Entry |
|
Name |
(GenBank) PolC-type DNA polymerase III
|
KO |
K03763 | DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7] |
|
Organism |
mpul Mycoplasmopsis pullorum
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:mpul00001]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
BLA55_02365
03430 Mismatch repair
BLA55_02365
03440 Homologous recombination
BLA55_02365
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:mpul03032]
BLA55_02365
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mpul03400]
BLA55_02365
Enzymes [BR:mpul01000]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
BLA55_02365
DNA replication proteins [BR:mpul03032]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
BLA55_02365
DNA repair and recombination proteins [BR:mpul03400]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
BLA55_02365
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
582612..586982
|
AA seq |
1456 aa
MSSKKYSYNDQNFSNFAQNIDLPFLESFTSIIMKEEMEIEEKDGQNYYHVDYIFDEKRMP
TPSDLFAFLNFISSKNPQIVPHISFKTDSNVSVSSLPITKDFIIYLFNFSKIFKDALVES
ELFYSDESQSWTLVTNISNFKDIDKFVAKISKMLRNSGFVDFSMSVEQKNLQTIEEISSI
EMNKDIDFLKHLEQSKNENELKEKVAQNKWDFRSRKSKEYINLEISKINEEEEIPNNFFV
NTKGLIFKNDYTVTQKGFHIYTYSITDHTDAIEIKHFFREPNPDGLIPVGKYIEVFGTVN
KNYNNAKQIYADSIVITDGDVQTREDNANLKRVELSVRSKMNTMDGLLKPEEIVLAAKKF
GHKGVALVDSDGVQGFPEFYSSSKKHGVKPIYGVSFKTTFENLGTVTSNFPNSTLRDYDY
VAFDIETTGLSPKVHEIIEFGAVFIKDNEIINKEQFFIKAQKPLSAFTYELTKINDELLE
KEGISLDKGLKRIYEILNNNVAIAHNVSFDKNFIFEKFNQNNIPLPNTTFLDTLMVSRIL
FPYKRSHSLGSFCQNLGIDYNENEAHRADYDAEVLGKVWRASLSQLSNININTFEDLYNY
KSPESYSKWSLKEVTVIALNQKGLKELFDLVTLAQTTRYYNTPKLFFSDLKKSPNLLIGS
GALKGHLIDALLYSSEQELDSLMPFFDYIEIPPVQDFNHKIEYGDFTKVEIENLLLHLYK
KAVQWNKIPVAVGDVRYVDEKDQILHKILVHSKGIGNEVHYLFERKRKNNIRIPMQNYLT
TEEMKQQFSFLPSSKIIEDVVVNNTNKIADMVEEIEVIKKDLYTPVFDNSKQNLHDLVYK
TAHEKYGENLPTIVKERIEKELTPILKYGFDVVYWISHKLVKKSVDNGYLVGSRGSVGSS
LVATLSGITEVNPLEPHYICPKCKHFELANIPSIKSGFDLDDKNCPNCVDVIMDKDGQTI
PFETFLGFNADKVPDIDLNFSGEYQSTIHAEVRRLFGEKHTFRAGTISTVAAKTAYRFVK
EMVEEQKWKISDSFVEYLASKIEGVKRTTGQHPGGIIIIPKEFDVEDFTPVNFPAEEPSS
DWKTTHFDFHAIHDNVLKLDILGHVDPTAIRMLENLTGINVKKDIPKKDPKVMSIFTSTE
ALGVKPEDIGGDKTGALGIPEFGTQFVRKMLQEANAQSFADLVSLSGLSHGENVWLNNAQ
SLIKEKNFSLKDVICCRDDIMDYLINKGIDPLFSFKIMEQVRKGKGISAEQEEELVKNSV
PDWYIDSMKKIKYMFPKAHATAYVLMAWRIAWFKVYYPLEYYATYLTTRIENFEIATMIN
DDKKATKIQQRIKEILDKDMKDRTTKENKLIPCFEIARELYARGFSISNIDLHRSLDTQW
VVDREAKKLIPPFSTIDGLGISVAKSIVDARNEREFISVNDFKKRTLVNNTQMKSLRDLG
VFEQVNETDQLILFNV |
NT seq |
4371 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgtcgtctaaaaaatattcatataatgatcaaaactttagcaattttgcacaaaatatt
gacttaccatttttagaatcttttacctcaattatcatgaaagaggagatggaaatagaa
gaaaaagatggacaaaactactaccatgtagactatatttttgacgaaaaaaggatgcca
acaccgtctgatttgttcgcttttttaaactttattagttcaaaaaatcctcaaattgta
ccacatattagctttaaaactgattcaaatgtaagtgtgtctagtttaccaatcacaaag
gattttattatttatttattcaatttttcaaaaatttttaaggatgctttagttgaatca
gaactgttttatagtgatgaaagtcaaagttgaactttggtaactaatatttctaatttc
aaagatattgataaattcgttgcaaaaattagcaagatgcttcgaaacagcggatttgtt
gatttttcaatgagcgttgaacaaaaaaatctccaaactattgaagaaatttcttcaatc
gaaatgaataaagatatagatttcttgaagcatttggaacaaagcaaaaatgaaaatgaa
cttaaagaaaaagttgcacaaaacaaatgagattttagaagtcgaaaaagcaaagagtat
attaatttagaaattagcaaaatcaacgaagaggaagaaatacctaacaactttttcgtt
aatactaaaggtttaatttttaaaaatgattatactgtaactcaaaaaggtttccatatt
tacacatacagtataactgatcatactgatgcgattgaaattaaacatttttttagagaa
ccaaatcctgatggtttaattcctgttggtaaatacattgaagtttttggtacggtaaat
aaaaattataataatgcaaaacaaatttatgctgattccattgtcattacggatggtgat
