KEGG   Mycoplasma seminis: Q8852_04140
Entry
Q8852_04140       CDS       T09354                                 
Name
(GenBank) PolC-type DNA polymerase III
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mses  Mycoplasma seminis
Pathway
mses03030  DNA replication
mses03430  Mismatch repair
mses03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mses00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    Q8852_04140
   03430 Mismatch repair
    Q8852_04140
   03440 Homologous recombination
    Q8852_04140
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mses03032]
    Q8852_04140
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mses03400]
    Q8852_04140
Enzymes [BR:mses01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     Q8852_04140
DNA replication proteins [BR:mses03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     Q8852_04140
DNA repair and recombination proteins [BR:mses03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     Q8852_04140
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP HHH_6 DNA_pol_A_exo1 HHH_3 CAF1 T2SSK
Other DBs
NCBI-ProteinID: WLP85481
UniProt: A0ABY9HAG6
LinkDB
Position
complement(965207..969604)
AA seq 1465 aa
MDYKNNNFKKLMDYLNISFLSSFADAEFNPNKLEFKRDANTGKIKYQKVFLSTKLPSWND
FEHMLKTCKKEKFWVEYDFEHLDLSNPEIIEYIKNIMQYDEELNGCELHQCLKTTASLYY
NKDNNAWEFEHCKPEQKDQLEQQSFQLTAVMRNFGFKNFILLPKAVESVCTLDDNQIRNN
FASVGKYYANEISEAASESGFNQKVQSRKFNEYRRNNKSKSYSNVDIQYVNSLDAEVVDI
PVTVSGLVYKSDVIEKPEFKIYKFFISNYKDAIETSYFVNNSKAPDYIPSIGDYVEVYGV
VNNPYSFKNDGGPLSKIIKAHFYTKIDNPRNNKQDNADFKRVELSAHSKMSTMDGILDPA
EIIKIAEKYGHKAVTLIDSNGVQGFPEFFAAAKKSSVKPIYGASFDVIDKNHNFLLNYDG
IDRDILTSQYVVLDIETTHLSAQYGELIEFGASVVIDGEIKETHQFFVKAKKPLSSTTIN
LTNITDAMLENEGYDLDAGLDKIYEIINNRICVAHNAHFDSHFIYQKFIQQNKPVPKTFF
IDTLMISRYLFSEKRDHNLGAFCANLSVLYDSQVAHRADYDADVLAQAWIKSMYLLKDRG
ILTFKQLDSIQDTSIYSRTRSSQVTVLALNQTGLKELFNLVTLSLTERYFGSPKLFIEDI
VKTPNILIGSGGLKSKLLDYCFYSSDIAIESWAQKFDYIEIPHIGALDHFDDAPDKFDAF
EIKDTIVKMIRLAHKFNKIPVAIGDVRYEDKMDQNIFKCLVYSKGIGNASHFLFDYKKAQ
GQGIKIPDLSFYTTDEMLEAFSFLNNEELVNDLVINNPNAIADMVQDKIEVIHNDLYTPK
FDNSKDKLYELVYKTAHEKYGEVLPELIEERLKKEITPILEYGFDVIYWISHKLVKKSLD
NGYLVGSRGSVGSSLVATMSGITEVNPLPPHYVCPKCKKFQLANVEGVTSGFDLDDKKCE
QCGIVMEKDGQTIPFETFLGFNADKVPDIDLNFSGDYQAEIHNEIKRLFGASHTFRAGTI
STIKDKTAYGYVKKAVEEYGFNFTPSYIDFISSQMQGVKRTTGQHPGGIIIIPKEYDVED
FTPINYPADDISLDWKTTHFDFHAIHDNVLKLDILGHVDPTAIRMLERLTGLNVKKDIPK
KDPKVMSLFNSTKALGIEPKDIGGEITGALGLPEFGTNFVRRMLYEAKAESFADLISLSG
