Mycoplasma putrefaciens KS1: MPUT_0331
Help
Entry
MPUT_0331 CDS
T01599
Name
(GenBank) DEAD-box ATP-dependent RNA helicase
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
mpf
Mycoplasma putrefaciens KS1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mpf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mpf03019
]
MPUT_0331
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mpf03009
]
MPUT_0331
Enzymes [BR:
mpf01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
MPUT_0331
Messenger RNA biogenesis [BR:
mpf03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
MPUT_0331
Ribosome biogenesis [BR:
mpf03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
MPUT_0331
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
AAA_19
Flavi_DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEM68709
UniProt:
A0A7U3ZSL5
LinkDB
All DBs
Position
375855..377225
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MKFTDFGFKKYINDTLQEIEFIYPTSIQQKVIPLFKKRQNIIALAHTGTGKTHSFLLPIL
NNLDLDLLKTKQHVQAVIITPTRELAKQIYLNIQQFAKLNPKITYAMFIGGEDINKNLEQ
LKKAQPAIVIGTPGRLKELYDQNQLRLTTASYLVIDECDMIFDLGFIEDVDYLISKMNNN
PTIGIFSATINKQLKNFASKYLKNVILIDDSKKQLATKNVRHILIDTKNREIEESLIKII
NSINPFLCLIFVNQKDQIANIVKILHTNKILRVGELHGDLQPRTRMTMLKKIKNHEYKYV
VATDVASRGVDITGVSHVISIDLPKDLNYYIHRSGRTGRNKLTGISYVIYNLKNQEQIKQ
LIKKGINFEVQKLVDDQLVDITSSKPTKKITYQNLDLESKQVINKYQNQKVKPNYRKKRK
QELEKIKQKIRRQHIKENIEKIKKQKYKKRRQELFD
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttactgattttggatttaaaaaatatattaatgatactttacaagaaatagaa
tttatttatcctacttcaattcagcaaaaagtgattcccttatttaaaaaacgtcaaaac
atcattgctttagctcatacaggaactggtaaaactcacagttttttacttccaattcta
aataacttagatctagatcttttaaaaacaaaacaacacgttcaagctgtaattattact
cctactagagaacttgcaaaacaaatctatttgaacattcaacagtttgctaaacttaat
ccgaaaattacttatgcgatgtttattggtggagaagatattaataaaaaccttgaacaa
ctaaaaaaagctcaaccagcaattgtaattggaactcctggtaggttaaaagaattatat
gatcaaaaccaactaagactaactacagcaagttatttggtaattgatgagtgtgatatg
atttttgatttgggatttattgaagatgttgattatttaatttcaaaaatgaacaacaac
ccaacgattggaatttttagtgccacaatcaataaacaactaaaaaacttcgctagtaaa
tacttaaaaaatgtcattttaattgatgatagcaaaaaacaattagcaaccaaaaacgtt
agacacattctaattgatactaaaaatcgtgaaattgaagaaagtctaattaaaatcatt
aattctattaacccatttttatgtctgatctttgttaatcaaaaagatcaaatagctaat
attgttaaaatattacatactaataagattttaagagttggtgagcttcatggtgattta
caaccaagaaccagaatgacaatgcttaaaaaaattaaaaaccatgaatataaatatgta
gttgccactgatgttgctagtcgtggagttgatattactggagttagtcacgtgatctca
attgatcttcctaaagatttaaattattatattcatcgttcaggtcgcactggaagaaac
aaactaactggaatcagttatgtaatctataatttaaaaaatcaagaacaaatcaaacaa
ttaattaaaaaagggattaactttgaagttcaaaaactagttgatgatcaactagttgat
attactagttcaaaacctactaaaaaaataacttatcagaatctagatctagaatcaaaa
caagtaattaataaatatcaaaatcaaaaagttaaaccaaattatcgtaaaaagcgtaaa
caagaacttgaaaagattaaacaaaagattagacgtcaacatattaaagaaaatatcgaa
aagattaaaaaacaaaaatacaaaaaaagaagacaagaattgtttgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
