Mycoplasma parvum: PRV_02120
Help
Entry
PRV_02120 CDS
T02873
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
KO
K13797
DNA-directed RNA polymerase subunit beta-beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mpv
Mycoplasma parvum
Pathway
mpv03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mpv00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
PRV_02120
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mpv03021
]
PRV_02120
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mpv03400
]
PRV_02120
Enzymes [BR:
mpv01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
PRV_02120
Transcription machinery [BR:
mpv03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
PRV_02120
DNA repair and recombination proteins [BR:
mpv03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
PRV_02120
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_1
Peptidase_M23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
17224624
NCBI-ProteinID:
AGX89162
UniProt:
U5NCL0
LinkDB
All DBs
Position
complement(363855..371792)
Genome browser
AA seq
2645 aa
AA seq
DB search
MNYKLKEINSVVKRIDFSKLPSGDWTPPNLKGIQIDAYNKFIESGIKELIMKYFPMSSAS
GNTQVFLEEIIIPEIEIDEKEAVNSSKSYQRSVYLKLKLVSKFNEEKNRLSSFKVFFGHL
PIFSSSSNFIINGIEKFVICQIVRSPGLYVLNKAQIRLSNSRKRTQEGIICELLPVKGVL
LLFHLPNVSEKDKEEGYIPSIKLLARNISGNNAFSFPITVFLTALGVSNKIVKELFGSFP
EVMKALSQDTFNTQAVLNDSTVTSIFAEIAGSKGVNKLRDSAKGWIRETIYSLCVKYTEA
EKSNSSKKEKEEILEKIAIELASKQLISAFSINTEVARREVHSYQELLWSYFYDMNYYHI
LPAGRYKLNHKLSIWDRMKNKYLAEDICDFSGKVIFPKDTFMDFEKLSEFKDAAIARKIN
IIRSFDITKSFDDAEKRYSNFDVIEYEKVAIYSGGLDSEVITLLGTPYLDDNKSLSPSDI
IAIISYMLHIKKKVGEYDDIDNLGNKRLKLIDELLKDRISIALSRIQKFSIDRMNSLESK
LNYFSLQDGELEDYFSLNAIMNTKPFQIAIKEFFNSHQLVQFLDQQNVLSEITNKRKISA
MGPGGIKREDPNLNIRDVHYSYYGRICPIETPEGMNIGLIMALASLSKVDKYGFINTPYY
RVKNGKVLKDTKIWLNSIQERSFCIAEATAEIDENGKLKGPVTVRRDEEVESVEPEEVHF
IDVDCTQITSISTSLIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPLISPKSPIVATGAEERIARDS
GVVLQAEGDGVISYLDSSQLRVKYKDKELGEKTYYLQKFIKTNQNTCKNQVIIPRDNKEV
KKGEILVDGHAIQNGELALGQNILVAFTSWYGYNYEDAIILSSRLVQENVYTSLHIQEYT
VNCMRTKIGDEEITRFIPGCTSEEKRYLDEDGVILVGAAVKEGDILVGKTSPKAMGDITP
EEKLLQAIFSEKAKSVKDSSLRLPSGSEGIVTKIIRYSAAKGDRLGDDILETIKIFVTSK
RNIQIGDKMVGRHGNKGIVSKVAPVEDMPYLEDGTPVDILLNPLGVPSRMNIGQILESYL
AFSARKLVFRRILEAHFANDLESCNSLFSKSKIELQSLSKVLSSYLTDKKIKNKEEAISK
LNQLDFSIILSMAGIKYDELEIKVLTPIFAGCKNADLINIMSHAGIDFNHHNGRFTLFDG
RTGEKFKDPISVGIIYMLKLDHMVDDKIYARSVGPYSKITQQPLGGKCQNGGQRFGEMEV
