KEGG   Marivirga salinarum: QYS49_34880
Entry
QYS49_34880       CDS       T10279                                 
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
msaa  Marivirga salinarum
SSDB
Motif
Pfam: TPR_1 TPR_2 TPR_11 TPR_16 TPR_8 TPR_12 TPR_9 ANAPC3 TPR_14 TPR_19 TPR_17 TPR_6 TPR_CcmH_CycH TPR_10 ARM_TT21_N ARM_TT21_4th SHNi-TPR ChAPs PPTA TPR_15 NatA_aux_su EF-Ts_N Rapsyn_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: WMN12873
UniProt: A0AA51RDA4
LinkDB
Position
1847187..1851926
AA seq 1579 aa
MLKIYRNILTIIFSISSLVAFSQAEQSLYFVQTYDNAGQPLQKGTAIILDGQGTGATHQN
LFIGATSAKVFTQDSSVHNISTFNAHDPATGLVKFAVDNNLSTKFQKASIKAGKFEEAGS
FTLLQSTDIQKTESSDVKIAKSKEIEGFGTFAVIPDNLKKSAIGAVVLSGNDMLGIILNE
ANGVNGAVIIDLGRLEKANPITNGFSNFAQRINVNGHLLSALNAYANEEWNNALNAFEEF
ANQNPKDEFAWKMAGFSAFEAKNYDKTISNLTNAFKIKSSPRAYSIRAFAYFEQKKYTEA
INDFAQSQDEKVNEAKWHAYKGISHYELDQLGQAIPDLEKAVELKYEDPQVSYYLGNAHF
KNDDFAKAITAYDQAEKLGYESEVLFNNRGKAKFLTEKYEAAIKDYTTSLGLKANYQTAL
ENRGAAYYKTEDWENSIKDFEKAIQAGTNDADVFLQLAEAYFNTENYSSAITNFDKAING
GKNEAEVYRKRGVAHLKEKNSDKAIVDFNAAVQRGANDGEIFQLLGTAQFEKGTYEEALQ
NLERAISFQVSDSNLYKNAAIASQKLNRNEGAITYFKKAIATGAKSPDVFEQYAILLYET
GNTQEAKINIERAMSAGASGEKLFLYKGYLAITDKNWDAAISSLQKAKDGGVREAGLYSA
LGKAYYHKDDYNSAIENLKQAFQAGDRTGENYELIGQSYFKVENYEEASRALNSAIQGGI
INQSVYFALGQSLFEQGNFKNAVDALTKAEEQGENSLILFEKRGLANNELKSAEPAIADL
SKASEKGSKSIEVYATLGDLYFRSQNLIKAVESYDKAISLGAKDAVIYNNRGKAKFLQDK
ISAAIADYNLALAEKPDYDQALLNRGSAHYKQENYSAAIADLVKTEKKSPEVAEMLGLAY
YKTQQFDKALQNMESAISGGVKNAELYYFKGNILYDKEEYRQAVSDFQKAEEGGISEGAL
YAKVGNAFFELESFKQSAEQLSKAVDKGVSDKIVIENLGNALYEGKKYEEASKFLQRAIG
FGTQNPKTHYHYANTLFREDRFKDAIKSYDEAIALGQKDEVIYNNRGKAKANLDQFELAI
QDYNQSLSIDENYGQAILNRGNAYYELEAYQEALNDYVRAVALAQTDNDTFVKMGLSYYS
LDNFEQTIEYMDQAFQTGNQSPNVFYGRGNAYYNLGQLDNAYSDLNQAVTFGDNHPETYF
HRGQINFQKEEYELALSDFNKAEEYGSKAEQLYFLRAKTHYALSNWKDALEDFNLAIAAD
KELYEAFALRGNTKFRLDDLSGAINDYNIAIAGGIEEAVYFNNRGKAKQLSGNIEQAIED
YDKAISTDSEYARAYENRASARYEMKNYAGVIEDVDKLEDLDEANPNAFYIKAESYYALE
DWVGAISYFERAIQGEVIKSDSYFKRGRSYLGVEDYQAALDDFNRAAEADPSNASIYLYR
AQCYLYLGEVRYAAEDYSKAITLEPENTDAYYNRAILREETEDWEGALQDYDKVVQLDPE
DASAYYYRGNVKAVLENYQPALKDLNKAIELNSEDASYYKLRGNIYYQLEDDLKACEDWK
RAKNMGDDSVNYYLNQYCE
NT seq 4740 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctgaaaatatacagaaatatacttaccattattttttcaataagctcgcttgtagct
ttttcacaagctgagcagagtttgtattttgtacagacttatgataatgcaggacagcct
ttgcaaaaaggaacagctattattttggatggtcagggaacgggggctacccatcagaat
