Methanobrevibacter ruminantium: mru_0796 Help Entry mru_0796          CDS       T01166                                  Name (GenBank) CRISPR-associated helicase Cas3   KO K07012   CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4] Organism mru  Methanobrevibacter ruminantium Brite KEGG Orthology (KO) [BR:mru00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02048 Prokaryotic defense system [BR:mru02048]     mru_0796 Enzymes [BR:mru01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      mru_0796 Prokaryotic defense system [BR:mru02048]  CRISPR-Cas system   Type I CRISPR-Cas system    Type I signiture cas proteins     mru_0796 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Cas3-like_C_2 DEAD ResIII Helicase_C PhoH Cas3_HD Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ADC46647 UniProt:  D3E286 LinkDB All DBs Position 1028497..1031322 Genome browser AA seq 941 aa AA seqDB search MVISHLNFNENESVIEINSDYFKVYAHKNELFNEHISKTLNIFKTIKSENILINFYDWFK DQGYIHLTFEEFNFLIEECVRFHDVGKLSFNFQLKRLNKNNPAKKKEQINVLKKFGLDSI LNQFEGNHSLSGALSFLSKYYDVLPKNELFFLILAYVIIGHHTNLKDIVSQDDFFYKEFE ENQALSTTLKFFALFFGLNQSTINQKFFQEINDIGFDFLENTINHYDSSFSFFYSYIYSL LISADSLATSEYKNSTDQIDYSKFNHRISDKLFAHMYKSFYNVKHNRNLLNETFNLNDIC PEDINVLRKAMLLESSETLNNALMDDDKKIFFLNMPTGGGKTNTSMKLALDMVKNTDANR IIYAMPFINIIEQNFDVICKSFGLNEEEGNIRQIYSASETIFNKSDEETLEIILSDDFFN YPVICTTFVSLFNPIIKNNKKYKYRLNALSNSVIILDEIQSLPLRNWVSLYFIINELSEK YNIYFLIMSATLPSFDKLKLENIRDDDNFLNYNNVSLINNPEKYFNHDLFSRTNINGGIK KLGINDDCSIDYFLEIIRENFSQDYNKGLIVLNTIKSSRLIYDKLKDFSQEYNFDIDLLN SSILPNRRKNIIHKINQEDLSNYILISTQSIEAGVDVSFDFVIRDFSILDSIEQVRGRCN RSRELNDKFHDSNIKGNVYLINLEDDNSNLYKYIYKDVELKTRIKETINLFNEGFELNDD LNYQYSNILTYYDNVSLDINDVHDSMDQSFLRNDRRNIVFWNKMKYSKIQKKKGIHIILN DLKQYSIFIPLDIKIYDDSLNLDKTIEDMDLNELREIYDEFGKHFIFSLNEILFMKENSD FLIEGDYVIGEEVLNHFQTMVARVKDDYNQKLLVEKVFSSILSNFIMNISFNNSDLEEQI KELDKESYFYILEKNMIGDSEEHFYSEEYGFNFKPTITNIL NT seq 2826 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt gtggttatctctcatttaaattttaatgaaaatgagtctgtaattgagattaatagcgat tattttaaagtatatgctcataaaaatgaattatttaatgagcatatctctaaaacttta aacatttttaaaacaattaaatcagagaatattttaatcaatttctatgattggtttaaa gatcaggggtatattcatttaacttttgaggagtttaattttttaattgaggaatgtgtc agatttcatgatgtggggaagttatcatttaattttcagttaaaaagattaaataaaaac aaccctgctaaaaagaaggaacaaattaatgttttaaaaaaatttggattagattctatt ttgaatcaatttgaaggaaatcactccttgtctggtgcattatcttttttatcaaaatat tatgatgttttaccaaaaaatgaattattttttcttattttagcttatgttattatagga caccatacaaatttaaaagacattgtaagtcaggatgattttttttataaggaatttgaa gaaaatcaagctcttagcactactttaaaattttttgcattgttttttggtttaaatcaa tccacaattaatcagaagttttttcaagaaattaatgatataggatttgattttttagag aatactataaatcattatgattcttccttttcatttttttattcatacatttattcttta ttaattagtgcagattcactagccactagtgaatataaaaactctacagaccaaattgat tattcaaaatttaatcatagaatatcagataagttatttgcccatatgtataaatcattt tataatgttaaacataatagaaatcttttaaatgagacatttaatttaaatgatatatgc ccggaggatattaatgttttaaggaaagcgatgcttttagaatcatcagaaactttaaat aatgctttaatggatgatgataaaaaaatatttttcttaaatatgcctactggaggaggc aaaacaaatacttctatgaaattagctttagatatggtaaaaaatactgatgctaatcgt attatttatgcaatgccttttattaacattattgagcaaaattttgatgtaatttgtaaa tcctttggtttaaatgaagaagaggggaatatacgtcaaatatattccgcatctgagact atttttaataaaagtgatgaagagacattagaaataattttatctgatgatttttttaat tatccggttatttgcactacttttgttagtttatttaatcctataataaaaaataataaa aaatataaatatcgtttaaatgcgttatctaattcagtaattattcttgatgaaattcaa tctttacctttgaggaattgggtgagtttatattttatcattaatgagttatctgaaaaa tataatatttattttttaattatgagtgcaactttacctagttttgataagttaaaatta gaaaatattagggatgatgataattttttaaactataataatgtttcattaattaacaat cctgaaaagtattttaatcatgatttgttctcaagaactaatattaatggaggaattaaa aaacttggaataaatgatgattgtagtatagattactttttagaaattattagagaaaat tttagtcaagattataataaaggacttatcgtcttgaatacaattaaatcatctagattg atttatgataaattaaaagacttttctcaggaatataattttgatattgacttattaaat tcaagtattttgcctaataggcgaaaaaatattattcataaaatcaatcaggaagattta tcaaattatattttaattagtacccaaagtattgaagctggagtggatgtaagttttgat tttgtaattagggatttttcgattttagattcaatagaacaagttcgaggtagatgcaat aggagtagggaattaaatgataagtttcatgattctaatattaaaggtaatgtttattta attaatttggaggatgataatagtaatctttataaatatatttataaagatgtggaactt aaaacaagaattaaagaaacaattaatctttttaatgaaggttttgagttaaatgatgat ttaaattatcaatatagtaacatattaacttattatgataatgtttctttagatataaat gatgtgcatgattctatggatcaatcattcttgcgtaatgatagaagaaatatcgtgttt tggaataaaatgaagtattctaaaattcaaaaaaagaaaggcattcatattatattaaat gatttaaagcaatattctatatttattccattagatattaaaatttatgatgattcttta aatttggataaaacaatagaggatatggatttgaatgagttaagagagatttatgacgaa tttgggaaacattttattttttcattgaatgagattttatttatgaaagaaaatagtgat tttttaatagaaggagattatgttataggggaggaggtattaaaccattttcaaactatg gttgctagagtaaaagatgattataatcaaaaattattagttgaaaaggtattttcatct attttaagcaattttattatgaatatttcttttaataattccgatcttgaggaacaaatt aaagaattagataaagaaagttatttctatattttagagaagaatatgattggtgattct gaggagcatttctattctgaagaatatggttttaattttaaacctactataacaaatata ttatga

DBGET integrated database retrieval system