Mycoplasma phocae: DA803_02290
Help
Entry
DA803_02290 CDS
T05577
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mpho
Mycoplasma phocae
Pathway
mpho03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mpho00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
DA803_02290 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mpho03021
]
DA803_02290 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mpho03400
]
DA803_02290 (rpoC)
Enzymes [BR:
mpho01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
DA803_02290 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mpho03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
DA803_02290 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mpho03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
DA803_02290 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Apocytochr_F_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXE60911
UniProt:
A0A2Z5IR69
LinkDB
All DBs
Position
complement(569476..573921)
Genome browser
AA seq
1481 aa
AA seq
DB search
MRKTSKYDLLQEDKIAEISLALATPNDIESWSHGEVTKPETINYKSYKPERGGLFDEIIF
GPMIDYRCPVCGFKYKRVNEGDFCTRTELCRQEHVEILPKIARRNHMGHIKLNSPVVHFW
YFKVDHSIIYKLLGLRSSRGQENVRREELENLIYYKNHIVLENGGLKSLPKNQIIEINEA
AIIYKDALEELLQRFTPGSEEYDDIKETLDSLIEKASSKIGQEYGIDFYELNEVIEHYSD
AKIGTGALAIEYLLKHLDLQKEKQFVTAEIDKLNAEELANTERFATTAKQTREKFYKRLQ
VINAFIESKQDPTSMLIYNLPVIPADLRPLIQLDGGRHSTSDINELYRRVIIRNNRLQQW
QEKDAPTLVIQNELRMIQEAVDALIDNQRRSPNPVLSKDNRPFKSISDALTGKKGRFRQN
LLGKRVDYSGRSVIVVGPNLKMHQCGIPREMAAKLFEPWIISRLVEKEVATTIKNAKKII
EDQNPIIWPHVAEAIKGRLVLLNRAPTLHRLSIQAFEPVLVRGKAIRLHPLVCTPFNADF
DGDQMAVHVPISEQALLESRELMLANKNILGPKDGEPIINPSQDMILGLYYLTIEKKGAK
GEGRVFDNFDHMMRALESKKVSLHARVALPADKVKDYRLLNNSTNQQYIISSVGKFIFNN
IFPKTFPFIYDNNVTKTVSLEEYNQIFKAKYIVTAPTNIPEYINYELSIQEGFNKKNIAK
IIRYVFDKYVASITMADVASVIDKIGLHNINILRSYMELKSYKNEKIDKEHALLLETFTN
EEIKNINTLNPMRSQYPEVSAHVPLTAEEKAKILDGVWFKYTNIVASILDNIKQLGFDYS
TISGISISFSDILETDKKAEYIAEGDEYISKLKHYYNLGYITDDDRYSLAIKKWAEIKDS
IQSQLQTIIKANSQNPVITMINSGARGNIANYVQLAGMRGLMANNTKTTKADAKNDRVVR
STVEVPVKSSFIEGLTAFEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRLVDVAQNIVVRQE
SCGSDYGYTAKNIVDTKTKQIIVSLKERIIGRFTNKPVYNSGGNMICDRNELITEKIAQR
IIDSNIEEVEIRSILGCNTRNGVCKMCFGKDLATNRIVNIGEAVGIIAAQSIGEPGTQLT
MRTFHTGGVAGVEDITGGFTRLIELIDAHEQPWGRTAEISSYDGIVTKIERSENDDSSYQ
ITIETRDRKNNKISHKIPVTTTKKLRVKENDRVKIGQKLSEGPIVLKKLLNLTDTITVQN
YLLKEIQRIYRIQGIAISDKYIEIIIRQMMSKIIIVDSGDSKFFAGAIVDIFDYQEENAQ
LLTKNLKPAFGKVVIKGAKQMPLLSDSFLAAASYQETSKILVHAAISSRIDTLSGLKENI
IIGKKIPSGTALYPFESYSKYDIKPSIKYFKSEEAENENEDDEDITIDLEALAKEIQEED
YNPSHEELVVEDENEDDEGMLEDEEENVADQDDNDDYSYEN
NT seq
4446 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaacctcaaaatatgatttactacaagaagataaaattgccgaaatttcatta
gctcttgccactcctaatgatattgaaagttgatcacacggtgaagtaacaaaacctgaa
actattaattacaaaagctataagccagaacgtggtggattgtttgacgaaataattttt
ggaccaatgattgattatcgttgtccagtttgtggattcaaatataagcgagtaaatgaa
ggtgatttttgtacaagaactgagctttgccgtcaagaacatgttgaaattcttccgaag
attgctcgtcgtaaccacatgggtcatattaaattgaatagtcctgtagttcacttctga
tattttaaagttgatcactcaattatttataaacttttaggattaagatcgagtcgcggt
caagaaaatgttcgtcgtgaagaactagaaaatctaatttattataaaaatcacattgtt
ttagaaaatggtggtcttaaatcgcttccaaaaaatcaaattattgaaattaatgaagct
gcgattatttataaagatgctttagaagaattactacaaagatttactcctggaagtgaa
gagtatgatgatattaaagaaacacttgattctttaattgaaaaagctagttcaaaaatt
ggtcaagaatatggaattgacttttatgaattaaatgaagtaattgaacattacagtgat
gctaaaattggcactggagctttagcaattgaatatttattaaaacatcttgatttacaa
aaagaaaaacaatttgttacagcagaaattgataaattaaatgctgaagaattagccaat
actgagagatttgcaacaactgctaaacaaactcgtgagaaattttataaacgtttacaa
gttattaacgcttttattgaatcaaaacaagatccaacaagtatgttaatttataattta
