KEGG   Mucilaginibacter rubeus: DEO27_006435
Entry
DEO27_006435      CDS       T06362                                 
Name
(GenBank) T9SS type B sorting domain-containing protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
mrub  Mucilaginibacter rubeus
Pathway
mrub02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mrub00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    DEO27_006435
SSDB
Motif
Pfam: Ig_7 PKD_5 CHU_C SprB
Other DBs
NCBI-ProteinID: QEM09672
UniProt: A0A5C1HUT0
LinkDB
Position
1576526..1581838
AA seq 1770 aa
MNNRLLVLLFLLLSFKAKAQNCTLNVNLTATSTTICSGSSVVLTAEATSGTAPYTYLWST
GETASAISVNKSGTYTVTVTDKTSGCKGVTKSVIIVAANTPAAPTAKSVVVCQNSTATLT
ATGPGGDYQWFDAPVDGNFLGGSSTFTTPPITASVTYYVQTTVAGCTSPRAPVSVYITGR
PEVVSAATCLGGVVTLSASGGQSYTWYASADGGTALQTGSSFVTPPLTKTTTYYVVAVIN
GCTSLPTPVTAWVNAPPPTPVAANANICSGSVATLHADASAGFFQWFDVPTGGTPLISSP
DYTTSVLTASKTYYVQTVLGDCVSQRVPVTVSVNPIPVAPEPQTITVCNGSVATLTAAVN
PTGTYAWYDAPTGGRLLKSGLKFTTPALTKTTTYYLENTSVAGCTSDRAPVKVNVNPFIV
APVANGAAICYGSIATLTAISAGNGTYQWYDAPTGGKLLSSQAGYTTPALTTSTTYYVQT
TVGDCASARTAVPVTVIPQVAAPQVPATTVCYNGSVVLTATGSGAGFTWYDSALGGKILS
SGSTYVTPNLTANATYYVESASNDCISARTAVTVKVNPQPSAPTASNTSVCSGTSARLTA
TGDGDILWFASPTSASPLFTGSTFNTPIISEQTTYYIQSRVGDCLSTRAPVTVSINSAGD
TQFLYTSGTFSPLSPNPKPIITNPSGGTFSASPAGLVFADVHTGEIDVKASAPGKYIITL
TGNGQCSSTYSAGVEIVSIFDAKFSYGGPFCQYGANPKPMFPPTSSAGTFSAIPSGLTFA
STSTGEINLSKTTPGTYEVTNTIYNPDGTVGSSATAKVTIEAGALVKAGLDQNIKAGEIV
YLTGSIMGVNGGKWSGGLGKFAKATDPVTTYTPAPGEKQVTLTLTSNDPPGNCGPGFDRV
VINIGSTLQAPIASGTNTCMGSIATVSATGPGGTYRWYDAAENGTLLSTGPNFITPALTQ
TTTYYVNTTANGLTSDMTAVTVTVNVPPTAPVASSIGACEGSQTTLTATGSPGTYQWYDA
PVGGTLLSVKSTYVTPALIANTSYYVQAVVNGCISERTKVDVTIKPLPVITSGSADNVCS
GVQQSYSITADQAGTTFLWSRAVVDGISNAAVSGQTSAQITETLINTKKDPVDVTYLITP
VSNGCSGTPFSYVVTVYPTPQVTSAPTGTLCNMTASNYTITFSIPGVSSSWSRDAVPGIS
NLAVSGQMAGTVREILFNTTNAPVDVAYVYNYQTSNCAGLPFKWVVKVNPSVNVTSSASG
QACSGEPLNYTITSNVQSATFTWSRAAVPGISNAAVTNKTGNKIDEILVNKGASPVNVLY
VITPSAFECDGAPFAYVVKVNPEVQVPDMRTNSPVCVNSTIKLNVPTTPNATYTWTGPNG
FKSALQNPEIKNVTTDMTGTYSLYITVNGCSSPVVSKEVVVNKPPTSSAGSNILACVTDQ
YIQLAGRIGGGTTTGVWSKKGSNPGQFLPSANEQNAKYEPTAEDKAAGSVTLVLTSTSKD
DCTIATSEMTINFGKTPGTNAGPDLEVCARPDPIKLDGNVLISGGGKWTSSGTGTMQFAE
NAQGAVYTPSDEDVKSGSVKLTLTANAPGQCYTASDDMVVKFIPPPTVNAGGIRYVLKNH
TITLTPTVSDENVQYLWLPDIGLSNNKVKEPVLTGDADIVYTLYVTDVRGCVNQSQTIIK
VSPDITVPNTFTPNGDGFNDFWEVKGLVAYESSTVDVFNRYGERLFHSIGYGVPWDGNFN
GRQLPAGTYYYIIDLKTGKPPLSGSVTILR
NT seq 5313 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaacaaccgtttattagtattattattcctgttattgtcatttaaagcaaaagcgcaa
aactgcactttgaatgtcaatctcacggcaacgtcaaccaccatctgttcgggcagttct
gtggtgttaacagccgaagctacttcggggaccgcgccgtatacctatttgtggagcaca