LSHGTDVWTGNAQSLIKERGMTLKDVISCRDDIMVYLINKGVDPLYSFKIMEKVRKGKGL
TDEEVAQLQKDNVPDWYIESMKKIKYMFPKAHATAYVLMAWRIAWFKLYYPLEYYATYFT
TRVEEFDLQILSNDHGGTKINKKIKELEETKNRKVKEENLLQTLEIARELYARGFNISNI
DLTKSLATEWVVDREHKMLIPPFSAVAGLGEAVANKIIQGREESEYISKEDFKKRSGINN
TLYKFLDEELKVLENLNETNQMKLF
NT seq 4398 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggactataaaaataataattttaaaaaacttatggattatttaaacataagtttttta
tcatcttttgcagatgctgagttcaatcctaataagcttgaattcaaaagagatgcaaat
acgggtaaaattaagtatcaaaaagtatttcttagtactaaattgccttcttgaaatgat
tttgaacacatgctcaaaacttgtaagaaggaaaagttttgggttgaatatgattttgaa
catttagatttatcaaatccagaaatcattgaatacattaaaaacattatgcaatatgat
gaagaattaaatggttgcgaattacatcaatgtttaaaaacaaccgcttcattatattac
aataaagacaataatgcttgagagtttgaacactgtaaacctgaacaaaaagatcaatta
gaacaacaaagttttcaacttactgcagtgatgcgaaattttggttttaaaaactttatt
ttgctacctaaagcagttgaatctgtttgtactttagatgacaatcaaatcagaaataat
tttgcttcggttggaaaatattatgcaaatgaaatttcagaagcagcaagcgagtctggt
tttaatcaaaaagtacaaagtagaaaatttaacgaataccgtagaaataataagtcaaaa
agttattcaaatgtagatattcaatatgttaattcacttgatgctgaagtagttgatatc
ccagttacagtttctggattagtttataaaagtgatgttattgaaaaaccggaatttaag
atttataaattctttatttcaaattataaagatgcaattgaaactagttattttgttaat
aattcaaaagctccagattatattccctctattggggattacgttgaagtctatggtgta
gttaataatccatattcatttaaaaatgatggtggtccattaagtaaaattattaaagca
catttttacacaaaaattgataatccaagaaacaataaacaagataatgctgattttaaa
agagttgaattaagtgcgcattctaaaatgagtacaatggatggaattttagatccggcg
gaaattattaagatagctgaaaaatatggacataaagcagttactttaattgattccaat
ggtgtgcaagggttcccagaattctttgctgctgcaaaaaaatcaagtgtaaagccaatc
tatggtgcttcatttgatgttattgataagaatcataatttcttattaaattacgatggt
attgatagagatattttaactagtcaatatgttgttttagatattgaaacaacccactta
tcagcacaatatggagaattaattgaatttggtgcttcagttgtaattgatggcgaaatt
aaagaaacacaccaattttttgttaaagctaaaaaaccactttcatctactacaattaat
ttaaccaacattactgatgctatgttggaaaatgaaggatatgacttagatgcagggcta
gataaaatttatgaaataataaataatcggatttgtgtagctcacaatgctcactttgac
tcgcattttatttatcaaaaatttattcaacaaaataaacctgtgccgaaaacatttttc
attgataccttgatgatttcaagatacttatttagtgaaaaaagagaccacaacttgggg
gcattctgtgctaatttatcagtactttatgattcacaagtagctcaccgtgctgactat
gatgctgatgtccttgcacaagcttgaattaaatcaatgtatttacttaaagatcgtggg
attttaacatttaaacaattagatagcatccaagatacaagtatttatagcagaactcgt
tcaagtcaagtcactgtacttgctttaaatcaaactggattaaaagaactatttaattta
gttactttatcacttacagaaagatattttggttcaccaaaattatttattgaagatatt
gttaaaactccaaacattttaattggttctggtggattaaaatctaaattattagattat
