Methanolobus sediminis: RE474_02050
Help
Entry
RE474_02050 CDS
T09570
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mseb
Methanolobus sediminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7507
HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig
NPCBM_assoc
DUF11
TRAP_beta
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMW25525
UniProt:
A0AA51YJF8
LinkDB
All DBs
Position
complement(449182..455409)
Genome browser
AA seq
2075 aa
AA seq
DB search
MNKTIKLAVAMHGRVKSSVTLLFALALIITSLAMVASAADSDISVDFVAAAPGSYNHLTG
GGAYDDGTVGVNEDIVNSLEGGDYKCGDIVTFFAVVHVDNTASAQTDAPQTIEMNFSFLM
DTTGQSGVAIGDVVDVHVNYGTIEDLIAGENNIDDGIYDDGGSVATLVSKTTTGPIFTAG
SELWATIELTDLDANETVVVRIDTKLFCDPGSNPTGNLQADLVESWLTFINNDTAVEPPD
DIAQGSGQNIPFKQTGNIGYPMISITKTVTTTDGDFPGNDSLTITYGETVKYLYVVENNG
DAPLYNVNVVDDAGTSGDDTDDFAVLLLTTLLTDLDGDGTADDLAAGGSASGVHLFSPST
LGIVINTATAAGNDSIIEPTTLTATDTATVLVIGTPSIDIEKIGILDVGGDGTATPGDMI
NYEFNVTNNGTINLNYVNVTDILLGIYNITPTNISLDPGEYQIFTGQYDLTQADINAGWV
NNTATAVGTSPQGIQVNDTDSYSIPIPQTPAIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFN
VTNIGTVTLYNVSVTEDMLAGMSSITPAEYASVAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNN
ATAEGTSPQDETVNDTDDETVLIPENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTN
IGTVTLYNVSVTEDILAGMSSITPAEYASVAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATA
EGTSPQDETVNDTDDETVMIPENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGT
VTLYNVSVTEDMLTGMSSITPAEYASVAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGT
SPQDETVNDTDDETVMIPENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGTVTL
YNVSVTEDMLTGMSSITPAEYASLAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGTSPQ
DETVNDTDDETVMIPENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGTVTLYNV
SVTEDMLTGMSSITPAEYASLAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGTSPQDET
VNDTDDETVMIPENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGTVTLYNVSVT
EDMLTGMSSITPAEYASLAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGTSPQDETVND
TDDETVMIPENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGTVTLYNVSVTEDM
LTGMSSITPAEYASLAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGTSPQDETVNDTDD
ETVMIPENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGTVTLYNVSVTEDMLTG
MSSITPAEYASLAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGTSPQDETVNDTDDETV
MIPENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGTVTLYNVSVTEDMLTGMSS
ITPAEYASVAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGTSPQDETVNDTDDETVMIP
ENPMIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGTVTLYNVSVTEDMLTGMSSITP
AEYASLAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGTSPQDETVNDTDDETVLIPENP
MIDLVKTGEFMDESGDGYGQVGENVSYTFNVTNIGTVTLYNVSVTEDILAGMSSITPAEY
ASVAPGDMVTFTATYALTQADLDMGSVYNNATAEGTSPQDETVNDTDDETVMIPQYPHIA
LTKTADPIIYTYEGQVIHYTLNATNDGTVTLNGTFVTDTLLASVNAVDASFTGVLSVGQS
AEFVGTYMIQAADLAGPFPNIVPNTATVTGYDPQGAPVFASASAVVTQVNATAQIAPTQT
TCYDFRTGTADDLETAYYMVLKKTGEIQSVAPGVMFYYSDVTPTSDTVVIEVDQNNTAGW
PDIAIQDEGQIILWDSDCLKVQNATVNMSGENPVLTVTGVTPGETYYLGVKYTLSSLQGY
VPTGTPDVTYLFVMYQDGAEVISSWDGITVEYKKK
NT seq
6228 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaaccataaagctagcggtggctatgcacggaagagtaaaatcttcagtgaca
