KEGG   Mycoplasma seminis: Q8852_04330
Entry
Q8852_04330       CDS       T09354                                 
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase family protein
  KO
K01153  type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]
Organism
mses  Mycoplasma seminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mses00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:mses02048]
    Q8852_04330
Enzymes [BR:mses01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     Q8852_04330
Prokaryotic defense system [BR:mses02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   Q8852_04330
SSDB
Motif
Pfam: ResIII SWI2_SNF2 DEAD EcoEI_R_C HSDR_N_2 AAA_22 NPHP3_N Helicase_C DUF6576 PIF1 AAA_7 SNF2-rel_dom AAA_19 SLFN-g3_helicase AAA_11 Mg_chelatase AAA_16 Sigma54_activat DUF87
Other DBs
NCBI-ProteinID: WLP85516
LinkDB
Position
complement(1010168..1012516)
AA seq 782 aa
MNQKDLNLSEEDTKRIYITPVLESPSKNWKDSIEMEFPISDGKIITNSETTTRKHPKKAD
YVLKSKQGQLLAVVEAKAFKYDDSEGIQQAKEYAKKLDVPFCYASSGHGFREVIFDGDTY
QERDIELNQFPSREELTQRFLEIKKNIKAENLDFINYKASVSDSNGNKPRYYQRRAINSV
LNAIANGQKRILLVMATGTGKTFVAKRIIQAINANKPNTRILFLCDRDALASQTMKSFSS
FGNKLIRIVNDKKYGYDTAAEIYVALYQQLTPKDNVNPLLNYKKDFFDYIIIDECHRGSA
NENSEWRNILEYFDSATQIGLTATPKESEDTSNRLYFGDPIYTYSLKEGIDDGYLAPYMI
FQIEMDDVEKAANTVGQVDNNGVLIEQAPSEGQMNRSYFYKERNRTVAREITNYLQKYDP
YAKTIVFCKNDQHALDMRDALAEMNAEEMSKANKLSKDYIVRITSNDEEGKKQIENFCDP
FEKYPVIATTAELLSTGVDTKTVKLIVLDTEVKSDIKLKQILGRGTRVFIYQNEEMQQEF
KDKTNFVIMDFGKSTDLLKNDEFFALPDVIYSAKLSSVNSVISEAFESRDFAPRVKNVVD
GEKVYVTNKNVLTLGEDFALTSEKYLELAKERVLNIYPTLEEFNNALLSLDIARKPLFIN
DLIAKAELNIDLIKDYKNINDNIENFDIIRLISYNVLPKTKQGNIKLIKESKLFNSLNEQ
QQEVVDKLLDKYLENGINDLISLQTLELDPLSNYGGMKKIIEIFDGRDKYNELINNLLKI
II
NT seq 2349 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatcaaaaagatttaaatttaagcgaagaagatacaaaaagaatttatataactcct
gtattggaatcaccatctaaaaactgaaaagatagtattgaaatggaatttccaatttca
gatggaaaaattattactaattctgaaacaacaactagaaaacatcctaaaaaagctgat
tatgtcttgaaatctaaacaaggtcaattacttgctgtagttgaagctaaagcttttaaa
tatgatgattccgaaggtattcaacaagctaaagaatatgctaagaaattagatgttcct
ttttgctatgcttctagtggtcatggatttagagaagttatttttgatggggatacttac
caagaaagagatattgaattaaatcagtttccttctcgtgaagaattaactcaaagattt
ttagaaattaaaaaaaatatcaaagctgaaaacttagattttattaactataaagcttcc
gtaagtgattcaaatggtaacaaacctagatattatcaaagaagagctatcaatagtgtt
ttaaatgctatagcaaatggtcaaaagcgtattttactagttatggctacaggtactggt
aaaacatttgttgcaaaaagaataatccaagcaattaatgctaataagccaaatactaga
atattattcttatgtgatagggatgcacttgctagccaaactatgaaaagtttttctagt
tttggaaataaattaattcgtattgttaatgataaaaagtatggatatgatacagctgct
gaaatttatgttgctttatatcaacaattaacccctaaagataatgtaaatcctttatta
aattacaaaaaagatttctttgattacataattattgatgaatgtcaccgtggttcagca
aatgaaaactctgaatgaagaaatattttagaatattttgattcagctactcaaatagga
ttaacagcaacaccaaaagaaagtgaagacacttctaatagattatattttggcgatcct
atttatacctattctttaaaagaaggaattgatgatggatatttagcaccatatatgatt
tttcaaattgaaatggatgatgttgagaaggctgcaaatacagttggacaagtagataat
aatggtgtattaattgaacaagccccaagtgaaggtcaaatgaaccgaagttatttctat
aaagaaagaaatagaacagtagctagagagataactaattatttacaaaagtatgatccg
tatgctaaaactattgtcttttgtaaaaatgatcaacatgctttagatatgcgtgatgca
cttgcagaaatgaatgctgaagaaatgtctaaagctaataagttatctaaagattatatt
gttcggattacatcaaatgatgaagaaggtaaaaaacaaattgagaacttctgtgatccg
tttgaaaaatatcctgtaattgcaactacagctgagttgctttcaactggagtagatact
aaaacagttaagttaattgttttagatacagaagttaaatctgatattaaacttaaacaa
attcttggtagaggaactagagtatttatttatcaaaatgaagaaatgcaacaagaattc
aaagataaaactaattttgtaattatggattttggtaaatctactgatttacttaaaaat
gatgaattctttgctttaccagatgtaatttatagcgctaaattatctagtgttaatagt
gtaatatcggaagcatttgaatctagagattttgctcctagagtaaaaaatgttgtagat
ggtgaaaaggtttatgtaactaataaaaatgttttaacactgggtgaagattttgcactt
actagtgaaaaatatcttgaattagctaaagaaagagttctaaatatatatcctacttta
gaagagtttaataatgctttgctttctcttgatatagctagaaaaccactatttattaat
gatttaattgcaaaagctgagttaaatattgatttaattaaagattataaaaatatcaat
gataatattgaaaattttgatattatcagacttatttcttataatgttttacctaaaact
aaacaaggtaatattaaactaattaaagagtctaaattatttaattctttaaatgaacaa
caacaagaagttgttgataagttactagataaatatttagaaaatggtattaatgattta
attagtttacaaacacttgaattagatccgcttagcaattatggcggaatgaaaaagatt
attgaaatctttgatggtagagataaatataatgaattaattaataacttattaaaaata
attatttaa

DBGET integrated database retrieval system