ccagttattccagctgatttgcgtccattaattcaattggatggtggtcgtcattcaaca
tctgatattaatgagctttaccgtcgggtaattatcagaaataatcgtttacaacaatga
caagaaaaagatgctccaactttagttattcaaaatgaattaagaatgattcaagaggct
gttgatgctttaattgataaccaaagaagaagtcctaaccctgtactttcaaaagataac
cgtccttttaaatcaattagtgatgcccttaccggtaaaaaaggtcgttttagacaaaac
ttacttggaaaacgtgttgactactcagggcgttcagttattgttgttggtcctaactta
aaaatgcaccaatgtggaattcctcgagaaatggctgctaagttatttgaaccttgaatt
atttcacgtttagttgaaaaagaagtagcaacaacaattaaaaatgccaaaaaaattatt
gaagatcagaatccaattatttgaccacatgttgctgaagctattaaaggaagattagta
ctactaaaccgggcaccaaccttacaccgtttatcaattcaagcgtttgaaccggtttta
gttaggggtaaagctattagattacatcctttagtatgtacacctttcaacgctgacttc
gatggtgaccaaatggcagttcacgtgccaatttctgagcaagctttattagaaagccgt
gaattaatgttggctaataaaaatattttaggtcctaaggatggtgagcctattattaac
ccatcacaagatatgattttaggactttactacctaacaattgaaaaaaaaggtgcgaaa
ggtgaaggccgtgtctttgataatttcgatcacatgatgcgagcattagaatcgaagaaa
gtttcacttcacgcaagagttgccttgccagctgataaggttaaagattatcgcttattg
aataatagtactaatcaacaatacattatttcatcagtaggtaaatttattttcaacaat
atttttcctaagacattcccatttatttatgacaataatgtaacaaaaacagtttcatta
gaagaatacaatcaaatctttaaagctaaatatattgtaactgctccaactaatattcct
gaatacataaattatgagttatcaattcaagaaggatttaacaaaaagaatattgccaaa
attattcgttatgtatttgataaatatgtggcatcaattactatggccgatgttgcttca
gtaattgataaaattggtcttcataatatcaatattttaagaagttatatggaacttaaa
tcatataaaaatgaaaaaattgataaagaacatgcgctattattagaaacatttactaat
gaagaaataaagaatataaatactttaaatccaatgagatctcaatatccagaagtttca
gcacatgtaccgctaacagctgaagaaaaagcaaaaatattggatggagtatgatttaaa
tatactaatattgttgcttcaattttggataatatcaaacaactaggatttgattattcg
acaatttcaggaatttcaatttcattttcagatattcttgaaacagataaaaaagcagaa
tatattgccgaaggtgatgaatatatttcaaaattaaaacactactacaatttaggatat
attactgatgatgatcgttactcattagcaattaagaaatgagccgaaattaaagattca
attcaaagtcaattgcaaactattattaaggctaattcacaaaaccctgttattacaatg
attaattcaggagcgcggggcaatattgctaactacgttcaattagctggtatgcggggc
ttgatggcaaataacactaaaaccacaaaagccgatgccaaaaatgatagagttgttcgt
tcaacagttgaagttccagttaaatcatcatttattgaaggactaactgcttttgaattc
tattcatcaacccatggtgcgcggaaaggtctaaccgataccgcccttaatacagctaaa
tcgggttatctaacaagacggctagttgacgttgctcaaaatattgtagttcgtcaagaa
agctgtggatctgactatggatacaccgccaaaaatattgttgacactaaaacaaaacaa
attattgtttcactaaaagaaagaattattggtcgtttcaccaataaaccagtttacaat
agtggcggtaacatgatttgtgatagaaatgaacttattaccgaaaaaattgcgcaaaga
attattgattctaatattgaagaagtagaaattagatctattcttggttgcaacactcgg
aacggagtttgcaaaatgtgttttggtaaagacttagcaactaatagaattgttaatatt
ggtgaagctgttggaattatcgctgctcaatcaatcggtgaacctggaactcagctaacc
atgcgtacattccatactggtggggtagccggagttgaagatattactggtggatttact
cgattaattgaattaattgatgctcacgaacaaccttgaggaagaaccgctgaaatttca
agttatgatgggattgttaccaaaattgaaagaagtgaaaatgatgactcaagttatcaa
attactattgaaacaagagatcgcaagaataataaaatttcgcacaaaattcccgtaact
actaccaagaaattgagagttaaggaaaatgatagagtcaaaattggtcaaaaattatct
gaagggccaattgttctgaaaaaattattaaatttaaccgatacaattactgtacaaaac
tatttattaaaagaaattcaaagaatttatcgtattcaagggattgcaattagtgataaa
tacattgaaattattattcgtcaaatgatgtcaaaaatcatcattgttgattccggagat
tcaaaattcttcgctggagccattgttgatatatttgattatcaagaagaaaatgcccaa
ttattgacaaagaatttaaaacctgcatttggaaaagtagtaattaaaggtgctaaacaa
atgccattgctatcagattcatttttagcagctgcttcatatcaagagacttcaaagatt
ttagttcatgctgctatttcttcaagaattgatactttgagtggtttaaaagaaaatatt
attattggtaaaaaaattccttctggaactgctttatatccgtttgaatcatattcaaaa
tatgacattaaaccttcaattaaatactttaaatcagaagaagccgaaaatgagaatgaa
gatgatgaagatatcacaattgatttagaggctttagctaaagaaattcaagaagaagat
tataatccttctcatgaagagttagttgttgaagatgaaaacgaagatgatgaaggtatg
ctagaagatgaagaagaaaatgttgctgatcaagatgataatgatgattattcatatgaa
aattaa
DBGET
integrated database retrieval system
