Mucilaginibacter saanensis: HDF21_03310
Help
Entry
HDF21_03310 CDS
T11639
Symbol
bamA
Name
(GenBank) outer membrane protein assembly factor BamA
Organism
msae Mucilaginibacter saanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
POTRA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPZ01314
LinkDB
All DBs
Position
complement(704499..707051)
Genome browser
AA seq
850 aa
AA seq
DB search
MYKFLFAILLSVFGTAAMAQVSNIPRSSLTKSIPADSLSYLNPRDYIIGGISVSGAKYLD
KDILIQLSKLTKGDRINLPGERNAEVLKTLYSQGLFDDVQLNITKINQDTIYLEIAVKEL
PRLSRLHITGIRKGEIEDVQKKLTDRTNKIVNENLLNTTVAIIKKHFNEKGFYNTTVKIT
QRKDPGDANSVILDVAVDKKTKVKINQVIFEGNKAFSSAKLKKFLKKTREKKWYNLFGSK
KFKLDKYEEDKQSLVESMQGKGYRDAELLSDSVWRNDDNTVNVKLKVYEGPKYYFGDVKW
SGNAKYTTELLNRILHVKKGDVFSEDELNKRLVGPTPNNDDVSSLYLNDGYLTYTADPVQ
VKVYNDTVDLDIRVYEGPQYTINRVSLKGNDVTNDKVVMREIQTKPGQKFNKELLIRSSR
EIGQLGNFDEQKTEPKPVNINPQDGTVDLVYNVVEKPSDQIELSGGFGGGQLVGTLGLTF
NNFSLRNIFNLKAYKPLPKGDGQKLSLRGQSSGRTYQNFSFTFSEPWLGGKKPIYFALSA
YTQGSSTGQYYPKTSPYYNNLRINGIGVTLGKRLKWPDNYFQLNYSLNFDHYNLDNYTGY
LFTNGTSFNIKLTQELSRNSIDAPIFPTSGSNIKFTVQATPPYSLFNNVNYKIATPEQRY
HFVEYYKFKYDAQWFSKLVGKFVLMSQVRFGFLGMYNKEVGPSPFERFKLGGDGMQSYQF
LQGSEIIGLRGYQNFSIVPEGSTENQNTNTGSTIYNKYTLELRHPVIASQSATIFLLAFA
EGGNVWNDFSQFNPFNVRRSVGVGARIFLPIFGLLGLDYGYGFDKIPGAPDANRGQFHFT
ISQSLSGGFN
NT seq
2553 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataaatttctttttgctattcttctctctgtttttggtaccgcagcaatggcccag
gtttccaatattccgaggtcatcactgacaaaatcgataccggctgatagtttaagttat
cttaatccgcgggattatattattgggggtatttctgtaagtggcgcaaaatatctggat
aaggatattttgatacaactttcaaaattaaccaaaggcgaccgtatcaacctgccaggc
gagcgtaacgccgaagtattaaaaacactttattcacagggattgtttgatgatgtacaa
ttaaacattacaaaaattaaccaggataccatttatcttgaaattgcagtaaaagagctt
ccaaggctatcgcgattgcatataaccggtattcgtaagggcgaaattgaggatgtgcag
aagaaactgaccgacaggacaaacaaaattgtaaacgagaatttattaaatactactgta
gcaattattaaaaagcattttaacgaaaaaggcttttataacaccactgtaaaaattacc
caacgcaaagatccgggagatgctaatagcgtgatacttgatgtagctgttgataaaaag
accaaagtaaaaattaaccaggttatttttgaaggtaataaagcctttagctcagctaag
cttaagaagtttttgaaaaaaacgcgcgaaaaaaaatggtataacttatttggctctaaa
aaattcaagcttgataaatacgaagaagataagcaaagcctggttgaatcaatgcaaggc
aaagggtatcgtgatgccgaattattaagcgattctgtttggcgcaatgatgacaatacc
gttaacgtaaagcttaaagtttacgaaggccctaaatattactttggtgatgtgaagtgg
tctggtaatgccaaatacaccaccgagcttttaaacaggatactacacgttaaaaaaggc
gatgtatttagcgaggatgagttaaacaaaagattagttgggccaacgcctaacaatgat
gacgtttcatcactttatttaaatgatggttacttaacctacactgccgatccggtacag
gttaaagtatataatgatactgttgatctggacattcgtgtgtatgaagggccgcagtat
accattaaccgcgtaagtttaaaaggtaacgacgtaaccaacgataaagtggtaatgcgt
gagattcaaactaaaccgggtcagaaattcaacaaagaacttttaatccgcagctcgcgc
gaaattggccagcttggtaattttgatgagcaaaaaacagaaccaaaaccggttaacatc
aacccacaggatggtactgttgacttagtttataatgttgttgaaaaaccttcagatcaa
attgagctttcaggtggttttggtggcgggcagctggtgggtacactggggcttaccttc
aataacttttcgttaagaaacatattcaaccttaaagcttacaagccgctgccaaagggc
gacggtcaaaaattaagcttaagaggccagtcaagcggaagaacctatcagaacttttca
ttcaccttctctgaaccatggttaggtggtaaaaaacctatttactttgcattatcagca
tatacacaaggtagttcaaccgggcagtattatccaaaaacaagcccatactacaacaac
ctgcgtattaatggtattggtgtaacattgggtaaacgcttaaaatggcctgataactac
ttccagttaaattactcactgaattttgaccactataacctggataattacaccggttat
ctgttcacaaatggtacgtcattcaacatcaagttaacacaggaattaagccgtaactct
attgatgcgcctattttcccaacctcgggttcaaatattaaatttactgtacaggctacg
ccgccatactcattatttaataacgtgaattacaaaattgctacacctgagcaacgctat
cactttgtggagtattacaagtttaaatatgatgcacagtggttctctaaattggttggt
aagtttgtattgatgtcgcaggtaaggtttggtttcctgggtatgtataacaaagaggta
ggtccttcaccgtttgagcgctttaaattaggtggtgacggtatgcagagctaccagttt
ttacagggtagtgagatcattggtttaaggggttatcaaaacttctctattgtgcctgag
ggttcaacagaaaatcaaaataccaacacaggtagtaccatttacaataaatatacactt
gagctgcgtcacccggttattgcaagccagtcggcaacaatattcttgttagcctttgct
gaaggtggtaacgtttggaacgattttagtcagttcaatccgtttaacgttaggcgttcg
gtaggtgttggagcaagaatatttttacctatatttggattgcttggattagattatggc
tatggatttgataaaataccaggtgcaccagatgcaaatagggggcagttccattttaca
atttctcagagtttatccggcggatttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system