Marinomonas sp. RS-M-Aa-14: ACJ3XJ_19325
Help
Entry
ACJ3XJ_19325 CDS
T11562
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis protein
Organism
mrsm Marinomonas sp. RS-M-Aa-14
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
CoA_binding_3
RmlD_sub_bind
CoA_binding
GDP_Man_Dehyd
3Beta_HSD
NAD_binding_10
adh_short
KR
PglD_N
NAD_binding_4
GFO_IDH_MocA
C2185-like_N
Ldh_1_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XLW32120
LinkDB
All DBs
Position
4148304..4150280
Genome browser
AA seq
658 aa
AA seq
DB search
MIKKLDFLWSLPRFYKRLISLAVDALFVCLAFTFAYWARLGEFTSFSNHAVWYVLVGTVA
VTLLVNIKLGLYRAILRYLTFHAFTAILCGAAASALSITTFAYFFEASIPRTVPIIYFPF
LVMLCGGARLLIRGLITQSPRKGYESVLVFGAGSTGRQLTLALRQASCYRVKGFIDHDAS
LANTIIQGIPVYDVAKLEELIEKYQIEKVLLAIPKASRSDRKKVIDQLLPYAVEVLTVPD
FDDIVTGKAKVSELQDVAVDDLLGRDVVAPVASLMQSNIAGKVVMVTGAGGSIGSELCRQ
ILAQQPSKLVLFDVSEFAVYNIDQELNELLETLPFNVTIVPLIGSVQRINRLASTMKAFG
VHTVYHAAAYKHVPLVEYNVVEGVRNNAFGTYYCAKAAIESGVESFVLISTDKAVRPTNV
MGATKRMAELGLQALAEEEAKKEARQETYTRFCMVRFGNVLGSSGSVIPVFKKQIQENQP
ITVTHPDIIRYFMTIPEAAQLVIQAGAMGKGGDVFVLDMGEPVKIVDLATNLIRLSGLEV
KSPENPNGDIEIQFTGLRPGEKLFEELLIGDNVQKTQHKRIMTAHERFLSLPDFVQTMEK
LDKACHDFDHEKVREILISAPTDFQPTDGIGDLVWNAKQAQDQKIEESNVVPLKKQVL
NT seq
1977 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaagttggattttctttggtctttgccgcggttttataagcgtttgattagt
ttggctgtcgacgccctgtttgtgtgtttggcttttacgtttgcttattgggcgcgttta
ggtgagtttaccagtttttccaatcatgctgtttggtatgtgttggttggtacggtggcc
gttaccttgttggtgaatattaagctaggtttgtaccgtgctattttgcgttatttaact
tttcatgcgtttaccgcgattttgtgcggtgcggcggcgtctgcgttaagcattacgacg
tttgcttacttttttgaagcgtctattcctcgtacggttcctattatttatttccctttt
ttggtgatgttgtgtggtggggcgcgtttgttgattcgtggtttgatcacgcaatcgcca
cgtaaaggttatgaatctgttttggtgtttggtgcgggttctacggggcggcagttaacc
ttggcattgcgccaggcgtcttgttatcgggtgaagggttttattgatcatgatgcgtcg
ttggcgaatactattattcaggggattcctgtttatgatgtggctaagttagaggagttg
attgagaagtatcaaatcgaaaaagtattgttagcgattccgaaagccagccgttctgac
cgtaagaaggtgattgatcagttgctgccttatgcggtggaagtgttaaccgtgccggat
tttgacgatattgtcacgggtaaagccaaggtgagtgagctgcaggatgtggcggtagat
gatttgttaggtcgtgatgtggtggcgcctgtggcgtcgctaatgcagtcgaatattgct
ggcaaggtggtgatggtaacgggcgcaggtggttcgattggttctgaactgtgccgacaa
atattggctcagcagccatcgaaattggtgttattcgatgtgtctgagtttgcggtgtac
aacatagatcaagagttgaatgagctgttagagaccttgccttttaacgttaccattgtg
cctttgatcggatctgtacagcgcattaatcgtttggcatcgacgatgaaggcgtttggg
gtgcatacggtttatcatgcggcggcttataaacatgtgccactggtggaatacaatgtt
gtcgaaggggtgcgtaataacgcctttggtacctactattgcgctaaagcagcgattgaa
agcggtgttgagtcttttgtgttgatttccaccgataaagctgtacgtccaaccaatgtc
atgggagcgaccaaacgcatggctgaattgggcttacaggcgctggcggaagaagaagcc
aaaaaagaagcgaggcaggaaacgtatactcgtttttgtatggtgcgttttggtaacgtg
ctcggttcgtctggttctgtgattccagtatttaaaaaacaaatacaggaaaatcagccg
attaccgtgactcatccggatattattcgttatttcatgacgattcctgaagcggctcaa
ttggttattcaggctggcgccatgggcaaaggtggcgatgtatttgtattggatatgggt
gaacccgtaaagatagtggatttggcgacaaacctgattcgcttgtctggattggaagtg
aaatcgcctgaaaatccgaatggggatattgaaattcagttcacgggtttgcgccctggt
gaaaagttgtttgaagagttattgattggcgacaatgtccaaaaaacccagcacaaacgc
attatgaccgctcatgaacgctttttgtctttgccagattttgtgcaaaccatggagaag
ctggataaagcttgtcatgattttgatcatgaaaaagtgcgtgagatcttgatcagtgcg
ccaaccgattttcagccaacggatggtatcggcgatttggtgtggaatgcaaaacaggca
caagatcagaagatcgaagaatctaacgtcgtgcccttgaagaaacaggtattgtag
DBGET
integrated database retrieval system