ggcgaaaccgcgtcggccatcagtgtaaataaatctggtacttatacggtaaccgttacc
gataaaacatccggttgcaagggtgttacaaaaagtgtaatcattgttgcagctaatact
ccggctgctccaacggctaaaagtgtggtggtttgtcaaaatagcacggcaacgcttacg
gctacaggccctggtggcgattatcaatggtttgatgctccggttgatggtaatttttta
gggggctcaagtacttttactacgccaccaataacagcatcagtcacttattatgtgcaa
actaccgttgcaggctgtaccagcccgcgcgcgccggtttctgtatacataaccggtcgg
cctgaagttgtaagtgccgcaacttgtttgggtggagtagttacgctatcggcaagcggg
gggcaaagctatacctggtatgcatcggcggatgggggaactgctttgcaaacagggtca
tcatttgttacaccgccattaactaaaactaccacctattatgttgtagctgtaattaac
ggatgcaccagtttacccacgccggttacagcctgggttaatgcgccgccgccaaccccg
gtggctgcaaatgccaacatttgctcggggtcagttgcaactttacatgcagacgcatct
gcaggcttttttcaatggtttgacgtgccaacaggtggtacaccgcttatttcaagccct
gattatacaacgtcggtattaaccgcaagtaaaacctactatgtgcaaacggtacttggt
gattgtgtaagtcagcgcgtaccggtaacagtatcagttaatccaatacccgtagcaccg
gaaccgcaaaccattactgtttgtaatggttcggtagccacattaacagcagctgtaaat
cctaccggcacatatgcatggtatgatgcaccaacaggtggccgcttactaaaatccgga
ttgaaatttacaactccggcgttaaccaaaaccactacttattatcttgaaaatacttcg
gtggcaggttgtacaagcgatcgggcaccggtaaaagtgaatgttaacccattcatagta
gcaccggttgccaatggtgctgcaatttgctatggctctatagctacgttaactgcaatc
tcggcaggtaatggtacctatcaatggtatgatgctccgactgggggcaaacttctgtca
tcgcaggcaggatatactacaccggctttaacaacaagcactacttattacgtgcaaact
actgttggtgattgtgccagtgccaggacagccgtaccagtaactgttattccgcaagta
gctgcaccccaggtgcctgctactactgtttgctataatgggtcggtagtgcttaccgcg
acaggtagcggtgcaggttttacctggtatgatagtgctttaggaggtaagatcctctca
tcaggctcaacatatgttacgcccaatttgacggcaaatgcaacgtattatgttgaaagt
gcctcgaatgattgtatcagtgcccgcacggcggttactgttaaggtaaatccgcaacca
tcagctccaacagcttctaatacttcggtttgttccggaacatcggccaggttaacagcc
accggcgatggagacatcctttggtttgcaagcccaacatcggcaagcccactgtttacc
ggtagtacatttaacaccccgatcatctccgaacaaacaacttactatattcaaagcagg
gtaggtgattgcttaagtacccgcgcacctgttacggtttctatcaattcggcaggcgac
acgcagtttctttatacttcaggcacttttagtccgcttagccctaatcctaagccaata
attactaatccatcgggtggtactttcagcgcttcgccggctggtttggtttttgcagat
gttcataccggcgagattgacgttaaggcaagtgcaccaggtaaatatattattacccta
actgggaatggccaatgttcgtcaacctatagtgccggggttgaaattgtttccatattt
gatgccaagtttagctacggaggcccgttttgccagtatggggccaacccaaaaccaatg
tttccgccaacttcaagtgccggtactttttcggcaataccctcgggcctgacgtttgcc
agcacatcaacaggcgaaatcaatttaagtaaaacaacgcctggtacttatgaagttacc
aataccatttataacccggacggtaccgtgggtagctcagctactgcaaaagtaaccata
gaggcaggcgcattggtaaaagcagggcttgaccaaaatataaaagccggagaaatcgta
tatttaacaggtagcataatgggtgttaacggaggtaaatggtcgggtggattgggcaaa
tttgctaaggctacagatcctgttaccacttatacaccagccccaggcgaaaaacaagta
acgcttactttaacatcaaacgatcctccgggcaattgcgggccagggtttgacagggtt
gttatcaacataggttcaactttgcaggctccgattgcatcaggcactaatacctgtatg
