Mucilaginibacter rubeus: DEO27_023550
Help
Entry
DEO27_023550 CDS
T06362
Name
(GenBank) response regulator
Organism
mrub
Mucilaginibacter rubeus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
Response_reg
HATPase_c
HisKA
Y_Y_Y
Beta-prop_LRRK2
SGL
HATPase_c_3
FUT8_N_cat
DUF3450
DUF4381
UPF0242
SLC52_ribofla_tr
RNase_Y_N
DUF948
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEM12858
UniProt:
A0A5C1I5Z1
LinkDB
All DBs
Position
complement(5893191..5897435)
Genome browser
AA seq
1414 aa
AA seq
DB search
MADPNFTAYYGRIKYTLTFFLLFILGASLNLSAQISDSRFRHISNEQGLSNSTINCIFQD
SRGFMWFGTRDGLNRYDGSKVIIYQNNPADKASISDGFINCIYEDADHKLWIGTNYNLNK
FDPITNKFSASGFKNITVTAITAKDDSHLWIGTQGNGISLLDTRNGKAVRVSNAGLSCDT
VNTLYKDAKGNLWVGTRHGLCVYDAAKSVFKPFATNTPVAGCDITSITADKANNIWIGTN
GQGAATFDAQGKHFKLFVHNDMDNGSLSGNMVLQVLCDRDGEIWIGTINQGMNWYDAKTN
KFVKYFPRPENTGSLSNTTVSAIYEDVQHDLWIGTHRGGINLYTAETDKFKLYRQGINES
TLSYNDVKAFFEDSRGNIWVGTDGGGLNLFNRNTEQFRQYKFNPYNASSISSNAIQDIAE
DGQGNIWVGTWGGGINLMDPATGKFTRFKANPADRNAVSSDFMQRMLLDSRGNFWVATYF
GGLNLLDTKTHKFARVLKDPDGKTSFEGNNVVSVGEDKDGNVWFGTDDGGLNCYNLNTRR
FSHYFDHEKKKTDSRVIFTDSKGRVWIGMAGLYLFDKAHNKFNLFTDRGNLSTDFIKGIT
EDEKHNLWISTSTGINRLNPETGDNKQFNTYDGLQGTEFEANAYLKTRDGEMYFGGVKGF
NRFYPEKIKANAFIPPVYLTDFQLFNKLVLPGGKDSLLKADIGFTHKITLNYDQSSVAFN
FVALNYIVSRNNLYQYKLDGLDKEWVKAGMERRATYTNLDPGTYTFHVKASNNDGVWNNT
GASVMIVITPPFWVRWWFRLLVVLLIILAAYSFYAYRINTIQKQKAHLEKLVQERTREVV
QKASELEVKSNELQDAYEELQAQSEELKTQSEELQVQSEHLHELNGQLVEQKEQEQQARE
EAEKANQAKSIFLATMSHEIRTPMNGVIGMASLLAETKLDYEQREYTDTIISCGEGLLSV
INDILDFSKIESGKMEVEHEDFDLRHTVEEVMDIFAQRAAQQKIDLIYQIDADVPLYIVG
DSLRIKQVLINLINNAIKFTSKGEIFIKVFLIEQIGQEAEIGFSVKDTGIGIPEEKISRL
FKAFSQVDSSTTRKYGGTGLGLAICQRLVNLMGGDISAASIYGEGSVFSFSIKTVKSKNP
VRTPLVCDLAALAGSRILIVDDNNTNLFILKTQLEHWKLEPVTASSGPEALAVLNKDNSF
KLLITDMEMPEMDGVGLANQVKVKYPQLPVVMLSSIGDETKSKFPGLFSSILVKPVKQHH
LCMSIQKAFNQDNTATTEVAAKSVLSADFAKDYPLRILVAEDNPINQKLIERVLGKLGYQ
PDIASNGVFVLEKLDEKYYDIILMDIQMPELDGLETTAQIRGRGGNQPYIVAMTANAMQE
DREICMQAGMDDYLSKPMRLEDLVTILQKVQVTG
NT seq
4245 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgatccaaatttcacggcatattacggccgtataaaatataccctgacctttttt
ttgctgtttattttaggggcttcgcttaatttatctgcacagatctccgattcccgattc
aggcatatcagtaatgaacaggggctttcaaatagcaccatcaattgcatttttcaggat
agtcgcggctttatgtggtttggcacccgcgatggcttaaaccgttatgatgggtcaaag
gtgatcatctaccaaaataatcctgccgataaggcaagcataagcgatggcttcattaat
tgtatttatgaagatgctgatcacaagctttggataggaaccaattataatttgaacaag
tttgatcccattaccaataagttttcggcaagtgggtttaaaaatataacagttaccgct
attactgctaaagatgacagtcatttatggatcggtacacaaggtaatggcatcagtttg
cttgatacacgtaatggtaaagctgttcgcgtaagcaatgccgggcttagctgcgatact
gttaatacgctttataaagacgctaagggcaacttatgggttggtacgcgccatggcctt
tgtgtatatgatgctgccaaatcggtatttaaaccttttgcaactaacactccggttgcc
ggctgtgatattacttccatcactgccgataaggccaataacatttggataggcactaac
ggacagggcgcagcaacattcgatgcgcagggtaagcatttcaaattatttgttcataat
gacatggacaacggcagtctgtcgggaaacatggtgctgcaagtactttgcgacagggat
ggcgaaatctggataggaactattaaccagggcatgaactggtatgatgccaaaaccaac
aagtttgtaaaatatttcccacggcccgaaaatactggcagcctttcaaatactaccgtt
tcggcaatttatgaggatgtgcagcacgatctttggataggcacacatcgcggcggtata
aacctttataccgccgaaacagataagtttaaactgtacaggcagggcatcaatgaaagt
accttaagctataatgatgttaaggccttttttgaagatagccgcggcaacatttgggtc