ttgctatttgcattggcattgataataacatcattggcaatggttgcatctgcagccgac
agtgatatttcagttgactttgttgcagctgcaccaggaagttataaccacttgacaggt
ggtggtgcttatgatgatggaactgttggtgtaaatgaggatattgtcaattcgctggaa
ggaggcgactacaaatgtggtgatattgtcactttctttgcagtcgtacatgttgataat
actgcatctgcacaaacggatgcgccacaaacgatcgagatgaacttttcatttttgatg
gatacaactggacaatccggtgtagcaatcggtgatgttgtagacgtgcatgtgaattat
ggcacaatagaggacctgatcgctggcgagaataacattgacgatggaatctacgatgat
ggcggaagtgtagcaacacttgtaagtaagacaacaactggcccaattttcactgctggc
tcggaattgtgggccaccattgaacttacagatctggatgcaaatgaaacagtggtcgtc
aggatagatactaaattgttctgcgaccccggatcaaaccctacaggtaatttgcaggcc
gatcttgtggaatcctggctgacatttattaataatgatactgcagtggaaccaccagac
gatattgcccagggaagtggacagaatattcctttcaagcagaccggaaacattgggtat
cctatgatcagtatcactaagaccgtaacaacaactgatggagatttccccggaaatgat
tcattgacaattacttacggtgaaactgtcaagtacctctatgtggtcgaaaataacgga
gatgctcctctctacaatgtaaatgtagtcgatgatgctggtacatctggtgatgacact
gatgattttgccgttttgctattgactacgctgcttactgatcttgatggcgatggaact
gctgatgaccttgcagcagggggtagtgcttctggggtgcatttgttcagtccatctacc
ttgggaattgtaattaacaccgctactgcagcaggtaatgattcaattatcgaacctaca
acccttactgctactgatacggcaactgtactcgttataggtacaccgtcaatagatatc
gagaaaataggtatactggatgtaggtggagatggaacggcaacacctggtgacatgatc
aactatgaattcaatgttaccaacaatggtacaataaatctcaactatgtgaatgtcaca
gatatactgctaggcatctataacataacaccaactaatatctcactggatccaggagaa
taccagatattcacaggacaatatgacctcacacaggctgatattaacgcaggatgggtc
aacaatacagcaacagctgtaggtaccagtcctcagggtatacaggtgaacgatacagat
tcttacagtataccaataccacagactccagctatcgatcttgtcaagacaggtgagttc
atggatgagagtggtgatggttacggccaggtcggcgagaatgtctcctacaccttcaat
gtcaccaacattggtacagttacactctacaatgtcagtgtaacggaggatatgctcgca
ggcatgagttcaatcacacctgccgaatatgcttcagttgcacctggtgatatggttaca
ttcactgctacctatgcccttacccaggcagaccttgatatgggctctgtatacaacaat
gcaaccgctgaaggtaccagtccacaggatgagactgtcaatgacaccgacgatgagact
gttctgatcccagagaatccaatgatcgatcttgtcaagacaggtgagttcatggatgag
agtggtgatggttacggccaggtcggcgagaatgtctcctacaccttcaatgtcaccaac
atcggtacagttacactctacaatgtcagtgtaacggaggatatcctcgcaggcatgagt
tcaatcacacctgccgaatatgcttcagttgcacctggtgatatggttacattcactgct
acctatgcccttacccaggcagaccttgatatgggctctgtatacaacaatgcaaccgct
gaaggtaccagtccacaggatgagactgtcaatgataccgacgatgagactgtaatgatc
ccagagaatccaatgatcgatcttgtcaagacaggtgagttcatggatgagagtggagat
ggttacggacaggtcggcgagaatgtctcctacaccttcaatgtcaccaacatcggtaca
gttacactctacaatgtcagtgtaacggaggatatgctcacaggcatgagttcaatcaca
cctgccgaatatgcttcagttgcacctggtgatatggttacattcactgcaacctatgcc
cttacccaggcagaccttgatatgggctctgtatacaacaatgcaaccgctgaaggtacc
agtccacaggatgaaactgtcaatgataccgacgatgagactgtaatgatcccagagaat
ccaatgatcgatcttgtcaagacaggtgagttcatggatgagagtggagatggttacgga
caggtcggcgagaatgtctcctacaccttcaatgtcaccaacatcggtacagttacactc
tacaatgtcagtgtaacggaggatatgctcacaggcatgagttcaatcacacctgccgaa
tatgcttcacttgcacctggtgatatggttacattcactgcaacctacgcccttacccag
gcagaccttgatatgggctctgtatacaacaatgcaaccgctgaaggtaccagtccacag
gatgaaactgtcaatgataccgacgatgagactgtaatgatcccagagaatccaatgatc
gatcttgtcaagacaggtgagttcatggatgagagtggagatggttacggacaggtcggc
gagaatgtctcctacaccttcaatgtcaccaacatcggtacagttacactctacaatgtc
agtgtaacggaggatatgctcacaggcatgagttcaatcacacctgctgaatatgcttca
cttgcacctggtgatatggttacattcactgcaacctacgcccttacccaggcagacctt
