Mannheimia pernigra 17CN0883: HV560_01765
Help
Entry
HV560_01765 CDS
T07233
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
mpeg
Mannheimia pernigra 17CN0883
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mpeg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mpeg02000
]
HV560_01765
Transporters [BR:
mpeg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HV560_01765
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLB41659
LinkDB
All DBs
Position
complement(360051..362600)
Genome browser
AA seq
849 aa
AA seq
DB search
MQKFHFKKSLFAVAVSSCCQFAYAEKEALLDEVVVSSSVVPDFQSLAFTQGRKASDVTIE
GKVFKSRSATLGNALAGELGVHSNPFGGGASAPVIRGQDGVRIKLLQNGSDIVDMSNISP
DHTVVVDTLLAQQVDLVRGTSTLMYGMASPAGVVNIIDKRIPTYRPEKGYEGEVISRFDT
ASKERLLNAGVTLSAGENFLIRAEGLTRKSGNYHVPEVYIGRKLNYLPDSHNKSNVGTFG
ASWIGSRGYLGASVSYRQDHYGIPGHNHAFDYCSGHLFDASNLNAVTSGGDAPYLNAYPH
LMTDKDVNDSLHFHCGTDLNGGAHSHSNVYGHQHDVSSAGPVIDMRSKRYDLRGEMKDPF
PGISKLKLSLTYADYYHDEKHDGKAHITSGDTGAIKESKKYTAARMAGKPEAFYFNRGFN
SRLEFYHQPTEYSNGVLGIQYQTQKSSSSRLSTSADKDDKDLSGERKESERNPLVVNTNK
QLSLFILEQVAIGNFIFEAGARWEKQSIPISYNKEKLRLNDRARQPDLSIYKENALSYSG
TIMWDFHPDYRLSVTGSHNERMPAPMELYYHGKHLATNSFEYGNRDLKKERSNNAEVGLI
HFSDKWDFKVSAYYQRFKNYIHNENLHREGNLFMRRYNQSQAKFHGFEGEIGYQVTEKHK
ISLFGDYVNGRLFGFKTFYGNKKYAKNCFINEWDEEECDYTQVGVETLERPNRNAARVPP
MRLGFRLKSQFNQNWSGSFEYTRMFAQKRVSINSVIKPIAQEEAEKRREASGGLGYDGYY
VEKVPEDVTKGYHLVNIAVNYQRKISDIEYSATLNINNLLNQKVYIHNSYLPYVPQMGRN
FILNLGVSF
NT seq
2550 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagaagtttcattttaaaaagagtttatttgcggttgcggtatcaagttgttgtcag
tttgcgtatgcggaaaaagaggctttgcttgatgaagttgtggtctcttccagcgtggta
cctgatttccaatcccttgcttttacgcaaggccgtaaagctagtgatgtgacaattgag
gggaaagtatttaaatctcgctctgccacattaggtaatgctctagctggagagttaggc
gttcactctaatccatttggtggcggagcaagtgcccctgtcattcgtggacaagatggt
gtgagaataaaattgttacaaaatggatcggatattgttgatatgtcgaatatttcgcca
gatcatactgtggtggtagatactcttttggcacagcaggtagatttagtacgaggtact
tcaactcttatgtatggtatggcttctcctgcgggtgtagtgaatattattgataaacga
attcctacctatcgtcctgaaaaaggctatgagggagaggtgatctcccgttttgatacg
gcaagtaaagagcgtttactaaatgcaggtgtaacgttatctgcgggggagaatttctta
attcgtgcggaaggattgactcggaaatcgggtaactatcatgtgccagaagtctatatt
ggtagaaagctaaactatttaccagatagtcataataaatccaatgtgggtacattcggg
gcaagttggattggtagcagggggtatctaggagcctcagttagttatcggcaggatcat
tacggtattccagggcataatcacgcgtttgattattgctctgggcatttatttgatgct
tcaaatttaaatgcggttacttctggtggtgatgcaccttatttaaatgcttacccacat
ttaatgactgacaaagatgtgaatgattctcttcatttccactgtggaacagatttgaat
ggcggtgcacatagccatagtaatgtttatggacatcagcacgatgttagttctgctggt
ccagttatagatatgcgttctaagcgctacgatcttcgtggcgagatgaaagatccattt
cctggtatcagcaagttgaaattgtctctcacttacgcggattattatcacgatgaaaag
catgatggcaaagcacacataacctcaggtgatactggtgcaataaaagagagtaagaaa
tatactgcagcacggatggcaggtaagccagaagcgttttattttaatcgtggttttaat
agcaggctagaattttaccaccagccaacggagtattcgaatggtgtgcttggcattcag
tatcaaacgcagaaaagcagttcgtctcgtttatcgacgagtgccgataaagatgataaa
gatttaagtggggagcgtaaagaatctgaacgtaatcctttagtggtaaatacgaataaa
cagctgagtttgtttattttagagcaggtggcaatcgggaattttatctttgaggctggt
gcacgttgggaaaaacaatctatcccaattagctacaataaagaaaagctacgattgaat
gatagggctcgccagccagatttgtcgatctataaggaaaatgcactctcttattcaggt
acgattatgtgggattttcatcccgattaccgtttatctgtcacgggttctcataatgaa
agaatgccagcaccaatggagctctattatcatggcaaacatcttgcgaccaactccttt
gaatacggcaatcgagatctgaaaaaagaacgttctaataatgcagaagtgggattaata
cacttctcggacaaatgggattttaaagtgagtgcgtattatcaacgctttaaaaattat
attcacaacgaaaacctacaccgagaaggcaacttgtttatgcgtcgttacaatcaatct
caagccaaattccacggatttgaaggtgaaattggctatcaggtgacagaaaagcacaaa
atttccttgtttggcgactatgtgaatgggagattgttcggttttaaaaccttctatggt
aataaaaagtatgcgaaaaactgctttatcaacgaatgggatgaagaagagtgcgattat
actcaagttggcgtagaaacgcttgagcgccctaaccgtaatgccgcccgtgtaccaccg
atgcggttaggttttcgactcaaaagtcaatttaatcagaactggtcaggctcgttcgaa
tacacccgaatgtttgcacaaaaacgtgtttcaattaacagcgtgattaaaccgattgcc
caagaggaagcggaaaaaagacgtgaggcatcaggtgggcttggttatgacggttactat
gtagaaaaagtgccagaggatgtgactaaaggctaccacttggtgaatatagcggtgaat
tatcaacgtaaaatcagtgatattgaatacagtgcaacgttgaatattaacaacttgtta
aatcagaaagtgtatattcacaactcttatttaccgtatgtgccacaaatgggccgcaac
tttatactgaaccttggcgtttcgttttag
DBGET
integrated database retrieval system