gtgcaaactcgcgaagataatgcgaatttgaaaagagttgagttatctgttagaagcaaa
atgaatactatggacggtttactaaaacctgaagaaattgttttagcagctaaaaaattc
ggacacaagggagttgcattagtggattctgacggtgttcaaggatttcctgaattttat
agtagttctaaaaaacacggtgtcaaaccaatttatggtgtttcctttaagacaactttc
gagaatttggggacagttacatctaattttccaaattcaaccttaagggactatgattat
gttgctttcgacattgaaactacaggattgtccccaaaagttcatgagattattgaattt
ggggctgtttttattaaagataatgaaattattaataaagagcagttttttattaaagct
caaaaaccattgagtgcctttacttatgagttaaccaaaattaatgacgaacttttagaa
aaagaggggattagtttagacaagggacttaaacggatttatgaaattttgaataataac
gtcgcgattgctcacaacgtttcattcgataaaaactttatttttgaaaaatttaatcaa
aataatatccctttaccaaacactacatttttagatacattaatggtatctagaatctta
tttccttataaaagaagtcactcattaggttcattttgtcagaatttaggaattgattac
aatgaaaatgaggctcacagagctgattatgatgcggaggttttggggaaagtttgaaga
gcttcactttcacagttaagcaatattaatattaatacttttgaagacttatataattat
aagtccccagaatcatattcaaaatgatcacttaaagaagttacagttatcgctttaaat
caaaaaggtttaaaagaattgtttgatttggttaccttagcacaaacaactagatactac
aatacaccgaaattattttttagtgatctaaagaaatcaccaaatttattaattggatct
ggtgcacttaaaggtcatttaattgacgctttattatattcgagcgagcaggaacttgat
agtttaatgccgttttttgactacattgaaatacctccagttcaggatttcaatcacaaa
attgaatatggtgattttactaaagtagaaatagaaaatttattattacatttatacaaa
aaagcagttcaatgaaataaaattcctgttgctgtcggtgatgttagatatgttgatgaa
aaagatcaaattttgcataagattttagttcattcaaaagggataggtaatgaggtacac
tatctttttgagcgtaaacgaaaaaataatattcgcattccaatgcaaaattatttaaca
acagaggaaatgaaacaacaattttcatttttaccatcttcaaaaattattgaggatgtt
gttgtaaataacacgaataagattgcagatatggtagaagaaattgaagttatcaaaaaa
gacttatatacaccggtttttgataattcaaaacaaaatttacatgatttggtttataaa
acagctcacgaaaaatatggtgaaaatttaccgacaattgttaaagaaagaattgaaaaa
gaattaactccgattttaaaatacggttttgatgttgtatattgaatttcgcacaaatta
gttaaaaaatcagttgataatggttatttagttggaagtcgtggatcggtaggatcttct
ttagtagcgactctaagcggtattacagaagttaatcctttagaaccacattatatatgt
ccaaaatgtaaacattttgaattagcaaatattccaagtattaaaagtggattcgattta
gatgataagaattgtccaaattgtgtagatgtaattatggataaagacggtcaaaccatt
ccttttgaaacatttttaggttttaatgctgacaaagtaccggatatcgatttaaacttt
tctggggaatatcaatcaactattcatgctgaagtgcgtcgtttatttggggagaaacac
acctttagagctgggacaatttcgactgtcgcagcaaaaacagcatatcgttttgttaaa
gaaatggttgaagaacaaaagtgaaaaatttcagattcttttgtggagtatttagcatca
aaaatagaaggtgtaaagcgtaccacgggacagcatcccggcgggataattattattcca
aaggaatttgatgtagaggattttactccggtaaatttccctgcagaggaaccaagtagt
gattgaaaaaccacacattttgatttccatgcaattcacgataatgtcttaaaactagat
attttaggtcatgtggatccaaccgcgattagaatgctagagaacttaacagggataaat
gtaaaaaaagatataccgaaaaaagatcctaaagtcatgtctatttttacttctacagaa
gcattaggagtgaaaccagaggacataggaggggacaaaactggggcactgggtatcccc
gaatttggaactcagtttgttcgcaagatgttacaagaagcaaatgctcaaagttttgca
gatttagtatcattatcaggtttaagtcatggtgaaaacgtatgattaaacaatgcacag
tcattaattaaggaaaaaaatttctctttaaaagatgttatttgttgtagggatgacatc
atggactacttaattaataaggggattgatccattattttcatttaagattatggagcaa
gtgcgtaaaggaaaggggattagtgctgaacaagaagaagagttagtgaaaaattctgtt
cctgattgatacattgacagcatgaaaaaaattaaatacatgttccctaaagctcacgcg
acagcttatgttttaatggcttgaagaattgcttgatttaaagtttattatcctttagaa
tattatgcaacctatttaacaactcgaatcgaaaactttgaaatagctactatgattaat
gatgataaaaaagcaactaaaattcaacaaagaattaaagaaatattagataaagatatg
aaagatcgaacaactaaggaaaataaattaattccatgttttgaaattgctcgagagttg
tacgcaagaggtttttctatttctaatattgatttacatcgttcattagatacacaatga
gtggtagatcgtgaagctaaaaaattaattccaccattttcaacaattgatggtctagga
attagtgttgctaagtctatagttgatgctcgtaatgagagggaatttatttcagttaat
gatttcaaaaaaagaacattggttaataatactcaaatgaaatcattgcgtgacttaggt
gtttttgaacaagttaatgaaactgatcaattaattttatttaatgtttaa |