Methanolobus sediminis: RE474_08955
Help
Entry
RE474_08955 CDS
T09570
Name
(GenBank) S-layer protein domain-containing protein
Organism
mseb
Methanolobus sediminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
S-layer
PKD_4
PKD
Pur_ac_phosph_N
NDNF
CARDB
CarbopepD_reg_2
fn3
CarboxypepD_reg
InlK_D3
DUF4198
HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig
BiPBP_C
fn3_6
E1_DerP2_DerF2
Fn3_arc
PEGA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMW24222
UniProt:
A0AA51YKT0
LinkDB
All DBs
Position
1820498..1824301
Genome browser
AA seq
1267 aa
AA seq
DB search
MRNKLKLILFGLSLIIFTGLALGSAPTLSNVGSSSISLDSAVISYDVNQSDADTQIEYGT
TPSLGSSSAIYSGLSSYSETLSGLSSGTTYYYSVFAYNSSNPGEFSNSTIDSFTTTAAST
DSAPALSNVGSSSISSDSAVISYDVNQSDADTQIEYGTTPSLGSSSAIYSGLSSYSQTLS
SLSSGTTYYYSVFAYNSSDSSLFSNSTIDSFTTTAASTDSAPVLSNVGSSSISSDSAVIS
YDVNQSDADTQIEYGTTPSLGSSSAIFSGLSSYSETLSGLSSGTTYYYSVFAYNSSDSSL
FSNSTIDSFTTSASSSAPDASFTTNVTDDEGEVPLTVQFNDTSDNDPTSWEWDFDDGSAN
STVQNPVHTFDSVGTYDVTLTATNADGSDSTTTTITVYSQTYYTGDRIWDENANQSADKY
IWDAKSFSGFFYDLESGFSSESMTIYNIDRSLGDGDIVYQTSPVETDFENSDWGSYQVIG
FMAEKYFAGYTDDTDIDGVDEVSLMSAGQLSKVLLDDDDKESVYSGSSLILEEGYELNVV
EVDVNGDSVYVTLTQDGDELDSAVISSGDDYVYETDLGDADDVALIIVHIDDVFSGTESN
AVFIQGVFQISDDYVELEDGESYGEMEITSISDDLIEMENDGTVSLSKGKTINLMGSINL
IVADNDDLRFAPYVDMSDPGTYELRGTVAEEDELLTWTPLNFEGFYYDIDEGIQTEKLEL
TAISGRTIDDGDLVYTSVPKPVEFEHSDWGEFQVIGFMAEKYFAGYTDDTDVDGVDDVSL
MSNGQLSEVLLDDDDKASVYSGSSLILEEGYTLDIIEVDTSGDSVLIELYQDGDEVDTEI
VSANDDYVYEKDLGDADDVPIIIIHFNEVFAGSESNAVFVEGIFQISEDYISLEDGDTYG
EMEVTSYSEDSIVMKNEDSISLSKDKDITLMGEVGIRVADSGTLRYYPYVEVTTAASQAL
TISLSDSTVSEGDEVTITVTSRGSRIADATVKVEGTTIGTTDDEGTIDYDADEIGTLEIT
AEKDGYTSASEDLEVIDPDDETRKMSIEVSPDKVYVGNSITIYVLQAIGGDEISGVTVTF
DGKSIGTTDSDGTVTYTATEAGTHSIEATKSGMNDAELDLKVNELAAEFEFSNLEISPLE
IKQGQKATITADVTNTGTAEGSYNVELKVDDVIVDSQTITLSVGNSTTVEFTHEEEEPGT
YEVQLGDLTTTYEVFEKSGTIWYVLGAIGLAAIGGVAYLFTAGGWTVEIAQAKAAEAVAA
IKELIGK
NT seq
3804 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgaaataagcttaaattaattttatttggattatccctaataatattcacaggactg
gcattaggttctgctcctactctttctaatgtaggttctagtagcatctctttggacagt
gctgtaatcagttatgatgtgaaccaaagtgatgcagatactcaaatcgaatatggaacc
actccctctttaggttcttccagtgctatttacagtggtctatctagctatagtgaaact
ctttccggtctaagttcaggcactacttattattatagtgtttttgcttacaattcaagt
aatccaggtgaattttccaattccacgatagacagctttactactactgctgccagtact
gacagtgctcctgccctctctaatgtaggttctagtagcatctcttcggacagtgcagtg
attagttatgatgtgaaccaaagtgatgcagatactcagatcgaatatggaaccactccc
tctttaggttcttccagtgctatttacagtggtttatctagctatagtcaaactctttcc
agtctaagttcaggcactacttattattatagtgtttttgcttataattcaagtgactca
agtttattctccaattccacgatagacagctttactactactgctgccagtactgacagt
gctcctgtcctctctaatgtaggttctagtagcatctcttcggacagtgcagtgattagt
tatgatgtgaaccaaagtgatgcagatactcagatcgaatatggaaccactccctcttta
ggttcttccagtgctattttcagcggtttatctagctatagtgaaactctttccggtcta
agttcaggcactacttattattatagtgtttttgcttataattcaagtgactcaagttta
ttctccaattccacgatagacagctttactacatctgcttcctcttctgctccagatgct
