Candidatus Methylopumilus rimovensis: FIT61_00400
Help
Entry
FIT61_00400 CDS
T10495
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
mrk Candidatus Methylopumilus rimovensis
Brite
Transporters [BR:
mrk02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
FIT61_00400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDD12958
UniProt:
A0AAE6KNX9
LinkDB
All DBs
Position
complement(73856..76951)
Genome browser
AA seq
1031 aa
AA seq
DB search
MIEKIVRGSLQERLIVLVFAIALLVAGFFGVKKLTIDAFPDVTNIQVQIATPAPGKSPEE
VERFITIPIEIAMTGLPGVTDMRSLNKNSLSLITLVFTDNTSVYFARQLVMERLMEVMEK
MPDGIVPVLGPVSTGLGEVFQYTLEKPSDENKKISEEELTERRTIQDWVVRPLLRSVPGV
AEINSFGGFIKQYQALVDPDRLNHYGIKLHEVYTALAKNNTNSGAGVLPQFDEQFLIRGV
GLIKNLDDIRSIVLKERNGVPVYMKDVAEVKLGHEVRVGSLVKNGDTESVGAIVMMLRGG
NAKEVVTRIKTKVNEINEKKLLPGGLQIKSFYDRSELVDSALFTVVKVLIEGVILVIGIL
FLFLGDVRSSLIVVMTLVLTPLVTFIAMNYFGISANLMSLGGLTIAIGLMVDGAVVVVEN
TFHRLGHDKSDSKIRTILESATEVGTPVLFGVGIIILVFLPLMTLTGMEGKMFSPLAVTI
AIALLISLILSFTLTPVLCSYFLKGGSGEDTKIIKLIKAPYEKLLNLCLNNEKKTILIAS
AVFIFSIVLLPFLGTSFIPEMKEGTIVASITRMPNISLDESIEMEKKATKEITTVPGVLS
VVSNIGRGESPADPQSQNESQAVISLKDKDTWPDGWTQDTIAQEIKNKLQSLLGAQTVMM
QPISARVAELSTGVRADVAIKIFGEDIKLLKTKADEVARLAGGIKGAADIKIEKVSGQVY
LNINLDRQAIARYGFNASDINELIETAIGGKIATRVYEGQRSFSAAVRFPEDQRSDVETI
GNTMLISPNGSKIALKDLASIEIKDGPAQISREFAKRRIVIAMNVKDRDLGGFVAELQKK
LDTQIKLPEGYYFVYGGQFENMQRALNHLALIVPVTILAIFFLLFILFNSIRFATMIISV
LPFAAIGGVFGLAITGEYLSVPASVGFIALCGIAVLNGVVLITCIQQLKSEGMSQFDAIR
EGCKQRLRPVLMTATVALLALVPFLFATGPGSEVQKPLAIVVIGGLITSTVLTLLVLPTL
YKKFAEAPTEA
NT seq
3096 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaaaaaatagtaaggggttcgctccaagaaagactgattgttttagtctttgcc
attgcacttttggtcgctggcttttttggcgttaaaaaactaactatcgatgcctttcct
gatgtcacaaatatccaagtgcaaattgcaactccagcgccaggaaaatcgcccgaggaa
gtagagcgctttatcactattccgattgaaattgccatgacaggtttgcctggtgtcact
gacatgcgctcacttaacaaaaattcactgtcgctcatcacacttgtatttaccgataac
acaagtgtctatttcgcaagacaattggtcatggaaagactgatggaggtcatggaaaaa
atgcctgatggtattgtgccagtgctaggtccagtatccacaggattaggagaagttttt
caatacacacttgaaaagccaagtgacgaaaataaaaaaatttctgaggaagaattaacc
gaaagaagaaccattcaagattgggtagtcaggcctcttttaagaagtgtccccggtgtt
gctgaaattaattcatttggtggcttcattaaacaatatcaagcgcttgttgatcctgac
cgacttaaccattacgggattaaactccatgaagtctataccgcattagctaagaacaat
accaatagtggtgcaggggtgcttcctcaatttgatgaacaatttttgatccgtggtgta
ggtcttattaaaaacttagatgacattcgctccatcgttttaaaagagcgtaatggtgtg
