KEGG   Metamycoplasma salivarium: NCTC10113_01458
Entry
NCTC10113_01458   CDS       T07316                                 
Symbol
rnjB
Name
(GenBank) putative hydrolase
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
msai  Metamycoplasma salivarium
Pathway
msai03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:msai00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    NCTC10113_01458 (rnjB)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:msai03019]
    NCTC10113_01458 (rnjB)
Messenger RNA biogenesis [BR:msai03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     NCTC10113_01458 (rnjB)
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_C RNase_J_b_CASP RMMBL NonGDSL
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAD7361353
UniProt: A0A7R9CBZ2
LinkDB
Position
1:complement(593881..595533)
AA seq 550 aa
MSKINFYALGGLDENGKNCYVLEINQKLFIINFGTKVPINSHTGIDTLICNFDYLEKRQK
DIVGIFVSDIHNDNFSGIPWLLMKLKNIKIYTSAFNKIVLIDRISKYDIQHKNYEVKVIN
RPTEFNNVIVTPFELAGSTPGQIGFNFFVDDGNILIMTNFVDGDLGPYGKTNLDKIKSIL
NNKELKILIMDSGKSNYPGKSIDKLWISKKIEYKFQEARPNQRIIVGLYDEDMITAHEVL
LLAKKYNRPVITYGRNYSQLLNLVQKIDANLSWPEFIDYREATKANNAVILVTGAIERLY
LRFVRIATNNDLYLKFRPDDAVIFIAPPVNGLEVNYAYTLDEVARNTSNLIELSSDQYYS
CHPTKDDIKRFVKELKPKYFIPIQGLYRYLVVATHDARDIGMNLANCLVLQNGKVAEFKD
FNLVSQKQTIKNIGHLIIDGFGIGDISNEVIKERENLGRDGVLALSILIDFKTKKPIGEL
QINSYGIITKDNKDVIYNIINTLFFREFEGKQTKEINLRAIQEQLRKSIKRKIYRTIDKE
PLIVITLYEI
NT seq 1653 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtaaaattaacttttacgcattagggggattagatgaaaatggcaaaaattgctat
gttctagagatcaaccaaaaactttttataattaactttggcactaaggttccaattaat
tcacatactggaattgacactttaatttgcaattttgactatttagaaaaaagacaaaaa
gatattgttggaatttttgtaagcgatatacacaatgataatttttctggaattccttga
cttttaatgaaacttaaaaatattaaaatttatacttcagcatttaataaaattgtatta
attgatagaatctcgaaatatgacattcaacataaaaattacgaagtcaaagttattaat
aggccaaccgaatttaataatgttatagtaacaccatttgaacttgccggaagcactcct
ggccaaattggatttaacttttttgttgatgatggaaacatcttgataatgactaatttt
gttgatggagatttaggaccttatggaaaaactaatttagacaaaattaaatcaattttg
aataacaaagaattaaaaattcttattatggattcaggcaaatcaaactatcctggtaaa
agtattgataaactttgaatttctaaaaaaattgaatataaatttcaagaagctagacct
aaccaaaggatcattgttggactttatgacgaagatatgattactgcacatgaagtcttg
ctattagctaaaaaatataatcgtcctgtaataacatatggtagaaattattcacaactt
ttaaatttagtgcaaaaaattgatgcaaatttatcttgacctgaatttattgattatcgc
gaagctactaaagcaaataatgctgttattttagttacaggagctattgaacgtttatat
ttaagattcgttaggattgcaacaaataatgacttgtatttgaaatttagacctgatgat
gctgttatttttatagcaccaccagttaatggactcgaagtaaattatgcttatacatta
gatgaagttgcaagaaatacttcaaatttaattgaactaagttcagaccaatattattca
tgtcaccctaccaaagatgatattaaaaggtttgtaaaggaattaaaacctaagtatttt
attccaattcaaggtttatatagatacttagtagtagcaacccatgatgctagagatatt
ggtatgaatttagctaattgcttagtcttacaaaatggaaaagttgctgaatttaaggac
tttaatttggtttctcaaaaacaaacaattaaaaatattggtcatttaattattgatggt
tttggaattggtgatatctcaaatgaagttattaaagaaagagaaaatttaggtcgtgat
ggtgttttagcattaagtattttgattgattttaagaccaaaaaaccgattggtgaactt
caaattaattcgtatggaataattacaaaagataataaggatgtaatttataatataatt
aatacattattttttagagaatttgaagggaaacaaacaaaagaaattaacttgcgtgca
atccaagaacaattaagaaagagtatcaaaagaaagatttatcgtacaatcgataaagaa
ccattaattgttataacattgtatgaaatttaa

DBGET integrated database retrieval system