gatatgggctctgtatacaacaatgcaaccgctgaaggtaccagtccacaggatgaaact
gtcaatgataccgacgatgagactgtaatgatcccagagaatccaatgatcgatcttgtc
aagacaggtgagttcatggatgagagtggagatggttacggacaggtcggcgagaatgtc
tcctacaccttcaatgtcaccaacatcggtacagttacactctacaatgtcagtgtaacg
gaggatatgctcacaggcatgagttcaatcacacctgctgaatatgcttcacttgcacct
ggtgatatggttacattcactgcaacctacgcccttacccaggcagaccttgatatgggc
tctgtatacaacaatgcaaccgctgaaggtaccagtccacaggatgaaactgtcaatgat
accgacgatgagactgtaatgatcccagagaatccaatgatcgatcttgtcaagacaggt
gagttcatggatgagagtggagatggttacggacaggtcggcgagaatgtctcctacacc
ttcaatgtcaccaacatcggtacagttacactctacaatgtcagtgtaacggaggatatg
ctcacaggcatgagttcaatcacacctgccgaatatgcttcacttgcacctggtgatatg
gttacattcactgcaacctacgcccttacccaggcagaccttgatatgggctctgtatac
aacaatgcaaccgctgaaggtaccagtccacaggatgaaactgtcaatgataccgacgat
gagactgtaatgatcccagagaatccaatgatcgatcttgtcaagacaggtgagttcatg
gatgagagtggagatggttacggacaggtcggcgagaatgtctcctacaccttcaatgtc
accaacatcggtacagttacactctacaatgtcagtgtaacggaggatatgctcacaggc
atgagttcaatcacacctgccgaatatgcttcacttgcacctggtgatatggttacattc
actgcaacctacgcccttacccaggcagaccttgatatgggctctgtatacaacaatgca
accgctgaaggtaccagtccacaggatgagactgtcaatgataccgacgatgagactgta
atgatcccagagaatccaatgatcgatcttgtcaagacaggtgagttcatggatgagagt
ggagatggttacggacaggtcggcgagaatgtctcctacaccttcaatgtcaccaacatc
ggtacagttacactctacaatgtcagtgtaacggaggatatgctcacaggcatgagttca
atcacacctgctgaatatgcttcagttgcacctggtgatatggttacattcactgcaacc
tatgcccttacccaggcagaccttgatatgggctctgtatacaacaatgcaaccgctgaa
ggtaccagtccacaggatgaaactgtcaatgataccgacgatgagactgtaatgatccca
gagaatccaatgatcgatcttgtcaagacaggtgagttcatggatgagagtggagatggt
tacggccaggtcggcgagaatgtctcctacaccttcaatgtcaccaacatcggtacagtt
acactctacaatgtcagtgtaacggaggatatgctcacaggcatgagttcaatcacacct
gctgaatatgcttcacttgcacctggtgatatggttacattcactgctacctatgccctt
acccaggcagaccttgatatgggctctgtatacaacaatgcaaccgctgaaggtaccagt
ccacaggatgagactgtcaatgacaccgacgatgagactgttctgatcccagagaatcca
atgatcgatcttgtcaagacaggtgagttcatggatgagagtggtgatggttacggccag
gtcggcgagaatgtctcctacaccttcaatgtcaccaacatcggtacagttacactctac
aatgtcagtgtaacggaggatatcctcgcaggcatgagttcaatcacacctgccgaatat
gcttcagttgcacctggtgatatggttacattcactgctacctatgcccttacccaggca
gaccttgatatgggctctgtatacaacaatgcaaccgctgaaggtaccagtccacaggat
gagactgtcaatgacaccgacgatgagactgtcatgatcccacagtatccacacatagct
ctgaccaagacagctgacccaataatatacacctatgaaggtcaggtcattcactataca
ctcaacgctaccaacgatggtaccgttactctgaatggtacgtttgtgaccgatacgctt
cttgcatctgttaatgcggtagatgcgagctttactggtgtattgtcagtaggccagtct
gctgaattcgtaggtacttatatgattcaggcagctgatctggctggaccgttccccaac
atcgtgcctaacacagcaacggttacaggatatgatccacaaggtgcccctgtctttgct
tcagcttcagccgtggttacacaggtcaacgcaacagcccagatagctcctacccagact
acatgctatgactttagaacaggcacagcggatgatctggaaacagcatattacatggtc
ctaaagaagacaggagaaatccagagtgttgcacctggtgttatgttctactacagtgat
gtcacaccaactagtgacactgtggttattgaggtcgaccagaacaatactgctggatgg
ccagacatagctattcaggatgaaggtcagattatcctctgggattctgactgtctaaag
gtccagaatgcaaccgtgaacatgtctggtgaaaatccggtacttacggtgacaggtgtg
acccctggtgaaacctactaccttggtgtaaagtataccctcagtagtctgcagggatat
gtgccaacaggaacaccagatgtaacataccttttcgtaatgtatcaggatggtgccgaa
gttatttcaagctgggacggtattacagttgaatacaagaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
