Metamycoplasma salivarium: NCTC10113_01458
Help
Entry
NCTC10113_01458 CDS
T07316
Symbol
rnjB
Name
(GenBank) putative hydrolase
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
msai
Metamycoplasma salivarium
Pathway
msai03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
msai00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
NCTC10113_01458 (rnjB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
msai03019
]
NCTC10113_01458 (rnjB)
Messenger RNA biogenesis [BR:
msai03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
NCTC10113_01458 (rnjB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_C
RNase_J_b_CASP
RMMBL
NonGDSL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAD7361353
UniProt:
A0A7R9CBZ2
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(593881..595533)
Genome browser
AA seq
550 aa
AA seq
DB search
MSKINFYALGGLDENGKNCYVLEINQKLFIINFGTKVPINSHTGIDTLICNFDYLEKRQK
DIVGIFVSDIHNDNFSGIPWLLMKLKNIKIYTSAFNKIVLIDRISKYDIQHKNYEVKVIN
RPTEFNNVIVTPFELAGSTPGQIGFNFFVDDGNILIMTNFVDGDLGPYGKTNLDKIKSIL
NNKELKILIMDSGKSNYPGKSIDKLWISKKIEYKFQEARPNQRIIVGLYDEDMITAHEVL
LLAKKYNRPVITYGRNYSQLLNLVQKIDANLSWPEFIDYREATKANNAVILVTGAIERLY
LRFVRIATNNDLYLKFRPDDAVIFIAPPVNGLEVNYAYTLDEVARNTSNLIELSSDQYYS
CHPTKDDIKRFVKELKPKYFIPIQGLYRYLVVATHDARDIGMNLANCLVLQNGKVAEFKD
FNLVSQKQTIKNIGHLIIDGFGIGDISNEVIKERENLGRDGVLALSILIDFKTKKPIGEL
QINSYGIITKDNKDVIYNIINTLFFREFEGKQTKEINLRAIQEQLRKSIKRKIYRTIDKE
PLIVITLYEI
NT seq
1653 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaaattaacttttacgcattagggggattagatgaaaatggcaaaaattgctat
gttctagagatcaaccaaaaactttttataattaactttggcactaaggttccaattaat
tcacatactggaattgacactttaatttgcaattttgactatttagaaaaaagacaaaaa
gatattgttggaatttttgtaagcgatatacacaatgataatttttctggaattccttga
cttttaatgaaacttaaaaatattaaaatttatacttcagcatttaataaaattgtatta
attgatagaatctcgaaatatgacattcaacataaaaattacgaagtcaaagttattaat
aggccaaccgaatttaataatgttatagtaacaccatttgaacttgccggaagcactcct
ggccaaattggatttaacttttttgttgatgatggaaacatcttgataatgactaatttt
gttgatggagatttaggaccttatggaaaaactaatttagacaaaattaaatcaattttg
aataacaaagaattaaaaattcttattatggattcaggcaaatcaaactatcctggtaaa
agtattgataaactttgaatttctaaaaaaattgaatataaatttcaagaagctagacct
aaccaaaggatcattgttggactttatgacgaagatatgattactgcacatgaagtcttg
ctattagctaaaaaatataatcgtcctgtaataacatatggtagaaattattcacaactt
ttaaatttagtgcaaaaaattgatgcaaatttatcttgacctgaatttattgattatcgc
gaagctactaaagcaaataatgctgttattttagttacaggagctattgaacgtttatat
ttaagattcgttaggattgcaacaaataatgacttgtatttgaaatttagacctgatgat
gctgttatttttatagcaccaccagttaatggactcgaagtaaattatgcttatacatta
gatgaagttgcaagaaatacttcaaatttaattgaactaagttcagaccaatattattca
tgtcaccctaccaaagatgatattaaaaggtttgtaaaggaattaaaacctaagtatttt
attccaattcaaggtttatatagatacttagtagtagcaacccatgatgctagagatatt
ggtatgaatttagctaattgcttagtcttacaaaatggaaaagttgctgaatttaaggac
tttaatttggtttctcaaaaacaaacaattaaaaatattggtcatttaattattgatggt
tttggaattggtgatatctcaaatgaagttattaaagaaagagaaaatttaggtcgtgat
ggtgttttagcattaagtattttgattgattttaagaccaaaaaaccgattggtgaactt
caaattaattcgtatggaataattacaaaagataataaggatgtaatttataatataatt
aatacattattttttagagaatttgaagggaaacaaacaaaagaaattaacttgcgtgca
atccaagaacaattaagaaagagtatcaaaagaaagatttatcgtacaatcgataaagaa
ccattaattgttataacattgtatgaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system