Mucilaginibacter robiniae: HH214_18615
Help
Entry
HH214_18615 CDS
T08554
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
mrob
Mucilaginibacter robiniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CILP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJD97743
UniProt:
A0A7L5EA17
LinkDB
All DBs
Position
4257014..4260043
Genome browser
AA seq
1009 aa
AA seq
DB search
MKRIYTISRLVLLCLLFSTVAFAQNVAVKGKVTDATTGEFLPGVTVAVQGTTTGTQTDVN
GAFTINVPSSATITFSFVGYTAQQIAVNARTTLDVKLANKASELQQVVVVGYGTQRKIDV
TGSVSQVRGEELSKQPDPNPVSALQGKVAGVQITNSGTPGASPQITIRGQGTVYGNNNPL
YVVDGVWFDDISFLNSNDIESMSILKDASSEAIYGVRAANGVVLITTKKGKGGKPTVNYN
GYVGVQKVTNMVKMANASQYAELVNELNGTTSFADPASLGKGTDWFDVILRKAFTTNHNV
SLSGSTDKSSYNMSIGYFNQQGNVKTNSYDRVTVRLQQDLQAYKFLKVGYNAILQGSNSK
DVPADIIYKAYTAAPVVPVYNADGTYGDPANYPIGNSPTNPQAQLDNYNQRTKDFRFNGN
MFGELKFNDHLTFRTSFGADVRQNEVRNYIPAYAATTNQFNTTSDLTLTKTQSRNWIWEN
TLTYNQTFNKDHRLTVLLGQSAQHYYNYYSIATVQNAPNSTATYYINSGDASTTTVRDYA
TITTSASYFGRVNYAYKDKYLLNASIRRDGSSAFSSDQRWGAFPSIGAGWVISNEDFFKD
QNIFNNLKIRGSWGKIGNSAIPANIYTNTVSRTGDLTAVYGTTNGVIASGANITTISNPI
LYWERGVGTDLGLEGSLFNNRFTFEIDYYNRVTQKGIFDVPVLKSLGTTNGSIITNQADF
RNRGWEFSAGWKGNTGKDFSYAINGNFSINNNKVTANYSGNNIIYVGSGATGGNTTSITT
VGLPISVFYGYRVTGIFQNAAQIASSSQKSASPGDFIYQDVNSDGVIDGKDRVVLGNPNP
KYQFGLNTTFNYKNFDLTVDIQGVAKVDVYNANKGLRYGAENYTLDFYKNRWHGEGTSNT
YPSANIGGGSNYYPNSWYVESGSYVRLRNLQLGYNLPSSVTSKLHIQRLRIYANAQNAVN
IFGYTGFNPEIGRTASAVSSSGVTSTAAGIDNGVYPLYATYNLGLNVTF
NT seq
3030 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagaatttacacaatctcgaggttggtattactgtgtctgttgttttcaactgta
gcttttgcacaaaatgttgcagttaaaggcaaagtaactgatgcaacaactggtgagttt
ttaccaggtgtaacagttgctgtacaaggaacaaccacaggtactcaaaccgatgttaat
ggtgcattcacaattaatgtaccatcaagtgctaccataactttttcttttgttggttat
actgcacaacaaatagcagtaaatgccagaactactttagatgtaaaactggccaataaa
gcaagtgagcttcaacaggtagtagtagtaggttacggaacccaaaggaagattgatgtt
acaggttctgtaagtcaagtaagaggtgaagagctttcgaagcaacctgatcctaatccg
gtaagtgctttacagggtaaagttgccggtgtgcaaatcactaactctggcactccaggt
gcttctccgcaaattactattcgtggccagggtactgtatatggcaacaataacccgtta
tacgttgtggatggggtgtggtttgatgacataagcttcttgaactctaatgatattgaa
agcatgagcatcctgaaagatgcctcaagtgaagcaatatatggtgttagagctgccaat
ggtgttgtattaattacgactaagaaaggcaaaggtggtaaacctacagttaattacaac
gggtatgtaggcgtacagaaagtaaccaacatggttaagatggctaatgcttcacaatat
gccgagttggtgaatgaactaaatggcactacttcgtttgctgatccggcaagcttgggt
