Methanobrevibacter smithii: Msm_0052
Help
Entry
Msm_0052 CDS
T00539
Name
(GenBank) adhesin-like protein
Organism
msi
Methanobrevibacter smithii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3_5
Beta_helix
TcfC
CE2_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ86257
UniProt:
A5UJ79
LinkDB
All DBs
Position
complement(41323..48915)
Genome browser
AA seq
2530 aa
AA seq
DB search
MVSAIEVEESDNSTTYQLSSIDSSQEIAAGDTDSSLESPTSGTVYVSKTGSDSNDGSTKD
KALASLTHALNVVPNSGNIIMLDGAYSYSSISIPSSKIVTIEGEGNVNLTGLSSYSTFIT
NEGELTLKNINIVNCKGDMIDSAAFNNKNKLNVINSTFINNKLVFYNNGDLLIDNSSFFN
SLGCVVNADEDSRTTTVTNSKFINGKYGNSILSFSRNKFPTLIENCTFENFYSTANTGGI
IGVSTIGADFRINNCSFINNTLDAKGMFTPTSDKYGVVIRVGITTDVLFNITNCVFANNK
GINGAIGVIQQVNSYINVTHSVFVNNTDYYGNTIVNGGSRGTSLYDYNWWGSDNPDFTTL
VKDTKNPVNKWAILDMDYTPSTNIKPGNTITVAAGLTKYTDVDGNIHILNDKLPDYGNVT
FEFQDGTKKVVPIKNGLAKIDYVVKSGENIVWATLNNQKTNITIVTKDLDTIYVSPDGDD
SNEGSKLSPVKTIAKAIELANTGKIVLLQGNYVENNVIVNKNVNITGEGNVVVDGNASGV
VFTINSGNTVYLKNLNVKNAVNAKDGGAIYNNGANLYLDSVNLYENIAGNGGAIYNTNKG
TIVITNSKLHHNNNTAKSGWNKGGSAIYNTASSKVTIENCEIYSNNALSDGTIQSYNSDL
IIKNSKFFNNTAKWGGAFYGENANIIVDNCNFYNNTANNAVIYARTSTVNITNSFIRFNK
AINYPSAIQNYGSKITIDNTTIANNTGTKAAVINQDLSSVSTSLIIINSRIYNNTNGAVY
NDKSSSDNSNITLDINNCAIFNNGDNSVIQHGTKSSGIYITANTNWWGSNKNPADIAGDG
VNIDNWIILQVTYDDRGIPVLYDQFDIEANLNYYVTKDGKNGTVLNNHIFDGLVVNFDTT
TGYLTKNKAIISNGMAVSKYSVLTQTANIIVVKFDNQTITIDLNANYYNGTTYVSTDGKD
TNDGSIDSPVASLEKALSINKNGNIIILNGTYIVRNVKIDGNYNIAGEGSVTLSGADVER
VLYILEGKVIIKNINFTNGRTLSESGALIGNAGDLTLINTTLSNSKSSKNGGAIYNAGNL
TVINATIANNKATIGGAIFIDKFNDYNYNIKFQNVVFKDNEASGENNHAGGAIYAQAVGG
QILIDNCSFISNSVSKNFAGGAIHALQLIDGIKITNSKFINNTANSPENYGGGAICFIGG
NTERMGKLDISDSVFEDNKDNVAGAIYIRGSTLDISYSALINNGNTAIYKGVSSYVITKI
TADNNWWGTNNNPSAFVNGEIVSKWIVMTFTNDTPITQGNKVLLIVALDTLNDGSKLDKA
LEFARPVTIVTPTETFSNQYNVEYTIPEKVTIISATIDSQSVYLYSAKTNTTVNINDTTV
NLGRNINLTAVIKDTIGNNIPMGAVEFYINDKLVGSADVKNGVATLVLSNNYAEGSYNIV
AKYGDVNGVYNQSMDKAVLKVISTSLIVTNSTFFNFFDNDGMLKESIDANELIFSGLFSG
LGVNTITIDRAIKLKGTNSTTLDNIFLELIGNGISVDNFTININKQNYGIYITNVDKVIV
KNSLINFNDVGTSDAMAIYANGVSNLQLVNNTIIYSGQSKGKTLNHPVHIDDCKGAVIEN
NTINAKMPSLAIDYDKITYAAITYSAAVFIDNSDNVKVINNRVTNAYTTFGGMFDTIEGI
LIRASKNPVVKSNIIDVTGHNYTYALKFVSVMDSDYNVVGCLNINVADNIITSKCDYYYA
NAIEVDGPITGKLFNNSVSVEALDVVYGIYSQAINGAVNVDYINNTILANAHTAYAMELM
GNDEKVTGNTIISKGNITMGIMSSSKNLKVFNNTIKSLGSGIGPITGGDVLGGANTGIIV
TGDKNSVKYSKLEAYNNTIIANGDYTVMIDKRNTQVNTVTGNYLVSGKFLGDKSVNASQL
NKVYNNTPDAFPTVIVVKDDELFINENYTISLTDIHGKELSGMNIIIKCGDKVWKEVTDE
FGNVSIPIASLGVGTHLIEVVFEGSGYYAPSKTLNNLTVNKFPSVINLTSEDVYVGSDVT
IKAEVTDGVTGEIIFIVNNKEYPVLIKDNKAILSIANLSSGTYDVIAKYDGNDLYGSASA
NTTFKINKYSSDIKADTNVSGNDLSVSIVLPEDATGNVIVSVDGKKESVAVNNGSAKVVI
NNLTSGNHSVEINYSGDDKYASATLIRNITVIPVEFKLSINELIKFQGGTDKLIATLIDG
QGNPIINASIVFTVNGVNYTKYTNKSGVASMGINLKAGVYNASATYNSTTVSSTVTIKST