WALQAYGAVNNLRELLTLKSDDIQARNLIYYSIIKGQALPKPTISESFKLLVKKLQAIGL
RVNIRFGASKEVLGFDDYLARRMKLNEKIQLLSWNNQKDEREGYKLRDANFSQESDLEDL
TINGFQISITSPEYLLSLSRGEVKSAETINYKTFKPEKGGLFCEAIFGPVKDYECFCGKY
KRVRYKGKYCEKCGVCITESIVRREWMGHIALACPIAHIWMIKELPLPSKVSLILGIKYK
SVEEVVYFVNYIVIDIKNTGSKRYSGIFERLEIVNVSDQNSPLRSLFKIRKLLRLIYEER
AQEEQDGVNSIAYQQGRTYYKALSSSNLPFSLHDVFEYIYQWTGIKIGTGAEAIYELLKM
IDIESLEHSILKQLESKNKESISYYDPKVKKLLSRLEVIRWFKESGNRPEWMILKNILVL
PPNLRPIVQLDAGRFTTSDLNIFYRRIIIRNERLKKILSLNVTSIIANNEKRMLQEAVDS
LIDNASRKKPLLAKDKHPLKSLTDHLKGKQGLFRQNLLGKRVDYSGRSVVVVGPELKLHQ
VGLPILIVLKLFKPFIIRELIRSYVDEKTGERIQLAQNIKVAEKIIEDQEDILWPVVQKV
IKERPVLLNRAPTLHSLGIQAFEPIIVEGKAICLHPLVTTAFNADFDGDQMAVHLPLSEE
SVQEARDILLAPHHVLAPKNGQPILMPSQDMVLGLYYLTNTRKGAKGEGRLCSSLEEVKY
LYDIGEIDLNAFIILSTTLFKEKKWDKEGLLFTTTGKVIFNQALPKDYRYVNDSSESGVS
PEDIVEFGSDYSKVLENLKEKAPFSKKVIQTIIEEVYEQYPLEVTSNMLDNIKSLGFEYS
TKSCITISPFDIPRFKDSFKEDLIVEAEKKVKAQKEYFELGMITEDERYQKVINLWSEVK
DKVSEEIKSWFRGEEYRDNPMAIMEKSGARGSLSNFVQLSGMRGLMNRSYNYGQSDESGV
IKDVIEVPIKHSFIEGLNMIEFFNSSYGSRKSMADTAVKTAKSGYMTRKLVDASQEVIVR
SIDCNPKKGVLIRAIKDENSDNIIKTLEERIKYRCAFGDIVSPRDGSVICRDGEYITAKA
AKEIEALGIEEVEVRGVFSCEQENGICQKCFGYDLKTRKPVKLGTAVGIIAAQSVGEPAT
QLTMRTFHSGGVAGEGNITQGFERLRQLFDGIDPKEWEEAVLTEISGKVESVEREGKMRT
ITIKGIKEKKKYEVSLSTKISVDVGDEVKVGQVIAQGALNLKKLKLSLGVEKIRNYITEE
VLKIYWLHGLDLSDKYVESVVRQMTNKWRITESDKSRVEVGEMIERESFKREIKSKMLGK
KAVSHAEYEILDLEEIPMMSGSFLAAASFQDTRKILTDAAVKGSVDMVVSLKSGLITGQI
ERKEN
NT seq
7938 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaattacaaactaaaagaaattaattccgttgtaaaacgaatagatttttctaaactc
ccttcaggagattgaactcctcctaatttaaagggaattcaaatagatgcttataacaaa
tttattgaaagtggtattaaagaattgattatgaaatatttccctatgtcatctgcttca
ggtaatactcaagtatttcttgaagaaattattattcctgagattgaaattgatgaaaaa
gaagcagttaatagttcaaaaagctatcaaagatctgtttatttgaaactgaaattggtt
tcaaaattcaatgaagaaaaaaatagattatcaagctttaaagtcttttttggccattta
cctattttctcttcttcttcaaatttcatcattaatggaattgaaaaatttgtaatttgt
caaattgttagatcgccaggtttatatgtacttaataaagcgcaaattagactttctaat
tctagaaaaagaacgcaagagggaataatttgtgaattactccctgtaaagggagtatta
ttactattccatttacctaatgtttctgaaaaagataaggaagaaggttatataccttca
attaaattgttggctagaaatatttcaggaaataatgctttttctttccctattacagta
tttttaacagctttaggtgtttctaacaaaattgtaaaagagttatttggatctttccct
gaagttatgaaagctttaagtcaagatacctttaatactcaagcagtattaaatgattct
actgtgacatcaatttttgctgaaattgcaggttcaaaaggagttaataaattaagagat
tcagctaaaggttgaattagagaaactatttattctctatgtgtgaaatatacagaagct