ttgtttataggcgccactagtgctaaagtctttacccaagacagctctgtccataatatt
tctactttcaatgcacatgatcccgctactggtttagtgaaatttgctgtggataataat
ctgagcaccaaatttcaaaaggcttccataaaagcagggaaatttgaggaggcaggttcc
tttactttattgcaatcaacagatatacagaagacagaaagtagtgatgtgaaaattgct
aaatcaaaagaaatagaaggctttggaacgtttgctgtaattcctgataacttaaaaaaa
tcagcaataggtgcggttgtgttatctggaaatgatatgctaggtattattttgaatgaa
gctaatggtgtaaatggtgcagtaattattgatttaggccgtttagaaaaagccaatcct
atcactaacggattctcaaattttgctcaaaggattaatgtaaatggacatttattgtca
gccttaaatgcttatgcaaatgaagagtggaacaatgctttaaatgcctttgaagaattc
gctaatcaaaatccaaaagatgaatttgcatggaaaatggctggattctctgcttttgaa
gctaaaaattatgataaaaccatcagtaacttaacaaatgcatttaaaataaaatctagt
ccaagagcttattctattagagcatttgcttatttcgaacagaagaaatatacggaagca
atcaatgattttgctcaaagccaagatgaaaaagtaaatgaagctaaatggcatgcttac
aaaggaatttcgcattatgaattagatcagttgggtcaagcaattcctgatttggaaaaa
gcagttgagttgaaatatgaagatcctcaagtaagctattatttaggaaatgcgcatttt
aaaaatgatgattttgcaaaagccattacagcttatgaccaagcagaaaaattaggctac
gaatcggaagtacttttcaataatagaggaaaagccaaattcttaactgaaaaatatgaa
gctgcaattaaagattatacaacctcattgggtctaaaagcaaattatcagacagctttg
gaaaataggggagccgcttattataaaactgaagattgggaaaactccattaaagatttt
gaaaaagcaattcaagcaggtaccaatgatgctgatgtttttctacaattagccgaagct
tactttaacactgaaaactattcatctgccatcaccaattttgataaagcaatcaatgga
ggtaaaaatgaagctgaagtttatagaaaaagaggggttgcacatttgaaagaaaagaat
agtgataaagctattgttgatttcaatgctgcggttcagagaggagctaatgatggtgaa
atattccaacttttaggaacggcacaatttgaaaaaggaacttatgaagaagcacttcaa
aatttggaaagagctatttcatttcaggttagtgatagcaatctttataaaaatgcagct
attgcaagtcaaaagttgaataggaatgaaggtgccattacttatttcaaaaaagctata
gcaacaggagctaaaagtcctgatgtttttgaacaatatgcaattcttctgtatgagact
ggaaacactcaggaggctaaaattaatatcgaaagagctatgtctgctggtgcttctggt
gaaaaattatttttgtataaagggtatttagctataacggataaaaattgggatgcagcc
atttcttctttacaaaaagctaaggatggaggggtgagagaagcaggcttgtattccgct
ttaggtaaagcctattaccataaagatgattataattcagctattgaaaacctaaaacaa
gcattccaggcaggagaccgcacaggcgagaattatgaattaattggacaatcatatttt
aaggtagagaattatgaggaggcttcaagagctctgaattcggcaattcaaggaggaatt
attaatcaatcagtttattttgctttggggcagtcgttatttgaacaagggaatttcaaa
aatgcagtagatgcacttaccaaagctgaagaacaaggagaaaacagtcttattttgttt
gaaaaaagaggtcttgcgaataatgaattgaaatctgccgaaccagctattgcagaccta
tcaaaagcatcggaaaaaggaagcaaaagcattgaggtttatgctactttaggagatttg
tattttcgttctcaaaatttaatcaaggcagttgagtcttatgataaagctatcagttta