VIGYDIVKMFRNATQYSALFLDSNGKALVNATVKFNINGVFYTKSTNGEGIATLNIQLLP
KEYIITNYNLVTGEENSNKVTVKSLLVDNSDLIKYYLNESSYTLKVIGKDGKVAAGQEVT
FNINGVFYHRVSDDNGIVSLGIKLRPGTYIVTAEYEGCWVSNNITVLPTLITKDLDMKYL
DGSNFTAQTLDGQGKALAKQNISFNVNGVFYHKTTDENGIANLNIRLNPGKYIITSIWNE
YQIGNNITIA
NT seq
7593 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaagtgcaatagaagttgaggagagtgataattcgactacttatcaattaagtagt
attgattcttctcaggaaattgctgctggtgatactgattctagtttggaatcaccaact
tcaggaactgtttatgtttctaaaactggtagtgattcaaatgatggttcaacaaaagac
aaagcattagctagtttaactcatgctttaaatgttgttccaaatagcggaaatattata
atgcttgatggagcatattcatatagttctatttctattccttcttctaaaattgttaca
attgaaggtgaaggaaatgttaatttaacaggtttaagctcatattctacattcattaca
aatgaaggggaattaactcttaaaaatatcaatattgtaaattgtaaaggagatatgatt
gatagtgcagcttttaacaataaaaacaaattaaatgtaataaattctacttttattaat
aataaattagtattttataataatggagatttattgattgataattccagtttcttcaat
agtttaggttgtgttgttaatgctgatgaagattctagaacaacaactgttacaaattcc
aaatttattaatggtaaatatggtaattctattttgtcattttctagaaataagttccct
acactaattgaaaactgtacttttgaaaatttttattctactgctaatactggtggaatt
attggagtaagtactattggagcagattttagaattaacaactgcagttttattaacaat
actttagatgcaaaaggaatgtttacaccaacatctgataaatacggtgtagttatacgt
gttggtattacaacagatgtattatttaacattacaaattgtgtttttgcaaataataaa
ggtattaatggagcaattggtgttattcagcaagttaactcttatattaatgtaactcat
tctgtttttgtaaataatacagattactatggaaatactattgtaaatggcggttcaaga
ggaacaagcctttatgattataactggtggggaagtgataatcctgattttactacatta
gttaaagatacaaaaaatccagttaataaatgggctattttagatatggattatactcct
tcaactaatataaaacctggaaacacaattacagttgcagctggtttaaccaaatatact
gatgttgacggaaatatacatatattaaatgataaacttccagattatggaaatgttact
tttgaattccaggatggaactaaaaaagtggtacctattaaaaatggactggctaaaata
gattatgtagttaaaagtggagaaaacattgtctgggcaacattgaataatcaaaaaaca
aatattacaattgtaactaaagatttagatactatttatgtatctccagatggtgatgac
tctaatgaaggatctaaattaagtccggttaaaacaatagctaaagcaattgaacttgca
aatactggtaaaatagttcttcttcagggaaactatgttgaaaacaatgttattgtaaat
aaaaatgtaaatataactggtgaaggaaatgttgttgttgacggtaatgcttcaggagta
gttttcactattaattccggaaatacagtttatttaaaaaatttaaatgttaaaaatgca
gttaatgctaaagatggtggggctatttacaataatggagctaatctttatttggattct
gttaatttatatgaaaatatagcaggaaatggtggggctatttacaatactaacaaagga
actattgtaattactaattctaaattacatcataacaataacacagctaaatccggatgg
aataaaggaggatcagctatttacaatactgcttcatcaaaagtaactattgaaaattgt
gaaatttactcaaataatgctcttagtgacggaacaattcagtcatataattctgattta
ataatcaaaaattcaaaattcttcaataacactgctaaatggggaggagcattttatggt
gaaaatgcaaatataattgtagataactgtaacttctacaataatactgctaataatgca
gttatttatgcaagaacatccactgtaaacattaccaactctttcattcgttttaacaaa
gcaattaattatccaagtgcaattcagaattatggaagtaaaattacaattgataacact
acaatagctaataatactggtactaaagcagctgttataaatcaggatttatccagtgtt
agtactagtttaattataatcaattcaagaatttataataatactaatggtgcagtttat
