Candidatus Methylopumilus rimovensis: FIT61_02510
Help
Entry
FIT61_02510 CDS
T10495
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
mrk Candidatus Methylopumilus rimovensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
AAA_19
AAA_30
Cas3-like_C_2
HC2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDD13334
UniProt:
A0AAE6KNY1
LinkDB
All DBs
Position
complement(487022..488701)
Genome browser
AA seq
559 aa
AA seq
DB search
MSFDSLKLDPQILRALHSVGYKTPTPIQEKAIPVILEGHDLMASAQTGTGKTAAFILPAL
NLLATPHPIKERGPRILVLTPTRELAAQVNEAARKYGTFIKAKTTSIVGGMPYPLQNKLL
SQPLDILIATPGRLLDHMERGRINLSRLQMLILDEADRMLDMGFIPDVKKICAAINTKHQ
TLLFSATLDGQISKIAKDLLHNPKTIEISHSKDKHENITQHMYFVDNLNHKNKLLEHLLI
QPGVKQTIIFTSTKRHADLLADELYNAGHKTGALHGDMTQGARNRTLTKFRHNDISVLVA
TDVAARGIDVDGITHVINYDLPKFAEDYVHRIGRTGRAKKEGVAISFVAPMDGKALRDIE
KYTGHKIEARTMAGFEPKLQSRDQLGEERKSKSRGGKRNSNDRKSFGDRKPFGEKKSFND
RKPSERKSFGDKKSFGDKKSFGDRSSMSDKKPFKKEFGSSDSPRRDFEPRTPRSPFEKKA
VEKRLFGKTSDKKPSFSRSDADKKTFGEKKSFGDRKTTDRKPATKRESAPKTFTKKPSTI
RTFRASDSKPDTAKRKARV
NT seq
1680 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtcttttgattcattaaagctcgacccacagatcctgcgcgcgttacatagtgtaggt
tataaaacccccacccctattcaagaaaaagctattcctgtgatcttagaaggtcatgat
ttaatggcctccgctcaaacaggcaccggtaaaacagcggcatttattttgccagcctta
aatttattagcgacaccccatccgatcaaagaacgtggtccgcgtattttagtcttaacc
cctacacgagaattagcagcacaagtcaatgaagcggcgcgtaagtacggtacatttatt
aaagctaaaaccaccagtatcgtaggtggcatgccttacccattacagaataaattatta
tctcaacctttggatattttaatcgcaacccctggtcggcttctagatcacatggaacgt
ggtcgtattaatttgtcacgtttacaaatgctcattttagatgaagcggatcgtatgctt
gatatgggctttattcctgatgtgaaaaaaatctgtgctgctattaatacaaaacatcaa
accttattattctcagcaaccttagatggtcaaattagtaagatcgctaaagatctttta
cacaatcctaaaacgattgagatctcacactctaaagataagcacgaaaatattacgcaa
catatgtatttcgtcgataacttaaatcataaaaataaactccttgaacatttactgatt
cagcccggtgtgaaacaaacgattatttttacctccaccaaacgtcatgccgatttatta
gccgatgaactttataacgcaggtcataagacaggggcacttcatggggacatgacacaa
ggtgctagaaaccgaacgctcactaaatttagacataacgatattagtgtgcttgttgca
actgatgttgcagcgcgcggtattgatgtcgatggcatcacacacgtcatcaattatgat
cttccaaagtttgctgaagactatgtccatcgtattggtcgaacaggtagagccaaaaaa
gaaggtgttgcgatttcatttgtagcacccatggatggcaaagcattacgtgatattgaa
aaatatacaggtcacaaaattgaagcgagaacgatggcaggttttgaaccgaaactacaa
tcgcgcgatcaattaggtgaagaaagaaaatctaaatcgcgtggtggtaaaagaaattcc
aatgatagaaagtcttttggtgacagaaaaccttttggtgaaaaaaaatcatttaatgac
agaaaaccaagtgaacgcaaatcatttggggataagaaatcattcggtgataaaaaatca
tttggggatcgatcatcaatgagcgataaaaaaccttttaaaaaagaatttggatcaagt
gactcaccaagacgtgatttcgaacctcgtacccctcgaagtccttttgagaaaaaggct
gtagaaaaaagattgtttggaaaaacgtcggataaaaaaccgagctttagtcgatcagat
gccgacaaaaaaacatttggtgaaaaaaaatcattcggtgacagaaaaaccactgatcga
aaaccagcgactaaacgtgaatcagcgcctaaaacctttactaaaaaaccatcgacgatt
agaacgtttagggcatcggactcaaaaccagatactgcaaaacgtaaagcacgcgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system