cctgtttatatgaaagatgtggctgaagtcaaacttggccatgaagtccgagtgggatcg
cttgtgaaaaatggggatacagaatcagtcggggctattgtcatgatgcttcgcgggggc
aatgccaaagaggttgttactcgcattaaaaccaaggtcaatgaaattaatgaaaaaaaa
ttattgccaggtggccttcaaattaaatctttctatgatcgtagtgagttagtcgactct
gcattatttaccgttgttaaagttttaattgagggtgtgattttagtgatagggattctt
ttcctttttttaggcgatgtacgatcaagtttaattgtcgtgatgacattagtcctcaca
ccactcgtaacatttattgcaatgaattattttggcatatctgccaatctcatgtcattg
ggtggcttaacgatcgctattggtcttatggtcgatggtgctgttgtggtggttgaaaat
acctttcatagactgggtcatgataaatcagacagtaaaattcgtaccattttagagtca
gcgactgaagtcggcacccctgttctttttggtgtgggtattatcattttagtatttctt
ccgcttatgaccttgaccggtatggaaggtaagatgtttagtcctcttgccgtcacaata
gcgatagcacttcttatctcattgatactttcgtttaccttaacgccagtcttatgctca
tattttttaaaaggtggtagtggagaggatacgaaaattattaaactcattaaagcgcct
tatgaaaaactcctgaatctttgtttaaataatgagaaaaaaacaattttaatagctagc
gcagtatttattttttccattgtcttattacccttcttaggcacttcttttattccagag
atgaaagaaggaacgattgtagcaagcatcacacgtatgccaaatatttcactggatgaa
tctattgaaatggaaaaaaaagcaaccaaagaaatcactacagtgccaggcgttttaagt
gtggtctcaaatattggccgtggtgaaagtcctgcggaccctcaatctcaaaacgaatct
caagctgtaattagtctaaaggataaagatacctggcctgatggttggacccaagatacg
attgctcaagaaattaaaaataaattgcaatccttgctaggcgcccaaactgtgatgatg
cagccaatttctgcgcgtgtagcagaattatcgacgggtgttcgagcagatgttgcaatc
aaaatttttggtgaggatatcaaacttttaaaaacaaaagcggatgaggttgcccgatta
gcaggaggtattaagggggccgctgatattaaaattgaaaaagtatcaggtcaagtgtat
ctaaatattaatttagaccgacaagcgattgcccgttatggattcaatgcatctgatatt
aatgagttaatcgaaaccgcaattggcggaaaaattgcaacacgcgtctatgaaggacaa
agaagtttttctgcagcagttcgattccctgaagatcagcgaagtgatgtagaaacgata
ggtaataccatgctgatatcacctaatggatcaaaaattgcattgaaagacttggcttcc
attgaaattaaagatggtccagctcagatcagccgcgaattcgctaaacgaagaattgtc
attgcaatgaatgtgaaagatcgagatcttggtggatttgttgcagaattacaaaaaaaa
ctcgatactcaaatcaagttaccggaaggttattattttgtttacgggggtcaatttgaa
aatatgcaacgtgcattaaatcatctggcgctcattgttcctgtcacgattcttgctatc
tttttcttactctttatcttatttaattcgattcgttttgccactatgattatttccgtt
cttccttttgcagccattggtggcgtttttggtctcgctatcacaggcgaatatctttca
gtacctgcttctgtcggttttattgcactatgtggtattgctgttctcaatggagttgtc
ttgatcacttgtattcaacagttaaaatctgaaggtatgtcgcaattcgatgccattcga
gaaggttgcaaacaaagattaaggcctgtgctgatgactgcaaccgtagcccttcttgcc
ttagtgcccttcttgtttgccacaggcccgggctctgaagtacaaaaaccgctcgccatt
gttgtcattggtggtctcattacctcaacagtgttgaccttacttgtattaccaacctta
tataaaaaatttgcagaggcgccaaccgaagcctaa
DBGET
integrated database retrieval system