Methylophaga pinxianii: LGT42_000995
Help
Entry
LGT42_000995 CDS
T08312
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
mpin
Methylophaga pinxianii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS_9
PAS
PAS_4
HATPase_c
Response_reg
PAS_8
HisKA
HPTransfase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPH45886
LinkDB
All DBs
Position
207118..210009
Genome browser
AA seq
963 aa
AA seq
DB search
MADSLTSPGFAHGILYAPILMLASVGTNLRRLTITFVISLLFIWCGLLIMQGGLEAILQP
QVLSNRILATLALMTIYLLSSFTIRSQQQQTRHQKQLKLAAGIAKLGYWQLDKSGVILLS
PEVARLLHLSRHDKISQTQFVAMFIEKQQQDLNQALNDCLNQQKAIDGEFSLRRDNGPYR
IRIMAYHDEQLPNQIQGIIQDVHESKQVEANLAEEQRRFHYLAESTLQFMWTVNAEGVWD
SISHLTHDYFGQSEDYILNNWIEFVHPDDQQSVGERWLHSIKTGSPYSDEYRLRRFDGEY
KWFLAQATAIRDENEQITKWYGSSINIHQTKLLQQQSEVLSLQLQNTLDSITDAFFTLTT
DLRFSYVNNQAMSLFNMSRSTLLDHKGIENTDLDPAGTLAKNLSSALFQQQVISFEHFYE
TRQLWLDVRIYPSTNGVTVYLRDITRQRRESEELKLLRSAVSQLNDVVIITEAPRYAHEK
PNIVFVNSAFERITGYNRQEVIGKTLQILHGPKTEKNELRKIRAAYSTWQPIRAQLTQYH
KSGREIVLELNSVPIGLTAGWYTHWVSVERDITEERHLQKQLQLAQRMEAIGQLTGGIAH
DFNNLLTVITGNTDLLIDELSDKPALQSLARLISSAAERGAGLTRNLLAFARRQPLSPEA
VNINMLIRNMEALLRSSLGQKYQLDMNLSSNIWPVMIDPVQLESSLLNLTINARDAMPKG
GKLMISTERFTLLDQQNAAQNDLEPGEYVKIDVMDTGEGIPQELLDKVFEPFFTTKSTGK
GNGLGLSMVFGFIKQSGGHIQVQSEIGRGTRFQLFIPHTDMVSPAPVLQAIELSASLENS
QQTILVVEDNDLVRQYALSQLRDAGYQVLAAADGHQALSWLASAQQIDLLFTDVLMPGGM
TGFELVQQAKELRKDLPVLYTSGYTEKALPEDQGQNGNIAILNKPYHRAALLNRIAQMLN
YKT
NT seq
2892 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggctgacagtttaaccagtcctgggtttgcacacggtatcttatatgctcccattctc
atgcttgccagtgtcggtactaatcttcgtcgtctcaccattacattcgtaattagtttg
ctatttatctggtgcggcttattgataatgcaaggtgggctggaagcaatattgcaaccc
caggttctctctaatcgaatattagcaaccctcgccttgatgaccatttatttgctcagc
agctttaccattcgttctcagcaacaacagacaagacaccaaaaacaactcaaactggcc
gccggcattgccaagctgggatattggcaactggataaatcaggcgtgattttgttgagt
cctgaagtggcccgactgctccatctgagccgtcacgataaaatttcacaaacacagttt
gttgccatgtttattgaaaaacagcaacaggatttaaatcaggcattaaatgactgcttg
aaccagcaaaaagccattgatggtgagttctccttacgccgtgacaatggcccatatcgc
atccgaataatggcttaccatgacgagcaactacccaatcaaattcaaggcattattcag
gatgtgcatgaaagtaaacaggttgaggcaaatctggctgaagaacagcgccgctttcat
tatctggctgagagcaccttgcagttcatgtggacagtaaatgcagagggtgtatgggat
tccatttcacacctcacacatgactatttcgggcaatcagaagattatattctgaacaac
tggattgagtttgttcatccagacgaccagcaaagtgtaggagaacgctggttgcactcc
ataaaaaccggctcaccctactcggacgagtatcgcctgcgccgttttgatggtgaatat
aaatggtttctggctcaggcgacggccattcgggatgaaaatgagcaaataaccaaatgg
tatgggtccagtatcaatattcatcagaccaagttgcttcaacaacaaagtgaagtgtta
tcgttacagctgcaaaatacgttggacagcatcaccgatgcctttttcacattaactaca
gacttgcgtttcagttatgtaaataatcaggcgatgtctttatttaacatgtcacggtcg
acgttactggatcataaaggcatcgaaaatactgacctcgatcctgctggcacactggct
aaaaatttgtcatctgccctgttccagcaacaagtgatttcctttgaacacttctatgag
accagacagctctggctggatgtcagaatttacccttcaacaaatggagtgacggtttat
ctacgagatatcacccggcaacgccgagaaagcgaggagcttaagctattacgcagcgcc
gtttcccagttgaatgatgtcgttatcattaccgaagctccccgttatgcgcatgagaaa
cccaatatcgtttttgttaacagcgcttttgaacgcatcaccggatacaaccgtcaagaa
gtcattggaaaaaccctgcaaattctgcatggacccaaaacagaaaaaaacgaactccgc
aaaatacgagcagcatatagcacatggcagcctattcgggctcaattgactcagtatcat
aaaagtggccgggagatagttctggaactgaatagcgtccctattggattaacggctggc
tggtatacccattgggtttcggtcgaacgggatattactgaagaaaggcatttgcaaaaa
caattacagctggctcaacgtatggaagctatcggccaattaacgggaggtatcgcgcac
gatttcaataacctgttaaccgttatcacaggaaatactgatttattaattgatgaatta
tcagataaaccggctttgcagtcacttgccagactgatcagcagtgctgccgaacggggg
gcagggttaacccgcaatctgctggcgtttgccagacgtcagcccttgtcacctgaagcc
gttaatatcaacatgctgatccgcaatatggaagccttactccgcagttcactaggtcaa
aaataccaattggatatgaatctgagcagtaatatctggccggtaatgattgatccggtt
cagttggaaagcagtttattaaacctgacgatcaatgctcgtgatgccatgcccaaaggc
ggaaaattaatgataagcacggaacgatttaccctgctggatcagcaaaatgcagcacaa
aatgatctggagccaggtgaatacgtcaaaatcgatgtgatggatacaggagaaggcata
cctcaggaattattggacaaagtttttgaaccgttttttaccaccaaatctaccggcaaa
ggtaacggcctggggttaagtatggtgtttggatttattaaacagtccggtggacatatt
caggtccaatctgaaataggacgaggcacacgatttcagctatttattccgcatactgat
atggtatcccctgcaccagtgcttcaagctatcgaattgtcagcctccttagagaattca
caacagacgattctggttgtcgaagacaatgatctggtcagacaatatgctctttcacaa
ttgcgtgacgcaggttatcaggtgcttgctgcagcagatggacatcaggcattaagctgg
cttgcttctgcacagcaaattgatttactgttcaccgatgtgctgatgccaggaggtatg
actggctttgaactggttcagcaagccaaagagcttcgcaaggatctgcctgttctttac
acctctggatacactgaaaaagcattgccagaagaccagggacaaaatggcaatatcgcc
atattgaataaaccctatcaccgggctgcactattaaatcggatcgcccaaatgctgaat
tacaagacttga
DBGET
integrated database retrieval system