ggtaccgatggcggtgggctgaacctgtttaatcgcaatactgagcagtttcgccagtat
aagtttaacccgtataatgcgtcaagtatctcaagtaatgccatacaggatatagccgag
gatgggcagggcaatatctgggttggtacctggggcggaggaatcaacctgatggacccg
gcaaccggtaagtttacccgttttaaagccaacccggctgatcgaaatgccgtaagctca
gattttatgcagcggatgctgttggatagccgtggcaatttttgggtagccacttatttt
ggcggtctcaatttactggataccaaaacgcacaagtttgcccgggtgcttaaagatccg
gatggcaaaacctcatttgaagggaacaacgttgtttcggtaggggaggataaagatggt
aatgtgtggtttggtaccgatgatggcggccttaattgctataatctgaacacgcgccgc
ttttctcattattttgatcacgaaaaaaagaaaacggattcgcgggtaatttttactgat
agcaaaggccgggtttggataggtatggcaggcttatacctgtttgataaagcgcacaat
aaatttaacctgtttactgatagaggtaatttaagcactgattttattaaagggatcacc
gaagatgaaaaacataacctctggatttctacatcaacagggatcaatcgcctaaatcct
gaaaccggcgacaataagcaatttaatacttatgacggcctgcagggtaccgagtttgaa
gccaatgcctatcttaaaacccgcgatggggaaatgtactttggcggcgtaaagggcttc
aacaggttttatcccgaaaagataaaagccaacgcgtttatcccaccggtttatctgacc
gattttcagttgttcaataaattggtattgccgggcggcaaagattctttactgaaagca
gatatcggctttacccataaaataacgcttaactatgatcaatcatctgtagctttcaac
tttgtggcgcttaattacattgtaagccgcaacaacctgtatcaatataaattggatggc
ctggataaagaatgggtaaaagcaggaatggaacgaagggctacttataccaaccttgat
ccgggaacatatactttccacgtaaaagcatctaataacgacggcgtttggaacaatacc
ggagcatcagtaatgattgtgatcactccgccgttttgggttaggtggtggttcaggcta
ttggtggtgttattaatcatattagccgcatatagcttttacgcctatcgtatcaatact
attcaaaagcagaaagcccatctcgaaaaactggtgcaggagcgtacgcgcgaggtagtt
caaaaagcaagcgaactcgaggtaaaatcaaatgaactgcaggatgcttatgaggaactg
caggcgcagtctgaagagttaaaaacccagtcggaagagttgcaggtacagtctgaacat
ttacatgaacttaatggccagttagttgagcaaaaggagcaggagcagcaagctcgtgaa
gaggctgaaaaagccaaccaggccaagagcattttcctggctaccatgagccacgagatc
cgtacgccaatgaatggggttataggtatggcctcgttgcttgccgaaaccaaacttgat
tatgaacagcgggagtataccgataccattatcagttgcggcgaaggcttgctgagcgtg
atcaacgatatccttgatttttcaaagatcgaatcgggtaagatggaggtggagcatgaa
gattttgacctgcgccatactgttgaagaggtgatggatatttttgcgcaaagggccgcc
cagcaaaaaatagaccttatttatcaaattgatgctgatgtaccgctgtatattgtaggt
gatagtctccggattaagcaggtgcttatcaaccttatcaataacgccatcaagttcaca
tcaaaaggcgagatctttatcaaagtatttttgatagagcaaattggccaggaggcagag
attgggtttagtgttaaagataccggcattggtattcccgaagaaaagatctcgcgcctg
tttaaagcattctctcaggttgattcatcaactacccgtaaatatggaggtaccggcctt
ggtttggctatttgccaaagactggtgaatttaatgggaggtgatatttcggctgcgagt
atctatggtgaaggatcggtgtttagtttttctatcaaaaccgttaagagtaaaaatcct
gtacggacaccattggtttgtgacttggcggctttagcaggctcacgtatcctgatagtt
gatgataacaatacaaacctgttcatccttaaaacgcagctcgaacattggaagctggaa
cctgtaacggcatcgtcaggccccgaagctttggccgtacttaataaggataacagtttt
aagctgttgataaccgatatggaaatgcctgaaatggacggcgttggcctcgcaaaccag
gtgaaagtcaagtatccgcaactgcctgttgtgatgctgagttccattggtgatgaaacc
aaaagcaaatttcctgggctgttttcatccatattggttaaaccagttaagcagcaccac
ctgtgcatgagtattcagaaagcgtttaaccaggataacacagcaacaaccgaagttgca
gctaagagtgtattgtcggccgattttgctaaggattacccgctccggattttggtggcc
gaagataacccgataaatcagaaactgatagagcgcgtattgggtaaattaggatatcag
cccgatatagcttccaatggtgtatttgtactggaaaaacttgacgaaaaatattacgat
atcattttaatggatatccagatgcccgaattagacggcctggaaaccacagcccagatt
cgcggacgaggcggaaatcagccatacatcgtggccatgacggccaacgctatgcaggaa
gatcgtgaaatctgcatgcaagccggtatggacgattatctttcaaaaccaatgcgtctg
gaagacctggtaacgatattgcaaaaagtacaggttactggataa
DBGET
integrated database retrieval system