aatgataaatcttcttcagataattcaaacattacattagatataaataactgtgctatt
tttaataatggagacaattctgttattcagcatggaactaaatctagcggtatttatata
actgcaaatactaactggtggggttctaataaaaatcctgcagatattgccggcgatgga
gttaatattgataactggattattttacaggtaacttatgatgacaggggaattcctgtt
ctttacgaccaatttgacattgaagctaatttaaattactatgttacaaaagacggtaaa
aatggaactgttttaaataatcatatatttgatggtttagttgttaattttgatacaaca
accggttatttaactaaaaataaagcaattatttctaatggaatggctgtttcaaaatac
agtgttttaactcaaacagcaaatattattgttgttaaatttgataatcagacaattact
atagatttaaatgcaaattattataatggaacaacttatgtttctaccgatggtaaagat
acaaatgacggatctatagattctcctgtagcttctcttgaaaaggcattgtctattaat
aaaaatggtaatattataattcttaatggaacttatattgtcagaaatgtaaaaatcgat
ggaaattacaatattgctggtgaaggcagtgtaacccttagcggtgcagatgttgagcgt
gttttatatattcttgaaggaaaagtaataattaaaaatattaactttacaaatggaaga
actttaagtgaaagcggagctttaattggaaatgctggtgacttaacattaatcaatact
acattatccaattcaaagtcaagtaagaatggaggagctatttataatgcaggtaattta
acagtaattaatgctacaatagctaataacaaagcaacaattggtggagctatatttatt
gataaattcaatgattacaattacaatatcaaattccaaaatgttgtatttaaagataat
gaagcttcaggagagaataatcatgcaggtggagctatttatgctcaagctgttggagga
caaatattaatcgataattgttcatttatttcaaattcagtttctaaaaactttgctggt
ggagctattcatgcccttcagcttattgatggaataaaaattacaaattccaaattcatc
aataacactgcaaattcacctgaaaattatggtgggggagcaatatgttttattggtgga
aacactgaaagaatgggtaaattagatatttctgattcagtatttgaagacaataaagat
aatgtagctggagcaatctatatcagaggttcaactttagatatatcatactctgcttta
atcaataatggaaacacagctatatacaaaggagttagtagctatgtcattaccaaaata
acagcagataataattggtggggaactaataacaatccgtctgcatttgtcaatggtgaa
attgtttcaaaatggattgtaatgacatttactaatgatactcccattactcaaggaaat
aaagttttattaattgtagctttagatactttaaatgacggatccaaattagataaagca
ttagaatttgcacgtcctgtaacaattgtaacacctacagaaacattcagtaatcagtat
aatgttgagtacacaatccctgaaaaagtaactattatttcagctactatagatagtcaa
tctgtttacttatattcagctaaaacaaacacaacagttaatataaatgatactactgtt
aatttaggtagaaatataaatttaactgctgtcataaaagatacaattggaaataatatt
cctatgggtgctgttgagttttatattaatgataaactggtaggtagtgctgatgttaaa
aatggtgtagctactttagttctatcaaataattatgcagaaggcagttataatatagtt
gcaaaatatggagatgttaatggtgtttataatcagagtatggataaagcagtccttaaa
gtcatttcaacttctttaattgtaacaaattcaacatttttcaacttctttgataatgat
ggtatgcttaaagaaagtattgatgcaaatgaattaatattttcaggtttatttagtggc
cttggagtaaatacaattactattgacagagctattaagcttaaaggcactaattcaact
actttagataatatctttttagagttaatcggtaatggcatatctgttgataactttaca
ataaatataaataaacagaattatggtatttatataacaaatgtagataaggttattgtt
aaaaattcattaattaattttaatgatgttggtacatctgatgcaatggctatttatgca
aatggagtaagtaatttacagttagttaataacacaatcatatattctggtcaaagtaaa
ggcaaaactcttaatcatccagttcatattgatgattgtaaaggtgctgtaattgaaaat
aacactatcaatgctaaaatgccttctcttgcaattgattacgataaaattacttatgca
gctataacttacagtgcagcagtctttatagacaatagtgataatgttaaagtcataaat
