc00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
mpc01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mpc00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
Mar181_0509
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
mpc01005
]
Mar181_0509
Enzymes [BR:
mpc01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.26 O-antigen ligase
Mar181_0509
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
mpc01005
]
Core region
Mar181_0509
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Wzy_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEF53570
UniProt:
F6CZQ9
LinkDB
All DBs
Position
553667..554917
Genome browser
AA seq
416 aa
AA seq
DB search
MLDKLFHFCVWFLAALTFAISLSYPSGYNIGATLIFLLGMIFLFVRDPKSDVDKSDVQLI
FTFAVYGLLMFFFVYLDGFHIRELDRPSRFILVLPIALLLMRLNGPREWMFYGVVIGAIS
AAILGVYERMYLGLGRAHGNEHPIMFGNIAMMLGMLSFVCALYFYSKKSIVWTVLSSLGC
VCGVAASVMSASRGGWVALPLVGLFLLWNSRFLLGKKRLLKIALSILVAFFTVYFVPQTG
VEGRINQALNDITRYDQGIDKNSSVGLRFEMWKGAIKMFEASPMVGVGEYGSYSFKQGLI
RDGVVSEKVLMFSHAHNEYLNSLGLTGILGFIALMLVYLVPLKLFLGKMKEHQDDWNIRS
YAMAGALVPMCYMDFALSQSMFSHSIGVMMYAFPIVYFWAALRWAERESLAKASVA
NT seq
1251 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctagataagctttttcatttttgtgtttggttcttggctgctttgacttttgccatt
tctcttagctatccatcgggttataacataggcgctactttaatcttcttactagggatg
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atgttcagtcatagtataggtgtgatgatgtacgcttttcctattgtttatttctgggca
gccttgcgttgggcagagcgggaaagtttagctaaagcttctgtggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
