Microcystis panniformis: VL20_1323
Help
Entry
VL20_1323 CDS
T04037
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mpk
Microcystis panniformis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4006
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKV66496
UniProt:
A0A0K1RXQ1
LinkDB
All DBs
Position
1095851..1100974
Genome browser
AA seq
1707 aa
AA seq
DB search
MSFQEKRIIPIEIVNPSSPAELLLALKQWLELDLIADKRLELAINARENSVQETLALTIT
TSVPLSNFLEGLGQWQERGWLTASQIRVVIRVRASHPSLVQGLEQWLQLGLLGESQVKQL
CRENLSCVMPILTTAPTREPLPDPISSQQTPPPALPSRRPEAPRRIPPQPPTSPRRQETP
SQFGQMLQSLMAELSVLWLLLLGVFMVVISSGVLAANFWEKFSTAGQYGVLWLYTLAFWG
ASFWSSQQPRLRLTSQALRLVTLLLVPMNFLAMDSLGLWRNPLDWLIVVVAALSLTAVTV
QLFRGRYGETRQAGFSQSLPNHLGLSYLHWGWAIGGFPLLATYLGMVGTTLISLSRVPEG
AGQEAASRRERLAPFSLNEAIVVYGLVILLVRAIFIAQVEISQLGLAVGICGWLASWQTR
QSVSLWQRIGGSLLLLGWLLSVGETPWQALAVSGLSLLFFARRIGYSWRKFDLAAALLIG
LQGLWLAWRLLPDTFRQGAITLGTGLTGAEATPWALLSLVLFPYLVLILFLTDWFSQLGK
RELASFTGSIALFWGTTLTFCSLVNPALRTLNLAASTLALVIFSQRQVKLASLQEISRRF
LSLAYLTHLAGLLTLILAIDWGWPRLSWAVWGVILIMLAVLELAFSVKRPFPATSLLHLL
HHTTWNLGLILAGLSYGLFVLNQGAVFAQLTSVLEHPLMGLEWGLVWGLAPLALTGVGTW
NLARREVASWLSIDALALWQWLILTALLLQGLEPGIASIGLGMATGLMFVNSRNLEQVAA
AAITVGFGLSWLALSLWDGSFGWALRQEASWLLAGVITATSLWILRQCLRALPNNLARIY
AQVSDGWATCLSLLMLLALSGNVLNSPDGREAIATWLLMGATAYRSWQPSRQPNLVIWLS
ISVLLVAQIPTWVGEETRLVTLAIATGLMFFQTHRLQKLAAAAITVGLSLGLSVALLERL
PLSGLDWLLAGAIALIPLWPLRYWLSQRTSKLALLYARACDGWAIALCSLELSILVANTS
IVQEPFRTLLLSLLLMGATAYRSWQPPRFPSAIWLSIATLSLVQLPLLGLTGYRLIGLGI
ATGLMLVHAYYLQQGAAVTLTIGFALALWGTCLWDGWAGWALRSIDGWLLAVALLLAVLW
MLRSWFLRRQSQLAALYTQSLDGWAIALCSLELVALTLHSLAVYWDWMAASSLSVLAAAL
TLGAIAYRSYLEPSNWGIYGVGWSLELLTIEVLNLTKQSLIALAIANILLGLLTQLLGDW
WHRSTHRREMLNSWNILPLLYGALGAALRWGFFSSWTGLSSLGLVLIAIGVGRRSPAGKP
LLYLGIGGISISAYELLFYQIADLSQGDQFLAMAALAASLVYGYRLLSPWLAGYLPLTAS
ELKLVAHLHWALGSCLLLGALFYPVAVNQLLGLATGIFLTRYAIWQGRNHPDQAIAEIWV
YLGILEATGIGVYAANTIPPMEFFSQYLVSWLGVIASGVAVFTYLLPWRLWGWPPRPWQF
LALVLPGLALGGSLDKLNPLSLLVVAGFYAWLAWLRQQPRWRYLTLLLVNWAIALWLAAF
SLATPFAYSSLVGLSLLCLVWIEPTCQGRQGKSLRHLLRLLGTGIIASAALWFDHQTGIL
PGILSLVAIFAGLALRIRAFLYLGTFTFVANAFYQLVIWISLYPLLKWIIGLLVGVSLLS
IAGNFETRRTQLTSLLQNWLRDLQEWD
NT seq
5124 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcctttcaagagaagcgaatcatcccaatagaaatcgtcaatccaagttcgccggcc
gaacttttactagctctcaagcaatggctagaattagatttgattgccgacaaaagacta
gaattagcaataaatgcgagagaaaattcagttcaagaaaccctcgctctgacaataacc
accagcgtccctttatctaactttttagaaggtttggggcaatggcaggagcgaggctgg
ctgactgcttctcaaatccgggttgttataagagtgagagcttcccatccctctctagta
