Metamycoplasma salivarium: NCTC10113_01548
Help
Entry
NCTC10113_01548 CDS
T07316
Symbol
yhgF
Name
(GenBank) RNA (S1 domain)-binding protein
KO
K06959
protein Tex
Organism
msai
Metamycoplasma salivarium
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
msai00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99973 Transcription
NCTC10113_01548 (yhgF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tex_YqgF
Tex_N
HHH_3
Tex_central_region
S1
HHH_9
YqgF
HHH_7
Spt6_S1
HHH_6
T2SSK
S1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAD7361437
UniProt:
A0A7R9GPP0
LinkDB
All DBs
Position
1:688713..690863
Genome browser
AA seq
716 aa
AA seq
DB search
MNLSIKNVAKKLQLKDIQVEKTLELLEQGCTVPFISRYRKNITEGLDEEQIAKIEELYKY
DVELEKRKEAILNILEENKLLTDELKLKIQNASTKQELENIYEPFKIGKKTKASEAIAMG
LLPLAEKIMSETSQDFNVFNECKKYFNDKLTTTEQIIEQVKYIIAQIISQDISTREFVKN
NLISYGTIEAKVKKDANDEKQVFLQYYDFKERVKFIPNHRILAISRGADKKILSYDISFN
EKPIQYELRNKYFVNKRTAFIINDSIDDSLKRLIYPSIIREIKTDLFERAEAEAIKLFAK
SVEQMLLAPAVKNKKVMAIDPAYVNGCKIAILDENGNFLEKAIIYPNPPKPNLDKAKEIV
NKLLDKYESDLILIGNGTASHETKDFITNLLNWRKEVNGQENAKCLVVSEIGASVYSASK
NAIEEFPNLSVEERSAISIGRRYQDPLNELVKIDPKAIGVGQYQHDVDQKMLENELEFKV
NKVVNEVGVNLNTASEYILRYISGLTKTLAKKIVEHRNKIKEFTNREELKEIKGISDKVY
EQAIGFLRLYNSNVFYDKTNIHPESYKLADSLVKYLNIDLSQIDKKLLQNIDKNKIMNDL
KINEFDLNLIIDSLLNPGKDIRDQKAGFTINENITKAEDLHVGQIISGQVLNLTDFGAFV
FIGIKQSVLVHVSHMKRTENEFINKPSDVLNIGDTVQIKILDIDLERNRIHGQIIW
NT seq
2151 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttatcaatcaaaaatgtcgcgaagaaattgcaacttaaagatattcaagttgaa
aaaacattagagttattagaacaaggatgtacagttccttttatttcaagatatagaaaa
aatattactgaaggtttagatgaagaacaaattgcaaaaattgaagaactttataaatat
gatgttgaattagaaaaaagaaaagaagcaattttgaatattttggaagaaaataaacta
ctaacagatgaattaaaattaaaaattcaaaatgcaagcacaaaacaagagcttgaaaac
atttatgaacctttcaaaattggcaagaaaaccaaagcttctgaagcgattgcaatgggc
ctcttacctttggctgaaaaaattatgtctgaaacatcacaggattttaatgtttttaat
gaatgcaaaaaatatttcaatgataaactaacaacaactgagcaaataattgaacaagtt
aaatacattattgcacaaattatttctcaagatatttccacaagggaatttgttaaaaat
aatctaattagttatggaactattgaagctaaggttaaaaaagatgctaatgatgaaaaa
caagtgtttttacaatactatgattttaaagaaagagttaaatttattccaaaccataga
atattagcaatctcacgtggcgctgataagaagattttatcttatgatatttcatttaat
gaaaagcctattcaatatgagcttaggaacaaatattttgtgaacaaaagaacagcattt
attattaatgattcaatcgatgatagtttaaaaaggttgatatatccttctattattaga
gaaattaaaaccgatttatttgaaagagcagaagctgaagcaattaaattatttgcaaaa
agcgtcgaacaaatgttacttgcacctgctgtcaaaaacaaaaaagttatggcaattgac
cccgcttacgttaatggctgtaaaatcgctattttagatgaaaatggtaattttttagaa
aaagcaattatttatcctaacccaccaaaacctaatttggataaagctaaagaaattgtt
aataaattgttagacaaatatgaatcagatttaattttaataggtaatggaactgcgagc
catgaaactaaggattttattacaaaccttttaaattgaagaaaagaagtaaatgggcaa
gaaaatgcaaaatgtttagtagtttctgaaattggtgcatcagtttattctgcttcaaaa
aatgcaattgaagaatttccaaatttatctgttgaagaaagatctgcaatttcaattggt
cgtagatatcaagatccattaaatgagcttgttaagattgatcctaaagcaattggcgtt
gggcaatatcaacacgatgtagaccaaaaaatgcttgaaaatgagctagaatttaaagtc
aataaggtagttaatgaagttggagttaacctaaatactgcaagtgaatatattctcaga
tatatttcaggcttaacaaaaacattagctaaaaaaattgttgagcatcgaaataaaatc
aaagaatttaccaaccgtgaagaacttaaggaaattaaaggaattagtgataaagtttat
gaacaagcaatcggttttttaagactttataattcaaatgttttttatgataaaacaaat
attcacccagaaagttacaaacttgctgattcattagttaaatatttaaatatcgattta
agtcaaattgataaaaaacttttacaaaatattgataaaaataagattatgaatgatctt
aaaatcaatgaatttgatttgaatttaattattgattctttattaaatccaggcaaagat
ataagagaccaaaaagctggatttacaataaatgagaatattacaaaagctgaagatttg
catgttggacaaattatatctggtcaagttttgaatttaactgattttggtgcatttgtt
tttataggaattaaacaaagtgtcttagttcatgtttcacatatgaaacgcactgaaaac
gaatttatcaacaaaccatctgatgttttaaacattggtgatactgttcaaattaaaatc
ttagacattgatttagaacgcaatagaattcatgggcaaattatttgataa
DBGET
integrated database retrieval system