ggtgcaaaagatgcggttatttataataacagaggaaaagctaaatttttacaggataaa
atctctgcagccatagccgattataatcttgctttagctgaaaaaccggattatgaccaa
gctttattgaatagagggtctgcacattataaacaagaaaattattcagctgccatcgct
gatttagtaaaaacagaaaagaaaagtcctgaggtggcggaaatgctcggtttggcatat
tacaaaacccaacagtttgataaggcgctacaaaatatggaatctgccatcagcggagga
gtcaagaatgcagagctttattatttcaagggaaatattttgtatgataaagaggaatac
cgtcaggctgtaagtgattttcaaaaagctgaagagggcggaataagtgagggtgcttta
tatgccaaagtgggaaatgctttttttgaattggagagtttcaaacaatcggctgagcaa
ttgtctaaagcagttgataaaggagtttctgataaaatagtaattgagaatttaggaaat
gcactttatgaaggcaagaaatatgaagaagctagtaagtttctgcaaagagcaattggt
tttggaacacaaaatcctaaaactcattatcattatgccaataccttatttcgtgaagat
agattcaaagatgctattaaatcctatgatgaggccattgcattaggtcaaaaagatgaa
gtgatttataataacagaggaaaagcaaaagctaatttagaccagtttgaacttgccatt
caagattataatcaatcactttcaatagatgaaaattatgggcaggctattttaaataga
ggaaatgcttattatgaattagaggcctatcaagaagcattgaatgattatgtgagagca
gttgcattggctcaaaccgacaatgatacttttgtgaaaatgggcttaagctattatagt
ttggataattttgagcaaactatcgaatatatggatcaagcctttcaaacaggaaatcaa
tctccaaatgttttctacggtagagggaatgcatattataatttgggacaattagataat
gcatattctgatctgaatcaggctgttacttttggagacaatcaccctgaaacatatttt
caccgaggtcaaattaattttcagaaagaagaatacgaattggcattatccgattttaat
aaagcagaagaatatggtagcaaagctgaacaactttatttcttaagagctaaaacacat
tatgcattgagtaattggaaggatgctttggaggacttcaatttagctattgcagctgac
aaagagctttatgaagcttttgctttacgtggaaacacaaagttccgcttggatgatttg
tcaggagccattaatgattacaatattgccattgcgggtggaattgaagaagcggtttac
tttaataatagaggtaaagccaaacagctgagcggtaatatagagcaagcaattgaagat
tatgataaagcaatttcaactgatagtgaatatgcaagagcatacgagaatagagcatca
gcaagatatgaaatgaaaaattatgctggcgtaatcgaggatgtagataaattggaagat
ttggatgaagctaatcctaatgcattttatattaaagctgagtcatattatgctttggaa
gattgggtaggggctatttcctattttgaaagagcaattcaaggggaggttataaaatcg
gattcctactttaaaagaggtagatcctatttgggagtagaggattatcaagccgcatta
gatgatttcaatcgtgctgctgaagcagacccttctaatgcaagtatttatttataccgg
gcgcagtgttatttgtacttaggtgaagtacgctatgcagcggaggattattctaaagcg
attacattagaacctgaaaatactgatgcttattacaatagagctattctgcgagaagaa
actgaagattgggaaggagcattgcaagattatgacaaagtggttcaattagatcctgaa
gatgcctcagcttattattacagaggaaatgtaaaagctgtattagaaaattatcagcct
gctttgaaggatttaaataaagcaatcgaattgaattctgaagatgcttcttattacaag
ttgagaggaaatatttactatcaattagaagatgatttgaaagcttgcgaggattggaaa
agagctaagaacatgggcgatgatagtgtgaattattatttgaatcagtattgtgagtag

DBGET integrated database retrieval system