gaaaaatcaaactcttctaaaaaagaaaaagaagaaatattagaaaaaatagctattgaa
ttagcttctaaacaattaattagtgctttttctattaatactgaagtagccagaagagaa
gttcattcatatcaagaattattgtgatcttatttctatgatatgaattattatcatatt
cttcccgcgggaagatataaattaaatcacaaattatctatttgagacagaatgaaaaat
aaatatcttgctgaagatatttgtgatttttcaggaaaggtgatttttcctaaagatacc
tttatggattttgaaaaactatcagaatttaaagatgcagctattgctagaaaaataaat
ataattcgtagctttgatattactaagagttttgatgatgcagaaaaaagatatagtaat
ttcgatgtaattgaatatgaaaaagtggctatttattctggtggattagatagtgaagta
attaccttattaggaacaccttatttggatgacaataaatctctttctccgtcagatatt
attgcaattatctcttatatgttgcatataaagaaaaaagttggagaatatgatgatata
gataatttaggtaataagagacttaagttaattgatgaactccttaaggatagaatttct
atagctctttcaagaattcaaaaattctctattgacagaatgaatagtcttgaatctaaa
ttaaattacttttctcttcaagatggagaattagaagattatttctctttaaatgccatt
atgaataccaaacctttccaaatagcaattaaagagttctttaattctcatcaattagtt
caattcttggatcaacaaaatgttctttctgaaataactaataagagaaaaatttctgct
atggggcctggaggcattaagagagaagatcctaatttaaatattcgtgacgttcactat
tcttactatggaaggatttgtcctattgaaactccagaaggtatgaatattggattaatt
atggctttagcttctttatctaaagtagataaatatggtttcattaatactccttattac
agagttaaaaatggaaaagtacttaaagatactaagatttgacttaactctattcaagaa
agaagtttctgcatagctgaagctaccgcagaaatagatgaaaatggtaaattaaaaggt
cctgtaacagttagaagagatgaagaagtagaatctgttgagcctgaggaagttcatttt
attgatgtagattgtactcaaattacctcaatttccacttctttaattcctttcttggaa
catgacgatgcaaacagagctttaatgggagcaaatatgcaacgtcaagctgttccatta
attagccctaaatctcctattgtagctacaggagctgaagaaagaatagctagagattct
ggagtagtacttcaagctgagggggatggagtaatctcttatctagatagctctcaattg
agagttaaatataaggataaggaattaggggaaaaaacctattatcttcaaaaatttata
aaaactaatcaaaatacttgcaaaaatcaagtaataattcctagagataataaagaagtt
aaaaaaggagaaatcttagtagatggccatgctatccaaaatggagagcttgcattaggt
caaaatattttagtagcctttacttcttggtatggttacaactatgaggatgctattatc
ctttcttctagattagtacaggaaaatgtttatacctctctgcacattcaagaatataca
gtgaattgcatgagaacaaaaataggagatgaagaaattactagatttattccaggatgc
acctcagaagagaaaagatatcttgatgaagatggagttattttggtaggtgctgcagta
aaggaaggagatattttggttggtaagacctctcctaaagctatgggagatattactcca
gaagaaaaattgctacaagcaattttctctgaaaaagctaagagcgttaaagattcatct
ttaagactaccttcaggctctgaaggtattgtaactaagataattagatattctgcagct
aagggagatagattaggagatgatattttggaaactattaagatatttgttacttcaaaa
cgaaatattcaaattggggacaaaatggttggacgtcacggaaataaaggtatagtttct
aaagtagctcctgtagaagatatgccttacttggaagatggaactcctgttgatattctt
ttgaatccattgggagttccttcaagaatgaatattggtcaaattctagaaagttatctt