ggaagcatcgctacagtatccgctacaggccccggcggtacatatcgctggtatgatgcg
gcggaaaacggtacactgttgtcgacgggccctaactttattaccccggcgctcacgcaa
acaaccacgtactatgtaaatactacggccaacggcctaaccagcgatatgacggcggta
actgtaacggttaacgtgcccccaacagcgccggtagccagcagcataggagcatgtgaa
ggcagtcaaactaccttaacggctaccggttcgccaggtacatatcagtggtatgacgcg
ccggttggaggaactttgctatctgtcaaaagtacttacgtaacacctgcccttattgcc
aatacaagctattatgtacaggccgtagtaaatggttgtatcagcgaacgtactaaggtt
gatgtaacaattaaaccgctaccggttattaccagtggttcggccgataatgtttgcagt
ggtgtgcagcagagttattccattactgctgatcaggctggcaccacatttttatggtca
cgtgcggtggtagatgggataagcaatgccgcggtatccggtcaaacatcggcacaaata
accgaaactttaattaacactaagaaagatcctgttgatgttacttatttaataactcct
gtatctaatggttgctctggtacgccgtttagttatgtggtaacggtttaccctacgcca
caggttacaagtgcgccaacaggtactttgtgtaatatgaccgccagcaattacaccata
acttttagtattcccggtgtaagttcaagctggtcgagagatgctgttcccggtatcagc
aatctggctgtatcagggcaaatggctggcactgtccgcgagatattgtttaatacaacc
aatgctcctgttgatgttgcctatgtttataattatcaaacaagtaactgtgccggtttg
ccttttaaatgggttgtaaaagttaatccatcggtgaatgttaccagcagcgcttccggt
caggcctgtagtggagagccacttaattataccattacttccaatgttcagtcggcaacg
tttacctggagccgtgctgctgtaccaggaatcagcaacgccgcggtaaccaataaaacc
ggcaacaagattgatgaaatactggttaataaaggggcgtcacctgtaaacgtgctttat
gttatcacaccatcggcatttgaatgtgatggtgccccatttgcctacgtggtaaaagtt
aatcccgaagtgcaggtaccagatatgagaacaaactcgcccgtatgtgtgaacagtacc
attaaattgaatgtaccaaccacgccaaatgcaacttatacctggacaggccctaacggt
tttaaatcggccctgcaaaatccggagattaagaatgtgacaaccgatatgactggcact
tattctttgtatatcaccgttaatggttgcagcagtcctgtagtttcaaaagaggttgta
gtgaacaaaccgcctacttcatctgcaggttctaatattttagcttgtgttaccgatcag
tacattcaattggcaggtaggataggaggtggcactactaccggtgtctggtccaaaaaa
ggatctaaccctggtcagtttttaccttctgccaacgaacagaatgcaaaatatgagcct
acagccgaagataaagccgccgggtctgtaacattagtgcttacatctaccagtaaagat
gactgtactattgcaacatcagaaatgaccataaacttcggtaaaacaccgggtacaaat
gctggtcccgatctggaagtttgtgcccgccccgacccgattaagctggatggtaatgtg
ttgatatccggaggtggcaagtggacaagctctggtacgggcacaatgcaatttgctgaa
aatgcccagggagcggtttatacaccatcagatgaggatgtcaaaagcggatcggtgaaa
cttacccttaccgcaaacgcgccggggcagtgctacacagccagtgatgatatggtagtt
aaatttattccgccgccaaccgtaaacgctggcgggatacggtacgtgctaaaaaatcat
accatcaccttaaccccaaccgtaagcgatgaaaatgttcaatacttatggttacctgat
ataggcttgagcaataataaagtaaaagaacccgtgttaaccggcgacgctgatattgtt
tatacgctttatgttactgatgttaggggctgtgttaaccaaagccagaccattattaaa
gtgtcgcccgatattactgttccaaatacttttacccctaatggcgacggtttcaatgat
ttttgggaagtgaaaggcttggtagcttacgaaagctcgacagttgatgtatttaacagg
tacggtgaaagattattccattcgataggctacggtgtgccatgggatggcaactttaac
ggacggcaattaccggcaggcacctattattatatcatcgatctgaaaacggggaaaccg
cctttatctggttcggtaactatattgcgatag

DBGET integrated database retrieval system