caaggtttagaacaatggctccaattaggattacttggggaatctcaagtcaagcaactg
tgtcgggaaaacctctcctgtgtcatgcctatactgacaactgcccctaccagagagccg
ctgccagaccccatctcctcccagcagactcccccacccgcgctaccttctcgacggcca
gaagctccccgtagaatcccgccacagccgccaacatctcctcgacggcaggaaactccc
agtcaattcggacaaatgttacagtctctgatggcagaattgagcgtcctctggctgctg
ctgttgggagtcttcatggtggtcatctcctctggtgtcctcgccgccaacttttgggaa
aaattctcaaccgccggacagtatggggtgttgtggctttatactttagctttttgggga
gccagtttttggagtagccaacagccgcgcctgcgcctgaccagtcaggctttgcgcctg
gttactctgttgctagtaccgatgaattttctggccatggatagcttgggcttgtggcgc
aaccctctagactggttgattgtggtagtggctgccctttcccttaccgccgtaacagtt
caactattccgggggaggtacggggaaactcgccaggcaggattttctcaaagtctgccg
aatcacttgggattgagctatctgcattggggatgggcaattggaggttttcccttgctg
gcaacttacttgggcatggtgggaacaactttgatctccctttcccgtgttcctgaagga
gccggacaagaagcagcatcaaggagagaaagattagccccttttagcttaaatgaggca
attgtcgtctatgggctagttatcctgctggtgcgggcaatttttatcgctcaagtagag
attagccaattggggctggctgtggggatttgcggctggttagccagttggcagaccaga
caatctgtttccttgtggcagcgtatcggcggtagcttgctgctgctaggttggttactg
tcggtgggtgaaacaccttggcaagccctagcagtgagtggtttatcactcctgtttttt
gcccgacgcatcggttactcctggcggaagttcgacttggcagcagccttgctgattggg
ttgcaggggttgtggctggcttggcgcttacttccagacactttcaggcaaggggcaatc
accttggggactggtttaactggcgctgaagctaccccttgggcgttactaagcttagtt
ctctttccttacctagtcttgatcctattcctgacagattggttctcccaattgggcaag
cgggaattagcctcttttaccggctcgatagccttgttctggggaacaaccttgaccttt
tgctccttagtcaatcctgccttgaggacgctcaacttggcagcttcaaccctggcgtta
gtaattttcagccaacggcaagtcaaactagcttcccttcaagagatttcccgccgtttt
ctctccctggcctatctcactcacctagctggcttgctcaccctaattttggcgattgac
tggggatggccaaggctgagttgggcagtttggggcgtgattttaatcatgctggcggtg
ctggaattggcattcagcgtgaaacggccttttcctgctacttccttgcttcatctccta
caccacacaacttggaatctgggactaatcttggctgggctatcctatggcttgtttgtc
ctcaatcagggggcagttttcgcccagttgacctctgtgttggagcacccgcttatgggg
ctagagtggggcttagtctggggtttggctcccctggccctgactggggtgggaacttgg
aatctggctcggcgggaagttgccagttggttgagtatagacgctttagccctgtggcag
tggcttatcttaacagccctactcctgcaagggttggaaccaggaattgcctcaattggc
ttagggatggctacaggattgatgttcgtcaatagccgtaacttagagcaggtagcagca
gcagcgattaccgtaggttttggcttgagttggctggcactgtctttgtgggatggcagt
tttggttgggcattgcggcaagaagcaagctggctgttggcaggggtaattactgcgaca
agcttgtggattctccgccaatgcttaagggcattaccgaataatttggcgagaatttat
gcccaggttagcgatggttgggcaacttgcctctcgctcctgatgttattggcgctttct
ggcaatgtccttaattctccagacggtagagaagcgatcgccacttggctgctgatgggg
gcgacagcttatcgcagttggcaaccctcgcgccaacctaacctagtcatttggttgagc
atctcagtcctgctagttgcccaaattcccacctgggtaggggaagaaactcgtctcgtc