aatagagttacaaatgcatatactactttcggcggaatgtttgatactattgaaggaatt
ttaataagagcttctaaaaatcctgttgtcaaatcaaatataattgatgtaacaggacat
aattatacctatgctttaaaatttgtaagtgtaatggacagtgattataatgttgtcgga
tgtttaaacataaatgttgcagacaatatcatcacttcaaaatgtgattattactatgca
aatgctattgaagtagacggccctatcacaggtaaattatttaataattctgttagtgtt
gaagctttagatgttgtttatggaatatattcacaagcaataaatggggcggttaatgtt
gattatataaacaatacaatattagctaatgctcatacagcttatgctatggagcttatg
ggaaatgatgaaaaggtcactggaaatacaataatctcaaaaggtaatattacaatgggt
ataatgtcttcttctaaaaatcttaaagtatttaataatacaattaaatctttaggaagt
ggaattggacctattactggtggtgatgttcttggaggagcaaatactggaattatagtt
actggagataaaaacagtgtaaaatactctaaattagaagcttataacaatacaataatt
gctaatggtgattatacagtaatgattgataaacgcaatactcaggtaaatacagttacg
ggcaattatttggtatctggcaaattccttggagataaatctgttaatgcttcacaatta
aataaagtttataataacactcctgatgcattcccaacagtaattgtagttaaagatgat
gaattatttataaatgagaattatacaatctcattaactgatattcatggaaaagaattg
tctggaatgaatattataattaaatgtggagataaagtttggaaggaagttactgatgaa
tttggtaatgtttcaataccaatagctagtttaggtgttggaactcatttgattgaagta
gtctttgaaggtagcggatattatgctccgtcaaaaacactaaacaatttaacagttaac
aaattcccgtctgttataaatttaacttctgaagatgtttatgttggatctgatgtaact
attaaagcggaagttactgatggtgtaactggagaaataatatttattgttaataataag
gaatatcctgttttaataaaagacaataaagctattttatctatagctaatttaagtagt
ggaacatatgatgttatagctaaatatgatggtaatgatttatatggttctgcatcagct
aatacaacttttaaaataaataaatattcatctgatattaaagctgatacaaatgttagt
ggcaatgatttaagtgtaagtattgttttacctgaagatgctactggaaatgtaattgtt
agtgtagatggtaaaaaagaaagtgttgctgtaaacaatggtagtgctaaagtggttatt
aataatttaactagtggaaatcatagtgttgaaattaattatagtggtgatgataaatat
gcttctgctactttgattagaaacataacagtaattcctgtagaatttaagttaagtatt
aatgaacttattaaattccagggaggaacagacaagcttatagctactttaattgatggt
caaggaaatccaattattaacgcatcaattgtttttactgtcaatggtgtgaattatact
aaatacactaataagagtggtgttgcttcaatgggcattaatttaaaagccggagtttat
aatgcatcagctacttacaatagcacaacagttagctcaacagtaacaattaaatctact
gttattggctatgatattgttaaaatgtttagaaatgcaactcagtattctgcactattc
ttagacagcaacggtaaggctttagttaacgctactgttaagtttaacattaacggtgtt
ttctatactaaatctaccaatggtgaaggtatagctactttaaacatccaactgcttcct
aaggaatacattataaccaattataatcttgttaccggtgaggaaaactcaaataaagta
actgtcaaatcattacttgttgataactctgatttgattaaatactacttaaatgaatcc
agctatactcttaaagtaattggtaaagacggtaaagtagcagctggtcaggaagtaacc
ttcaacatcaacggagtcttttaccacagagtatctgatgacaatggtatcgttagctta
ggtattaagttacgcccaggcacttacatcgtaacagctgaatatgaaggctgctgggta
tctaacaacattacagtattgccaactttaattactaaagatcttgatatgaaatactta
gacggcagcaacttcactgcacaaacattagacggtcaaggcaaagcattagctaagcag
aacatatcatttaacgtaaacggtgtattctaccataaaacaacagatgaaaacggcata
gctaacttgaatatacgcttaaacccaggtaaatatatcatcacatctatctggaacgaa
taccaaattggaaacaatattacaattgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system