Entry |
|
Symbol |
trmE
|
Name |
(GenBank) tRNA modification GTPase TrmE
|
KO |
K03650 | tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-] |
|
Organism |
mpf Mycoplasma putrefaciens KS1
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:mpf00001]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:mpf03016]
MPUT_0018 (trmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:mpf03016]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
MPUT_0018 (trmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
MPUT_0018 (trmE)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
complement(19839..21203)
|
AA seq |
454 aa
MISLQDTIVAPATNISTQAIALIRVSGDQAFNVVNKLLKPEKQLATKKGIFLRKLYFNNE
LIDEVVLTCFVAPYSFTGENVVEIACHGGILNTNKIINIIIQSGARMALKGEFSQRSFIN
GKIDLIQAEGINNLIHAKNELALKIGVSNMSGANNKAIIQLKDNLLDIISRIQVSIDYPD
YDDVEGSSVEDLTKLLEVINNQINKLLVRSKIAFKNSEGIQTAIVGQTNVGKSSILNTLI
NEDKAIVTDIPGTTRDIVEGQINLENVTLNLIDTAGIRKTDDLVESLGIKKSKDLINQAD
LILFVVNKDNIDDQNNQEIFELLNDKPYILIVNKADQLTEQDKENLLVKYQNIVFTSAKN
QDIDQLLFKINHMFTNEEIKKNDELILIGLNQIALVEQIKNKLSTALDVIKSKMPIDIVN
VDLYDAWNLLNQLIGIEYEDEIIDNIFRKYCLGK |
NT seq |
1365 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgattagtttacaagatacaatagtggctcctgcaacaaatatttcaactcaagcaatt
gctttaattagagttagtggagatcaagcttttaatgtggttaataaacttttaaaacca
gaaaaacaactagctactaaaaaaggaatctttttaagaaagctttattttaataacgaa
ttaattgatgaagttgtgctcacttgttttgttgctccttactcttttactggagaaaat
gttgttgaaattgcttgtcatggcgggattttaaatactaataaaattattaatataatc
attcaatcaggagctagaatggcattaaaaggtgaatttagtcaacgctcttttattaat
ggaaaaattgatttaattcaagcagaaggaattaataatttaattcatgctaaaaatgaa
ctagctttaaaaattggtgtatctaatatgagtggggctaacaataaagctattatccaa
ttaaaagacaatcttttagatattattagtcgaatacaagtgtcaattgattatcctgat
tatgatgatgttgaaggatcaagtgttgaagatttaactaaattgttagaagtaattaac
aatcaaatcaataaattactagttagatctaaaatagcgtttaaaaactcagaaggaatt
caaacagctattgttggtcaaactaatgttggtaaatcatctattttaaatactttaatt
aatgaagataaagcaattgtaactgatatacccggaacaactcgtgatattgttgaaggt
caaattaacttagaaaatgttactttaaacttaattgatactgcaggaattagaaaaact
gatgatttagttgaaagtttaggaatcaaaaaatctaaagatttaattaatcaagctgat
ctaattttatttgttgttaataaagataatattgatgatcaaaataatcaagagattttt
gaattattaaatgataaaccttatattttaatagttaataaagctgatcaattaacagaa
caagacaaagaaaatctgttagttaaatatcaaaacattgtctttacaagtgctaaaaat
caagatattgatcaattattatttaaaattaatcacatgtttacaaatgaagaaattaaa
aaaaatgatgagttaattttaattggattaaaccaaatcgctctagttgaacaaattaaa
aataaactatcaacagcacttgatgttattaagtcaaaaatgccaattgacatagttaat
gttgatttgtatgatgcgtgaaatttgttaaaccaattaattggtattgaatatgaagat
gaaattattgataacatctttagaaagtattgtctaggtaaataa |