gctttttcagctagaaagttagtatttagaagaattttggaagctcattttgcgaatgat
ttggaatcatgtaattctctattctctaagtcaaaaatagagcttcaatcattatctaaa
gtacttagctcttatttaactgataaaaaaataaagaataaggaagaggctatttctaaa
ttgaatcaattggatttctctattattctttctatggctggaattaaatatgatgaacta
gaaattaaagtattaactcctatttttgctggctgcaaaaatgctgatttaataaatatt
atgtctcacgccggaattgatttcaatcatcataatggaagatttactctatttgatggc
agaacaggagagaaatttaaggatccgatttcagtaggaattatttatatgttgaaattg
gatcatatggttgatgataagatatatgctcgttctgtaggtccttattctaagattact
caacaaccactgggtggtaagtgccaaaatggtggtcaaagatttggggaaatggaagta
tgagctcttcaagcttatggggcagttaataatttgagagaattattaactcttaaatca
gatgatattcaagctagaaatttaatatattactccattattaaaggtcaagctcttcct
aagccgacaatttctgaatctttcaaattgttggttaagaagttgcaagctattggtctt
agagtaaatattagatttggggcctccaaggaggttcttggatttgatgattatttagct
agaagaatgaaattaaatgaaaaaattcaattacttagctgaaataatcaaaaagatgaa
agagagggatacaaattaagagatgctaatttttctcaagaaagtgacttagaagactta
actattaatggcttccaaattagtattacctctcctgagtaccttctttctttatctaga
ggagaggttaaatctgcggaaacaattaattacaaaacatttaagccagaaaaaggaggt
ttattctgtgaagcaatttttggacctgtaaaggattatgaatgtttctgcggtaaatat
aagagagtgagatataagggtaaatattgtgaaaaatgtggtgtatgtattactgaatca
atagttagaagagaatgaatgggacatattgccttagcatgccctattgcacacatttga
atgataaaggaattacctttgccttcaaaagtatctctaattttgggaattaagtataag
agtgtagaagaagtagtttatttcgttaactatatagttattgatataaaaaatactgga
tctaagagatattcaggtatttttgaacgattggaaatagttaatgtttcagatcagaat
agccctctaagatctttattcaaaattagaaaacttcttagattaatttatgaagaaaga
gctcaagaagaacaagatggagttaattctattgcttatcaacaaggaagaacttattat
aaagctctttcttcttcaaatcttcctttctcccttcatgatgtttttgaatatatctat
caatgaacaggaataaagataggtacaggagcagaagctatttatgaacttctaaaaatg
atagatatagaatctttggaacattctattctaaaacaattagaaagtaaaaataaagaa
tctattagttattatgatcctaaagttaaaaaacttctttctagattagaagttattaga
tgatttaaagaatcaggaaatagacctgaatgaatgattttgaagaatattctagttcta
cctcctaatttaagacctatagttcaattagatgctggaagattcaccacttcagatctg
aatattttctatagaagaattattatcagaaatgaaagacttaagaaaatattaagtctt
aatgttacttctatcattgccaataatgagaagagaatgttgcaagaagctgtagattct
ttaattgataatgcaagtagaaaaaaaccattattagcaaaagataaacatccattgaaa
tccttaactgatcatttgaaaggtaagcaggggctatttagacaaaacttactaggtaaa
agagtagactattcaggtagatctgtagttgttgtaggccctgaattaaaactacatcaa
gtaggtttgcctattctaatagttttgaaattatttaaacctttcattattagagaatta
attagaagttatgtagatgaaaagactggagaaagaattcaattagctcaaaatattaaa
gttgcagaaaaaatcattgaagatcaagaagatattttatgaccagtagtacaaaaagtt
attaaagaaagacccgtgctattaaatagagctccaactcttcacagcttaggaattcaa