tgtttttactcatcagatattgcaatagaatcatgggcacaaaaatttgattacattgaa
attccacatattggagcgttggatcactttgatgatgcgccggataaatttgatgctttt
gaaattaaagatactattgttaaaatgattcgtttagctcataaatttaacaagattcca
gttgcaattggtgatgttagatatgaagataaaatggatcaaaatatttttaaatgttta
gtatattcaaaaggtatcggaaatgcatcccacttcttatttgattataaaaaagcccaa
ggacaagggataaaaattccggatctttcattttacacaactgatgaaatgttagaagct
ttttcattcttaaataatgaagaattagttaatgatttagtaataaataatccaaatgca
attgcagatatggtgcaagataaaattgaagttatccacaatgatttatacaccccaaaa
tttgataattctaaagataagttatatgaattagtttataaaactgctcatgaaaaatac
ggagaagttttacctgaattaattgaggaaagacttaaaaaagaaatcacacctatttta
gagtatggatttgatgttatttactgaatttcacacaaacttgttaagaagtcacttgat
aatggatacctagtaggtagtcgtggaagtgtcgggtcttcattagttgctaccatgtca
ggaattactgaagttaatccacttcctcctcactatgtgtgtcctaaatgtaagaaattc
caattagctaatgttgaaggcgttacttcaggatttgacttagatgataaaaaatgtgaa
caatgtggaattgttatggaaaaagatggacaaacaattccatttgaaacattcttagga
tttaatgctgataaagttccggatattgatttaaacttctccggagattatcaagctgaa
atccataatgaaattaagcgactatttggtgctagtcacacatttagagccggaacaatt
tcaactatcaaagataaaacagcttatggatatgttaaaaaagctgttgaagaatatggc
tttaattttactccatcatatattgatttcatatctagccaaatgcaaggggtaaaaaga
acaactgggcaacaccctgggggaattattattattccgaaagaatatgatgtcgaagac
tttactccaattaactaccccgctgatgatattagtttggattgaaaaactactcacttt
gatttccatgctatccatgataatgttttaaaacttgatattttagggcatgttgatcca
actgcaattagaatgcttgaaagattaacaggattaaatgttaaaaaagatatacctaaa
aaagatcctaaagttatgtcactgtttaactcaaccaaagctttaggaattgaaccaaaa
gatattgggggagaaatcacaggagctttagggcttcctgaatttggaacgaactttgtt
cgccgtatgttatatgaagcaaaagctgaatcatttgctgatttaatttcactttcagga
ctttcacacgggactgatgtttgaacaggaaatgcacaaagtttaattaaagaaagagga
atgacacttaaagatgttatttcttgtcgtgatgatattatggtttaccttataaataag
ggtgtagatcctttatattcattcaaaataatggaaaaggttcgtaagggtaaagggcta
actgatgaagaagtagctcaattgcaaaaggataatgttccggattgatatattgagtca
atgaaaaaaatcaagtacatgttccctaaagcccatgcaacagcttatgttttaatggct
tgaagaattgcttgatttaaactgtattatccattagaatattatgctacttactttact
actagagttgaagaatttgatttacaaattctttctaatgaccatggcggaactaaaata
aataaaaagattaaagagttagaagaaactaaaaatagaaaagtaaaagaagaaaactta
ttacaaactttagaaatagctcgggaattatatgcaagaggatttaatatttcgaatatt
gatttaacaaaatctcttgcaactgaatgagttgttgaccgtgaacacaaaatgttaatt
cctccattttctgctgtagctggacttggtgaagcggttgcaaataagataattcaaggt
agagaagaaagtgaatatatttctaaagaagactttaaaaaacgtagtggtataaataat
accttatataagtttttagatgaagaattaaaagttttagaaaacttaaatgaaacaaac
caaatgaaattgttctaa

DBGET integrated database retrieval system