tcattcacaacaaatgtaacagatgatgaaggtgaagttcctcttacagttcagttcaat
gacacttcagataatgatccgacatcttgggaatgggactttgatgatggtagcgctaat
tcaacagttcagaatccagtccatacctttgattctgtaggcacttatgatgtcactctg
accgcaaccaacgctgatggttctgattctacaactacgacaattactgtgtattcccag
acctactacacaggtgacaggatatgggatgagaatgccaatcaatcagcagataaatat
atctgggatgcaaagtctttctcaggtttcttctatgaccttgaatcaggtttcagttct
gagagcatgaccatctataacatagaccgttcacttggtgacggtgacattgtttaccag
acaagtccggtagaaaccgactttgaaaactcggattggggttcatatcaggttattgga
tttatggcagagaaatacttcgcaggatacactgatgatacagatatcgatggtgtcgat
gaagtaagtcttatgtctgcaggtcagctctcaaaggttcttcttgatgatgatgacaaa
gagtctgtttattctggttcttcacttatacttgaggaaggttatgaactgaatgtcgtt
gaagttgacgtcaatggagacagtgtttatgtaaccctcacacaagatggcgatgaactt
gatagtgcagtaatttccagtggagatgactatgtatatgagaccgatcttggcgatgca
gatgatgtagcattgataattgttcacatcgatgatgtattcagtggtactgaatcaaat
gctgtcttcatccaaggtgtcttccaaatatcagatgattatgttgaacttgaagacggt
gaatcctatggcgagatggaaatcacatccataagtgacgacctcattgaaatggaaaac
gatgggacagtttcactttcaaaaggcaagacaattaatcttatgggcagtatcaatctc
atagttgctgacaacgatgatctcagatttgctccatatgttgacatgtctgacccaggt
acatacgaactccgtggtacagttgcagaagaagatgagcttctcacatggacgcctctt
aactttgaaggtttctactatgatattgatgagggtatacaaactgagaaacttgaactg
acagctatatccggcagaacaattgacgatggtgaccttgtttacactagtgtgcctaag
cctgttgagtttgaacactcagactggggagaattccaggtaatcggatttatggccgag
aaatacttcgcaggttatacagatgatacagatgtcgatggtgttgatgacgtaagcctc
atgtccaacggccagctctcggaagttctgcttgacgacgatgataaagcatcagtttat
tccggttcctcattgatccttgaggaaggttatactctggatataattgaagtcgacact
agtggtgacagtgtacttattgaactgtatcaggacggagatgaagtagatactgaaatc
gtatctgcgaacgatgattatgtctatgagaaagaccttggtgatgcagatgatgtgcct
atcataataatacacttcaacgaggtatttgccggtagcgaatcaaacgctgtcttcgta
gagggtattttccagatatcagaagattatatcagtctggaagatggagatacttatggc
gagatggaggttaccagttatagtgaagattccattgtcatgaagaatgaggattcaatc
agtctttcaaaagacaaggatatcactctcatgggagaagttggtataagggtagctgac
tcaggtactctaagatactatccatatgttgaagttacaaccgctgcttcccaggcactg
accattagccttagtgactctactgtgtcagaaggcgatgaggtaacaatcaccgtaact
tcacgcggttcaagaatagcagatgccactgttaaggtggaaggaactactatcggaacc
actgatgatgaaggtacaattgattatgacgcagatgagattggtactctagagataact
gccgaaaaggatggttacacatctgcttctgaagatcttgaggtaattgatcctgatgat
gaaaccaggaagatgagcatcgaggtctcacctgataaggtttatgtgggtaattctatt
accatctatgtcttgcaggcaatcggcggcgatgaaatttctggagtaactgtcacattt
gacggaaaatccattggcacgactgacagcgatggtactgtaacttacacagcaacagaa
gcgggtactcactcaattgaagctacaaagtccggtatgaatgatgccgaacttgatctt
aaggtcaatgaacttgctgcagagtttgaattcagcaatctggaaataagccctcttgag
atcaaacagggacagaaagcaacaattaccgctgatgtcaccaacacaggtacagcagaa
ggttcctataatgttgagctcaaggttgatgacgtaatagtagattcccagacaataaca
ctttcagttggtaattctacaacagttgagtttacccacgaagaagaagaacctggtact
tatgaagtacagcttggagatcttacaacaacatatgaggtctttgagaaatcaggcacg
atatggtatgttctcggagcaattggtcttgcagcaattggtggagttgcatatctgttc
acagcaggtggatggacagtagaaatagcacaggcaaaggctgcagaagcagtagcagca
atcaaagagttgatcgggaaataa
DBGET
integrated database retrieval system