gcttttgaacctattattgtagaaggtaaagctatttgccttcaccctctagtaactaca
gctttcaatgctgacttcgatggagaccaaatggcagttcatcttccactatcagaagaa
tcagttcaagaagcaagagatattctattagctcctcaccatgtcttagcacctaagaat
ggacaaccaattttgatgccttctcaagatatggtattaggtctttattatttgactaat
actagaaaaggagctaaaggggagggaagattatgttcttctctagaagaagttaaatat
ctttatgatattggcgaaatagatttaaatgcttttattattctttcaactactttattc
aaagaaaagaaatgagataaagaaggtttattgtttactactacaggtaaggtaattttc
aatcaagcattacctaaggattatagatatgtaaatgattcttcagaaagcggagtttct
ccagaagatatagtagagtttggttcagattattctaaagtattagaaaatctgaaagaa
aaagctcctttcagtaagaaagtaattcaaacaattattgaagaagtttatgaacaatat
ccattagaagtaacttcaaatatgttagataatattaaaagcttaggttttgaatattct
acaaaatcatgtattaccatttctccttttgatattcctagatttaaagattcatttaag
gaagatttaattgttgaggctgagaagaaagtaaaagctcaaaaagaatattttgaacta
ggaatgattactgaagatgaaagatatcaaaaagtaattaatttgtgaagcgaagttaag
gataaagtttcagaagaaattaaatcctgatttagaggagaagaatatagagataatccg
atggcaattatggaaaaatctggagctagaggtagcctttcaaacttcgttcaactttca
ggtatgagaggcttaatgaacagatcttataactatggacaaagtgatgaatcaggagta
attaaggatgtaatagaggtacctattaaacattcattcatagagggattaaatatgatt
gaattctttaattcttcttatggttctagaaagagtatggcagacacagctgttaaaaca
gctaaatcaggttatatgactagaaaattagtagatgcttctcaagaagtaattgttaga
tctatagattgcaatcctaagaaaggagtattaattagagctattaaagatgaaaacagc
gataacataataaaaacattagaagagcgaattaaatatagatgtgcttttggagatata
gtatctccaagggatggttcagttatatgtagggatggagaatatataactgcaaaagct
gccaaagaaattgaagctcttggcattgaggaggtagaagttagaggtgtatttagctgc
gagcaagagaatggtatttgtcaaaaatgttttggttatgacttaaagactagaaaacca
gttaaattaggtactgctgtaggaattattgcagctcaatcagttggtgagcctgcaact
caattgaccatgagaactttccactctggaggggttgctggggaaggtaatattactcaa
ggttttgaacgtttgagacaattgttcgatggaattgatccaaaagaatgagaagaagct
gtattaactgaaatttcaggaaaggtagaaagtgttgaaagagaaggtaaaatgagaaca
attactattaaaggaattaaagagaaaaagaaatatgaggttagtctttctacaaaaata
agtgttgatgtgggagatgaggttaaagtgggtcaagtaattgctcaaggagctttaaac
ttaaagaagttgaaattaagtttaggagtagaaaaaattagaaattatattactgaagag
gtattaaaaatttattgattgcatggtcttgatttatcagataaatatgtggaatctgta
gtgcgacaaatgaccaataagtggagaattacagaatctgataaatcaagagtagaagtt
ggggagatgattgaaagagaaagctttaagagagaaattaaaagcaagatgttgggtaaa
aaagctgtttcacatgcagaatatgaaatattagatcttgaagaaattcctatgatgtca
ggttcttttttggctgcagcatctttccaagatactagaaaaatcttgacagatgctgct
gttaaaggtagtgtagatatggttgtttccttaaaatctggattaatcacaggacaaata
gaacgaaaagaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