accctggcgatcgccactgggttgatgttcttccagactcatcgcctacaaaaattagca
gcggctgccatcacggtaggcttgtccttgggcttgagcgttgccttactagagagattg
cctctctctggattagattggctgttggcgggggcaatcgcccttatccccctctggccg
ttgcgctattggttgagccagcgtacttctaaacttgccctcctctatgcccgcgcctgc
gatggctgggcaatcgccctctgtagtctggagttgtcgattctggtagctaacacctcg
atagtgcaggagcctttccgcactctcctcttgtcgctcttgcttatgggagcaaccgcc
tatcgcagttggcaacctccccgttttccctcagcaatctggttgagtattgccacctta
tccctagtccagttgcccttgctagggctgacagggtacaggctaatcggcttaggaata
gcaactgggttgatgctggttcatgcctattatttacaacaaggggcggcagttaccctt
accatcggcttcgctctggctttgtggggaacttgcctgtgggatggttgggcgggatgg
gctttgcgttcaattgacggctggttgctggcagttgccttgctcttagctgtcctctgg
atgctgcggagttggttcttgcgccgccagagccaacttgccgccctctatacccagtcc
ctcgatggctgggcaattgccctctgtagtctggagttagtcgccctgactctccattct
ctagccgtttactgggattggatggcggcctcgagcctctctgtcctagcggctgccctg
actttaggggcgatcgcctatcgaagctacctcgagccgagtaactggggcatctacggg
gtaggctggagcttggaactgctcaccatcgaagttctcaacctgactaagcagtcttta
attgccctagcgatcgccaatattctcttgggattgcttacccaactgttgggagattgg
tggcacagatctactcacagacgggaaatgctcaatagctggaatattctacccttgctc
tatggggcattaggagcggctctgcgttggggatttttcagtagttggactggcttgagt
tctctgggactggtactgattgccatcggagttgggcggcgctctccggccgggaagccc
ttgttgtatctgggaattggcgggatctccatctcagcctacgagctattgttttatcaa
attgccgacctgtcccaaggcgatcaatttttggcaatggcagccctggccgccagcttg
gtttacggctatcgattgctctctccctggttggctggctacttgcctctgacggcctca
gaattgaagttggttgcccacctgcactgggctttgggcagttgcctgttactaggggct
ttattctatcccgttgcagtcaatcaactgttgggattggcaaccggtatctttttgact
cgttatgctatctggcaagggcgcaaccatcctgaccaggcgatcgctgaaatctgggtc
tatctgggtattctagaagcgactgggattggggtttatgctgccaatactattcctccg
atggaattcttctctcaatacctagtttcttggttgggagtaatcgcctctggggtggct
gttttcacctatctgctcccttggcggctttggggctggccacctcgtccttggcaattc
ctcgctcttgttcttccaggactcgcccttgggggcagtttagacaagctcaatccccta
agtttgctggtggtggctggattctatgcttggctggcttggctgcggcagcaaccccgg
tggcgctatcttaccctactgttagtgaattgggcgatcgccctttggctggcggctttc
tctctggcaactcccttcgcctacagcagtcttgtcggactgtctctcctctgtcttgtc
tggatagaacctacctgtcaggggaggcaaggcaaatccttgcgccacctgctccgcctc
ttgggaacaggcattattgctagtgcggctctctggtttgatcatcagacgggaatcctg
cctggcatcctcagtttagtggcaatttttgccggattagccttacgaattcgcgccttc
ctctatcttggcacttttacttttgtggctaatgctttctatcagttggtaatttggatt
tccctttatcctctgcttaaatggattatcggattgctggtgggggttagcttgctctca
attgctggcaattttgaaactcgccgtactcaattaactagcttgctgcaaaattggctc
cgagacttacaggagtgggattga
DBGET
integrated database retrieval system