aaaggtacagactggtttgatgtaattttgcgtaaagcatttactacaaaccataacgta
tcattaagtggtagtaccgataagtcgtcttataacatgtctattggttattttaaccag
caaggtaacgtaaaaaccaatagttatgatcgtgtaactgtacgtttacagcaagattta
caagcttataagtttttaaaagtaggatacaatgctatacttcaaggcagcaattctaaa
gatgtacctgcggatatcatttacaaagcttatactgcagcacctgtagtaccggtgtat
aatgctgatggtacatatggtgatcctgccaattatcctattggtaattcacctactaac
ccacaggcgcagctagataattacaaccagcgcactaaagatttccggtttaatggcaat
atgtttggtgaactgaaattcaatgatcatttaactttccgcaccagttttggtgctgat
gttaggcagaatgaagtacgcaactacattccggcatatgctgcaacaaccaaccagttc
aacaccactagcgatttaaccttaaccaaaacacagtcccgcaactggatttgggaaaac
acattaacttacaaccagacttttaataaagatcatcggttaacggtattgttgggtcaa
agtgctcagcattactataattattattcgattgctacagtacaaaatgcacctaattca
acagctacttactacatcaattcaggtgatgcatcaactactacagtaagagattatgct
actattactacatcagcatcgtactttggtcgtgtaaattatgcttataaagataaatat
ctgttaaatgcatctatacggcgcgatggttcatcagcattcagcagcgatcaacgttgg
ggcgcttttccttctataggtgccggatgggtaatctctaatgaagatttctttaaagat
caaaacatattcaataatttgaaaattcgtggtagctggggtaaaattggtaactctgct
attcctgctaacatttatactaacaccgtatctcgtaccggcgatttaactgctgtttac
gggacaactaacggtgtaattgcttctggtgctaacattactactatttcaaatcctatt
ctatactgggaaagaggtgtaggtactgatttaggtttagaaggtagtttatttaataac
cgatttacctttgaaattgactactacaatcgtgtaacccaaaagggtatcttcgatgta
cccgttctaaaatcattaggcacaactaacggttccattattactaaccaagctgatttt
agaaaccgtgggtgggaattctctgctggctggaaaggcaatacaggtaaagatttttcc
tatgctatcaacggtaactttagcatcaacaataataaagtaacagctaattatagcggc
aataacatcatttatgtaggcagtggtgctacgggtggcaacactacaagtattacaacc
gtagggttgcctattagtgtattttacggttacagagtaactggtatattccaaaatgca
gcgcagatagcatcatcttcacaaaagagtgcgagtccaggtgattttatctaccaggat
gttaatagtgatggtgtaattgatggtaaagaccgtgttgtactaggtaatccaaaccct
aaataccaatttggtttaaacactactttcaattacaaaaacttcgatctaacagttgat
atacaaggcgtagctaaagtagatgtatataacgctaacaaaggtttgcgttacggtgct
gaaaactacacgcttgatttttataagaaccgctggcatggtgaaggtacttctaatact
tatccttctgcaaacattggtggcggcagcaactattacccaaatagctggtacgtggaa
agcggcagttatgtaaggttaagaaatctacaattaggctataatttgccatcatcggtt
acaagtaagctacacattcaacggttaagaatttacgctaatgcgcaaaatgcggttaac
atatttggttataccggctttaaccctgaaatcggtagaacagctagcgcggtatcttct
agtggtgtaacatcaacagcagcaggtattgataacggtgtgtaccctttatatgctact
tataacttgggcttaaacgtaaccttctaa
DBGET
integrated database retrieval system