Metamycoplasma phocicerebrale: DMC14_000645
Help
Entry
DMC14_000645 CDS
T06657
Name
(GenBank) S1 RNA-binding domain-containing protein
KO
K06959
protein Tex
Organism
mphc
Metamycoplasma phocicerebrale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mphc00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99973 Transcription
DMC14_000645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tex_YqgF
HHH_3
Tex_N
Tex_central_region
HHH_9
S1
HHH_7
YqgF
HHH
T2SSK
HHH_6
DUF2096_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZZ65310
UniProt:
A0A3Q9V8W4
LinkDB
All DBs
Position
complement(99432..101585)
Genome browser
AA seq
717 aa
AA seq
DB search
MDISIKNVSKKLNISHDQVQKTLNLLKEGATIPFISRYRKEITGGLDEEQVSKINEYYAY
DVELQKRKEYVMSILEEKKLLDEKTKAKIQNAITKQEVENIYEPFKVGKKTKATEAIALG
LGPLAELILKNKDESFDVFNEAKKYINGDTLKDVDQVIEQTKFIIAQNVSQDIVAREYIK
SQLYNFGTIVTKKKNTEDDKEVFKLYYDFSERVKNIPNHRILAITRAEDKKILSYTIQYN
EKPLIYYLNNKYFINKRTAKITNEAIKDSLDRLIIPSIIREIKTDLFERAEKEAIELFSS
NLESLLLAPATKNKNIMSIDPGYLNGCKIVILDKNGNYLEGFVIYPHIGNKEKFIQAVKK
THDMLNKYPIDLIVIGNGTASRETEEWVDKLLKVRREKGYNVDTKYAIVSEVGASVYSAS
KIAQEEFPDLELEYRSAINIGRKFQDPLNELIKIDPKSLGVGQYQHDVNQKELAQKLAYK
VNKVVNLVGVDLNTATKFILEYVSGLSKSIAQNIVDYRNENGLFQDREELKKVKGLGPKA
YEQCVGFLRIYDSKEFYDQTNIHPESYKLADRVVSILNIDLNNIDKNILKNANRDDLANK
LNASRYDIDLIVDSLIAPGKDIRENKAGFIVNDQILKFEDIKVGQEIIGQIQNITNFGVF
AYIGLKENVLIHITNMKKNDNQFIKHPSELVSVGDNLNIKIIDLDKKNGKIQGKIIW
NT seq
2154 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatatatctattaagaacgtttctaaaaaattgaatataagtcacgatcaagtgcaa
aagactttaaatttattaaaagaaggtgccacaattccttttatttctcgttatagaaaa
gaaataacaggtggtttagatgaggaacaagtatctaaaattaatgaatactatgcatat
gatgtggaattgcaaaagagaaaagaatatgtaatgagtattcttgaagaaaaaaaatta
ttagatgaaaaaacaaaagccaaaatacaaaatgcaattacaaaacaagaagtagaaaat
atttatgagccatttaaagttggtaaaaaaacaaaagccactgaagctatagctttaggt
ttaggacccttggcagaattaatacttaaaaacaaagatgaaagtttcgatgtttttaat
gaagctaaaaaatatattaatggagatactttaaaggacgttgatcaagttattgagcaa
acaaaatttattatagctcaaaatgtatctcaagacatagttgctcgtgaatatattaag
tctcaattgtataattttggtactattgttacaaagaaaaaaaatactgaagatgataaa
gaagtatttaagctttattatgatttttctgaaagagtaaaaaatattcctaatcataga
attcttgcaataactagagccgaggacaaaaaaattctttcttacactattcagtacaat
gaaaaaccccttatttattatttaaataataaatattttattaataaaagaacagctaaa
ataacaaatgaagctataaaagattctttagatagattaataattccttccataataaga
gaaataaaaacagatttatttgaaagggctgaaaaagaagctatcgaattgttttcaagt
aatttagaatctttattattggctcctgctacaaaaaataaaaacattatgtcaattgat
ccaggatatttgaatggatgcaaaattgtaattttagataaaaatggaaattatttagaa
ggttttgtaatttatcctcatatcggaaataaagaaaaatttattcaagcagttaaaaag
acccatgatatgttaaataaatatcctattgatttaattgttataggaaatggaacagcc
agtcgcgaaacagaagaatgagtagataaattattaaaagttagaagagaaaaaggatat
aacgttgataccaaatatgcaatagtaagtgaagtgggcgcttctgtgtattctgcttct
aaaatagctcaagaggaatttccagatttagaattagaatatagatctgctataaatatt
ggaagaaaatttcaagaccctcttaatgaattaattaaaattgatccaaaatctttagga
gttgggcaatatcaacacgatgttaaccaaaaagaattagcgcaaaaattagcttacaaa
gttaataaagtagttaacttagttggagttgatttaaataccgcaactaaatttatttta
gaatatgtttcaggcctttcaaaatctattgctcaaaatatagtggattatagaaatgaa
aatggtttatttcaagatagagaggaactgaaaaaagtaaaaggattaggacctaaggcc
tatgaacaatgtgttggttttttaagaatttatgattctaaagaattttatgatcaaaca
aatatacaccctgaatcatacaagttagcagatagggttgtatcaatattgaacattgat
ttaaacaatattgataaaaatattttgaaaaatgcaaatagagacgatttggccaataaa
ttaaatgcaagtagatatgatatagatttaattgttgattctttaatagctcctggaaaa
gatatcagagaaaataaagccggttttattgtaaatgaccaaattttaaaatttgaagat
attaaagtgggccaagaaattattggtcaaattcaaaacattactaattttggcgtattt
gcttatattggtttaaaagaaaatgttttaattcatattacaaatatgaaaaaaaatgat
aatcaatttataaagcacccaagcgagttggtttctgttggtgataatttaaatataaaa
ataattgatcttgataaaaaaaatggcaaaatacaaggaaaaattatttgataa
DBGET
integrated database retrieval system